Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.27 0.24 0.35 0.24 0.17 0.07 0.06 0.04 0.02 0.01 0.01 0.02 0.04 0.04 0.03 0.02 0.01 0.38 0.29 1.0
0.21 0.14 0.3 0.15 0.16 0.03 0.07 0.03 0.03 0.03 0.05 0.03 0.01 0.01 0.05 0.03 0.02 0.53 0.18 1.0
0.21 0.14 0.3 0.15 0.16 0.03 0.07 0.03 0.03 0.03 0.05 0.03 0.01 0.01 0.05 0.03 0.02 0.53 0.18 1.0
0.27 0.24 0.35 0.24 0.17 0.07 0.06 0.04 0.02 0.01 0.01 0.02 0.04 0.04 0.03 0.02 0.01 0.38 0.29 1.0
0.58 0.0 0.04 0.0 0.09 0.05 0.03 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 1.0 0.45
0.22 0.01 0.01 0.02 0.02 0.29 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0
1.0 0.0 0.19 0.04 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.23 0.97
0.67 0.0 0.1 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.48 0.17 1.0
0.8 0.18 0.32 0.27 0.4 0.37 0.05 0.32 0.2 0.18 0.21 0.15 0.31 0.28 0.24 0.13 0.15 0.8 0.37 1.0
0.14 0.02 0.06 0.03 0.06 0.55 0.06 0.02 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.36 0.09 1.0
0.47 0.06 0.07 0.02 0.04 0.04 0.01 0.12 0.04 0.03 0.07 0.1 0.14 0.09 0.04 0.01 0.02 0.12 0.09 1.0
0.39 0.0 0.13 0.02 0.03 0.12 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.33 1.0
0.53 0.18 0.28 0.37 0.33 0.35 0.15 0.11 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.09 0.08 0.54 0.24 1.0
0.28 0.01 0.1 0.08 0.03 0.05 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.43 0.21 1.0
0.91 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.02 0.03 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.08 0.01 1.0
0.3 0.2 0.26 0.16 0.22 0.04 0.04 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.05 0.04 0.23 0.05 1.0
1.0 0.11 0.27 0.06 0.05 0.07 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.14 0.04 0.84
0.79 0.09 0.2 0.05 0.08 0.11 0.09 0.14 0.09 0.11 0.11 0.09 0.06 0.04 0.08 0.06 0.07 0.6 0.31 1.0
0.67 0.08 0.59 0.41 0.15 0.26 0.03 0.09 0.02 0.03 0.04 0.08 0.02 0.02 0.02 0.0 0.03 0.67 0.28 1.0
0.39 0.03 0.1 0.05 0.07 0.03 0.02 0.09 0.01 0.02 0.01 0.06 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.4 0.12 1.0
0.5 0.04 0.14 0.1 0.09 0.05 0.05 0.28 0.09 0.1 0.06 0.1 0.15 0.25 0.02 0.01 0.03 0.7 0.2 1.0
0.78 0.14 0.63 0.12 0.18 0.08 0.06 0.07 0.05 0.1 0.07 0.11 0.01 0.01 0.13 0.12 0.22 0.39 0.01 1.0
0.48 0.03 0.18 0.07 0.08 0.04 0.03 0.07 0.1 0.12 0.08 0.05 0.03 0.02 0.06 0.07 0.07 0.31 0.16 1.0
0.32 0.0 0.06 0.01 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 0.03 0.01 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.51 0.33 1.0
0.17 0.0 0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.22 1.0
0.38 0.0 0.11 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.38 0.19 1.0
0.49 0.15 0.2 0.16 0.24 0.23 0.2 0.12 0.07 0.07 0.09 0.1 0.08 0.07 0.11 0.06 0.08 0.33 0.21 1.0
0.3 0.04 0.38 0.03 0.06 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.51 0.31 1.0
0.37 0.02 0.17 0.04 0.05 0.05 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.49 0.1 1.0
0.64 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.04 1.0
0.45 0.03 0.08 0.02 0.03 0.07 0.01 0.04 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.03 0.1 0.02 1.0
0.07 0.28 0.09 0.14 0.05 0.0 0.07 0.08 0.05 0.1 0.08 0.01 0.0 0.0 0.07 0.05 0.09 0.37 0.29 1.0
0.99 0.28 0.35 0.22 0.2 0.3 0.2 0.24 0.15 0.15 0.3 0.16 0.15 0.14 0.23 0.09 0.08 0.65 0.21 1.0
0.41 0.05 0.15 0.05 0.21 0.06 0.01 0.15 0.1 0.1 0.03 0.1 0.02 0.04 0.03 0.02 0.06 0.73 0.36 1.0
0.46 0.16 0.08 0.42 0.06 0.07 0.0 0.04 0.0 0.02 0.02 0.04 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.26 1.0
0.71 0.79 0.91 0.19 0.19 0.0 0.07 0.08 0.05 0.03 0.01 0.07 0.08 0.12 0.01 0.02 0.02 0.06 0.0 1.0
0.53 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.14 1.0
0.73 0.26 0.36 0.3 0.29 0.09 0.44 0.16 0.12 0.1 0.15 0.11 0.11 0.11 0.14 0.13 0.18 0.37 0.26 1.0
0.28 0.03 0.11 0.04 0.06 0.07 0.08 0.11 0.03 0.02 0.05 0.04 0.05 0.03 0.03 0.03 0.02 0.43 0.26 1.0
0.63 0.13 0.27 0.3 0.12 0.04 0.05 0.14 0.05 0.05 0.09 0.14 0.04 0.05 0.08 0.03 0.07 0.34 0.11 1.0
0.43 0.11 0.15 0.18 0.25 0.06 0.05 0.12 0.06 0.07 0.05 0.07 0.05 0.04 0.05 0.07 0.09 0.5 0.22 1.0
0.18 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.15 1.0
0.24 0.07 0.15 0.03 0.06 0.09 0.13 0.04 0.04 0.04 0.04 0.07 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.45 0.26 1.0
0.19 0.12 0.22 0.1 0.14 0.04 0.05 0.04 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02 0.05 0.03 0.21 0.14 1.0
0.53 0.07 0.12 0.03 0.16 0.13 0.37 0.06 0.03 0.03 0.03 0.09 0.0 0.01 0.03 0.03 0.06 0.33 0.17 1.0
1.0 0.27 0.48 0.17 0.25 0.21 0.07 0.06 0.04 0.03 0.09 0.1 0.01 0.02 0.07 0.06 0.07 0.08 0.02 0.68
0.94 0.18 0.41 0.26 0.35 0.53 0.14 0.16 0.04 0.05 0.05 0.1 0.02 0.02 0.05 0.08 0.08 0.62 0.21 1.0
0.34 0.34 0.32 0.17 0.19 0.3 0.07 0.13 0.08 0.09 0.04 0.06 0.02 0.05 0.05 0.13 0.06 0.66 0.11 1.0
0.64 0.07 0.19 0.06 0.12 0.1 0.01 0.16 0.14 0.14 0.18 0.17 0.08 0.07 0.17 0.05 0.04 0.26 0.23 1.0
0.31 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 1.0
0.3 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 1.0
0.4 0.12 0.19 0.19 0.22 0.11 0.26 0.08 0.03 0.02 0.05 0.03 0.01 0.01 0.06 0.03 0.03 0.26 0.14 1.0
0.2 0.2 0.19 0.39 0.46 0.19 0.04 0.2 0.16 0.17 0.18 0.14 0.13 0.13 0.17 0.13 0.15 0.62 0.19 1.0
0.95 0.14 0.36 0.24 0.21 0.14 0.04 0.15 0.14 0.17 0.1 0.09 0.08 0.07 0.11 0.07 0.07 0.92 0.33 1.0
0.27 0.05 0.13 0.09 0.07 0.24 0.04 0.09 0.03 0.04 0.05 0.11 0.05 0.04 0.04 0.02 0.04 0.11 0.21 1.0
0.41 0.1 0.12 0.03 0.04 0.21 0.01 0.22 0.04 0.03 0.22 0.12 0.16 0.11 0.1 0.04 0.02 0.21 0.15 1.0
0.45 0.65 0.5 0.44 0.29 0.72 0.27 0.39 0.22 0.24 0.24 0.32 0.09 0.07 0.19 0.15 0.2 0.54 1.0 0.93
0.35 0.02 0.08 0.04 0.03 0.04 0.03 0.08 0.05 0.05 0.07 0.06 0.04 0.04 0.06 0.03 0.03 0.23 0.13 1.0
1.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.76 0.44 0.47
1.0 0.0 0.06 0.01 0.03 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.85 0.46 0.55
1.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.13 0.11 0.09 0.14 0.01 0.01 0.02 0.09 0.06 0.76 0.42 0.83
0.66 0.07 0.25 0.21 0.14 0.21 0.05 0.11 0.06 0.07 0.04 0.1 0.02 0.02 0.04 0.08 0.1 0.38 0.13 1.0
0.21 0.09 0.08 0.08 0.13 0.03 0.08 0.05 0.08 0.08 0.24 0.03 0.04 0.02 0.27 0.02 0.02 0.42 0.42 1.0
0.43 0.03 0.13 0.01 0.01 0.04 0.02 0.11 0.07 0.09 0.09 0.13 0.14 0.14 0.05 0.0 0.0 0.35 0.34 1.0
0.28 0.09 0.11 0.1 0.12 0.07 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.08 0.09 1.0
0.95 0.3 0.45 0.26 0.19 0.09 0.02 0.05 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.04 0.31 0.07 1.0
0.06 0.06 0.03 0.03 0.06 0.19 0.29 0.05 0.03 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.2 0.25 1.0
0.45 0.0 0.08 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 1.0
0.49 0.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.09 1.0
0.52 0.0 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 1.0
0.48 0.14 0.23 0.12 0.15 0.22 0.21 0.09 0.05 0.05 0.09 0.06 0.04 0.05 0.1 0.04 0.07 0.18 0.24 1.0
0.47 0.05 0.13 0.17 0.23 0.08 0.02 0.11 0.05 0.06 0.01 0.09 0.03 0.02 0.02 0.03 0.09 0.52 0.18 1.0
0.4 0.02 0.09 0.08 0.18 0.12 0.03 0.08 0.03 0.04 0.02 0.06 0.03 0.02 0.02 0.02 0.05 0.47 0.36 1.0
0.61 0.03 0.47 0.06 0.11 0.34 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.58 0.01 1.0
0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.31 0.06 0.06 0.02 0.03 0.03 0.04 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.16 0.13 1.0
0.64 0.17 0.19 0.26 0.3 0.19 0.06 0.27 0.27 0.22 0.3 0.17 0.21 0.19 0.31 0.39 0.29 0.61 0.34 1.0
0.49 0.08 0.23 0.14 0.25 0.11 0.16 0.21 0.18 0.15 0.13 0.15 0.19 0.14 0.12 0.09 0.09 0.46 0.29 1.0
0.39 0.05 0.15 0.06 0.06 0.2 0.09 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.26 0.04 1.0
0.23 0.17 0.12 0.06 0.09 0.08 0.06 0.05 0.06 0.06 0.07 0.05 0.03 0.03 0.09 0.05 0.03 0.29 0.16 1.0
0.34 0.19 0.28 0.08 0.12 0.08 0.12 0.06 0.03 0.03 0.04 0.04 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.38 0.16 1.0
1.0 0.0 0.07 0.01 0.08 0.05 0.03 0.07 0.04 0.04 0.06 0.06 0.04 0.07 0.05 0.05 0.06 0.63 0.15 0.1
0.23 0.08 0.11 0.07 0.15 0.06 0.07 0.11 0.09 0.11 0.25 0.09 0.07 0.05 0.24 0.05 0.1 0.34 0.2 1.0
0.85 0.33 0.38 0.35 0.34 0.28 0.21 0.25 0.1 0.03 0.09 0.18 0.31 0.14 0.16 0.21 0.11 0.71 1.0 0.71
0.47 0.1 0.17 0.05 0.08 0.06 0.01 0.16 0.07 0.09 0.13 0.08 0.17 0.12 0.08 0.02 0.03 0.4 0.12 1.0
0.28 0.0 0.05 0.04 0.04 0.0 0.04 0.07 0.03 0.08 0.1 0.05 0.04 0.03 0.06 0.06 0.09 0.44 0.2 1.0
0.05 0.0 0.02 0.06 0.05 0.13 0.01 0.22 0.14 0.17 0.25 0.14 0.18 0.12 0.19 0.04 0.17 0.11 0.22 1.0
0.85 0.16 0.31 0.24 0.26 0.01 0.07 0.05 0.1 0.08 0.0 0.04 0.0 0.01 0.02 0.18 0.15 0.63 0.21 1.0
0.57 0.34 0.42 0.29 0.37 0.28 0.05 0.24 0.18 0.17 0.12 0.12 0.12 0.11 0.12 0.3 0.31 0.64 0.31 1.0
0.73 0.01 0.19 0.06 0.06 0.01 0.19 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.36 0.25 1.0
0.71 0.1 0.17 0.07 0.1 0.23 0.06 0.25 0.32 0.27 0.24 0.24 0.15 0.13 0.15 0.29 0.39 0.38 0.28 1.0
1.0 0.16 0.22 0.23 0.27 0.07 0.06 0.14 0.12 0.12 0.09 0.09 0.09 0.07 0.09 0.09 0.08 0.56 0.05 0.93
1.0 0.02 0.08 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.11 0.61
0.29 0.06 0.16 0.04 0.06 0.05 0.02 0.08 0.07 0.09 0.06 0.08 0.04 0.04 0.03 0.02 0.03 0.28 0.24 1.0
0.69 0.29 0.28 0.48 0.31 0.16 0.22 0.22 0.09 0.12 0.13 0.12 0.09 0.08 0.14 0.08 0.09 0.68 0.35 1.0
0.51 0.13 0.2 0.23 0.12 0.05 0.16 0.12 0.05 0.07 0.09 0.08 0.07 0.05 0.09 0.07 0.08 0.24 0.15 1.0
0.2 0.3 0.29 0.17 0.15 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.11 0.24 1.0
0.28 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 1.0
0.36 0.02 0.07 0.07 0.06 0.04 0.08 0.19 0.08 0.06 0.1 0.09 0.06 0.03 0.07 0.03 0.07 0.92 0.38 1.0
1.0 0.27 0.41 0.26 0.17 0.2 0.08 0.08 0.06 0.08 0.1 0.22 0.06 0.09 0.07 0.01 0.05 0.07 0.01 0.94
0.27 0.18 0.17 0.23 0.26 0.12 0.14 0.15 0.06 0.08 0.14 0.06 0.09 0.07 0.13 0.08 0.07 0.48 0.4 1.0
0.31 0.1 0.33 0.11 0.13 0.02 0.06 0.05 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.22 0.1 1.0
0.3 0.01 0.03 0.02 0.01 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.11 1.0
0.04 0.0 0.01 0.01 0.01 0.08 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.03 1.0
0.9 0.13 0.28 0.1 0.14 0.11 0.02 0.17 0.06 0.06 0.05 0.1 0.06 0.02 0.04 0.01 0.02 0.21 0.14 1.0
0.71 0.08 0.16 0.06 0.09 0.06 0.02 0.16 0.06 0.06 0.06 0.13 0.1 0.06 0.04 0.02 0.03 0.13 0.09 1.0
0.56 0.22 0.41 0.27 0.24 0.46 0.24 0.1 0.1 0.12 0.14 0.08 0.04 0.03 0.16 0.11 0.11 0.56 0.55 1.0
0.09 0.0 0.02 0.04 0.01 0.13 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.12 0.06 1.0
1.0 0.24 0.38 0.24 0.22 0.09 0.05 0.18 0.1 0.08 0.14 0.08 0.07 0.05 0.12 0.12 0.13 0.38 0.32 0.98
0.53 0.0 0.05 0.13 0.12 0.02 0.03 0.11 0.04 0.05 0.09 0.03 0.15 0.12 0.09 0.01 0.01 0.32 0.01 1.0
0.77 0.28 0.4 0.23 0.15 0.14 0.05 0.14 0.12 0.11 0.09 0.11 0.06 0.05 0.07 0.06 0.1 0.63 0.35 1.0
0.32 0.12 0.27 0.24 0.2 0.04 0.12 0.05 0.03 0.03 0.03 0.04 0.02 0.02 0.03 0.05 0.06 0.21 0.14 1.0
0.17 0.02 0.03 0.09 0.13 0.02 0.0 0.04 0.04 0.05 0.04 0.03 0.05 0.08 0.04 0.03 0.02 0.31 0.4 1.0
0.91 0.03 0.14 0.06 0.11 0.05 0.02 0.16 0.07 0.06 0.07 0.09 0.05 0.05 0.05 0.03 0.03 0.48 0.17 1.0
1.0 0.09 0.27 0.08 0.12 0.08 0.03 0.17 0.08 0.07 0.06 0.08 0.01 0.01 0.04 0.02 0.02 0.53 0.34 0.84
0.43 0.07 0.24 0.06 0.07 0.02 0.27 0.05 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.81 0.05 1.0
0.11 0.0 0.01 0.01 0.04 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.06 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.58 0.93 1.0
0.33 0.22 0.29 0.19 0.12 0.08 0.06 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.86 0.22 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)