1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_259 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.3 0.46 0.33 0.33 0.53 0.42 0.41 0.33 0.13 0.13 0.26 0.19 0.12 0.09 0.27 0.08 0.12 1.0 0.88 0.61
0.1 0.28 0.18 0.06 0.14 0.21 0.04 0.14 0.04 0.06 0.01 0.19 0.06 0.08 0.03 0.22 0.14 1.0 0.37 0.37
0.61 0.83 0.56 0.4 0.77 0.72 0.44 0.73 0.63 0.58 0.68 0.41 0.75 0.66 0.66 0.61 0.46 1.0 0.8 0.55
0.17 0.1 0.08 0.24 0.26 0.02 0.04 0.29 0.15 0.12 0.15 0.2 0.12 0.1 0.16 0.36 0.23 1.0 0.41 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.19 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.01 1.0 0.56 0.17
0.01 0.14 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02
0.05 0.06 0.07 0.05 0.12 0.08 0.01 0.14 0.05 0.05 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 1.0 0.55 0.14
0.05 0.05 0.06 0.05 0.14 0.05 0.02 0.16 0.13 0.13 0.03 0.03 0.04 0.02 0.07 0.04 0.03 1.0 0.22 0.2
0.31 0.4 0.37 0.38 0.49 1.0 0.37 0.44 0.31 0.29 0.32 0.42 0.35 0.35 0.38 0.28 0.28 0.58 0.37 0.38
0.11 0.0 0.0 0.53 0.42 0.78 0.0 0.19 0.02 0.0 0.01 0.04 0.02 0.05 0.04 0.19 0.19 1.0 0.58 0.16
0.29 0.18 0.18 0.31 0.33 0.35 0.17 0.33 0.16 0.15 0.2 0.15 0.18 0.17 0.19 0.2 0.17 1.0 0.39 0.45
0.04 0.0 0.0 0.24 0.3 0.54 0.01 0.16 0.01 0.01 0.07 0.08 0.02 0.05 0.07 0.1 0.15 1.0 0.4 0.19
0.59 0.93 0.42 0.28 0.56 0.51 0.42 0.68 0.84 0.79 0.7 0.2 0.71 0.58 0.7 0.43 0.25 0.63 0.75 1.0
0.07 0.03 0.02 0.28 0.26 0.4 0.33 0.31 0.12 0.18 0.04 0.11 0.04 0.05 0.09 0.34 0.24 1.0 0.01 0.66
0.03 0.0 0.0 0.37 0.67 0.51 0.0 0.25 0.1 0.06 0.08 0.19 0.15 0.19 0.05 0.22 0.31 1.0 0.3 0.1
0.26 1.0 0.27 0.42 0.62 0.62 0.09 0.4 0.29 0.3 0.17 0.25 0.44 0.35 0.25 0.26 0.24 0.81 0.33 0.09
0.09 0.05 0.08 0.07 0.19 0.55 0.01 0.1 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 1.0 0.53 0.12
0.26 0.05 0.1 0.33 0.13 1.0 0.03 0.43 0.15 0.13 0.19 0.24 0.16 0.1 0.19 0.12 0.42 0.32 0.13 0.18
0.26 0.04 0.19 0.17 0.01 1.0 0.1 0.39 0.28 0.26 0.26 0.3 0.03 0.04 0.05 0.14 0.51 0.31 0.25 0.31
0.1 0.0 0.02 0.58 0.53 0.75 0.0 0.2 0.03 0.03 0.07 0.16 0.04 0.07 0.09 0.14 0.19 1.0 0.64 0.26
0.03 0.0 0.0 0.05 0.37 0.19 0.01 0.18 0.1 0.08 0.04 0.09 0.0 0.02 0.04 0.43 0.17 1.0 0.95 0.07
0.61 0.37 0.59 0.4 0.73 0.46 0.08 0.47 0.59 0.46 0.39 0.46 0.41 0.36 0.48 0.24 0.2 1.0 0.49 0.46
0.21 0.18 0.19 0.39 0.49 0.46 0.45 0.33 0.2 0.21 0.21 0.28 0.12 0.12 0.24 0.23 0.23 1.0 0.77 0.32
0.26 0.2 0.16 0.25 0.36 0.05 0.05 0.15 0.03 0.02 0.07 0.19 0.01 0.01 0.11 0.53 0.26 1.0 0.23 0.02
0.04 0.01 0.02 0.08 0.08 0.05 0.0 0.21 0.02 0.07 0.06 0.1 0.03 0.05 0.1 0.34 0.79 1.0 0.01 0.35
0.04 0.01 0.02 0.08 0.08 0.05 0.0 0.21 0.02 0.07 0.06 0.1 0.03 0.05 0.1 0.34 0.79 1.0 0.01 0.35
0.01 0.04 0.01 0.02 0.2 0.17 0.0 0.13 0.03 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.58 0.3 1.0 0.06 0.31
0.05 0.06 0.05 0.05 0.22 1.0 0.02 0.1 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.53 0.05 0.01
0.14 0.02 0.01 0.66 0.42 0.75 0.01 0.22 0.03 0.02 0.05 0.11 0.01 0.03 0.12 0.18 0.11 1.0 0.74 0.26
0.35 0.29 0.22 0.24 0.4 0.36 0.3 0.24 0.15 0.14 0.17 0.18 0.07 0.07 0.22 0.26 0.19 1.0 0.33 0.14
0.09 0.0 0.0 0.25 1.0 0.15 0.0 0.19 0.16 0.11 0.1 0.1 0.06 0.09 0.05 0.11 0.05 0.89 0.33 0.02
0.22 0.0 0.0 1.0 0.55 0.58 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.03 0.0 0.92 0.29 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.72 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 0.07 0.0 0.1 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.41 0.57 1.0 0.13 0.05
0.19 0.65 0.15 0.31 0.36 0.58 0.14 0.21 0.15 0.2 0.3 0.1 0.13 0.1 0.35 0.31 0.18 1.0 0.87 0.44
0.02 0.0 0.0 0.28 0.26 0.5 0.0 0.14 0.02 0.01 0.06 0.07 0.02 0.03 0.08 0.08 0.04 1.0 0.63 0.27
0.11 0.18 0.14 0.33 0.28 0.19 0.13 0.16 0.04 0.05 0.11 0.23 0.01 0.04 0.11 0.15 0.26 1.0 0.13 0.59
0.12 0.0 0.09 0.28 0.2 0.46 0.3 0.35 0.36 0.2 0.16 0.27 0.2 0.19 0.14 0.29 0.18 1.0 0.82 0.31
0.08 0.0 0.01 0.16 0.21 0.8 0.01 0.15 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 1.0 0.37 0.03
0.1 0.17 0.12 0.01 0.19 0.61 0.0 0.15 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 1.0 0.15 0.18
0.06 0.07 0.05 0.07 0.05 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.03 0.08
0.06 0.0 0.01 0.38 0.22 0.61 0.0 0.32 0.14 0.2 0.16 0.24 0.18 0.2 0.15 0.24 0.54 1.0 0.68 0.15
0.04 0.05 0.05 0.1 0.38 0.36 0.07 0.28 0.2 0.27 0.23 0.34 0.06 0.11 0.3 0.5 0.42 1.0 0.14 0.24
0.26 0.14 0.15 0.23 0.2 0.78 0.25 0.17 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 1.0 0.93 0.45
0.04 0.01 0.05 0.12 0.09 0.08 0.03 0.08 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.06 0.04 1.0 0.21 0.35
0.35 0.05 0.1 0.22 0.13 0.16 0.05 0.23 0.11 0.13 0.05 0.08 0.02 0.03 0.05 0.72 0.32 1.0 0.36 0.24
0.06 0.05 0.09 0.69 0.33 0.18 0.06 0.34 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.44 1.0 0.02
0.12 0.02 0.04 0.66 0.66 0.07 0.06 0.4 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.03 0.05 0.02 1.0 0.88 0.02
0.22 0.41 0.3 0.17 0.35 1.0 0.02 0.29 0.42 0.31 0.12 0.15 0.23 0.16 0.11 0.24 0.16 0.79 0.08 0.33
0.3 0.17 0.19 0.37 0.32 1.0 0.0 0.23 0.17 0.13 0.27 0.1 0.16 0.1 0.31 0.13 0.1 0.51 0.05 0.15
0.22 0.67 0.36 0.28 0.41 1.0 0.01 0.32 0.26 0.19 0.19 0.12 0.26 0.15 0.19 0.35 0.21 0.76 0.11 0.4
0.12 0.1 0.08 0.36 0.35 0.09 0.01 0.29 0.12 0.11 0.13 0.15 0.11 0.1 0.19 0.05 0.07 1.0 0.29 0.11
0.05 0.0 0.01 0.34 0.47 0.66 0.0 0.22 0.1 0.1 0.12 0.19 0.23 0.18 0.09 0.39 0.43 1.0 0.38 0.01
0.07 0.0 0.0 0.19 0.04 0.41 0.01 0.2 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 1.0 0.08 0.03
0.22 0.1 0.06 0.47 0.44 0.05 0.02 0.21 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.43
0.03 0.0 0.0 0.54 0.12 0.24 0.0 0.12 0.03 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.34 0.29 1.0 0.34 0.74
0.15 0.28 0.2 0.38 0.3 0.93 0.02 0.33 0.2 0.19 0.15 0.25 0.18 0.35 0.17 0.3 0.23 1.0 0.54 0.5
0.34 0.48 0.33 0.34 0.11 0.33 0.03 0.13 0.02 0.03 0.06 0.06 0.02 0.04 0.09 0.27 0.05 1.0 0.32 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.07 0.01 0.01 0.04 0.02 0.0 0.0 0.07 0.01 0.01 1.0 0.14 0.03
0.08 0.0 0.0 0.18 0.11 0.74 0.0 0.14 0.02 0.01 0.04 0.04 0.01 0.03 0.08 0.12 0.08 1.0 0.44 0.11
0.87 0.51 0.62 0.62 0.73 0.67 0.44 0.71 0.52 0.42 0.86 0.52 0.65 0.46 0.81 0.58 0.64 0.79 1.0 0.49
0.02 0.0 0.0 0.11 0.15 0.7 0.0 0.18 0.01 0.0 0.03 0.07 0.01 0.01 0.06 0.09 0.16 1.0 0.7 0.55
0.17 0.36 0.16 0.96 1.0 0.02 0.0 0.23 0.09 0.08 0.1 0.02 0.04 0.03 0.14 0.07 0.01 0.95 0.35 0.09
0.31 0.38 0.24 0.26 0.49 0.49 0.48 0.33 0.19 0.17 0.27 0.21 0.18 0.18 0.27 0.28 0.23 1.0 0.8 0.34
0.5 0.3 0.32 0.61 0.55 0.43 0.11 0.49 0.5 0.51 0.4 0.25 0.56 0.39 0.46 0.36 0.31 1.0 0.61 0.2
0.01 0.0 0.0 0.06 0.04 0.05 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.11 0.1
0.69 0.23 0.36 0.68 0.79 0.45 0.23 0.63 0.57 0.45 0.6 0.28 0.31 0.27 0.54 0.52 0.39 0.68 1.0 0.28
0.07 0.04 0.02 0.1 0.13 0.47 0.01 0.13 0.02 0.03 0.02 0.07 0.01 0.01 0.03 0.09 0.08 1.0 0.39 0.37
0.08 0.03 0.02 0.12 0.15 0.4 0.01 0.13 0.03 0.04 0.03 0.09 0.02 0.03 0.05 0.1 0.08 1.0 0.23 0.38
0.06 0.09 0.13 0.1 0.35 0.4 0.11 0.16 0.24 0.17 0.21 0.09 0.13 0.12 0.22 0.25 0.24 1.0 0.32 0.61
0.47 0.43 0.23 0.23 0.59 0.09 0.0 0.25 0.05 0.06 0.02 0.02 0.0 0.01 0.03 0.2 0.14 1.0 0.22 0.15
0.08 0.42 0.31 0.08 0.29 0.41 0.56 0.17 0.13 0.09 0.14 0.11 0.03 0.07 0.19 0.14 0.32 1.0 0.57 0.37
0.02 0.12 0.04 0.04 0.08 0.18 0.21 0.18 0.08 0.08 0.02 0.15 0.01 0.02 0.03 0.36 0.17 1.0 0.06 0.11
0.48 0.21 0.28 0.48 0.51 0.38 0.04 0.45 0.37 0.34 0.41 0.2 0.4 0.32 0.46 0.62 0.44 1.0 0.48 0.14
0.54 0.59 0.59 0.88 0.79 0.97 0.49 0.72 0.52 0.48 0.67 0.49 0.99 0.89 0.73 0.53 0.58 1.0 1.0 0.71
0.19 0.05 0.08 1.0 0.37 0.18 0.05 0.11 0.01 0.01 0.02 0.05 0.03 0.01 0.02 0.07 0.13 0.56 0.34 0.1
0.26 0.09 0.08 1.0 0.59 0.15 0.05 0.14 0.01 0.01 0.03 0.02 0.05 0.04 0.04 0.14 0.12 0.89 0.35 0.1
0.53 0.05 0.02 0.54 0.76 1.0 0.0 0.31 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.7

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)