Heatmap: Cluster_114 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.32 0.05 0.02 0.0 0.17 0.96 0.0 0.31 0.26 0.37 0.24 0.15 0.13 0.12 0.16 0.27 0.57 0.55 1.03 0.52
0.07 0.14 0.09 0.03 0.06 0.08 0.0 0.07 0.03 0.1 0.14 0.03 0.03 0.08 0.13 0.06 0.04 0.27 0.23 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.01 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.12 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02
0.03 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.02 0.03 0.1 0.01 0.0 0.03 0.01
8.55 10.22 7.15 16.21 29.0 223.35 16.82 75.98 116.23 114.27 18.64 67.93 41.5 451.79 16.79 34.27 163.65 10.34 130.27 10.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 4.37 1.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 4.37 1.12
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.1 0.07 0.17 0.0 0.0 0.02 0.2 0.26 0.0 0.0 0.11 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.18 0.0 1.21 0.35 1.35 0.35 0.11 0.86 0.3 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.3 0.02
0.0 0.0 5.56 0.0 0.0 0.0 0.0 1.36 0.75 1.58 0.0 0.0 1.24 1.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.15 0.25 0.0 0.0 0.05 0.34 0.91 1.13 0.0 0.05 0.11
0.03 0.1 0.05 0.22 0.43 0.76 0.72 0.89 0.44 0.59 0.24 0.36 0.26 0.15 0.33 0.8 1.64 0.78 0.15 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.6 6.96 4.76 4.95 7.1 8.46 7.71 12.7 7.77 7.56 7.44 4.7 15.1 28.75 7.01 3.26 3.52 12.73 5.96 4.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.84 0.0
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.27 0.0 0.21 0.0 0.21 2.55 0.74 0.22 0.06 0.05 0.26 0.12 0.12 0.09 0.44 0.4 0.15 0.56 1.4 1.61
1.93 0.54 0.42 11.29 5.76 12.2 1.65 1.21 0.27 0.28 0.59 0.71 0.17 0.24 1.14 1.65 2.34 2.38 6.62 7.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 1.32 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.08 0.0 0.09 0.28 0.0 0.1 0.05 0.12 0.11 0.05 0.0 0.06 0.17 0.16 0.93 0.69 0.09 0.02 1.23 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.29 0.07 0.13 0.25 0.07 0.02 0.29 0.28 0.33 0.29 0.19 0.42 1.38 0.18 0.12 0.17 0.47 0.49 0.02
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.35 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.28 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.52 0.21 0.0 1.12 0.13 0.07 0.3 0.48 0.45 1.12 0.16 0.29 0.13 0.75 0.0 0.0 0.42 1.04 0.3
0.04 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.12 0.61 0.0 0.0 2.22 5.09 0.0 5.55 2.21 5.42 8.66 8.91 10.62 3.77 12.28 0.71 1.72 0.9 0.2 0.86
0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.33 0.61
0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 1.07 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.48 1.7 4.49
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.13 0.03 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.33 0.02 0.11 0.01 0.02 0.15 0.06 0.0 0.0 0.13 0.0 0.03 0.67
0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.3 1.93 0.03
0.28 0.0 0.39 0.89 1.07 1.75 1.16 1.4 0.98 0.94 1.95 0.34 0.53 0.8 1.62 0.71 0.46 1.3 0.2 0.23

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)