Heatmap: Cluster_290 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.12 0.12 0.14 0.4 0.91 0.7 0.09 0.63 0.43 0.36 0.27 0.5 0.47 0.53 0.29 0.54 0.58 1.0 0.42 0.14
0.55 0.34 0.24 0.48 0.9 0.41 0.69 0.91 0.67 0.59 0.69 0.43 0.67 0.61 0.64 0.42 0.39 0.43 1.0 0.3
0.89 0.22 0.39 0.44 0.18 0.24 0.23 0.66 0.33 0.32 0.65 0.55 0.19 0.15 0.59 0.28 0.36 0.55 1.0 0.34
0.78 0.46 0.47 0.93 1.0 0.54 0.31 0.78 0.5 0.48 0.68 0.75 0.46 0.44 0.73 0.6 0.82 0.66 0.61 0.4
0.89 0.78 0.54 0.72 0.94 0.55 0.32 1.0 0.47 0.53 0.84 0.85 0.61 0.58 0.9 0.59 0.84 0.54 0.68 0.42
0.47 0.37 0.21 0.44 0.7 0.47 0.38 0.65 0.7 0.62 1.0 0.38 0.56 0.58 0.99 0.56 0.36 0.61 0.61 0.74
0.54 0.22 0.3 0.51 0.49 0.49 0.23 0.48 0.28 0.31 0.7 0.35 0.19 0.17 0.66 0.23 0.25 0.45 0.3 1.0
0.74 0.48 0.51 0.69 0.52 0.28 0.32 0.7 0.41 0.44 0.87 0.35 0.7 0.41 1.0 0.5 0.35 0.36 0.47 0.3
0.29 0.69 0.79 0.41 0.76 0.46 0.18 0.78 0.52 0.47 0.57 0.65 0.62 0.49 0.56 0.43 0.76 1.0 0.53 0.46
0.18 0.06 0.04 0.02 0.77 0.59 0.01 0.88 0.61 0.82 1.0 0.65 0.86 0.45 0.83 0.23 0.75 0.33 0.09 0.05
0.71 0.62 0.5 0.76 0.84 0.59 0.32 0.94 0.78 0.7 1.0 0.76 0.75 0.66 0.99 0.75 0.65 0.82 0.83 0.87
0.75 0.45 0.49 0.79 0.68 0.58 0.06 0.56 0.29 0.31 0.35 0.38 0.49 0.42 0.32 0.27 0.36 0.73 0.26 1.0
0.02 0.0 0.03 0.35 0.06 0.05 0.02 0.69 0.92 0.5 0.14 0.26 0.83 1.0 0.14 0.91 0.43 0.34 0.71 0.45
0.38 0.1 0.15 0.29 0.33 0.19 0.27 0.73 0.36 0.51 0.96 0.24 0.84 0.62 1.0 0.16 0.23 0.32 0.32 0.16
0.06 0.04 0.01 0.15 0.15 0.5 0.11 0.43 0.7 0.66 0.69 0.53 1.0 0.83 0.82 0.37 0.24 0.12 0.22 0.59
0.59 0.45 0.44 0.6 0.77 0.72 0.43 0.9 0.58 0.63 1.0 0.63 0.74 0.69 0.77 0.43 0.48 0.79 0.51 0.46
0.37 0.36 0.36 0.39 0.46 0.4 0.4 0.88 0.59 0.51 0.78 0.49 1.0 0.75 0.71 0.28 0.31 0.29 0.78 0.58
0.57 0.19 0.37 0.41 0.47 0.6 0.23 0.67 0.49 0.41 0.97 0.28 1.0 0.81 0.83 0.48 0.39 0.31 0.31 0.16
0.36 0.43 0.31 0.41 0.49 0.42 0.19 0.82 0.31 0.33 0.39 0.65 0.54 0.36 0.38 0.16 0.29 0.84 1.0 0.29
1.0 0.32 0.84 0.26 0.67 0.28 0.25 0.73 0.73 0.81 1.0 0.27 0.28 0.28 0.76 0.66 0.41 0.37 0.37 0.22
0.56 0.39 0.24 1.0 0.85 0.42 0.19 0.77 0.4 0.48 0.28 0.67 0.56 0.4 0.23 0.33 0.43 0.7 0.69 0.23
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.17 1.0 0.81 0.87 0.08 0.25 0.51 0.06 0.11 0.09 0.28 0.0 0.03 0.0
1.0 0.59 0.67 0.89 0.94 0.46 0.14 0.74 0.47 0.5 0.85 0.34 0.68 0.67 0.76 0.47 0.54 0.92 0.53 0.42
0.8 0.57 0.54 0.72 0.86 0.67 0.52 0.77 0.61 0.55 0.74 0.4 0.64 0.76 0.81 0.7 1.0 0.74 0.75 0.7
0.56 0.43 0.41 0.7 0.85 0.66 0.65 0.88 0.64 0.67 1.0 0.75 0.63 0.5 0.97 0.48 0.49 0.66 0.71 0.57
0.38 0.26 0.27 0.38 0.51 0.5 0.29 0.56 0.52 0.53 0.95 0.38 0.55 0.4 1.0 0.48 0.45 0.44 0.39 0.59
0.11 0.12 0.03 0.29 0.86 0.08 0.08 0.56 0.28 0.47 0.23 0.26 0.48 0.37 0.21 0.03 0.1 1.0 0.42 0.32
0.61 0.43 0.38 0.7 0.88 0.7 0.36 0.84 0.76 0.89 0.98 0.77 0.8 0.66 1.0 0.37 0.56 0.91 0.4 0.98
0.34 0.39 0.35 0.44 0.33 0.84 0.2 0.64 0.58 0.55 0.86 0.51 1.0 0.69 0.86 0.68 0.77 0.36 0.32 0.27
0.12 0.05 0.07 0.18 0.45 0.24 0.04 0.43 0.35 0.34 0.2 0.27 1.0 0.66 0.15 0.02 0.04 0.52 0.05 0.02
0.35 0.19 0.22 0.52 0.37 0.36 0.07 1.0 0.53 0.57 0.86 0.77 0.62 0.46 0.77 0.45 0.34 0.35 0.06 0.92
0.69 0.62 0.68 0.53 0.77 1.0 0.87 0.54 0.82 0.9 0.64 0.38 0.28 0.26 0.51 0.87 0.91 0.27 0.81 0.45
0.94 0.26 0.41 0.84 1.0 0.58 0.28 0.63 0.41 0.39 0.86 0.38 0.21 0.25 0.81 0.46 0.6 0.71 0.21 0.61
0.29 0.18 0.27 0.44 0.67 1.0 0.28 0.69 0.52 0.52 0.56 0.45 0.53 0.54 0.48 0.28 0.48 0.66 0.53 0.94
1.0 0.2 0.63 0.51 0.66 0.28 0.46 1.0 0.52 0.76 0.86 0.4 0.73 0.56 0.97 0.12 0.43 0.95 0.41 0.29
0.76 0.51 0.66 0.69 0.77 1.0 0.33 0.88 0.63 0.53 0.79 0.51 0.87 0.78 0.75 0.66 0.45 0.77 0.47 0.64
0.62 0.3 0.36 0.86 0.78 1.0 0.55 0.83 0.62 0.64 0.79 0.58 0.5 0.37 0.94 0.5 0.42 0.83 0.31 0.22
0.32 0.48 0.29 0.43 0.59 0.41 0.17 0.8 0.63 0.66 0.81 0.48 1.0 0.64 0.84 0.3 0.34 0.52 0.5 0.7
0.46 0.29 0.37 0.53 0.9 1.0 0.46 0.56 0.35 0.39 0.75 0.41 0.51 0.47 0.75 0.37 0.48 0.6 0.39 0.27
0.24 0.3 0.23 0.27 0.51 0.89 0.74 1.0 0.57 0.49 0.75 0.57 0.91 0.72 0.62 0.36 0.51 0.73 0.37 0.83
0.8 0.62 0.63 0.78 0.79 0.63 0.3 0.96 0.63 0.66 0.99 0.56 0.83 0.69 1.0 0.57 0.62 0.78 0.65 0.54
0.46 0.27 0.19 0.35 0.41 0.44 0.01 1.0 0.68 0.65 0.53 0.38 0.91 0.51 0.53 0.39 0.43 0.76 0.44 0.68
0.81 0.2 0.34 0.67 0.46 0.17 0.22 0.4 0.34 0.3 1.0 0.2 0.14 0.13 0.77 0.54 0.44 0.18 0.29 0.51
0.04 0.03 0.01 0.05 0.02 0.14 0.09 1.0 0.52 0.66 0.47 0.64 0.63 0.35 0.32 0.11 0.63 0.04 0.15 0.29
0.56 0.83 1.0 0.51 0.46 0.68 0.2 0.71 0.39 0.35 0.35 0.3 0.46 0.4 0.35 0.25 0.24 0.14 0.04 0.32
0.09 0.11 0.1 0.08 0.42 0.89 0.09 0.58 0.18 0.14 0.38 0.13 0.21 0.13 0.42 0.34 0.25 1.0 0.21 0.12
0.51 0.19 0.29 0.45 0.77 0.59 0.16 0.79 0.55 0.59 0.96 0.44 0.67 0.54 1.0 0.47 0.54 0.73 0.44 0.36
0.45 0.36 0.3 0.34 0.44 0.57 0.26 0.89 0.61 0.51 1.0 0.63 0.76 0.73 0.94 0.34 0.6 0.33 0.19 0.16
0.45 1.0 0.31 0.32 0.49 0.2 0.17 0.96 0.62 0.77 0.44 0.7 0.51 0.47 0.32 0.21 0.25 1.0 0.55 0.21
0.38 0.73 0.21 0.31 0.42 0.15 0.12 0.86 0.42 0.53 0.25 0.48 1.0 0.66 0.26 0.12 0.18 0.75 0.65 0.15
0.53 0.39 0.29 0.55 0.75 0.68 0.42 1.0 0.64 0.62 0.93 0.72 0.84 0.66 0.84 0.51 0.51 0.79 0.77 0.83
0.42 0.44 0.57 0.5 0.89 0.46 0.23 0.74 0.52 0.51 0.48 0.61 0.5 0.39 0.61 0.48 0.65 1.0 0.52 0.38
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.07 0.35 0.85 1.0 0.65 0.86 0.58 0.36 0.82 0.04 0.07 0.0 0.11 0.15
0.27 0.39 0.36 0.57 0.73 0.85 0.17 0.98 0.71 0.7 0.59 0.73 0.73 0.6 0.56 0.45 0.59 1.0 0.38 0.47
0.72 0.25 0.46 1.0 0.48 0.62 0.37 0.66 0.23 0.25 0.64 0.54 0.19 0.2 0.63 0.31 0.35 0.57 0.27 0.49
0.6 0.39 0.49 0.52 0.39 0.28 0.28 0.54 0.51 0.5 0.99 0.27 0.55 0.41 0.88 1.0 0.76 0.32 0.34 0.42
0.81 0.44 0.61 1.0 0.78 0.54 0.33 0.91 0.59 0.6 0.92 0.83 0.7 0.59 0.88 0.5 0.67 0.68 0.63 0.65
0.09 0.05 0.13 0.5 0.57 0.01 0.0 0.43 0.15 0.21 0.15 0.34 0.31 0.16 0.12 0.06 0.1 1.0 0.19 0.07
0.55 0.21 0.3 1.0 0.57 0.31 0.22 0.4 0.26 0.22 0.37 0.2 0.46 0.4 0.38 0.32 0.24 0.53 0.58 0.39
0.63 0.0 0.37 0.57 0.38 0.42 0.19 0.98 0.44 0.8 0.17 0.36 1.0 0.39 0.47 0.0 0.63 0.31 0.31 0.17
0.44 0.25 0.48 0.5 0.59 0.36 0.09 0.59 0.44 0.41 0.44 0.54 0.29 0.31 0.43 0.46 1.0 0.48 0.48 0.25
0.52 0.14 0.21 0.39 0.45 0.34 0.1 0.82 0.52 0.56 0.87 0.25 1.0 0.78 0.84 0.21 0.24 0.87 0.59 0.12
0.47 0.23 0.3 0.5 0.66 0.42 0.11 0.9 0.6 0.61 0.81 1.0 0.58 0.47 0.81 0.31 0.51 0.66 0.33 0.31
0.28 0.41 0.15 0.34 0.6 1.0 0.2 0.5 0.36 0.27 0.23 0.28 0.73 0.67 0.21 0.25 0.22 0.39 0.36 0.39
0.54 0.65 0.43 0.71 1.0 0.81 0.39 0.78 0.66 0.56 0.77 0.56 0.5 0.51 0.84 0.63 0.58 0.91 0.76 0.58
0.82 0.46 0.6 0.88 0.64 0.86 0.37 0.78 0.54 0.55 0.99 0.36 0.62 0.52 1.0 0.65 0.79 0.53 0.67 0.6
0.76 0.28 0.41 0.55 0.57 0.54 0.2 0.65 0.43 0.43 1.0 0.33 0.77 0.62 0.92 0.35 0.25 0.29 0.49 0.19
0.68 0.41 0.5 0.69 0.77 0.66 0.4 0.87 0.4 0.41 0.62 0.56 0.66 0.53 0.57 0.36 0.46 0.69 0.69 1.0
0.33 0.29 0.38 0.43 0.59 0.18 0.38 0.38 0.32 0.44 0.45 0.3 0.18 0.17 0.36 0.49 1.0 0.5 0.25 0.24
0.35 0.44 0.4 0.59 0.89 0.4 0.36 0.56 0.37 0.45 0.84 0.33 0.54 0.38 0.78 0.51 1.0 0.72 0.6 0.3
0.63 0.32 0.54 0.61 0.47 0.41 0.07 0.87 0.47 0.43 0.67 0.22 1.0 0.8 0.66 0.17 0.18 0.41 0.2 0.19
0.52 0.2 0.44 1.0 0.43 0.14 0.01 0.75 0.39 0.4 0.86 0.44 0.83 0.64 0.81 0.2 0.27 0.15 0.08 0.09
0.11 0.13 0.06 0.19 0.2 0.09 0.0 0.85 0.49 0.47 0.21 0.46 1.0 0.72 0.17 0.2 0.21 0.37 0.17 0.12
0.89 0.47 0.35 0.46 0.6 0.49 0.3 0.57 0.4 0.37 0.99 0.18 0.73 0.44 1.0 0.34 0.27 0.42 0.67 0.29
0.44 0.44 0.27 0.69 1.0 0.65 0.69 0.73 0.38 0.54 0.51 0.1 0.9 0.65 0.54 0.17 0.2 0.69 0.24 0.17
0.68 0.72 0.42 0.73 0.65 0.61 0.44 0.87 0.82 0.64 0.98 0.37 0.9 0.81 1.0 0.72 0.52 0.46 0.81 0.46
0.16 0.11 0.07 0.1 0.22 1.0 0.15 0.89 0.54 0.44 0.68 0.67 0.67 0.62 0.65 0.45 0.42 0.15 0.55 0.45
0.59 0.4 0.32 0.59 0.65 1.0 0.47 0.54 0.28 0.32 0.38 0.29 0.68 0.58 0.39 0.26 0.19 0.56 0.94 0.46
0.78 0.73 0.21 0.9 1.0 0.4 0.28 0.52 0.42 0.21 0.05 0.23 0.43 0.24 0.05 0.05 0.05 0.5 0.38 0.06
0.95 0.86 0.8 0.85 0.89 0.82 0.6 0.99 0.75 0.66 0.98 0.65 0.67 0.58 1.0 0.59 0.73 0.84 0.91 0.92
0.39 0.26 0.06 0.76 0.85 0.25 0.18 1.0 0.75 0.56 0.19 0.17 0.97 0.47 0.17 0.03 0.06 0.57 0.27 0.19
0.13 0.08 0.29 0.09 0.28 0.05 0.0 1.0 0.55 0.53 0.29 0.42 0.22 0.29 0.16 0.08 0.17 0.56 0.23 0.88
0.9 0.72 0.48 0.96 1.0 0.87 0.26 0.88 0.56 0.51 0.62 0.75 0.77 0.55 0.57 0.55 0.73 0.84 0.8 0.37
0.59 0.27 0.42 0.58 0.63 0.37 0.23 0.57 0.43 0.48 1.0 0.38 0.51 0.36 0.86 0.37 0.47 0.34 0.34 0.31
0.83 0.44 0.52 0.7 1.0 0.93 0.2 0.64 0.84 0.58 0.7 0.28 0.48 0.52 0.68 0.57 0.52 0.3 0.32 0.42
0.45 0.26 0.33 0.57 0.7 1.0 0.29 0.51 0.35 0.4 0.77 0.33 0.38 0.42 0.71 0.46 0.6 0.53 0.52 0.54
0.92 0.62 0.63 0.79 0.68 0.74 0.39 0.74 0.8 0.63 1.0 0.49 0.66 0.56 0.97 0.66 0.47 0.51 0.61 0.51
0.32 0.32 0.29 0.55 0.63 0.47 0.13 0.63 0.5 0.52 0.52 0.41 0.59 0.46 0.46 0.27 0.32 1.0 0.32 0.25
0.49 0.21 0.17 0.42 0.6 0.46 0.47 0.65 0.42 0.46 0.52 0.33 1.0 0.64 0.51 0.2 0.27 0.41 0.38 0.27
0.37 0.2 0.15 0.23 0.53 0.3 0.51 0.57 0.41 0.43 0.43 0.33 1.0 0.84 0.39 0.16 0.3 0.34 0.18 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.37 0.01 0.33 0.7 0.67 0.55 0.56 0.65 0.86 0.72 1.0 0.07 0.11 0.03 0.19
0.54 0.29 0.36 0.51 0.76 0.34 0.35 0.63 0.46 0.41 0.96 0.36 0.24 0.25 1.0 0.55 0.5 0.47 0.35 0.67
0.17 0.1 0.12 0.32 0.38 0.49 0.07 1.0 0.69 0.74 0.82 0.58 0.86 0.81 0.7 0.59 0.71 0.8 0.19 0.37
0.66 0.43 0.59 0.76 0.68 0.39 0.41 0.71 0.59 0.51 0.91 0.41 0.55 0.4 1.0 0.75 0.65 0.72 0.34 0.34
0.1 0.32 0.17 0.05 0.11 0.0 0.86 0.76 0.65 0.57 0.38 0.54 1.0 0.74 0.38 0.14 0.2 0.04 0.25 0.5
0.48 0.28 0.23 0.52 0.53 0.35 0.19 0.57 0.58 0.49 1.0 0.36 0.35 0.35 0.78 0.59 0.35 0.57 0.47 0.29
0.3 0.48 0.28 0.39 0.68 0.68 0.36 0.65 0.6 0.57 1.0 0.38 0.68 0.54 0.87 0.47 0.51 0.5 0.5 0.52
0.49 0.5 0.71 0.83 1.0 0.15 0.18 0.78 0.59 0.25 0.43 0.39 0.2 0.37 0.34 0.34 0.43 0.4 0.25 0.13
0.42 0.27 0.2 0.38 0.63 0.13 0.1 0.91 0.91 0.76 0.38 0.66 1.0 0.75 0.34 0.06 0.11 0.82 0.08 0.03
0.49 0.41 0.59 0.75 0.71 0.78 0.68 0.78 0.48 0.54 0.89 0.46 0.92 1.0 0.82 0.41 0.65 0.67 0.68 0.6
0.46 0.18 0.23 0.33 0.88 0.73 0.46 0.73 0.6 0.49 0.92 0.5 0.65 0.75 0.84 0.57 0.55 0.8 0.54 1.0
0.5 0.26 0.31 0.42 0.86 0.99 0.4 0.76 0.5 0.43 0.72 0.45 0.77 0.69 0.7 0.39 0.43 0.89 1.0 0.81

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)