1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_251 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
2.23 4.6 0.07 0.6 0.21 0.46 0.35 0.09 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.73 0.06 0.0 0.0 0.02 0.11 1.91 0.0 0.0 0.06 0.15 0.76 0.02 0.0 0.03 0.17 1.73 6.82 0.13 0.2 0.05 0.04 0.0 1.0 0.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.07 52.13 0.38 0.17 0.1 0.19 0.44 0.06 0.07 0.13 0.11 0.32 0.19 23.6 36.46 5.11 11.17 1.72 9.04 26.75 64.01 0.49 0.35 1.25 5.71 0.71 86.59 0.05 5.65 0.05 52.23 0.31 0.58 0.62 0.16 0.35 0.27 1.44 0.83 0.0 0.0 0.31 0.02 0.12 0.9 0.0 0.0 0.36
12.34 1098.53 1.48 0.0 0.62 1.08 1.56 0.0 0.0 1.43 0.25 1.59 0.0 9.38 47.75 0.48 452.14 56.69 4.04 564.85 346.41 0.7 0.0 0.66 0.13 0.61 0.0 0.0 0.3 0.0 694.42 0.07 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.2 0.0 0.13 3.11 0.0 3.05 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.6 15.93 0.31 0.21 0.29 0.05 0.23 0.0 0.08 0.01 0.0 0.08 0.0 2.77 1.44 0.01 0.0 0.21 0.26 6.09 8.05 0.02 0.03 2.63 0.0 0.45 0.0 0.16 0.02 0.01 35.15 0.03 0.02 0.14 0.02 0.0 0.03 0.18 0.0 0.0 0.0 0.48 0.03 0.05 2.48 0.0 0.0 0.06
4.24 16.64 0.27 0.94 0.51 0.0 2.43 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 14.95 0.0 0.0 0.0 2.94 8.28 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.07 0.0 0.0 21.23 0.0 21.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT1G66950 (PDR11)
 0.29 7.37 0.34 2.76 0.42 0.17 1.66 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.37 0.69 0.0 0.0 0.04 0.0 3.31 4.52 0.38 0.14 0.06 0.0 0.03 0.0 0.66 0.01 0.0 6.86 0.34 0.1 0.0 0.01 0.16 0.0 0.15 0.0 0.06 0.1 0.01 0.0 0.01 2.3 0.0 0.02 0.0
6.5 31.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.15 0.01 1.53 1.09 0.02 0.1 0.0 0.01 7.52 0.06 0.07 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 36.24 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 648.87 2.78 0.04 0.12 0.1 1.18 0.03 0.0 2.25 0.2 0.0 0.39 0.18 250.67 0.27 0.49 0.47 0.5 498.52 286.2 0.76 0.0 0.37 0.03 0.55 0.17 0.0 0.03 0.03 332.45 0.11 0.0 3.75 0.15 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
2.55 22.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.65 0.0 0.0 0.03 0.0 1.21 0.05 0.0 0.05 7.29 0.05 2.45 0.0 0.0 3.6 0.03 5.17 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.03
1.92 15.64 6.53 43.87 3.79 1.57 18.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.15 2.43 0.0 0.0 0.0 0.0 2.17 0.0 0.0 0.0 2.66 0.0 0.65 0.0 0.0 21.51 0.0 16.68 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.24 0.0 0.0 0.0 0.01 0.22 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.2 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT2G19020 (RALFL10)
 9.8 14.58 0.0 2.12 1.0 4.0 4.97 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 2.04 0.49 7.58 0.0 0.0 0.0 0.25 6.29 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 17.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.04 189.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.37 8.36 20.2 0.0 0.0 0.0 0.0 10.46 0.0 0.0 0.0 0.77 1.45 0.0 0.0 0.0 58.37 0.0 45.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
15.3 21.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.16 5.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.13 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT2G34870 (MEE26)
 22.9 1306.93 1.11 0.0 0.32 0.59 0.42 0.0 0.0 0.05 0.0 0.17 0.0 6.61 72.02 2.85 2770.66 2789.81 22.96 570.23 190.61 0.37 0.0 65.99 2.65 27.37 0.0 473.03 19.39 0.47 455.31 0.15 0.0 0.07 0.67 0.0 0.35 167.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0
0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.01 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.77 69.27 0.2 0.07 0.38 0.09 0.14 0.03 0.09 0.04 0.05 0.51 0.03 40.8 42.46 15.51 23.6 21.3 4.92 70.03 142.67 21.35 30.55 13.55 3.32 11.22 10.33 26.15 26.06 1.46 47.65 14.34 9.84 9.5 25.9 30.31 15.2 25.22 5.67 2.49 0.21 7.54 30.81 24.03 18.47 25.73 13.05 19.38
6.58 17.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.05 0.24 1.64 0.0 0.0 0.0 0.06 5.44 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 19.9 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 68.23 0.3 0.04 0.0 0.01 0.41 0.0 0.0 0.15 0.11 0.0 0.01 0.2 45.71 0.07 0.04 0.1 0.09 81.06 306.52 0.13 0.01 1.91 0.04 0.59 0.22 0.2 147.31 0.01 45.7 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.56 33.14 0.07 0.04 0.07 0.0 0.12 0.06 0.32 0.02 0.05 0.0 0.0 1.99 5.2 3.05 0.3 0.04 0.01 8.28 0.42 0.01 0.0 0.83 0.01 1.38 0.0 0.01 0.01 0.0 9.07 0.01 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0
0.9 27.52 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.43 0.03 2.66 29.77 5.45 10.27 6.99 0.32 21.1 25.74 7.88 6.32 7.12 0.0 4.58 0.0 0.0 0.49 0.02 17.5 4.11 2.44 1.7 3.95 37.24 0.65 6.91 0.72 0.0 0.0 3.89 1.42 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0
0.04 7.47 0.0 0.0 0.0 0.16 0.28 0.0 0.46 0.0 0.28 0.0 0.0 0.24 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.0 0.06 0.0 0.15 0.0 7.5 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 5.79 0.0 0.17 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.75 0.0 0.0 0.0 0.11 0.94 0.0 0.0 0.0 1.71 0.13 0.26 0.16 0.19 13.17 0.15 7.21 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.16 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT3G60160 (MRP9)
 2.28 40.42 0.64 0.24 0.14 0.03 0.27 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 15.72 31.19 11.91 2.1 0.83 7.11 35.59 21.58 0.47 0.16 15.99 2.3 18.66 21.37 0.64 27.31 1.53 29.51 0.08 1.16 0.42 0.62 0.03 1.96 0.5 1.69 0.04 0.0 0.11 0.19 0.01 2.04 0.0 0.0 0.02
AT3G60970 (MRP15)
 2.25 8.27 0.22 0.01 0.45 0.24 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 1.23 7.01 0.62 1.33 0.32 0.53 6.41 5.36 0.01 0.01 0.61 0.16 0.72 3.19 0.0 0.37 2.58 1.69 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.07 0.05 0.0 0.03 0.0 0.07 0.01 0.09 0.0 0.0 0.01
AT3G62340 (WRKY68)
 3.59 9.27 0.98 0.29 3.35 5.05 0.2 0.72 0.25 0.13 0.0 1.79 0.6 0.82 0.53 0.0 0.0 0.0 0.29 4.09 0.0 0.02 0.0 1.17 0.0 0.27 0.0 0.03 13.37 0.0 12.24 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.0
0.13 3.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.27 4.1 0.16 0.57 0.91 0.0 1.82 0.07 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 1.42 0.0 0.0 0.0 0.17 1.76 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.07 0.0 0.0 0.19 0.0 7.96 0.0 0.08 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
8.3 18.26 2.09 1.49 2.31 1.29 1.58 0.11 0.0 0.06 0.0 0.19 0.0 1.46 9.71 2.4 1.04 0.38 2.37 13.86 6.39 0.57 0.17 0.48 0.2 0.35 2.49 1.69 1.22 0.13 14.19 1.3 0.85 0.47 0.15 0.34 3.35 0.34 3.01 3.46 0.48 1.47 1.23 0.65 0.2 11.36 0.3 0.49
0.0 1.6 0.0 0.05 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 1.12 0.0 0.0 0.0 0.03 0.27 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.09 0.0 0.0 4.12 0.0 0.79 0.0 0.01 0.01 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 1.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT5G09730 (BX3)
 8.07 220.75 0.45 0.28 0.28 0.31 0.32 0.02 0.0 0.03 0.03 0.01 0.01 25.33 101.25 2.76 19.64 5.23 1.5 163.08 45.66 0.07 0.03 35.37 0.02 5.05 0.04 0.04 315.47 0.01 315.11 0.14 0.3 0.18 0.29 0.07 0.02 0.11 0.77 0.0 0.0 0.08 0.02 0.15 0.13 0.0 0.0 0.01
1.52 5.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 1.13 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 5.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 2.48 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT5G23960 (TPS21)
 0.03 54.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 2.55 75.43 0.2 0.06 0.09 0.04 87.04 32.3 1.23 0.0 0.32 0.02 0.29 0.61 0.0 0.01 0.0 4.16 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.8 14.85 5.53 8.35 2.46 0.31 6.39 0.38 0.17 0.05 0.08 0.6 0.11 2.41 13.45 0.75 2.68 2.74 2.46 16.87 60.53 2.84 4.8 1.5 0.86 1.2 0.67 2.9 21.82 1.8 10.24 1.07 0.69 1.82 0.67 0.75 0.2 0.92 0.94 0.01 0.13 0.04 0.18 0.23 0.12 0.0 0.0 0.04
5.27 13.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.23 0.0 0.0 0.0 0.11 3.76 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.03 12.38 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 2.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.86 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 3.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.57 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 4.67 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.33 11.2 1.61 2.84 6.82 14.24 7.12 0.92 1.76 0.28 0.19 0.0 0.0 3.05 4.67 0.13 0.72 3.28 0.51 11.9 22.23 0.08 0.44 1.35 0.47 1.06 4.35 0.03 5.42 0.03 9.95 0.02 0.67 0.08 4.56 6.4 12.02 3.22 0.28 0.16 0.0 0.24 0.23 0.08 0.33 0.0 0.02 0.24

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)