Heatmap: Cluster_154 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00202	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.06	1.0	0.26	0.0	0.0	0.4	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0
Gb_00791	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00885	0.09	0.82	0.0	0.0	0.39	0.0	1.0	0.3	0.71	0.64	0.18	0.05	0.36	0.0	0.47	0.0	0.0	0.18	0.31	0.0
Gb_01072	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01418	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01445	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.05	0.19	0.67	0.58	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01651	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01793	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01921	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02588	0.24	0.0	0.94	0.0	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02699	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_03131	0.47	0.17	0.4	0.25	0.91	0.23	0.42	0.46	0.65	0.37	0.59	0.26	0.28	0.46	0.31	0.31	0.57	1.0	0.44	0.76
Gb_03705	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.27	0.1	0.26	0.14	0.27	0.13	0.22	0.38	0.18	0.0	0.43	0.0	1.0
Gb_04508	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04553	0.0	0.0	0.0	0.0	0.93	1.0	0.57	0.16	0.0	0.0	0.81	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04766	1.0	0.0	0.14	0.43	0.98	0.15	0.31	0.22	0.5	0.15	0.0	0.07	0.12	0.09	0.23	0.42	0.28	0.35	0.46	0.23
Gb_04996	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06122	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_07445	0.31	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.38	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0
Gb_08035	0.34	0.64	0.61	1.0	0.76	0.27	0.0	0.22	0.34	0.23	0.08	0.03	0.19	0.28	0.2	0.22	0.05	0.3	0.0	0.18
Gb_08248	0.04	1.0	0.09	0.0	0.28	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.4	0.0
Gb_08257	0.04	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.09	0.1	0.11	0.13	0.04	0.02	0.07	0.0	0.03	1.0	0.15	0.0	0.27	0.07
Gb_08313	0.18	0.0	0.0	0.6	1.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.17	0.0	0.0
Gb_08331	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08716	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.09	0.03	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08839	0.31	0.55	0.2	1.0	0.07	0.0	0.18	0.29	0.54	0.28	0.41	0.2	0.02	0.09	0.38	0.3	0.35	0.51	0.36	0.35
Gb_08942	0.45	0.68	0.8	0.62	0.66	0.79	0.89	0.68	0.56	0.83	0.62	0.46	0.69	0.73	0.61	0.64	0.46	0.66	0.33	1.0
Gb_09007	0.12	0.0	0.5	0.0	1.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.19	0.44	0.0	0.0	0.76	0.49	0.0
Gb_09020	0.23	0.0	0.58	0.0	0.46	0.0	0.2	0.19	0.07	0.19	0.33	0.15	0.09	0.08	0.29	0.0	0.0	1.0	0.19	0.0
Gb_09021	0.46	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.34	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.33	0.0
Gb_09066	0.07	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.15	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.37
Gb_09082	0.12	0.52	0.33	0.17	0.42	0.0	0.15	0.19	0.06	0.09	0.05	0.1	0.05	0.13	0.14	0.0	0.08	1.0	0.09	0.08
Gb_09308	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	1.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.39
Gb_10545	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.04	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.11	0.26	1.0	0.67	0.27	0.63	0.0
Gb_12206	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.21	0.13	0.1	0.38	0.32	0.0	0.13	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0
Gb_14210	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14229	0.1	0.0	0.64	0.06	0.0	0.0	0.39	0.09	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.15	0.23	0.0
Gb_15388	0.12	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.2	0.07	0.0	0.03	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.63	0.12	0.0
Gb_15720	0.0	0.0	1.0	0.0	0.81	0.0	0.76	0.32	0.24	0.46	0.48	0.2	0.0	0.09	0.22	0.0	0.0	0.45	0.2	0.24
Gb_16035	0.0	0.63	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.19	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16086	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.02	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.34	0.0
Gb_16879	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18204	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.34	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19536	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.07	0.21	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0
Gb_19787	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19960	0.2	0.88	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	1.0	0.67	0.38	0.0	0.83	0.73	0.74	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0
Gb_20923	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20969	0.16	0.2	0.23	0.0	0.23	0.17	0.08	0.46	0.43	0.28	0.39	0.38	0.91	1.0	0.53	0.06	0.05	0.24	0.35	0.61
Gb_21029	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0
Gb_21303	0.0	0.0	0.0	1.0	0.61	0.0	0.0	0.01	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0
Gb_21488	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22253	0.38	1.0	0.24	0.0	0.96	0.0	0.14	0.11	0.0	0.28	0.0	0.0	0.36	0.84	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.17
Gb_22289	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22303	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22786	0.04	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.2	0.1	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0
Gb_24343	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.28	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0
Gb_25460	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26335	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0	0.0	0.05	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27704	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.53	1.0	0.37	0.0	0.0	0.09	0.47	0.0	0.69	0.0	0.0	0.6	0.6
Gb_28237	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28683	0.0	1.0	0.07	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30833	0.0	1.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31869	0.06	0.13	0.37	0.39	0.81	0.48	0.26	0.69	0.41	0.24	0.57	0.49	0.46	0.72	0.69	0.17	0.26	0.57	0.3	1.0
Gb_32305	0.11	0.0	0.0	0.0	0.8	0.18	0.65	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.16	0.0
Gb_33472	0.41	0.0	0.4	0.0	0.84	0.23	0.61	0.47	0.75	0.35	0.57	0.21	0.42	0.07	0.18	0.0	1.0	0.53	0.76	0.17
Gb_34134	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0
Gb_34453	0.1	0.41	0.0	0.6	0.0	0.0	0.58	0.42	0.74	0.42	0.36	0.2	0.36	0.14	1.0	0.0	0.0	0.66	0.46	0.85
Gb_34892	0.18	0.0	0.0	0.0	1.0	0.28	0.0	0.06	0.11	0.07	0.0	0.01	0.0	0.12	0.0	0.05	0.0	0.28	0.0	0.21
Gb_35943	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35974	0.19	0.0	0.23	1.0	0.11	0.0	0.0	0.14	0.09	0.06	0.12	0.03	0.16	0.2	0.0	0.19	0.11	0.0	0.07	0.19
Gb_36073	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_36950	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.32	0.44	0.15	0.0	0.02	0.0	0.32	0.0	0.0	0.87	0.0	0.0	0.0
Gb_38468	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39141	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.69	0.17	0.65	0.0	1.0	0.0	0.41	0.0	0.96	0.85	0.0	0.0	0.92	0.43
Gb_39161	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.04	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.07	0.0
Gb_39320	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_40463	0.35	0.69	0.27	0.6	0.71	0.73	0.52	0.52	1.0	0.67	0.71	0.56	0.2	0.24	0.55	0.4	0.53	0.45	0.69	0.32
Gb_40795	0.0	1.0	0.0	0.0	0.71	0.38	0.01	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85
Gb_41035	0.76	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.34	0.0	0.0	0.2	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	1.0
Gb_41345	0.26	0.0	0.19	0.57	0.57	0.0	0.55	0.23	1.0	0.61	0.33	0.19	0.21	0.0	0.64	0.22	0.0	0.16	0.19	0.29
Gb_41349	0.4	0.18	0.51	0.19	0.38	0.0	0.03	0.09	0.18	0.45	1.0	0.03	0.0	0.0	0.25	0.0	0.18	0.0	0.12	0.13
Gb_41822	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)