1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.03 0.0 0.03 0.14 0.21 3.79 0.48 0.12 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 0.08 0.05 0.02 0.01 0.44 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14.38 0.1 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.2
0.36 0.09 0.72 0.13 0.25 2.5 0.39 0.09 0.04 0.11 0.22 0.06 0.0 0.0 0.35 0.21 0.3 0.36 0.12 0.66
3.31 4.87 1.95 1.57 3.31 60.52 1.02 1.3 0.66 1.34 7.64 0.34 0.57 0.26 17.21 0.64 0.8 3.53 2.48 13.04
773.96 552.87 386.37 1115.03 1146.56 2916.65 255.46 344.45 186.43 110.75 86.04 194.25 121.48 128.76 94.77 302.78 354.63 826.35 205.58 2196.38
164.07 254.41 178.07 133.34 418.97 872.18 37.55 111.54 49.46 31.05 16.02 67.28 27.5 28.19 18.07 136.72 150.37 327.5 124.08 568.23
0.77 0.43 2.92 1.25 3.37 288.15 1.31 0.06 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.26 1.11 0.3 0.03 1.13
12.47 4.5 6.79 8.42 10.72 157.39 1.79 0.29 0.03 0.5 0.0 0.22 0.05 0.06 0.0 0.5 5.0 2.06 0.0 3.71
17.69 8.41 12.4 12.18 21.45 196.73 12.38 0.34 0.12 0.32 0.0 0.1 0.0 0.18 0.0 1.51 1.04 4.95 0.31 7.01
1.41 1.23 0.84 0.51 3.33 26.34 2.35 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.05 0.61 0.02 0.23
17.16 5.25 8.21 5.24 6.04 68.02 1.55 0.26 0.1 0.88 0.0 0.08 0.0 0.05 0.0 0.13 1.51 2.87 0.09 1.51
0.02 0.03 0.01 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.02 0.05 0.15 1.26 36.5 0.28 1.03 1.66 2.68 3.08 0.23 0.58 1.19 7.86 0.62 1.29 1.66 0.13 3.09
0.08 0.0 0.01 0.0 0.81 23.47 0.24 0.56 0.2 1.21 1.01 0.13 0.54 0.39 2.42 0.0 0.0 0.79 0.17 2.35
0.0 0.0 0.0 3.38 0.0 48.17 0.4 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 3.75 0.61
0.06 0.0 0.14 0.0 0.02 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
6.46 0.35 1.8 4.32 8.84 224.99 20.6 0.98 0.6 0.41 2.09 0.17 0.23 0.22 6.61 0.54 1.5 2.31 3.46 4.68
1.53 0.27 0.87 1.33 1.9 21.19 3.12 2.8 1.55 1.24 1.67 1.04 0.28 0.31 1.77 1.53 2.91 1.69 1.24 0.36
1.31 0.26 1.92 1.36 1.95 27.26 2.19 2.12 0.94 1.18 1.1 0.51 0.08 0.51 1.46 0.87 1.77 1.42 1.55 0.58
0.08 0.0 0.02 1.39 1.09 6.36 0.0 0.07 0.0 0.02 0.03 0.09 0.08 0.07 0.0 0.26 0.36 0.4 0.01 1.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.88 0.0 0.0 0.18 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
85.24 91.3 85.28 1228.26 654.08 2797.26 1.74 248.59 124.27 132.41 58.03 135.13 40.34 48.93 58.78 559.53 314.48 547.19 7.9 3.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.15 0.17 0.76 1.9 0.45 9.48 0.71 0.23 0.02 0.0 0.01 0.07 0.03 0.02 0.01 0.12 0.18 0.26 0.08 0.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.38 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.47 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.08 8.43 0.03 0.05 0.0 0.04 0.75 0.06 0.22 0.03 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22
0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 97.64 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.08
0.0 0.0 0.0 5.18 0.0 4.47 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.04 0.22 7.23 7.48 224.83 8.96 4.16 1.44 1.26 2.94 0.71 0.53 0.56 8.65 7.16 14.34 5.57 0.33 12.91
0.23 0.03 0.06 0.33 1.0 409.99 4.39 0.21 0.11 0.06 0.02 0.02 0.02 0.06 0.02 0.35 0.14 8.41 0.21 20.22
0.49 1.28 0.0 0.0 0.1 5.45 0.0 0.06 0.11 0.55 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
12.26 6.41 9.58 13.78 16.59 29.75 3.43 7.98 4.9 5.66 9.67 3.43 7.8 5.69 9.19 1.96 3.21 4.21 6.58 3.92
0.81 0.53 0.13 0.82 6.99 136.07 0.57 1.47 0.32 0.31 3.74 0.74 0.78 0.48 8.95 0.65 1.15 1.91 2.19 9.27
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.13 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.07 2.19 6.99 0.53 11.28 296.44 1.76 4.38 4.23 3.33 5.09 1.52 1.84 2.14 11.27 0.73 3.35 7.3 1.48 130.79
3.48 8.45 7.92 24.45 91.93 1283.88 1.32 12.22 6.55 8.04 0.74 7.37 0.83 2.43 0.93 12.23 84.25 40.53 5.76 197.16
0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 51.91 4.09 0.99 0.26 0.0 0.0 0.69 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 2.82 0.26 1.33
0.09 0.07 0.48 0.58 1.16 194.14 15.42 0.65 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.0 0.85 0.02 2.42
0.56 0.32 2.35 0.23 0.38 82.24 1.24 0.05 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.04 0.07 0.21 0.03 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 1.13 0.63 3.88 0.01 0.13 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.04 0.86 1.35 0.4 0.01 1.68
1.06 0.0 0.0 4.91 8.8 37.99 0.64 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.11 2.03 17.74 9.73 9.76
0.25 0.0 0.71 1.15 3.34 94.05 5.62 0.78 0.27 0.24 1.08 0.2 0.09 0.08 3.86 0.72 1.46 1.58 0.01 0.91
1.4 1.54 1.47 4.87 9.07 66.95 2.04 1.89 0.34 0.35 5.83 0.66 0.13 0.11 13.57 0.9 1.84 2.47 3.38 5.4
20.32 7.64 23.47 34.39 28.21 168.27 1.69 3.59 1.76 1.96 3.7 1.65 2.11 1.69 3.55 2.96 3.81 13.5 9.65 13.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 2.01 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.11
3.94 0.8 1.5 1.55 6.17 18.89 1.71 1.29 1.71 1.71 0.59 1.04 0.48 0.64 1.17 4.63 1.49 1.89 0.33 2.74
65.27 16.84 6.74 25.76 18.6 164.65 0.57 6.77 6.22 10.06 20.33 9.53 2.87 2.1 12.63 3.84 10.33 6.32 0.04 4.72
0.41 0.0 0.0 0.76 2.17 4.79 0.0 0.22 0.06 0.04 0.03 0.04 0.02 0.03 0.0 1.0 0.72 1.08 0.06 1.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.39 0.85 0.76 0.36 0.84 4.85 0.76 0.37 0.47 0.22 0.47 0.27 0.11 0.09 0.51 0.38 0.42 0.33 0.33 0.4
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.24 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.07 0.0 0.0 0.37 0.88 1.84 0.22 0.08 0.09 0.13 0.09 0.03 0.0 0.04 0.1 0.69 1.29 0.64 0.22 0.44
0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.79 0.22 0.02 0.02 0.05 0.1 0.01 0.03 0.0 0.09 0.0 0.0 0.01 0.05 0.12
0.05 0.05 0.0 0.0 0.02 0.61 0.36 0.04 0.07 0.05 0.14 0.03 0.21 0.09 0.12 0.0 0.0 0.02 0.07 0.18
0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.77 0.28 0.07 0.08 0.12 0.12 0.02 0.14 0.09 0.13 0.0 0.0 0.0 0.15 0.18
0.14 0.0 0.35 0.12 0.04 16.48 1.33 0.07 0.02 0.05 0.0 0.07 0.05 0.0 0.05 0.02 0.0 0.1 0.02 0.0
5.98 6.28 1.86 4.84 13.23 592.74 6.16 11.61 3.89 6.82 7.23 8.41 2.59 2.33 13.4 3.51 7.57 17.21 3.1 58.37
1.19 0.0 0.16 7.88 15.75 42.49 0.8 0.27 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.7 2.41 31.81 14.74 16.27
0.0 0.11 0.0 0.22 0.33 3.42 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.12
5.31 2.05 3.2 14.49 11.06 190.12 0.58 10.77 3.86 3.31 3.95 8.32 5.15 14.86 5.77 11.03 9.72 15.01 0.3 18.27
2.97 4.19 3.86 3.61 4.76 56.62 0.74 3.08 2.69 2.34 5.41 1.97 2.41 2.22 7.74 2.54 2.95 10.41 3.08 8.38
1.21 0.0 0.06 0.99 0.1 69.57 0.41 0.94 0.09 0.26 0.05 0.08 0.06 0.11 0.13 0.08 0.11 1.24 0.47 17.04
13.18 5.36 5.61 13.12 19.54 543.21 0.25 74.2 33.53 61.26 206.57 71.99 75.09 70.13 237.89 26.66 90.77 53.63 16.19 60.8
0.26 0.06 0.0 0.03 0.15 6.37 0.0 0.01 0.02 0.11 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.12
0.2 0.0 0.05 3.42 0.93 33.59 0.01 0.51 0.05 0.01 0.03 0.26 0.28 0.44 0.05 0.18 0.34 0.14 0.07 16.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.86 0.6 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.31
0.93 0.96 1.33 2.56 20.76 66.07 0.36 1.68 0.42 0.36 0.2 0.17 0.13 0.3 0.5 6.5 11.48 11.28 0.74 6.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.65 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
1.04 0.0 0.15 0.25 0.16 10.59 0.0 0.69 0.32 0.43 0.29 0.35 0.36 0.28 0.27 0.71 2.35 0.54 0.05 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.85 0.72 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.06 0.0
1.62 0.15 0.79 0.18 3.04 233.52 42.91 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.36
0.15 0.16 0.1 5.25 2.11 15.99 0.6 0.88 0.7 0.67 0.55 0.1 0.32 0.47 0.6 0.6 1.29 1.55 0.26 1.52
3.15 0.13 0.49 0.08 0.98 53.11 0.05 0.37 0.16 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.15 2.36 0.03 1.9
6.54 5.36 7.39 6.17 9.61 34.26 4.31 5.43 4.39 4.23 8.81 3.58 2.73 2.6 8.36 4.11 4.24 4.31 8.23 4.3
6.38 3.3 5.4 6.97 8.21 24.41 4.44 5.73 4.97 5.05 8.9 3.74 4.19 4.12 8.53 4.92 4.64 4.37 5.69 3.98
0.09 0.0 0.03 0.0 0.0 0.39 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.48 4.22 0.34 0.0 0.25 26.09 3.14 0.34 0.44 1.54 0.07 1.58 0.32 1.18 0.05 0.89 0.54 0.12 0.08 8.28
11.53 20.14 2.37 2.32 7.17 81.55 0.49 1.08 0.22 0.41 0.26 3.7 0.0 0.03 0.22 10.28 1.58 6.81 0.12 1.02
1.04 1.07 1.65 1.31 2.3 85.18 8.88 5.27 8.69 9.02 8.38 6.68 3.95 2.44 9.03 15.14 10.23 7.03 2.02 14.31
10.14 11.87 12.89 20.31 32.77 224.68 2.52 7.2 2.97 2.07 26.08 4.17 4.49 3.25 59.31 3.69 5.88 11.37 14.2 12.02
0.09 0.0 0.0 4.25 2.64 10.15 0.02 0.42 0.09 0.05 0.13 0.17 0.11 0.15 0.14 2.17 2.05 1.41 0.11 3.49
4.27 3.91 3.03 6.59 6.79 110.65 7.73 1.81 0.31 0.26 2.22 4.79 0.18 0.44 2.21 1.4 0.9 5.36 0.24 16.88
5.85 5.62 9.0 7.18 9.33 27.23 4.12 8.94 5.12 5.24 12.37 7.88 1.82 2.29 15.56 7.56 7.91 15.19 8.03 12.8
0.8 0.42 0.65 2.24 1.63 12.37 0.18 2.03 1.44 1.27 4.56 2.15 0.76 1.28 7.91 1.72 2.75 3.07 1.13 5.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.04 2.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.94 1.04 0.87 3.62 4.01 27.04 0.38 3.12 2.95 2.8 0.87 2.23 2.09 2.13 0.83 0.51 1.23 2.64 0.79 3.94
7.71 1.46 2.16 21.86 15.79 30.17 3.68 13.73 9.1 10.83 28.45 23.16 10.15 10.41 29.92 16.98 22.29 16.84 2.85 22.57
0.15 0.0 0.0 0.46 0.45 4.55 0.05 0.27 0.02 0.01 0.04 0.0 0.22 0.52 0.29 0.12 0.0 0.99 0.13 0.09
7.2 6.02 2.23 5.02 21.0 152.77 2.54 10.34 9.86 12.3 11.06 13.53 4.09 3.38 9.8 13.82 16.17 2.82 1.03 21.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.22 5.08 2.74 7.17 15.36 956.94 0.48 30.51 42.12 21.76 52.41 42.6 47.76 74.7 48.0 19.45 21.74 16.19 11.82 6.94
0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 87.21 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06
0.03 0.0 0.05 1.13 0.02 68.34 0.01 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.04 0.08 0.62 0.11
0.0 0.0 0.33 3.43 5.04 235.32 0.33 2.3 2.41 2.54 9.94 2.11 1.25 0.8 22.59 5.26 17.97 6.11 5.59 24.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.66 1.77 1.09 1.25 1.21 16.47 0.42 0.41 0.13 0.08 0.19 0.12 0.0 0.01 0.38 0.0 0.44 0.51 0.17 1.0
0.04 0.24 0.21 0.69 0.99 83.56 0.61 1.13 0.4 0.42 1.06 0.19 0.13 0.19 3.44 0.95 1.8 1.68 0.14 3.22
0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 18.21 0.1 0.05 0.05 0.08 0.05 0.0 0.21 0.06 0.01 0.0 0.07 0.36 0.04 0.4
0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 2.93 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.14 0.01 0.1
0.23 0.14 0.64 0.87 1.16 2.4 0.56 1.26 0.69 0.99 3.79 0.48 1.71 1.23 3.99 0.46 1.04 2.18 0.63 1.22
0.44 5.97 3.9 4.06 65.83 973.14 6.9 57.79 59.25 63.03 307.96 152.92 53.01 65.51 233.27 4.52 30.63 17.86 3.68 4.7

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)