Heatmap: Cluster_238 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_01594	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.64	1.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02
Gb_01843	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04	1.0	0.92	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.06
Gb_02227	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.14	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03387	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04688	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.83	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.01
Gb_05798	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06694	0.09	0.0	0.18	0.27	0.0	1.0	0.33	0.06	0.02	0.0	0.0	0.04	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.07	0.09	0.49
Gb_07567	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.0
Gb_07622	0.07	0.04	0.04	0.01	0.01	1.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.18	0.03
Gb_07623	0.11	0.13	0.14	0.13	0.11	1.0	0.68	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.59	0.48
Gb_07991	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_08598	0.24	0.23	0.26	0.07	0.32	0.55	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.32	0.12
Gb_09217	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09219	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09268	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09666	0.14	0.31	0.18	0.1	0.15	0.41	1.0	0.06	0.13	0.11	0.04	0.09	0.08	0.08	0.07	0.16	0.1	0.08	0.0	0.1
Gb_10572	0.26	0.4	0.12	0.22	0.16	1.0	0.43	0.05	0.08	0.06	0.19	0.03	0.11	0.02	0.12	0.04	0.02	0.11	0.13	0.05
Gb_10860	0.08	0.0	0.25	0.0	0.08	1.0	0.31	0.07	0.07	0.13	0.08	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.12
Gb_12539	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.49	1.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.07	0.07
Gb_12589	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.65	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_12606	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.76	1.0	0.07	0.11	0.01	0.15	0.03	0.06	0.02	0.16	0.1	0.04	0.0	0.01	0.07
Gb_12797	0.16	0.1	0.13	0.15	0.08	0.23	1.0	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.03	0.02	0.07	0.08	0.09	0.08	0.07	0.05
Gb_13373	0.1	0.11	0.09	0.01	0.03	1.0	0.36	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01
Gb_13813	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_13888	0.02	0.0	0.04	0.0	0.07	0.65	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0
Gb_14208	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14619	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14781	0.11	0.04	0.0	0.13	0.13	0.28	1.0	0.03	0.03	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.04	0.02	0.02	0.0	0.08	0.02
Gb_15158	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77
Gb_15726	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.21	0.03	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03
Gb_15728	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16811	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0
Gb_17714	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	1.0	0.73	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.12	0.26	0.11
Gb_18861	0.15	0.06	0.05	0.17	0.03	1.0	0.22	0.03	0.08	0.06	0.05	0.04	0.09	0.03	0.05	0.06	0.0	0.15	0.48	0.06
Gb_19006	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0
Gb_19889	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	1.0	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
Gb_19930	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_20051	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.18	0.3	0.0	0.42	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20360	0.05	0.09	0.16	0.15	0.21	0.35	1.0	0.07	0.13	0.25	0.04	0.02	0.1	0.12	0.04	0.1	0.14	0.45	0.06	0.14
Gb_20757	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21150	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21463	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21927	0.08	0.1	0.1	0.04	0.04	0.48	1.0	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03
Gb_23474	0.05	0.03	0.02	0.01	0.0	1.0	0.69	0.05	0.04	0.05	0.07	0.03	0.03	0.02	0.08	0.1	0.06	0.0	0.0	0.01
Gb_24137	0.24	0.02	0.11	0.0	0.0	1.0	0.04	0.01	0.01	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.07	0.32
Gb_24589	0.02	0.01	0.0	0.03	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.02	0.13
Gb_25070	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	1.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01
Gb_26195	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.25	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.16	0.0	0.13	0.09	0.09	0.07
Gb_26766	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.44	0.01	0.0	0.0	0.08	0.01	0.02	0.02	0.09	0.03	0.02	0.01	0.01	0.0
Gb_27237	0.19	0.27	0.13	0.19	0.29	1.0	0.21	0.16	0.11	0.11	0.15	0.08	0.09	0.06	0.18	0.08	0.05	0.1	0.11	0.19
Gb_27641	0.02	0.0	0.01	0.0	0.03	1.0	0.06	0.05	0.03	0.06	0.06	0.15	0.01	0.01	0.08	0.09	0.05	0.08	0.48	0.32
Gb_29078	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30104	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30512	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_31865	0.17	0.23	0.19	0.1	0.07	1.0	0.19	0.09	0.05	0.04	0.05	0.09	0.01	0.01	0.04	0.29	0.08	0.78	0.19	0.61
Gb_31896	0.01	0.0	0.01	0.01	0.03	1.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
Gb_32018	0.02	0.01	0.03	0.06	0.07	1.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.04	0.02	0.0	0.02
Gb_32378	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_34999	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35814	0.08	0.41	0.2	0.1	0.16	1.0	0.4	0.07	0.04	0.04	0.03	0.06	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.03	0.07	0.08
Gb_36304	0.18	0.22	0.19	0.07	0.19	0.62	1.0	0.1	0.08	0.11	0.1	0.12	0.09	0.12	0.11	0.11	0.12	0.17	0.18	0.26
Gb_36773	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37296	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.16
Gb_37831	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	1.0	0.29	0.04	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02
Gb_37912	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38467	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	1.0	0.95	0.07	0.02	0.02	0.11	0.04	0.05	0.04	0.12	0.01	0.01	0.05	0.27	0.09
Gb_38610	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.74	1.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.03	0.0	0.0	0.01	0.11	0.05
Gb_38687	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38780	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.25	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38954	0.07	0.03	0.07	0.14	0.11	0.68	1.0	0.02	0.01	0.04	0.01	0.0	0.0	0.06	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.17
Gb_38955	0.08	0.04	0.04	0.03	0.14	0.53	1.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.02	0.01	0.08	0.03	0.18
Gb_39280	0.13	0.05	0.04	0.09	0.03	0.25	1.0	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.1	0.06	0.02
Gb_39329	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39330	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_40372	0.04	0.0	0.01	0.08	0.01	1.0	0.32	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.0	0.02	0.01	0.02	0.06	0.04
Gb_40692	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41058	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.24	0.0	0.02	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05
Gb_41246	0.0	0.01	0.09	0.01	0.02	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)