Heatmap: Cluster_263 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
46.51 22.65 20.11 39.9 106.07 76.32 10.37 25.16 12.59 11.51 14.25 7.65 2.78 3.73 11.6 18.43 26.66 61.15 25.27 112.24
0.08 0.12 0.28 0.17 0.59 3.57 0.02 0.41 0.12 0.13 0.14 0.34 0.17 0.12 0.08 0.05 0.44 0.79 0.34 9.12
0.07 0.0 0.6 0.11 0.97 6.99 0.14 0.49 0.12 0.07 0.06 0.11 0.05 0.12 0.03 0.15 0.87 1.31 1.01 11.8
21.74 0.0 0.98 0.29 0.66 19.03 5.35 0.46 0.36 0.34 0.06 0.45 0.01 0.22 0.08 0.05 0.3 1.35 1.95 61.32
3.82 0.85 1.71 1.98 6.37 166.82 1.4 12.79 0.65 0.61 1.38 8.4 5.31 7.39 1.59 0.32 3.89 16.47 17.69 38.39
10.49 2.04 3.92 4.25 15.57 357.54 2.21 25.99 2.2 1.97 4.64 19.03 14.64 26.17 3.87 0.67 9.81 44.25 13.22 134.07
4.8 1.62 1.57 6.94 7.67 32.77 6.28 2.68 0.73 0.96 2.38 3.35 0.47 0.9 1.17 2.39 2.82 13.54 4.62 10.29
0.02 0.05 0.1 0.16 0.49 15.96 1.29 0.36 0.18 0.22 0.16 0.07 0.08 0.06 0.37 0.36 0.73 2.48 3.32 14.78
0.0 0.0 0.16 0.0 0.31 0.17 5.28 0.07 0.07 0.04 0.0 0.35 0.03 0.13 0.0 0.23 1.5 2.18 1.11 5.85
10.6 23.07 12.99 8.84 4.78 5.29 2.89 6.62 2.27 2.74 4.97 12.14 3.76 2.43 3.15 1.68 5.98 7.53 3.62 12.65
62.77 69.14 46.73 38.81 17.25 94.29 21.86 20.63 11.96 9.55 10.84 14.66 11.31 18.56 6.76 15.44 13.0 16.23 2.89 14.47
9.49 3.47 5.76 1.99 1.34 47.71 0.2 1.08 0.54 0.62 1.37 5.54 1.1 0.91 0.42 0.19 0.5 0.05 0.0 3.38
0.25 0.27 0.45 0.79 0.64 9.71 0.12 1.04 0.43 0.43 0.46 1.26 0.42 0.78 0.61 0.75 1.2 0.46 0.11 20.43
159.31 47.99 82.52 59.6 46.93 603.29 76.58 31.24 9.09 10.66 5.84 97.3 2.75 6.99 4.87 1.98 13.65 147.79 44.04 252.23
3.56 2.92 7.04 2.96 1.65 3.29 0.44 2.2 0.96 1.76 0.77 2.52 0.38 0.17 0.49 0.66 1.61 0.96 2.25 1.34
50.71 25.31 30.91 43.4 69.69 250.19 5.05 34.44 1.98 2.37 5.24 22.36 2.77 5.31 4.52 6.59 7.76 87.11 7.06 133.98
47.63 39.11 44.43 16.36 11.95 80.7 13.08 26.21 29.28 22.11 13.13 18.64 25.31 21.16 11.76 26.93 16.98 23.42 3.92 108.61
73.83 178.3 42.24 61.44 58.21 338.5 197.56 36.81 45.56 95.12 14.63 72.87 33.19 80.74 8.63 16.13 16.9 23.04 0.14 79.61
1.79 1.6 1.71 3.63 4.71 61.36 4.49 2.82 0.37 0.7 0.31 1.63 0.01 0.01 0.35 4.26 5.06 16.02 1.5 13.44
0.86 1.57 0.84 2.2 1.78 8.88 0.44 2.9 1.34 1.71 1.11 2.32 2.74 1.58 1.4 0.72 1.05 1.1 0.18 1.82
13.21 8.96 8.92 9.54 6.3 30.8 2.03 9.52 7.62 9.76 5.39 18.32 6.57 4.68 4.69 7.56 9.67 3.87 0.19 6.03
7.09 3.12 6.59 3.0 0.29 10.9 5.97 2.55 3.6 6.01 2.25 4.32 3.73 3.62 5.51 4.99 3.63 1.05 0.57 7.47
0.06 0.26 0.16 0.05 0.12 1.06 0.45 0.23 0.01 0.02 0.06 0.04 0.02 0.04 0.05 0.08 0.15 0.27 0.1 1.49
0.16 0.04 0.02 2.0 1.91 33.61 0.52 2.13 0.52 0.54 2.2 0.35 0.32 0.25 4.84 0.86 2.0 1.74 0.21 15.9
12.34 6.3 2.23 0.92 1.23 46.03 17.01 2.82 0.32 0.38 0.17 10.88 0.37 0.73 0.35 0.55 1.25 0.26 0.0 40.57
5.57 3.96 12.65 0.53 7.66 2.88 96.6 11.76 26.31 12.11 2.71 15.25 4.18 3.35 3.3 7.74 31.57 8.66 6.27 83.34
195.54 408.98 63.34 240.87 273.69 1285.6 50.89 36.73 15.85 72.8 3.75 74.8 2.35 13.83 1.7 144.7 69.06 100.06 0.1 22.0
11.07 3.88 6.44 12.34 15.46 84.88 5.97 9.11 2.98 2.55 2.86 5.2 3.19 3.24 2.75 4.31 6.62 23.47 9.59 17.09
3.4 1.89 1.83 1.86 2.27 5.66 0.79 1.29 0.79 0.62 1.22 1.1 0.49 0.36 1.28 0.71 0.81 1.97 1.04 6.03
4.89 3.82 2.76 3.4 2.95 9.88 1.04 2.18 0.87 0.69 1.11 1.59 1.43 0.85 1.2 0.69 1.22 2.61 2.5 4.12
25.74 6.74 8.28 25.36 16.81 123.61 9.66 6.15 0.5 0.57 0.21 1.8 0.23 0.27 0.19 4.72 5.21 17.26 0.14 94.96
4.09 1.51 2.74 2.54 1.05 12.07 0.56 0.14 0.01 0.03 0.05 0.04 0.02 0.0 0.05 0.06 0.06 2.02 0.6 8.94
1.31 0.7 1.38 0.49 0.49 13.07 0.5 0.3 0.15 0.12 0.29 0.31 0.06 0.07 0.13 0.25 0.04 0.36 0.21 8.37
0.24 0.19 0.02 0.0 0.44 4.24 0.81 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.04 0.0 0.0 0.09 0.02 18.93
37.59 26.41 36.27 26.96 34.43 62.12 34.72 32.51 18.64 22.0 16.55 25.76 37.45 37.06 15.82 20.74 20.87 44.2 18.27 65.15
61.0 44.28 24.81 40.32 38.37 140.11 22.58 23.25 9.96 10.93 3.18 22.98 7.19 9.03 3.17 11.49 19.69 29.07 22.41 17.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.2 0.0 0.0 0.0 0.41 0.37 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.69 0.0 1.3
0.85 0.91 0.59 0.37 0.91 2.03 1.21 0.12 0.05 0.05 0.48 0.04 0.02 0.03 0.73 0.03 0.17 0.67 1.26 9.8
0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.11 0.05 0.03 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.04
15.65 1.83 2.14 1.13 1.92 32.23 3.29 4.35 3.55 5.33 2.2 7.24 1.28 2.5 0.96 2.72 3.23 4.25 0.33 22.05
6.01 7.83 5.44 4.57 8.01 18.13 3.21 8.48 3.34 3.35 7.24 7.0 6.08 4.14 7.02 3.46 3.58 9.85 7.67 9.27
0.0 0.0 0.23 0.18 0.29 2.82 3.33 0.15 0.05 0.09 0.11 0.06 0.02 0.04 0.24 0.27 0.14 0.99 1.81 3.7
0.1 0.1 0.28 0.15 0.3 1.17 0.52 0.05 0.02 0.03 0.0 0.13 0.0 0.07 0.0 0.06 0.0 0.26 0.62 2.21
0.33 0.0 0.2 0.0 0.0 7.4 0.16 0.12 0.03 0.03 0.14 0.1 0.0 0.0 0.09 0.0 0.07 0.42 0.63 5.85
12.56 16.54 30.84 0.0 2.46 305.75 38.56 10.04 4.04 0.0 19.12 7.13 1.95 5.4 20.39 0.0 5.33 41.09 0.0 243.2
3.58 1.87 1.29 0.24 0.23 16.13 2.53 0.24 0.0 0.01 0.01 0.15 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.97 0.05 14.01
22.28 0.12 0.99 0.04 0.29 60.7 2.05 4.07 0.15 0.17 0.12 1.11 0.5 0.23 0.04 0.0 0.03 1.41 9.91 44.86
2.94 2.46 2.05 1.48 2.07 35.38 1.29 3.83 0.88 1.18 1.87 1.75 2.24 1.82 1.63 0.95 2.19 3.98 4.1 6.57
0.04 0.06 0.03 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.2 0.0 0.11 0.03 0.0 0.0 0.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63
0.54 1.13 2.42 1.57 1.63 60.77 4.78 6.44 0.16 0.23 1.17 4.54 0.37 0.39 1.38 0.58 1.22 1.87 0.13 23.58
0.11 0.0 0.01 0.82 0.01 2.92 0.03 0.04 0.01 0.0 0.07 0.01 0.04 0.03 0.08 0.0 0.0 0.05 0.03 9.49
3.34 3.39 2.77 1.45 1.46 6.53 8.04 0.49 0.26 0.29 0.99 3.16 0.38 0.56 0.67 0.54 0.36 1.04 0.44 1.36
37.35 36.0 29.79 27.7 31.42 59.44 22.33 22.2 8.39 9.89 10.73 26.41 24.92 35.55 9.11 12.8 8.19 31.23 9.94 39.28
173.56 24.71 58.58 12.0 19.48 55.83 17.39 3.28 4.47 3.73 2.37 7.64 0.96 1.65 2.93 26.39 23.89 10.21 28.5 354.44
6.39 0.71 6.21 6.82 0.9 34.08 0.78 7.7 0.03 0.02 0.0 0.06 0.0 0.11 0.0 5.72 5.14 24.59 3.05 111.03
109.02 90.92 93.56 91.68 84.34 208.92 36.2 93.77 85.42 85.23 88.97 79.29 106.91 108.98 86.21 81.26 96.88 107.67 89.25 160.01
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.2 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0
69.56 55.62 87.46 79.97 58.25 163.28 43.3 43.65 21.38 18.97 30.99 42.73 27.25 24.7 29.39 22.35 26.47 44.71 42.94 45.71
5.13 1.65 4.31 3.88 2.27 44.85 23.03 1.63 0.75 0.66 0.76 0.23 0.1 0.17 0.81 0.81 1.64 2.94 0.27 33.28
2.04 2.9 1.99 0.81 0.8 7.9 0.75 0.23 0.13 0.2 0.29 0.39 0.26 0.37 0.24 0.03 0.1 0.27 0.14 2.4
7.33 4.76 2.86 9.57 4.94 27.9 0.97 3.18 0.72 0.54 1.84 3.92 2.51 2.8 1.22 1.67 1.78 4.17 0.44 3.51
45.02 5.13 27.98 26.26 10.93 63.0 3.53 3.6 0.61 0.55 0.26 0.66 0.42 0.48 0.18 1.24 1.42 7.69 1.57 88.85
18.62 2.64 6.76 6.51 14.02 15.67 2.87 1.82 2.17 0.65 0.25 1.41 0.93 1.74 0.38 0.5 0.53 10.4 14.05 61.65
23.72 3.35 8.53 9.43 15.7 20.55 3.06 2.36 1.92 0.8 0.58 1.7 0.21 0.52 0.48 0.29 0.65 13.37 26.17 76.55
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.19 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15
1.54 0.05 0.43 1.17 0.99 3.01 0.76 0.5 0.26 0.13 0.05 0.28 0.12 0.01 0.3 0.32 0.71 0.65 0.18 5.23
6.01 2.58 1.59 1.25 4.74 151.68 0.54 10.38 3.56 2.85 11.55 36.52 6.6 6.61 5.27 1.35 14.12 5.59 12.03 211.84
20.88 3.3 4.76 0.52 2.49 9.3 12.89 3.21 3.16 2.52 0.2 0.47 0.4 0.86 0.14 0.37 2.72 5.79 14.77 37.04
19.36 2.56 3.64 0.18 2.95 7.99 11.77 2.96 3.68 2.42 0.51 0.66 0.57 0.9 0.55 0.6 2.06 5.78 8.94 42.24
2.19 1.76 1.46 1.68 1.76 13.02 0.37 1.0 0.48 0.29 0.59 0.33 0.19 0.34 0.8 0.49 0.51 3.94 0.83 5.37
5.55 3.86 5.28 4.94 2.08 17.59 1.26 2.42 3.24 2.16 0.57 1.86 0.19 0.25 0.34 12.24 7.06 5.94 4.13 4.45
3.11 7.81 8.45 1.66 1.98 14.69 4.04 3.12 6.48 3.36 7.72 3.22 0.92 1.67 5.44 0.05 0.49 0.77 3.02 27.96
0.42 0.15 0.32 0.07 0.19 0.74 0.31 0.06 0.02 0.04 0.07 0.03 0.05 0.04 0.05 0.01 0.02 0.02 0.02 0.97
0.05 0.0 0.06 0.04 0.07 6.82 0.06 0.26 0.01 0.04 0.04 0.01 0.01 0.02 0.04 0.01 0.08 0.17 0.03 2.74
4.85 2.12 2.69 0.0 2.14 54.8 8.35 7.54 2.7 2.01 1.63 15.8 1.06 1.46 1.78 0.1 2.05 3.88 1.29 103.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.93 0.91 1.08 1.99 1.92 17.75 7.1 4.8 2.39 2.46 2.55 3.13 1.3 1.26 2.88 3.31 4.81 6.57 1.86 38.16
8.1 6.3 7.27 2.42 0.26 20.42 3.31 0.74 1.32 1.7 0.13 2.95 0.35 0.81 0.07 0.07 0.05 3.18 0.1 16.81
27.25 5.21 9.93 11.15 13.69 144.13 5.81 41.59 30.01 24.63 15.32 37.09 46.89 38.45 13.12 14.93 24.07 38.82 0.7 203.74
0.7 2.92 4.0 1.61 3.33 27.94 1.17 3.2 4.19 2.81 0.56 0.56 0.28 1.07 0.26 1.31 8.84 10.05 6.81 44.34
18.9 25.08 12.44 26.2 27.12 105.49 23.27 14.41 19.58 16.76 9.99 13.84 19.29 20.47 11.55 21.93 13.41 39.22 35.69 68.24
30.31 14.74 35.03 23.93 24.68 45.67 6.81 13.29 13.63 11.77 18.57 7.77 12.62 11.42 15.2 14.14 15.76 18.43 11.62 76.29
0.25 0.02 0.02 0.07 0.03 0.47 0.17 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13
2.93 0.86 1.36 0.7 0.28 5.38 2.2 0.17 0.0 0.01 0.02 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.16 0.21 8.16
12.96 2.95 5.79 8.8 5.57 30.88 8.12 8.37 2.22 2.32 2.85 4.81 4.95 7.27 2.93 3.56 5.0 5.69 7.66 80.94
0.09 0.49 0.0 0.0 0.0 1.23 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
21.79 4.71 17.28 12.59 7.49 35.96 2.96 8.59 4.72 4.88 6.12 5.25 2.59 2.29 6.48 4.89 7.99 6.93 6.42 30.54
0.38 0.0 0.13 0.82 2.2 5.82 0.77 0.12 0.04 0.0 0.12 0.28 0.02 0.07 0.0 0.0 0.27 0.39 0.4 5.74
16.58 5.1 1.67 5.85 3.14 41.52 0.0 16.65 5.9 8.34 0.81 19.53 2.56 10.28 0.23 1.08 7.8 2.66 0.01 0.73
4.1 1.77 3.49 5.1 5.76 2.39 9.46 3.35 0.09 0.28 0.48 0.3 0.05 0.16 0.1 0.24 0.09 6.96 1.7 27.85
7.12 0.2 1.35 0.15 0.13 13.79 0.14 0.09 0.04 0.03 0.06 0.05 0.07 0.11 0.05 0.0 0.0 2.34 1.55 18.37
5.11 14.74 2.0 0.0 3.52 130.87 18.91 11.82 0.91 1.24 0.84 5.34 0.6 2.0 0.18 0.0 0.39 4.53 2.66 288.27
0.57 3.01 1.55 0.19 1.86 59.88 3.08 3.7 7.99 7.08 1.68 0.46 0.82 1.12 1.46 1.48 2.53 0.21 6.02 49.82
4.18 25.51 18.51 14.35 5.42 5.77 51.45 0.08 0.03 0.07 0.0 0.03 0.0 0.03 0.01 0.51 0.01 0.49 76.86 0.62
0.19 0.1 0.0 0.03 0.04 2.25 0.0 0.08 0.02 0.01 0.07 0.04 0.0 0.02 0.02 0.09 0.15 0.09 0.0 0.08
3.75 0.06 0.03 0.0 0.05 12.02 3.39 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.24 1.69

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)