Heatmap: Cluster_225 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.03 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.0 0.57 0.63 0.63 1.0 0.16 0.79 0.4 0.69 0.25 0.25 0.05 0.0 0.01
0.56 0.3 0.35 0.75 0.59 0.44 0.07 0.85 0.61 0.66 1.0 0.5 0.28 0.31 0.84 0.66 0.87 0.59 0.1 0.4
0.43 0.15 0.23 0.22 0.22 0.1 0.02 0.75 0.43 0.41 0.45 0.33 0.43 1.0 0.31 0.08 0.59 0.38 0.12 0.42
0.19 0.1 0.07 0.16 0.07 0.2 0.0 0.6 0.5 0.43 0.49 0.29 1.0 0.55 0.41 0.26 0.19 0.22 0.02 0.02
0.08 0.11 0.13 0.14 0.17 0.64 0.04 0.62 0.9 0.7 0.46 1.0 0.95 0.85 0.42 0.42 0.21 0.27 0.02 0.8
0.11 0.18 0.19 0.1 0.18 0.12 0.0 0.74 0.9 0.64 0.48 0.86 1.0 0.7 0.47 0.3 0.41 0.15 0.0 0.44
0.13 0.04 0.04 0.33 0.21 0.18 0.01 0.71 0.42 0.36 0.7 1.0 0.35 0.52 0.55 0.45 0.47 0.51 0.2 0.7
0.12 0.0 0.01 0.08 0.06 0.27 0.0 0.8 0.66 0.55 0.28 0.31 1.0 0.64 0.19 0.42 0.43 0.15 0.0 0.08
0.1 0.1 0.09 0.08 0.08 0.13 0.01 0.88 0.75 0.69 1.0 0.61 0.95 0.91 0.75 0.18 0.4 0.1 0.0 0.02
0.07 0.0 0.05 0.0 0.04 0.09 0.01 0.84 1.0 0.56 0.24 0.22 0.89 0.55 0.26 0.12 0.08 0.26 0.0 0.02
1.0 0.08 0.32 0.05 0.17 0.03 0.04 0.83 0.54 0.51 0.29 0.36 0.47 0.27 0.12 0.0 0.06 0.52 0.01 0.62
0.22 0.1 0.03 0.09 0.09 0.1 0.14 0.59 1.0 0.97 0.17 0.37 0.44 0.55 0.19 0.66 0.81 0.16 0.0 0.04
0.09 0.02 0.04 0.1 0.07 0.1 0.07 0.83 1.0 0.87 0.5 0.6 0.54 0.6 0.34 0.59 0.74 0.2 0.0 0.35
0.68 0.04 0.18 0.65 0.74 0.23 0.01 1.0 0.58 0.79 0.79 0.4 0.49 0.27 0.83 0.4 0.99 0.78 0.01 0.03
0.07 0.02 0.03 0.05 0.07 0.03 0.0 0.46 0.3 0.54 0.64 0.08 1.0 0.56 0.3 0.06 0.1 0.04 0.04 0.03
0.01 0.0 0.0 0.09 0.04 0.0 0.0 0.44 1.0 0.78 0.44 0.08 0.86 0.88 0.21 0.46 0.21 0.05 0.02 0.0
0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.03 0.0 0.55 1.0 0.82 0.84 0.13 0.18 0.23 0.47 0.55 0.26 0.04 0.0 0.0
0.02 0.02 0.0 0.14 0.04 0.02 0.01 0.99 0.77 0.9 0.57 0.19 0.88 1.0 0.3 0.55 0.25 0.06 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.03 0.13 0.09 0.0 0.72 0.3 0.33 0.17 0.28 1.0 0.82 0.11 0.05 0.19 0.27 0.0 0.03
0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 1.0 0.79 0.77 0.36 0.06 0.24 0.13 0.16 0.01 0.02 0.05 0.0 0.08
0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.29 0.38 0.32 0.13 0.46 0.15 0.14 0.01 0.05 0.01 0.0 0.01
0.09 0.01 0.0 0.07 0.09 0.04 0.0 1.0 0.59 0.76 0.26 0.12 0.51 0.46 0.17 0.12 0.15 0.04 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0 1.0 0.57 0.87 0.2 0.13 0.12 0.15 0.11 0.04 0.13 0.02 0.0 0.01
0.51 0.57 0.53 0.41 0.38 0.2 0.06 0.99 0.82 0.99 0.96 0.7 0.29 0.23 0.84 0.6 1.0 0.34 0.12 0.87
0.33 0.15 0.23 0.26 0.3 0.17 0.04 0.94 0.63 0.69 1.0 0.65 0.89 0.89 0.82 0.37 0.68 0.17 0.02 0.8
0.14 0.13 0.17 0.07 0.05 0.08 0.08 1.0 0.67 0.72 0.54 0.18 0.99 0.76 0.48 0.42 0.15 0.02 0.01 0.09
0.03 0.06 0.07 0.05 0.04 0.21 0.0 0.91 0.64 1.0 0.3 0.21 0.74 0.45 0.28 0.15 0.18 0.02 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.72 0.62 0.61 0.09 0.87 0.53 0.36 0.09 0.15 0.0 0.0 0.0
0.14 0.08 0.1 0.04 0.05 0.03 0.05 1.0 0.5 0.51 0.99 0.44 0.44 0.25 0.5 0.02 0.14 0.16 0.0 0.16
0.03 0.0 0.02 0.05 0.01 0.01 0.0 0.79 1.0 0.84 0.33 0.09 0.42 0.18 0.3 0.17 0.06 0.29 0.09 0.01
0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.07 0.0 0.74 0.85 0.95 0.18 0.18 0.82 1.0 0.1 0.2 0.53 0.01 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.57 0.55 0.58 0.05 0.01 0.41 1.0 0.0 0.03 0.04 0.02 0.0 0.0
0.0 0.04 0.02 0.28 0.11 0.02 0.0 0.59 1.0 0.44 0.87 0.25 0.12 0.23 0.83 0.26 0.56 0.0 0.0 0.06
0.04 0.04 0.1 0.01 0.0 0.03 0.0 0.43 0.31 0.6 0.26 0.06 0.03 0.02 0.76 0.48 1.0 0.09 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.37 0.57 1.0 0.06 0.77 0.66 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.42 0.56 0.45 0.15 0.73 0.28 0.2 0.02 0.19 0.02 0.0 0.22
0.03 0.0 0.38 0.0 0.0 0.37 0.04 0.45 0.65 0.63 1.0 0.2 0.1 0.3 0.73 0.38 0.13 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.63 0.54 0.22 0.35 0.96 0.88 0.06 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.31 0.25 0.19 0.29 0.31 0.44 0.11 0.72 0.53 0.51 1.0 0.47 0.8 0.67 0.86 0.44 0.53 0.23 0.21 0.2
0.04 0.0 0.02 0.04 0.04 0.0 0.0 0.9 1.0 0.9 0.53 0.42 0.3 0.21 0.45 0.26 0.3 0.53 0.0 0.01
0.27 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.02 1.0 0.54 0.54 0.45 0.46 0.26 0.2 0.44 0.05 0.15 0.51 0.0 0.06
0.49 0.11 0.11 0.57 0.21 0.14 0.03 1.0 0.75 0.79 0.73 0.72 0.8 0.35 0.5 0.28 0.3 0.37 0.01 0.01
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.82 0.84 0.87 0.65 0.5 1.0 0.97 0.52 0.24 0.63 0.13 0.0 0.11
0.11 0.07 0.06 0.04 0.06 0.05 0.01 0.75 0.53 0.63 1.0 0.42 0.64 0.47 0.85 0.49 0.5 0.12 0.08 0.04
0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.88 1.0 0.5 0.81 0.76 0.43 0.86 0.38 0.36 0.86 0.05 0.0 0.0
0.23 0.7 0.33 0.12 0.44 0.19 0.18 0.51 0.42 0.43 1.0 0.59 0.4 0.49 0.75 0.8 0.67 0.35 0.22 0.06
0.04 0.02 0.03 0.15 0.16 0.06 0.0 0.85 0.74 0.77 1.0 0.16 0.58 0.39 0.8 0.31 0.46 0.47 0.04 0.0
0.25 0.25 0.26 0.1 0.34 0.07 0.12 0.79 0.86 0.85 0.76 0.73 0.38 0.41 0.54 1.0 0.92 0.2 0.06 0.08
0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.1 0.5 0.42 0.37 1.0 0.18 0.56 0.52 0.72 0.12 0.08 0.02 0.02 0.26
0.15 0.02 0.01 0.21 0.04 0.0 0.05 0.77 1.0 0.83 0.3 0.05 0.29 0.52 0.12 0.23 0.13 0.08 0.16 0.1
0.18 0.2 0.0 0.12 0.1 0.02 0.08 0.9 1.0 0.68 0.48 0.07 0.44 0.41 0.33 0.3 0.26 0.05 0.53 0.08
0.21 0.06 0.1 0.16 0.16 0.04 0.2 0.86 1.0 0.85 0.62 0.12 0.4 0.39 0.43 0.43 0.36 0.13 0.28 0.14
0.31 0.13 0.18 0.02 0.06 0.1 0.05 0.94 0.39 0.7 0.42 0.21 1.0 0.78 0.26 0.0 0.15 0.17 0.01 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.62 1.0 0.51 0.2 0.09 0.33 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17
0.11 0.11 0.12 0.23 0.34 0.15 0.04 0.73 0.72 0.81 0.1 0.85 0.65 0.35 0.04 0.12 1.0 0.09 0.28 0.06
0.01 0.03 0.02 0.03 0.05 0.03 0.0 1.0 0.52 0.59 0.35 0.31 0.34 0.28 0.17 0.12 0.31 0.1 0.0 0.0
0.01 0.03 0.01 0.03 0.04 0.06 0.06 0.8 0.41 0.56 0.79 0.26 1.0 0.57 0.83 0.2 0.21 0.28 0.01 0.0
0.03 0.04 0.02 0.11 0.22 0.1 0.0 1.0 0.54 0.48 0.25 0.14 0.81 0.67 0.12 0.02 0.1 0.12 0.03 0.01
0.01 0.06 0.03 0.01 0.02 0.09 0.05 0.75 0.63 0.74 0.25 0.26 1.0 0.88 0.25 0.52 0.69 0.21 0.0 0.1
0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.55 0.79 0.84 0.8 0.37 1.0 0.67 0.63 0.52 0.42 0.13 0.0 0.0
0.21 0.03 0.02 0.05 0.33 0.0 0.0 1.0 0.87 0.83 0.31 0.11 0.07 0.05 0.22 0.0 0.06 0.16 0.25 0.26
0.17 0.27 0.12 0.03 0.1 0.0 0.0 1.0 0.71 0.9 0.17 0.13 0.02 0.02 0.19 0.0 0.05 0.39 0.09 0.21
0.22 0.18 0.17 0.2 0.21 0.15 0.08 0.32 0.24 0.36 0.57 0.29 0.13 0.15 0.41 0.24 1.0 0.29 0.16 0.29
0.01 0.06 0.0 0.0 0.05 0.1 0.39 0.64 0.23 0.24 0.33 0.43 0.95 1.0 0.11 0.0 0.01 0.01 0.01 0.16
0.08 0.11 0.11 0.07 0.05 0.05 0.02 1.0 0.72 0.66 0.77 0.2 0.99 0.84 0.58 0.28 0.21 0.01 0.01 0.03
0.01 0.01 0.01 0.09 0.05 0.02 0.0 0.37 0.49 1.0 0.03 0.12 0.21 0.51 0.05 0.08 0.11 0.01 0.0 0.03
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.71 1.0 0.55 0.6 0.77 0.83 0.46 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 0.0 0.06 0.1 0.05 0.0 1.0 0.7 0.63 0.33 0.19 0.37 0.3 0.14 0.06 0.14 0.06 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.18 0.1 0.32 0.0 0.61 0.3 0.28 0.12 0.31 0.84 1.0 0.1 0.1 0.69 0.24 0.02 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)