Heatmap: Cluster_272 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.72 0.68 0.77 0.47 1.0 0.19 0.27 0.11 0.12 0.12 0.17 0.14 0.06 0.07 0.14 0.04 0.08 0.15 0.06 0.42
0.94 0.45 0.98 0.8 1.0 0.86 0.85 0.36 0.09 0.1 0.14 0.42 0.06 0.06 0.1 0.23 0.55 0.64 0.23 0.89
0.9 0.72 0.56 0.91 0.71 0.51 0.1 0.43 0.47 0.41 0.51 0.25 0.12 0.16 0.57 1.0 0.84 0.51 0.25 0.48
1.0 0.3 0.46 0.73 0.92 0.5 0.1 0.32 0.17 0.11 0.24 0.33 0.17 0.23 0.16 0.21 0.39 0.59 0.24 0.52
0.73 1.0 0.9 0.81 0.75 0.32 0.05 0.26 0.1 0.12 0.11 0.19 0.06 0.05 0.07 0.21 0.27 0.65 0.52 0.5
0.68 0.33 0.46 0.52 0.63 0.29 0.25 0.17 0.09 0.08 0.04 0.18 0.06 0.07 0.05 0.08 0.17 0.49 0.14 1.0
0.74 0.64 1.0 0.88 0.95 0.47 0.38 0.52 0.32 0.33 0.3 0.58 0.23 0.24 0.27 0.67 0.91 0.86 0.51 0.51
0.66 0.94 0.88 0.44 1.0 0.27 0.39 0.17 0.13 0.15 0.09 0.19 0.08 0.12 0.08 0.08 0.15 0.26 0.32 0.62
0.16 1.0 0.69 0.4 0.77 0.13 0.05 0.06 0.05 0.04 0.03 0.03 0.01 0.01 0.03 0.03 0.03 0.14 0.22 0.04
0.36 1.0 0.78 0.59 0.95 0.26 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.01 0.02
0.58 0.76 0.77 0.56 0.66 0.18 0.25 0.54 0.3 0.34 0.32 0.42 0.4 0.32 0.27 0.37 0.49 0.6 0.54 1.0
0.43 0.39 1.0 0.66 0.56 0.26 0.11 0.2 0.12 0.12 0.08 0.14 0.14 0.11 0.09 0.18 0.25 0.33 0.21 0.19
0.89 0.43 0.84 0.84 1.0 0.5 0.49 0.43 0.24 0.24 0.19 0.42 0.18 0.18 0.19 0.42 0.65 0.92 0.41 0.64
0.18 0.65 0.18 0.63 0.84 0.31 0.5 0.24 0.34 0.42 0.32 0.69 0.12 0.16 0.29 0.91 0.63 0.39 0.04 1.0
1.0 0.36 0.68 0.53 0.55 0.45 0.07 0.18 0.11 0.13 0.08 0.31 0.08 0.15 0.1 0.53 0.36 0.49 0.22 0.83
1.0 0.58 0.58 0.54 0.75 0.36 0.07 0.15 0.12 0.05 0.1 0.24 0.06 0.08 0.08 0.37 0.27 0.39 0.26 0.69
0.57 0.36 0.61 0.7 1.0 0.38 0.46 0.21 0.09 0.09 0.11 0.33 0.11 0.13 0.11 0.15 0.31 0.44 0.21 0.81
0.87 0.27 0.8 0.96 1.0 0.52 0.13 0.24 0.11 0.1 0.08 0.55 0.06 0.08 0.07 0.29 0.61 0.41 0.17 0.37
0.65 0.19 0.5 1.0 0.79 0.4 0.08 0.16 0.06 0.06 0.05 0.37 0.01 0.02 0.05 0.18 0.45 0.28 0.2 0.27
0.46 0.56 0.58 0.63 0.71 0.22 0.09 0.17 0.11 0.14 0.08 0.25 0.04 0.04 0.08 0.21 0.4 0.6 0.08 1.0
0.58 0.73 1.0 0.14 0.6 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0
0.32 1.0 0.53 0.39 0.55 0.08 0.1 0.03 0.01 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.14 0.23 0.06
0.45 0.73 1.0 0.76 0.65 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.3 0.26 0.35 0.46 0.38 0.55 0.37 0.09 0.03 0.02 0.0 0.09 0.01 0.01 0.0 0.07 0.15 0.18 0.02 1.0
0.4 1.0 0.25 0.28 0.44 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.42 0.28 0.41 0.26 0.52 1.0 0.2 0.03 0.01 0.0 0.02 0.03 0.01 0.01 0.03 0.01 0.06 0.21 0.03 0.69
0.87 0.43 0.83 0.69 0.96 0.92 0.2 0.37 0.21 0.23 0.22 0.44 0.24 0.32 0.23 0.32 0.46 0.83 0.14 1.0
1.0 0.67 0.76 0.74 0.84 0.72 0.16 0.32 0.15 0.15 0.2 0.11 0.07 0.07 0.21 0.13 0.17 0.9 0.43 0.51
0.95 0.64 1.0 0.66 0.81 0.01 0.03 0.1 0.02 0.01 0.01 0.18 0.01 0.0 0.01 0.07 0.2 0.43 0.0 0.67
0.87 0.5 0.59 0.92 0.98 0.47 0.62 0.42 0.23 0.23 0.31 0.26 0.25 0.33 0.26 0.25 0.2 1.0 0.5 0.4
0.74 0.17 1.0 0.51 0.74 0.0 0.24 0.03 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.38 0.34 0.0 0.8
0.44 0.85 0.77 0.47 1.0 0.24 0.09 0.16 0.06 0.06 0.04 0.03 0.05 0.06 0.05 0.03 0.08 0.25 0.1 0.27
0.52 0.05 0.42 0.82 1.0 0.81 0.27 0.14 0.06 0.1 0.08 0.61 0.07 0.07 0.09 0.1 0.59 0.39 0.26 0.95
1.0 0.62 0.67 0.95 0.85 0.36 0.03 0.23 0.14 0.08 0.24 0.22 0.11 0.08 0.22 0.1 0.17 0.36 0.13 0.53
0.72 0.03 0.35 0.84 0.72 1.0 0.03 0.08 0.01 0.02 0.0 0.17 0.01 0.01 0.0 0.06 0.22 0.22 0.07 0.41
1.0 0.49 0.85 0.82 0.61 0.85 0.08 0.43 0.32 0.27 0.28 0.34 0.12 0.11 0.32 0.37 0.32 0.33 0.1 0.12
0.46 1.0 0.79 0.78 0.61 0.01 0.06 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.18 0.12 0.04
1.0 0.31 0.61 0.84 0.96 0.3 0.13 0.17 0.08 0.08 0.06 0.22 0.06 0.05 0.07 0.13 0.2 0.68 0.29 0.65
0.9 0.4 0.73 1.0 0.96 0.32 0.14 0.19 0.09 0.06 0.06 0.24 0.06 0.07 0.05 0.17 0.23 0.55 0.37 0.7
0.44 0.89 1.0 0.61 0.81 0.03 0.03 0.05 0.02 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.1 0.05 0.36
0.72 0.68 0.77 0.47 1.0 0.19 0.27 0.11 0.12 0.12 0.17 0.14 0.06 0.07 0.14 0.04 0.08 0.15 0.06 0.42
0.41 0.44 0.36 0.21 1.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
1.0 0.48 0.62 0.63 0.66 0.89 0.05 0.28 0.15 0.18 0.05 0.13 0.16 0.12 0.06 0.28 0.22 0.82 0.26 0.27
0.89 0.2 0.59 0.98 1.0 0.76 0.85 0.34 0.08 0.1 0.12 0.35 0.13 0.12 0.08 0.22 0.54 0.64 0.21 0.97
0.76 0.7 0.91 0.9 1.0 0.99 0.22 0.23 0.08 0.07 0.15 0.21 0.09 0.1 0.16 0.28 0.33 0.52 0.12 0.71
0.67 0.12 0.24 0.41 0.38 0.54 0.15 0.3 0.14 0.21 0.24 0.22 0.32 0.22 0.2 0.25 0.21 0.71 0.24 1.0
0.74 0.37 0.37 0.27 0.46 0.42 0.05 0.3 0.19 0.13 0.22 0.19 0.18 0.17 0.27 0.18 0.1 0.57 0.17 1.0
0.49 0.32 0.6 0.64 1.0 0.57 0.04 0.38 0.2 0.21 0.27 0.19 0.14 0.11 0.33 0.21 0.27 0.55 0.32 0.5
0.61 0.69 1.0 0.9 0.75 0.39 0.2 0.37 0.25 0.23 0.27 0.28 0.22 0.17 0.3 0.38 0.42 0.52 0.4 0.34
0.87 0.36 0.65 0.8 0.92 0.5 0.52 0.41 0.32 0.36 0.4 0.36 0.21 0.22 0.33 0.33 0.42 0.75 0.43 1.0
0.69 0.24 0.76 0.6 1.0 0.34 0.34 0.15 0.1 0.21 0.15 0.15 0.05 0.07 0.05 0.16 0.35 0.31 0.42 0.54
0.68 0.45 1.0 0.72 0.84 0.39 0.28 0.18 0.11 0.18 0.07 0.17 0.05 0.06 0.1 0.18 0.36 0.3 0.14 0.56
0.79 0.5 0.72 0.77 0.54 0.81 0.66 0.87 0.71 0.61 0.49 0.68 0.19 0.15 0.5 0.62 0.63 0.67 1.0 0.12
0.42 0.77 0.88 0.5 1.0 0.19 0.41 0.06 0.01 0.01 0.01 0.05 0.02 0.02 0.01 0.01 0.05 0.25 0.16 0.33
0.48 0.55 1.0 0.96 0.51 0.15 0.06 0.19 0.08 0.08 0.09 0.18 0.14 0.12 0.09 0.14 0.22 0.32 0.21 0.1
0.52 0.37 0.54 0.75 0.92 0.49 0.41 0.12 0.03 0.04 0.02 0.1 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.69 0.42 1.0
0.7 0.26 0.41 0.76 1.0 0.67 0.01 0.25 0.14 0.17 0.12 0.39 0.26 0.24 0.1 0.26 0.48 0.56 0.03 0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)