1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_31 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.19 0.4 0.14 1.14 0.26 0.21 0.11 0.07 0.1 0.24 0.06 0.13 0.11 0.18 0.0 0.0 0.36 0.2 1.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.62 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.8 0.31 0.68 0.0 0.0 0.16 0.21 0.0 0.0 1.5 0.0 0.48 0.35 0.0
0.23 0.33 0.61 0.0 0.31 0.0 0.7 0.39 0.72 0.76 0.15 0.08 0.24 0.37 0.27 0.78 0.16 0.13 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.0 0.14 0.59 0.23 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.14 0.11 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.92 1.16 0.46 0.23 1.14 0.83 0.16 0.17 0.21 0.26 0.18 0.23 0.12 0.21 0.2 3.2 0.7 0.66
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.13 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.16 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
3.21 7.12 3.17 0.0 6.37 7.3 1.76 2.25 2.57 0.0 5.94 0.82 0.0 0.0 11.59 0.0 0.0 8.51 0.0 10.98
0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
0.11 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.03 0.0 0.06 0.42 0.0 0.0 0.04 0.03 0.08 0.04 0.0 0.02 0.13 0.0 0.0 0.36 0.0 0.11 0.0 0.05
0.07 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.04 0.02 0.0 0.27 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.19 0.45 0.23
0.28 0.0 1.15 0.79 0.19 0.49 0.32 2.8 0.25 0.36 0.01 0.49 0.05 0.06 0.0 0.22 0.4 1.07 0.41 0.01
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.1 0.13 0.14 0.05 0.0 0.0 0.1 0.06 0.07 0.1 0.18 0.0 0.37 0.37
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.1 0.04 0.02 0.03 0.2 0.03 0.0 0.0 0.09 0.13 0.24 0.05 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.18 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.05 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.13 1.55 0.13 0.45 0.13 10.33 0.04 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 2.34 39.61 2.45 0.94
0.07 0.0 0.05 0.0 0.15 0.0 0.0 0.05 0.08 0.03 0.26 0.01 0.03 0.18 0.08 0.0 0.0 0.04 0.09 0.29
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.09 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.1
3.29 0.0 0.56 0.0 2.51 0.0 1.17 0.76 0.17 0.12 0.21 0.13 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 1.65 0.0 0.81
1.86 0.07 0.35 0.87 1.36 0.43 2.35 1.28 1.26 1.73 1.06 0.26 0.81 0.67 1.09 2.03 2.08 2.16 0.29 1.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.16 0.0 0.0 0.11 0.02 0.0 0.01 2.56 2.7 8.89 1.41 0.04 3.0 1.01 0.78 6.89 10.08 1.85 0.06 2.63
0.1 0.17 0.14 2.32 1.2 0.27 0.02 0.96 0.34 0.07 0.09 0.06 0.01 0.02 0.46 0.53 0.43 1.75 1.14 0.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.11 1.19 1.48 0.2 0.79 0.4 4.69 1.99 1.53 1.23 4.08 0.34 0.03 0.21 5.89 2.46 0.14 9.11 6.42 3.89
1.06 0.62 1.65 0.66 2.25 0.69 0.44 1.89 2.03 2.31 3.56 0.45 0.42 0.73 6.66 1.01 1.15 3.34 2.76 4.08
1.01 0.39 0.27 0.25 0.27 5.96 3.59 3.2 0.97 1.1 1.06 0.39 0.39 0.71 1.12 2.74 0.28 9.43 0.25 0.05
0.78 0.0 0.06 0.2 0.26 5.37 4.64 3.06 1.59 2.14 0.76 0.4 0.3 0.91 1.47 3.54 0.26 11.77 0.15 0.42
0.66 0.0 0.2 0.61 0.3 4.61 3.11 2.04 0.82 1.39 1.6 0.37 0.04 0.63 1.01 3.26 0.23 6.96 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.3 0.09 0.07 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0
0.11 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.01 0.0 0.01 0.04 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
1.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.78 0.25 0.13 0.0 0.0 0.1 0.19 0.92 0.0 1.06 0.6 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.0 0.0 0.06 0.31 0.0 0.09 0.06 0.07 0.06 0.08 0.22 0.04 0.17 0.0 0.0 0.43 0.18 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.1 0.12 0.08 0.07 0.07 0.22 0.0 0.25 0.0 0.0 0.45 0.15 0.42
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.0 0.07 0.05 0.05 0.23 0.0 0.05 0.2 0.26 0.17 0.05 0.03 0.03 0.07 0.07 0.02 0.03 0.07 0.16

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)