Heatmap: Cluster_93 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00237	0.2	0.24	0.25	0.28	0.17	0.04	0.96	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.05	0.2	1.0
Gb_00270	0.16	0.07	0.1	0.04	0.07	0.04	0.09	0.07	0.07	0.09	0.24	0.04	0.05	0.04	0.23	0.07	0.07	0.04	0.05	1.0
Gb_00778	0.69	0.33	0.34	0.4	0.39	0.25	0.29	0.28	0.24	0.24	0.34	0.17	0.27	0.21	0.35	0.21	0.18	0.33	0.41	1.0
Gb_00818	0.57	0.21	0.38	0.55	0.45	0.35	0.36	0.38	0.25	0.24	0.43	0.24	0.16	0.14	0.41	0.31	0.37	0.42	0.71	1.0
Gb_01803	0.17	0.11	0.28	0.18	0.14	0.16	0.71	0.15	0.05	0.07	0.27	0.36	0.18	0.22	0.18	0.05	0.03	0.06	0.12	1.0
Gb_01950	0.39	0.24	0.3	0.35	0.4	0.33	0.34	0.27	0.16	0.15	0.26	0.18	0.2	0.19	0.28	0.14	0.18	0.39	0.47	1.0
Gb_01959	0.2	0.09	0.11	0.07	0.12	0.09	0.29	0.07	0.05	0.06	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.03	0.03	0.24	0.08	1.0
Gb_02222	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	1.0
Gb_02369	0.13	0.07	0.12	0.12	0.08	0.15	0.32	0.07	0.03	0.04	0.1	0.04	0.06	0.05	0.09	0.01	0.06	0.25	0.16	1.0
Gb_02663	0.07	0.04	0.04	0.0	0.02	0.0	1.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.1	0.01	0.0	0.0	0.01	0.04	0.09	0.1	0.5
Gb_02693	0.61	1.0	0.42	0.28	0.58	0.11	0.76	0.19	0.04	0.05	0.09	0.21	0.09	0.11	0.08	0.2	0.2	0.51	0.2	0.57
Gb_02825	0.18	0.19	0.17	0.19	0.2	0.15	0.38	0.24	0.16	0.17	0.31	0.15	0.16	0.09	0.26	0.09	0.13	0.11	0.3	1.0
Gb_03180	0.46	0.35	0.28	0.28	0.39	0.19	0.63	0.31	0.26	0.24	0.39	0.3	0.39	0.36	0.44	0.17	0.18	0.37	0.47	1.0
Gb_03313	0.57	0.15	0.43	0.37	0.35	0.14	0.21	0.14	0.1	0.08	0.11	0.07	0.11	0.1	0.1	0.1	0.09	0.16	0.13	1.0
Gb_03346	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.35	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.17	0.0	1.0
Gb_03362	0.32	0.19	0.12	0.08	0.06	0.13	0.56	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.21	0.11	1.0
Gb_03700	0.16	0.22	0.01	0.05	0.06	0.0	0.36	0.04	0.08	0.11	0.12	0.02	0.03	0.02	0.1	0.04	0.06	0.22	0.29	1.0
Gb_03701	0.08	0.18	0.03	0.0	0.01	0.0	0.18	0.02	0.03	0.04	0.05	0.0	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.23	0.13	1.0
Gb_04106	0.32	0.2	0.21	0.23	0.35	0.13	0.17	0.29	0.3	0.31	0.43	0.19	0.31	0.25	0.45	0.29	0.29	0.24	0.26	1.0
Gb_04217	0.32	0.52	0.73	0.3	0.53	0.16	0.96	0.15	0.1	0.12	0.08	0.21	0.03	0.06	0.08	0.15	0.21	0.18	0.27	1.0
Gb_04640	0.27	0.11	0.29	0.32	0.35	0.09	0.95	0.05	0.04	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.06	0.07	0.01	0.03	1.0
Gb_04705	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.27	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.15	0.27	1.0
Gb_04840	0.46	0.67	1.0	0.31	0.42	0.18	0.36	0.15	0.11	0.09	0.2	0.07	0.02	0.04	0.17	0.21	0.21	0.47	0.22	0.55
Gb_05135	0.08	0.6	0.34	0.19	0.28	0.01	0.69	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	1.0
Gb_05281	0.31	0.19	0.2	0.11	0.11	0.43	1.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.0	0.03	0.29	0.02	0.95
Gb_05689	0.14	0.19	0.22	0.15	0.12	0.4	0.4	0.08	0.06	0.06	0.06	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.08	0.12	0.2	1.0
Gb_06084	0.04	0.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.95	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.04	0.0	1.0
Gb_06143	0.57	0.48	0.6	0.44	0.56	0.35	0.53	0.36	0.28	0.35	0.41	0.28	0.25	0.26	0.38	0.22	0.44	0.54	0.39	1.0
Gb_06651	0.5	0.45	0.21	0.28	0.34	0.35	0.21	0.17	0.15	0.13	0.16	0.11	0.19	0.13	0.16	0.16	0.13	0.3	0.31	1.0
Gb_07026	0.24	0.35	0.31	0.23	0.33	0.21	0.5	0.17	0.13	0.15	0.21	0.11	0.14	0.12	0.22	0.15	0.17	0.31	0.25	1.0
Gb_07235	0.17	0.02	0.11	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.23	0.15	1.0
Gb_07876	0.22	0.26	0.24	0.13	0.22	0.1	0.43	0.2	0.2	0.18	0.22	0.14	0.11	0.11	0.18	0.16	0.24	0.2	0.71	1.0
Gb_07968	0.58	0.15	0.28	0.38	0.22	0.28	0.41	0.19	0.11	0.11	0.21	0.14	0.25	0.22	0.18	0.16	0.18	0.27	0.21	1.0
Gb_07969	1.0	0.47	0.73	0.58	0.5	0.67	0.82	0.33	0.24	0.18	0.19	0.25	0.3	0.28	0.26	0.26	0.28	0.57	0.4	0.76
Gb_08198	0.21	0.27	0.24	0.39	0.44	0.31	0.88	0.22	0.09	0.08	0.31	0.15	0.11	0.24	0.25	0.09	0.03	0.44	1.0	0.61
Gb_09131	0.65	0.72	0.4	0.54	0.66	0.37	0.44	0.42	0.26	0.27	0.38	0.27	0.09	0.08	0.5	0.31	0.26	0.29	1.0	0.79
Gb_09133	0.56	0.44	0.32	0.5	0.68	0.37	0.58	0.34	0.25	0.28	0.44	0.25	0.15	0.1	0.39	0.39	0.28	0.35	0.71	1.0
Gb_09234	0.2	0.5	0.33	0.08	0.38	0.35	0.69	0.13	0.09	0.09	0.13	0.05	0.07	0.06	0.11	0.05	0.06	0.15	0.34	1.0
Gb_09244	0.24	0.8	0.45	0.27	0.4	0.56	0.8	0.2	0.11	0.11	0.19	0.09	0.1	0.09	0.2	0.06	0.08	0.18	0.72	1.0
Gb_09676	0.57	0.1	0.09	0.49	0.23	0.04	0.6	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.03	0.06	0.05	0.03	0.12	0.12	1.0
Gb_09825	0.16	0.33	0.08	0.11	0.14	0.25	0.29	0.15	0.13	0.13	0.12	0.08	0.18	0.14	0.13	0.05	0.04	0.12	0.17	1.0
Gb_09902	0.26	0.26	0.28	0.2	0.18	0.32	0.31	0.1	0.03	0.03	0.06	0.07	0.05	0.06	0.06	0.04	0.06	0.21	0.1	1.0
Gb_10498	0.41	0.48	0.36	0.32	0.37	0.61	0.54	0.28	0.19	0.19	0.3	0.18	0.18	0.18	0.3	0.14	0.12	0.29	0.42	1.0
Gb_11791	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_11802	0.07	0.15	0.17	0.06	0.06	0.08	0.2	0.03	0.06	0.04	0.09	0.04	0.05	0.04	0.08	0.02	0.02	0.03	0.06	1.0
Gb_12024	0.79	0.59	0.48	0.52	0.68	0.53	0.6	0.46	0.38	0.35	0.52	0.32	0.22	0.16	0.54	0.4	0.44	0.58	0.66	1.0
Gb_12065	0.39	0.32	0.33	0.43	0.43	0.41	0.36	0.41	0.33	0.26	0.45	0.28	0.41	0.34	0.41	0.37	0.46	0.4	0.5	1.0
Gb_12711	0.36	0.23	0.21	0.26	0.34	0.3	0.32	0.3	0.22	0.2	0.3	0.14	0.26	0.24	0.28	0.2	0.16	0.35	0.41	1.0
Gb_13077	0.05	0.07	0.02	0.04	0.05	0.05	0.36	0.02	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.01	0.08	0.04	0.03	0.21	0.35	1.0
Gb_13191	0.0	0.03	0.04	0.0	0.02	0.19	0.53	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.23	0.02	1.0
Gb_13340	0.19	0.07	0.14	0.16	0.19	0.35	0.42	0.06	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.01	0.03	0.17	0.12	1.0
Gb_13431	0.4	0.29	0.27	0.43	0.39	0.47	0.47	0.33	0.21	0.18	0.45	0.22	0.24	0.16	0.46	0.31	0.24	0.33	0.58	1.0
Gb_14775	0.23	0.24	1.0	0.11	0.16	0.01	0.16	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.08	0.73
Gb_14783	0.26	0.44	1.0	0.1	0.28	0.01	0.33	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.22	0.09	0.75
Gb_15613	0.54	0.47	0.54	0.33	0.34	0.23	0.82	0.17	0.19	0.23	0.4	0.24	0.18	0.15	0.45	0.21	0.19	0.09	0.22	1.0
Gb_16351	1.0	0.71	0.88	0.87	0.8	0.63	0.44	0.6	0.48	0.46	0.56	0.49	0.39	0.3	0.51	0.55	0.75	0.82	0.82	0.83
Gb_17336	0.25	0.13	0.25	0.15	0.2	0.07	0.57	0.11	0.18	0.22	0.24	0.16	0.09	0.06	0.25	0.32	0.64	0.11	0.3	1.0
Gb_17337	0.27	0.17	0.25	0.18	0.27	0.12	0.65	0.11	0.16	0.19	0.28	0.12	0.06	0.07	0.23	0.29	0.36	0.13	0.46	1.0
Gb_17569	0.09	0.07	0.06	0.06	0.08	0.11	0.36	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.04	0.06	0.07	0.14	0.1	1.0
Gb_18487	0.1	0.03	0.06	0.01	0.05	0.02	0.21	0.05	0.02	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.0	0.0	0.03	0.2	1.0
Gb_18562	0.18	0.22	0.16	0.21	0.29	0.19	0.44	0.12	0.05	0.05	0.07	0.09	0.12	0.12	0.09	0.03	0.06	0.28	0.27	1.0
Gb_18688	0.55	1.0	0.35	0.18	0.34	0.14	0.65	0.19	0.16	0.21	0.13	0.11	0.11	0.06	0.26	0.19	0.29	0.53	0.39	0.83
Gb_19309	1.0	0.46	0.44	0.24	0.34	0.17	0.91	0.14	0.12	0.13	0.1	0.1	0.11	0.1	0.09	0.1	0.07	0.52	0.23	0.95
Gb_21928	0.13	0.08	0.1	0.06	0.05	0.44	0.31	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	1.0
Gb_21967	0.63	0.47	0.29	0.62	0.61	0.3	1.0	0.23	0.14	0.11	0.38	0.24	0.19	0.19	0.36	0.12	0.17	0.31	0.78	0.67
Gb_21979	0.07	0.12	0.02	0.01	0.0	0.12	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.05	1.0
Gb_22185	0.08	0.12	0.11	0.11	0.31	0.9	0.88	0.09	0.06	0.04	0.14	0.06	0.02	0.04	0.17	0.03	0.14	0.07	0.17	1.0
Gb_23037	0.11	0.09	0.06	0.09	0.08	0.48	0.13	0.06	0.04	0.05	0.1	0.03	0.05	0.04	0.09	0.08	0.05	0.07	0.08	1.0
Gb_24796	0.32	0.04	0.13	0.28	0.3	0.42	0.4	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.23	0.08	1.0
Gb_24804	0.77	0.53	0.47	0.45	0.47	0.08	1.0	0.17	0.1	0.08	0.2	0.16	0.22	0.07	0.28	0.02	0.15	0.3	0.1	0.59
Gb_25350	0.33	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.05	1.0
Gb_26278	0.05	0.04	0.01	0.01	0.03	0.05	0.63	0.03	0.0	0.01	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	0.11	0.01	1.0
Gb_26406	0.12	0.0	0.01	0.04	0.01	0.08	0.57	0.06	0.0	0.0	0.19	0.29	0.03	0.02	0.23	0.0	0.0	0.08	0.04	1.0
Gb_26408	0.04	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.92	0.03	0.0	0.0	0.12	0.07	0.03	0.01	0.15	0.0	0.0	0.01	0.02	1.0
Gb_26412	0.09	0.0	0.01	0.08	0.0	0.06	0.64	0.05	0.0	0.0	0.38	0.29	0.06	0.03	0.43	0.0	0.0	0.06	0.04	1.0
Gb_26413	0.14	0.0	0.0	0.05	0.0	0.02	0.59	0.01	0.0	0.0	0.13	0.09	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.02	0.04	1.0
Gb_27307	0.07	0.05	0.07	0.04	0.06	0.0	0.77	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	1.0
Gb_29369	0.01	0.12	0.13	0.05	0.1	0.0	0.59	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.0	0.01	0.03	0.02	1.0
Gb_30254	0.68	0.56	0.4	0.52	0.7	0.2	0.3	0.35	0.26	0.11	0.34	0.2	0.33	0.41	0.36	0.08	0.13	0.5	0.47	1.0
Gb_30258	0.78	0.4	0.45	0.26	0.71	0.36	0.41	0.41	0.28	0.2	0.37	0.18	0.35	0.42	0.39	0.18	0.19	0.7	0.44	1.0
Gb_31764	0.21	0.2	0.23	0.06	0.14	0.22	0.3	0.08	0.05	0.07	0.03	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.31	0.09	1.0
Gb_31863	0.07	0.05	0.06	0.04	0.04	0.05	0.19	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.06	0.09	1.0
Gb_32586	0.53	0.51	0.37	0.49	0.75	0.54	0.58	0.5	0.29	0.24	0.43	0.47	0.31	0.3	0.46	0.31	0.2	0.83	0.93	1.0
Gb_32889	0.15	0.05	0.05	0.04	0.08	0.21	0.29	0.09	0.11	0.11	0.16	0.1	0.07	0.07	0.15	0.1	0.13	0.13	0.12	1.0
Gb_34014	0.35	0.15	0.11	0.12	0.12	0.15	0.21	0.11	0.08	0.08	0.09	0.08	0.08	0.06	0.09	0.05	0.06	0.26	0.22	1.0
Gb_34450	0.68	0.2	0.24	0.35	0.4	0.31	0.15	0.25	0.2	0.21	0.29	0.13	0.3	0.24	0.28	0.2	0.2	0.41	0.44	1.0
Gb_34697	0.11	0.06	0.06	0.05	0.03	0.11	0.23	0.05	0.06	0.06	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.07	0.09	0.16	1.0
Gb_36942	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.16	1.0
Gb_38645	0.3	0.03	0.06	0.0	0.1	0.15	0.4	0.05	0.06	0.06	0.06	0.0	0.01	0.06	0.04	0.0	0.0	0.39	0.23	1.0
Gb_38648	0.32	0.17	0.13	0.14	0.22	0.41	0.52	0.13	0.09	0.1	0.16	0.09	0.08	0.06	0.17	0.08	0.07	0.2	0.2	1.0
Gb_38845	0.66	0.5	0.56	0.49	0.61	0.38	0.64	0.41	0.33	0.32	0.48	0.25	0.39	0.35	0.48	0.29	0.34	0.51	0.57	1.0
Gb_38942	0.17	0.06	0.08	0.11	0.11	0.19	0.4	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.16	0.22	1.0
Gb_39218	0.49	0.37	0.34	0.38	0.43	0.19	0.28	0.27	0.23	0.22	0.21	0.09	0.39	0.3	0.23	0.13	0.12	0.27	0.32	1.0
Gb_39324	0.09	0.0	0.02	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.03	0.02	1.0
Gb_39332	0.11	0.02	0.04	0.01	0.03	0.07	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.03	0.03	1.0
Gb_39360	0.18	0.27	0.29	0.15	0.27	0.09	0.39	0.12	0.08	0.1	0.25	0.07	0.11	0.09	0.27	0.08	0.07	0.18	0.23	1.0
Gb_39497	0.49	0.15	0.17	0.18	0.27	0.23	0.26	0.16	0.13	0.15	0.3	0.11	0.14	0.1	0.26	0.1	0.15	0.24	0.23	1.0
Gb_39567	0.42	0.61	0.44	0.66	0.74	0.62	0.54	0.54	0.22	0.27	0.33	0.37	0.63	0.43	0.24	0.19	0.17	0.82	0.79	1.0
Gb_39794	0.06	0.38	0.46	0.01	0.06	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_40030	0.11	0.32	0.31	0.18	0.17	0.02	0.58	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.17	0.13	1.0
Gb_40242	0.42	0.47	0.51	0.22	0.39	0.05	0.62	0.12	0.06	0.08	0.14	0.06	0.01	0.02	0.11	0.24	0.18	0.35	0.2	1.0
Gb_41644	0.46	0.26	0.33	0.41	0.33	0.3	0.25	0.26	0.18	0.18	0.18	0.2	0.27	0.25	0.21	0.13	0.18	0.44	0.32	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)