Heatmap: Cluster_332 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00519	0.16	0.62	0.15	0.1	0.22	1.0	0.16	0.13	0.16	0.13	0.25	0.1	0.09	0.07	0.33	0.07	0.07	0.25	0.61	0.1
Gb_00533	0.95	0.63	0.7	0.96	1.0	0.93	0.22	0.94	0.6	0.59	0.87	0.75	0.74	0.63	0.82	0.53	0.59	0.67	0.6	0.54
Gb_01203	0.58	0.4	0.58	0.59	0.72	0.64	0.38	0.55	0.37	0.3	0.27	0.38	0.27	0.21	0.26	0.67	0.66	0.54	1.0	0.42
Gb_02116	0.76	0.5	0.64	0.82	0.8	0.67	0.38	0.7	0.4	0.39	0.61	0.49	0.51	0.55	0.53	0.59	0.64	0.83	1.0	0.74
Gb_05495	0.68	0.39	0.54	0.84	0.92	0.77	0.51	0.91	0.52	0.47	0.97	0.59	0.86	0.61	0.85	0.32	0.49	0.83	1.0	0.96
Gb_06851	0.95	0.5	0.64	1.0	0.98	0.69	0.68	0.78	0.7	0.59	0.96	0.56	0.92	0.89	0.99	0.64	0.62	0.96	0.79	0.7
Gb_07897	0.02	0.06	0.04	0.06	0.11	1.0	0.14	0.53	0.43	0.42	0.28	0.38	0.21	0.2	0.28	0.45	0.5	0.4	0.87	0.47
Gb_08343	0.56	0.56	0.36	0.73	1.0	0.89	0.35	0.72	0.52	0.54	0.85	0.55	0.55	0.51	0.83	0.55	0.53	0.7	0.68	0.79
Gb_08701	0.51	0.23	0.27	0.41	0.49	0.18	0.28	0.49	0.36	0.28	0.51	0.34	0.27	0.31	0.55	0.17	0.17	0.82	1.0	0.49
Gb_08884	0.77	0.49	0.74	0.89	0.94	0.71	0.43	0.83	0.45	0.44	0.76	0.72	0.49	0.5	0.7	0.63	0.88	0.9	1.0	0.72
Gb_09400	0.28	0.29	0.26	0.38	0.4	0.52	0.27	0.55	0.39	0.37	0.92	0.33	0.29	0.23	0.91	0.41	0.37	0.37	1.0	0.35
Gb_09734	0.33	0.25	0.35	0.32	0.45	0.83	0.49	1.0	0.51	0.51	0.67	0.74	0.4	0.3	0.64	0.29	0.38	0.33	0.52	0.71
Gb_09801	0.9	0.73	0.6	0.89	0.8	0.88	0.33	0.77	0.54	0.52	0.65	0.43	0.92	0.82	0.62	0.61	0.57	1.0	0.63	0.64
Gb_09916	0.68	0.45	0.41	1.0	0.68	0.87	0.13	0.67	0.25	0.25	0.49	0.27	0.41	0.27	0.45	0.2	0.29	0.82	0.66	0.4
Gb_10938	0.7	0.61	0.71	0.62	0.68	0.58	0.41	0.77	0.52	0.58	1.0	0.51	0.71	0.44	0.92	0.34	0.49	0.53	0.51	0.96
Gb_11473	0.23	0.24	0.19	0.23	0.3	0.5	0.18	0.4	0.35	0.29	0.75	0.49	0.31	0.37	0.79	0.57	0.43	0.31	1.0	0.44
Gb_13900	0.1	0.04	0.03	0.15	0.28	1.0	0.06	0.48	0.23	0.22	0.32	0.24	0.12	0.09	0.32	0.16	0.33	0.18	0.82	0.2
Gb_13902	0.19	0.06	0.03	0.28	0.58	1.0	0.14	0.9	0.55	0.51	0.81	0.45	0.45	0.55	0.69	0.45	0.86	0.42	0.79	0.62
Gb_15482	0.57	0.45	0.54	0.4	0.47	0.54	0.08	0.6	0.33	0.48	0.63	0.66	0.5	0.36	0.55	0.32	0.39	0.68	0.33	1.0
Gb_15532	0.68	0.87	0.55	0.83	0.79	0.6	0.44	0.76	0.85	0.85	1.0	0.65	0.82	0.68	0.96	0.67	0.72	0.55	0.53	0.3
Gb_15533	0.68	0.87	0.55	0.83	0.79	0.6	0.44	0.76	0.85	0.85	1.0	0.65	0.82	0.68	0.96	0.67	0.72	0.55	0.53	0.3
Gb_16480	0.59	0.63	0.38	0.7	0.79	0.98	0.47	0.82	0.7	0.63	1.0	0.55	0.62	0.45	0.97	0.69	0.56	0.78	0.84	0.79
Gb_19824	0.7	0.33	0.35	0.57	0.63	0.56	0.33	0.67	0.42	0.44	0.6	0.45	0.44	0.46	0.62	0.59	0.54	0.86	1.0	0.75
Gb_19951	1.0	0.51	0.5	0.58	0.77	0.27	0.19	0.49	0.3	0.3	0.55	0.37	0.28	0.2	0.47	0.32	0.44	0.77	0.4	0.76
Gb_21006	0.87	0.88	0.83	0.59	0.62	1.0	0.1	0.75	0.35	0.34	0.59	0.36	0.27	0.2	0.53	0.3	0.34	0.32	0.99	0.42
Gb_21007	0.96	0.66	0.65	0.64	0.7	0.92	0.15	1.0	0.46	0.45	0.9	0.73	0.96	0.73	0.9	0.31	0.38	0.36	0.49	0.74
Gb_23438	0.86	0.58	0.67	0.91	1.0	0.85	0.57	0.76	0.53	0.47	0.79	0.53	0.65	0.71	0.8	0.51	0.52	0.87	0.88	0.84
Gb_23733	0.71	0.33	0.58	0.8	0.76	1.0	0.3	0.73	0.48	0.46	0.79	0.63	0.72	0.62	0.78	0.7	0.92	0.76	0.72	0.55
Gb_23972	0.68	1.0	0.45	0.49	0.62	0.6	0.4	0.76	0.54	0.52	0.76	0.54	0.71	0.57	0.71	0.38	0.43	0.49	0.53	0.43
Gb_24005	0.87	0.59	0.69	0.81	0.85	0.94	0.27	0.91	0.57	0.54	0.82	0.56	0.48	0.38	0.74	0.55	0.58	0.98	0.71	1.0
Gb_25349	0.75	0.89	0.86	0.94	1.0	0.54	0.7	0.75	0.51	0.47	0.58	0.58	0.42	0.35	0.61	0.35	0.3	0.9	0.85	0.79
Gb_25438	0.09	0.22	0.21	0.14	0.18	1.0	0.6	0.38	0.32	0.34	0.37	0.23	0.51	0.42	0.4	0.19	0.24	0.32	0.9	0.46
Gb_26255	0.2	0.04	0.07	0.28	0.3	0.58	0.37	0.29	0.33	0.27	0.31	0.13	0.17	0.19	0.32	0.25	0.3	0.87	1.0	0.82
Gb_26619	0.9	0.67	0.79	0.78	1.0	0.71	0.54	0.76	0.44	0.41	0.69	0.55	0.49	0.44	0.64	0.42	0.52	0.84	0.93	0.8
Gb_27439	1.0	0.33	0.59	0.9	0.76	0.88	0.24	0.69	0.48	0.61	0.81	0.38	0.41	0.32	0.82	0.51	0.63	0.74	0.48	0.67
Gb_27727	0.89	0.46	0.51	0.78	0.77	1.0	0.2	0.94	0.53	0.56	0.76	0.52	0.57	0.47	0.78	0.6	0.71	0.92	0.79	0.58
Gb_27929	0.55	0.56	0.31	0.6	0.69	0.47	0.6	0.62	0.59	0.5	1.0	0.46	0.85	0.66	0.88	0.38	0.37	0.87	0.87	0.5
Gb_29530	1.0	0.54	0.59	0.87	0.85	0.76	0.29	0.61	0.37	0.41	0.62	0.4	0.41	0.39	0.51	0.45	0.56	0.61	0.54	0.91
Gb_29712	0.04	0.08	0.04	0.07	0.31	1.0	0.17	0.31	0.19	0.18	0.33	0.21	0.29	0.24	0.34	0.1	0.15	0.1	0.82	0.18
Gb_29837	0.5	0.47	0.42	0.54	0.69	1.0	0.44	0.52	0.39	0.36	0.89	0.45	0.31	0.29	0.9	0.37	0.36	0.48	0.69	0.57
Gb_29892	0.08	0.03	0.04	0.2	0.22	1.0	0.05	0.42	0.36	0.37	0.41	0.29	0.39	0.41	0.4	0.17	0.26	0.87	0.51	0.19
Gb_30553	0.43	0.54	0.31	0.63	0.67	1.0	0.25	0.71	0.37	0.44	0.92	0.55	0.22	0.17	0.96	0.5	0.39	0.64	0.65	0.46
Gb_31891	0.36	0.25	0.27	0.5	0.67	0.76	0.28	0.68	0.46	0.45	0.65	0.41	0.43	0.34	0.69	0.57	0.47	0.53	1.0	0.49
Gb_31892	0.75	0.52	0.62	0.76	0.99	0.78	0.45	0.84	0.5	0.54	0.65	0.75	0.82	0.79	0.58	0.5	0.85	0.9	0.63	1.0
Gb_32597	0.48	0.16	0.2	0.61	0.68	0.82	0.45	0.5	0.34	0.33	0.8	0.4	0.3	0.28	0.68	0.33	0.39	0.88	0.95	1.0
Gb_32598	0.31	0.18	0.21	0.46	0.39	0.72	0.33	0.4	0.23	0.27	0.52	0.32	0.43	0.35	0.4	0.16	0.3	0.65	1.0	0.6
Gb_32599	0.26	0.09	0.15	0.33	0.32	0.5	0.25	0.26	0.16	0.13	0.26	0.21	0.22	0.22	0.24	0.16	0.19	0.43	1.0	0.4
Gb_32600	0.36	0.28	0.28	0.65	0.48	0.68	0.34	0.29	0.22	0.15	0.26	0.25	0.36	0.37	0.23	0.07	0.26	0.59	1.0	0.6
Gb_32973	0.64	0.9	0.7	0.69	0.73	0.52	0.32	0.7	0.49	0.45	1.0	0.46	0.66	0.54	0.9	0.58	0.49	0.49	0.64	0.42
Gb_33482	0.78	0.45	0.43	0.62	1.0	0.59	0.37	0.62	0.35	0.3	0.54	0.46	0.72	0.66	0.5	0.41	0.61	0.74	0.78	0.5
Gb_35244	0.31	0.42	0.34	0.01	0.04	1.0	0.08	0.05	0.24	0.13	0.1	0.08	0.14	0.12	0.12	0.06	0.01	0.23	0.3	0.54
Gb_35749	0.91	0.38	0.51	1.0	0.54	0.54	0.28	0.61	0.25	0.25	0.73	0.34	0.27	0.22	0.67	0.38	0.44	0.61	0.42	0.3
Gb_35867	0.32	0.34	0.37	0.32	0.4	0.29	0.21	0.48	0.48	0.49	0.76	0.47	0.26	0.21	0.79	0.47	0.69	0.51	1.0	0.54
Gb_36239	0.79	0.53	0.46	0.69	0.68	0.83	0.53	0.78	0.49	0.57	0.82	0.44	0.47	0.31	0.73	0.35	0.34	0.74	0.9	1.0
Gb_37496	0.36	0.22	0.31	0.52	0.63	1.0	0.17	0.62	0.33	0.36	0.54	0.4	0.3	0.34	0.47	0.49	0.58	0.76	0.77	0.44
Gb_37700	0.3	0.4	0.29	0.37	0.43	1.0	0.26	0.57	0.44	0.34	0.63	0.34	0.31	0.31	0.64	0.45	0.33	0.42	0.66	0.38
Gb_38790	1.0	0.52	0.51	0.52	0.73	0.84	0.22	0.9	0.61	0.66	0.85	0.53	0.74	0.54	0.71	0.33	0.49	0.56	0.41	0.52
Gb_39536	0.25	0.3	0.23	0.33	0.56	0.78	0.69	0.7	0.5	0.46	1.0	0.58	0.26	0.25	0.95	0.46	0.47	0.72	0.68	0.35
Gb_39788	1.0	0.59	0.7	0.9	0.9	0.63	0.44	0.64	0.44	0.42	0.63	0.61	0.3	0.33	0.59	0.46	0.47	0.89	0.67	0.81
Gb_41574	1.0	0.91	0.55	0.58	0.43	0.43	0.17	0.95	0.35	0.3	0.3	0.35	0.89	0.57	0.26	0.12	0.16	0.18	0.18	0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)