Heatmap: Cluster_19 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.34 0.1 0.06 0.16 0.44 0.4 0.13 0.46 0.36 0.22 0.57 0.09 1.0 0.83 0.66 0.65 0.41 0.57 0.09 0.61
0.5 0.65 0.5 0.46 0.42 0.34 0.57 0.68 0.88 0.74 1.0 0.64 0.54 0.46 0.93 0.82 0.58 0.3 0.51 0.43
0.34 0.83 0.21 0.3 0.24 0.15 0.25 0.87 1.0 0.94 0.77 0.8 0.54 0.52 0.74 0.79 0.87 0.49 0.22 0.97
0.05 0.07 0.02 0.06 0.07 0.06 0.06 0.58 0.68 0.67 0.67 0.4 1.0 0.68 0.6 0.4 0.29 0.29 0.24 0.42
0.31 0.33 0.32 0.22 0.32 0.49 0.07 0.72 0.81 0.86 0.49 0.75 0.83 0.77 0.42 0.41 0.43 1.0 0.52 0.42
0.28 0.0 0.08 0.04 0.29 0.23 0.05 0.73 0.96 1.0 0.6 0.72 0.78 0.67 0.45 0.49 0.37 0.88 0.24 0.39
0.01 0.1 0.05 0.04 0.19 0.08 0.0 0.47 1.0 0.84 0.46 0.28 0.42 0.64 0.42 0.79 0.33 0.89 0.08 0.01
0.14 0.15 0.14 0.43 0.74 0.13 0.11 0.69 0.77 0.66 0.43 0.59 0.54 0.56 0.48 0.82 0.95 0.42 1.0 0.53
0.06 0.0 0.14 0.84 0.27 0.0 0.0 0.59 0.55 0.15 1.0 0.07 0.91 0.62 0.61 0.79 0.79 0.0 0.66 0.44
0.28 1.0 0.3 0.28 0.46 0.27 0.09 0.55 0.67 0.62 0.81 0.51 0.36 0.31 0.8 0.53 0.38 0.28 0.52 0.22
0.4 0.6 0.39 0.39 0.73 0.27 0.37 0.69 0.83 0.8 0.99 0.49 0.42 0.56 0.95 1.0 0.73 0.62 0.38 0.2
0.17 0.31 0.06 0.5 0.16 0.2 0.14 0.39 0.39 0.47 0.17 0.12 1.0 0.7 0.18 0.38 0.12 0.13 0.41 0.11
0.72 0.46 0.6 0.71 0.63 0.67 0.27 0.92 0.87 0.79 0.94 0.62 0.66 0.6 1.0 0.64 0.77 0.82 0.75 0.48
0.31 0.37 0.36 0.36 0.29 0.16 0.11 0.41 1.0 0.93 0.75 0.8 0.7 0.46 0.53 0.91 0.81 0.36 0.21 0.55
0.15 0.3 0.16 0.18 0.38 0.28 0.34 0.57 0.74 0.76 1.0 0.52 0.53 0.54 0.86 0.47 0.44 0.23 0.39 0.25
0.07 0.05 0.12 0.11 0.11 0.09 0.14 0.63 0.7 0.81 1.0 0.45 0.73 0.72 0.98 0.97 0.77 0.33 0.16 0.49
0.01 0.02 0.01 0.03 0.07 0.39 0.05 0.68 0.91 1.0 1.0 0.68 0.78 0.81 0.88 0.25 0.41 0.86 0.04 0.25
0.21 0.01 0.06 0.01 0.07 0.1 0.0 0.6 0.59 0.53 0.53 0.3 1.0 0.73 0.51 0.2 0.15 0.24 0.16 0.1
0.41 0.72 0.43 0.32 0.59 0.73 0.07 0.57 0.69 0.74 0.52 0.22 0.7 0.45 0.58 0.86 0.36 1.0 0.87 0.44
0.38 0.49 0.35 0.41 0.28 0.23 0.06 0.68 0.84 0.85 0.74 0.62 0.95 0.74 1.0 0.56 0.47 0.26 0.28 0.33
0.51 0.47 0.52 0.45 0.47 0.2 0.41 0.66 0.67 0.67 1.0 0.57 0.84 0.62 0.88 0.4 0.54 0.5 0.28 0.66
0.23 0.32 0.29 0.47 0.42 0.11 0.1 0.45 0.47 0.5 1.0 0.42 0.55 0.44 0.96 0.6 0.48 0.3 0.38 0.3
0.34 0.63 0.48 0.7 0.62 0.31 0.13 0.61 0.56 0.56 1.0 0.57 0.9 0.56 1.0 0.62 0.57 0.52 0.73 0.42
0.48 0.63 0.24 0.38 0.64 0.57 0.76 0.76 0.7 0.71 0.94 0.44 0.75 0.46 0.81 0.35 0.53 0.64 1.0 0.55
0.16 0.11 0.04 0.2 0.32 0.26 0.0 0.74 0.59 0.73 0.9 0.41 1.0 0.74 0.94 0.69 0.55 0.92 0.26 0.36
0.29 0.23 0.21 0.42 0.25 0.3 0.39 0.5 0.57 0.38 0.8 0.29 0.84 0.91 0.65 1.0 0.5 0.38 0.38 0.27
0.14 0.15 0.19 0.16 0.33 0.08 0.03 0.75 0.8 0.6 1.0 0.58 0.32 0.35 0.96 0.74 0.68 0.29 0.24 0.21
0.65 0.97 0.59 0.66 0.85 0.49 0.37 0.73 1.0 0.98 0.92 0.65 0.67 0.63 1.0 0.73 0.56 0.69 0.97 0.61
0.23 0.58 0.46 0.38 0.82 0.33 0.39 0.79 0.79 0.79 0.84 1.0 0.66 0.54 0.8 0.63 0.71 0.52 0.54 0.48
0.29 0.45 0.24 0.31 0.31 0.08 0.28 0.36 0.47 0.5 1.0 0.24 0.47 0.38 0.92 0.36 0.2 0.12 0.05 0.48
0.45 0.27 0.21 0.25 0.37 0.18 0.33 0.59 0.95 0.77 0.75 0.62 0.72 0.56 0.78 0.35 0.36 0.33 1.0 0.17
0.53 0.11 0.0 0.3 0.46 0.05 0.24 0.5 0.63 0.36 0.4 0.02 0.54 0.11 0.46 0.74 0.44 1.0 0.07 0.12
0.84 0.4 0.0 0.61 0.87 0.42 0.41 0.69 0.74 0.71 0.4 0.06 0.68 0.17 0.49 0.61 0.51 1.0 0.21 0.12
0.15 0.07 0.01 0.12 0.19 0.06 0.09 0.27 0.26 0.24 0.22 0.02 1.0 0.36 0.34 0.27 0.2 0.22 0.02 0.07
0.23 0.29 0.18 0.31 0.56 0.14 0.24 0.54 0.74 0.57 1.0 0.46 0.47 0.55 0.97 0.71 0.53 0.5 0.39 0.47
0.25 0.23 0.2 0.38 0.65 0.13 0.23 0.63 0.78 0.61 0.93 0.43 0.84 0.89 1.0 0.73 0.54 0.5 0.57 0.44
0.25 0.34 0.19 0.28 0.65 0.13 0.22 0.61 0.68 0.53 1.0 0.44 0.75 0.66 0.99 0.62 0.56 0.45 0.43 0.46
0.25 0.27 0.13 0.57 0.55 0.23 0.22 0.61 0.6 0.5 0.77 0.41 1.0 0.77 0.86 0.46 0.39 0.49 0.77 0.47
0.26 0.0 0.13 0.68 0.07 0.0 0.03 0.55 0.93 0.37 0.28 0.06 1.0 0.72 0.23 0.76 0.34 0.17 0.12 0.31
0.03 0.02 0.07 0.39 0.06 0.0 0.0 0.56 0.99 0.81 1.0 0.29 0.3 0.2 0.53 0.53 0.76 0.06 0.08 0.0
0.11 0.03 0.06 0.36 0.1 0.0 0.0 0.6 0.9 0.98 1.0 0.24 0.14 0.07 0.64 0.89 0.67 0.09 0.19 0.0
0.71 0.53 0.52 0.65 0.57 0.73 0.26 0.9 0.72 0.61 1.0 0.6 0.76 0.67 0.95 0.9 0.94 0.56 0.65 0.37
0.34 0.57 0.45 0.41 0.54 0.31 0.25 0.53 0.57 0.46 0.99 0.37 0.59 0.53 1.0 0.59 0.32 0.41 0.37 0.29
0.59 0.73 0.57 0.67 0.65 0.25 0.49 0.85 0.98 0.96 0.81 0.9 0.78 0.67 0.85 0.82 0.99 1.0 0.55 0.57
0.54 0.07 0.37 0.16 0.51 0.32 0.21 0.56 0.51 0.51 0.84 0.3 0.86 0.84 1.0 0.28 0.45 0.3 0.0 0.79
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.32 0.03 0.18 0.66 1.0 0.69 0.11 0.43 0.82 0.72 0.08 0.06 0.02 0.1 0.13
0.65 0.15 0.3 0.65 0.86 0.23 0.03 0.82 1.0 0.87 0.9 0.53 0.83 0.75 0.95 0.61 0.82 0.77 0.26 0.85
0.13 0.04 0.1 0.22 0.36 0.37 0.15 1.0 0.88 0.75 0.66 0.65 0.86 0.83 0.66 0.66 0.69 0.43 0.64 0.31
0.09 0.03 0.09 0.14 0.25 0.23 0.12 0.83 0.91 0.77 0.71 0.58 0.83 1.0 0.61 0.57 0.75 0.3 0.27 0.54
0.13 0.02 0.11 0.13 0.19 0.02 0.01 0.36 0.35 0.38 0.42 0.14 1.0 0.53 0.37 0.2 0.27 0.24 0.25 0.07
0.34 0.43 0.29 0.39 0.42 0.36 0.34 0.59 0.89 0.69 0.64 0.62 0.64 0.65 0.64 1.0 0.62 0.33 0.64 0.43
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.12 0.01 0.18 0.78 0.9 0.97 0.14 0.26 0.61 1.0 0.06 0.04 0.01 0.13 0.14
0.27 0.39 0.78 0.69 0.45 0.16 0.0 0.51 0.51 0.24 0.27 0.23 0.29 0.42 0.19 0.66 1.0 0.88 0.05 0.01
0.35 0.26 0.21 0.2 0.19 0.18 0.03 0.61 0.4 0.33 1.0 0.36 0.21 0.23 0.84 0.61 0.39 0.26 0.05 0.2
0.71 0.75 0.52 0.89 1.0 0.07 0.18 0.51 0.62 0.54 0.61 0.53 0.15 0.18 0.6 0.77 0.45 0.56 1.0 0.24
0.46 0.35 0.35 0.41 0.65 0.24 0.17 0.59 0.51 0.46 0.53 0.51 0.59 0.48 0.5 0.41 0.36 0.44 1.0 1.0
0.11 0.0 0.16 0.52 0.11 0.2 0.06 0.48 0.44 0.49 0.26 0.0 1.0 0.49 0.14 0.39 0.36 0.1 0.46 0.43
0.28 0.17 0.25 0.26 0.21 0.21 0.02 0.88 0.85 0.89 1.0 0.96 0.92 0.83 0.89 0.82 0.97 0.62 0.47 0.61
0.61 0.53 0.47 0.58 0.57 0.52 0.32 0.79 0.52 0.39 0.53 0.45 0.79 0.66 0.52 1.0 0.85 0.51 0.49 0.37
0.15 0.08 0.05 1.0 0.33 0.08 0.02 0.27 0.12 0.11 0.55 0.04 0.86 0.66 0.71 0.02 0.05 0.33 0.13 0.03
0.51 1.0 0.85 0.67 0.73 0.38 0.34 0.69 0.75 0.73 0.85 0.61 0.82 0.79 0.86 0.71 0.48 0.72 0.9 0.59
0.37 0.42 0.28 0.33 0.39 0.6 0.16 0.57 0.69 0.52 0.64 0.35 1.0 0.74 0.68 0.37 0.31 0.27 0.58 0.27
0.12 0.32 0.21 0.1 0.08 0.03 0.05 0.37 0.41 0.4 1.0 0.3 0.38 0.3 0.84 0.48 0.3 0.34 0.19 0.43
0.01 0.0 0.01 0.06 0.09 0.02 0.0 0.54 0.38 0.45 0.39 0.4 0.84 1.0 0.28 0.02 0.06 0.46 0.01 0.01
0.3 0.31 0.18 0.37 0.26 0.61 0.09 0.42 0.43 0.32 0.62 0.3 0.37 0.42 0.57 1.0 0.48 0.73 0.18 0.68
0.05 0.16 0.1 0.13 0.25 0.21 0.08 0.4 0.45 0.52 0.38 0.09 0.95 0.45 0.46 0.09 0.09 1.0 0.5 0.13
0.43 0.34 0.38 0.5 0.45 0.39 0.14 0.56 0.5 0.5 0.91 0.39 0.62 0.55 1.0 0.6 0.44 0.51 0.25 0.29
0.18 0.04 0.19 0.18 0.24 0.13 0.0 0.64 0.74 0.78 0.83 0.09 1.0 0.54 0.77 0.43 0.19 0.52 0.11 0.09
0.26 0.37 0.21 0.36 0.55 0.31 0.1 0.64 0.64 0.5 0.72 0.34 0.99 0.66 0.7 1.0 0.52 0.89 0.88 0.68
0.11 0.31 0.19 0.45 0.36 0.14 0.1 0.47 0.52 0.4 0.38 0.27 0.27 0.45 0.62 1.0 0.43 0.46 0.75 0.44
0.07 0.05 0.04 0.1 0.02 0.08 0.0 0.47 0.62 0.44 0.71 0.32 1.0 0.65 0.73 0.33 0.29 0.14 0.06 0.43
0.11 0.72 0.13 0.08 0.06 0.05 0.13 0.58 1.0 0.87 0.81 0.4 0.97 0.91 0.85 0.58 0.18 0.3 0.0 0.31
0.8 0.96 0.63 0.77 0.74 0.38 0.31 0.72 0.68 0.62 0.72 0.54 0.63 0.63 0.75 0.71 0.47 0.53 1.0 0.48
0.56 0.39 0.38 0.5 0.74 0.64 0.43 0.98 0.87 0.68 0.93 0.62 0.76 0.64 0.83 1.0 0.71 0.73 0.62 0.73
0.0 0.03 0.0 0.08 0.09 0.11 0.0 0.54 0.39 0.41 0.56 0.3 0.83 0.57 1.0 0.27 0.15 0.46 0.17 0.3

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)