Heatmap: Cluster_322 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.56 0.42 0.62 0.51 0.71 0.63 0.54 0.68 0.46 0.45 0.7 0.46 0.48 0.39 0.79 0.42 0.52 0.8 0.73 1.0
0.59 0.94 0.62 0.38 0.78 0.45 0.51 0.62 0.51 0.54 0.92 0.53 0.33 0.26 1.0 0.55 0.6 0.78 0.97 0.51
1.0 0.48 0.62 0.92 0.61 0.64 0.24 0.61 0.29 0.29 0.26 0.33 0.05 0.07 0.26 0.34 0.37 0.87 0.59 0.21
0.48 1.0 0.75 0.52 0.45 0.23 0.33 0.63 0.42 0.33 0.52 0.23 0.6 0.69 0.42 0.2 0.19 0.54 0.54 0.17
0.88 0.33 1.0 0.55 0.44 0.27 0.25 0.64 0.3 0.17 0.54 0.21 0.48 0.27 0.55 0.35 0.36 0.52 0.11 0.44
0.44 0.46 0.5 0.47 0.6 0.15 0.01 0.5 0.38 0.32 0.1 0.19 0.2 0.27 0.09 0.24 0.32 1.0 0.47 0.12
0.71 0.28 0.26 0.51 0.42 0.5 0.27 0.47 0.33 0.24 0.8 0.16 0.75 0.65 1.0 0.2 0.14 0.74 0.32 0.29
0.55 0.67 1.0 0.39 0.49 0.32 0.47 0.4 0.4 0.36 0.49 0.18 0.27 0.27 0.45 0.25 0.24 0.4 0.47 0.48
0.45 0.64 0.26 0.21 0.8 0.38 0.15 0.79 0.68 0.72 1.0 0.67 0.74 0.59 0.8 0.9 0.96 0.88 0.41 0.55
0.35 0.26 0.3 0.34 0.56 0.28 0.14 0.51 0.55 0.57 0.41 0.56 0.4 0.38 0.54 1.0 0.77 0.81 0.25 0.49
0.27 0.42 0.31 0.45 0.46 0.26 0.13 0.58 0.51 0.43 0.46 0.51 0.22 0.25 0.47 1.0 0.57 0.95 0.6 0.42
0.6 0.41 0.47 0.44 1.0 0.52 0.37 0.51 0.27 0.24 0.54 0.38 0.11 0.09 0.61 0.28 0.36 0.68 0.89 0.43
0.71 0.46 0.67 0.59 0.99 0.44 0.5 0.76 0.54 0.48 0.68 0.6 0.33 0.32 0.7 0.5 1.0 1.0 0.8 0.55
0.78 0.85 0.7 0.69 0.71 0.16 0.25 0.71 0.4 0.28 0.63 0.28 0.65 0.59 0.28 0.3 0.25 1.0 0.23 0.84
1.0 0.69 0.68 0.71 0.79 0.1 0.15 0.43 0.22 0.17 0.04 0.18 0.14 0.15 0.14 0.39 0.18 0.6 0.69 0.32
0.55 1.0 0.58 0.49 0.75 0.36 0.32 0.38 0.17 0.19 0.33 0.2 0.29 0.18 0.36 0.28 0.21 0.44 0.92 0.23
0.73 1.0 0.7 0.24 0.64 0.0 0.1 0.33 0.18 0.08 0.5 0.24 0.34 0.43 0.19 0.3 0.0 0.4 0.43 0.0
0.49 0.64 0.74 1.0 0.71 0.19 0.31 0.24 0.18 0.13 0.12 0.11 0.24 0.23 0.16 0.1 0.07 0.38 0.79 0.19
0.68 0.43 0.49 0.72 0.64 0.12 0.27 0.5 0.6 0.5 0.26 0.16 0.48 0.5 0.21 0.48 0.41 0.58 0.82 1.0
0.79 0.62 0.85 0.65 0.9 0.37 0.56 0.65 0.54 0.51 1.0 0.59 0.39 0.35 1.0 0.51 0.65 0.62 0.6 0.76
0.7 0.54 0.39 0.55 0.6 0.26 0.36 0.39 0.33 0.36 0.78 0.18 0.24 0.17 0.76 0.3 0.34 0.33 1.0 0.29
0.36 0.5 0.62 0.55 0.79 0.61 0.76 0.54 0.51 0.46 0.63 0.45 0.13 0.14 0.63 0.36 0.29 0.74 1.0 0.54
1.0 0.81 0.92 0.65 0.79 0.23 0.36 0.55 0.36 0.33 0.52 0.43 0.18 0.12 0.34 0.31 0.21 0.59 1.0 0.06
0.55 0.5 0.48 1.0 0.69 0.23 0.17 0.28 0.11 0.21 0.24 0.19 0.02 0.04 0.14 0.05 0.15 0.44 0.6 0.18
1.0 0.97 0.75 0.82 0.73 0.85 0.42 0.62 0.53 0.43 0.88 0.37 0.27 0.24 0.89 0.88 0.69 0.76 0.94 0.51
0.69 0.88 1.0 0.35 0.63 0.24 0.37 0.51 0.5 0.46 0.63 0.3 0.51 0.52 0.35 0.4 0.39 0.46 0.35 0.53
0.68 0.89 0.79 0.77 1.0 0.78 0.21 0.69 0.57 0.6 0.68 0.58 0.13 0.15 0.67 0.79 0.56 0.6 0.5 0.35
0.47 0.56 0.52 0.71 0.59 0.68 0.21 0.7 0.73 0.64 0.63 0.41 0.58 0.61 0.75 1.0 0.79 0.91 0.56 0.4
0.43 0.74 0.36 0.63 0.85 0.45 0.14 0.46 0.26 0.25 0.31 0.18 0.48 0.36 0.29 0.14 0.18 0.78 1.0 0.09
0.57 1.0 0.67 0.97 0.78 0.45 0.32 0.6 0.4 0.41 0.67 0.32 0.39 0.28 0.57 0.27 0.19 0.63 0.74 0.26
0.55 0.62 0.53 0.55 0.89 1.0 0.31 0.62 0.37 0.38 0.68 0.4 0.7 0.65 0.77 0.36 0.49 0.53 0.88 0.72
0.66 0.52 0.61 0.66 0.62 0.4 0.53 0.44 0.39 0.43 0.87 0.37 0.13 0.12 0.97 0.49 0.42 0.57 1.0 0.36
0.14 0.28 0.37 0.38 0.4 0.12 0.02 0.56 0.49 0.37 0.25 0.44 0.04 0.16 0.27 0.47 1.0 0.89 0.46 0.19
0.88 0.47 1.0 0.68 0.88 0.34 0.36 0.52 0.28 0.27 0.46 0.45 0.1 0.12 0.56 0.32 0.52 0.53 0.4 0.83
0.85 0.39 1.0 0.63 0.87 0.34 0.41 0.57 0.3 0.29 0.66 0.46 0.08 0.11 0.53 0.26 0.52 0.46 0.23 0.79
0.68 1.0 0.82 0.65 0.65 0.34 0.38 0.44 0.26 0.35 0.3 0.24 0.23 0.19 0.41 0.18 0.19 0.54 0.46 0.25
0.39 0.3 0.46 1.0 0.74 0.11 0.13 0.39 0.18 0.08 0.26 0.32 0.46 0.5 0.19 0.11 0.19 0.65 0.45 0.03
0.78 0.5 0.6 1.0 0.81 0.34 0.25 0.27 0.1 0.1 0.16 0.27 0.06 0.07 0.12 0.1 0.12 0.53 0.46 0.13
0.38 0.6 0.22 0.34 0.69 0.53 0.58 0.38 0.21 0.23 0.36 0.34 0.17 0.22 0.35 0.43 0.33 0.6 1.0 0.41
0.37 0.7 0.36 0.35 0.66 0.49 0.37 0.35 0.18 0.15 0.21 0.3 0.11 0.12 0.23 0.25 0.28 0.66 1.0 0.36
0.45 0.6 1.0 0.53 0.63 0.22 0.24 0.22 0.19 0.2 0.21 0.14 0.15 0.08 0.29 0.03 0.1 0.56 0.77 0.0
0.61 0.66 0.48 0.36 0.73 0.43 0.47 0.54 0.37 0.4 0.54 0.24 0.43 0.33 0.53 0.24 0.2 0.54 1.0 0.41
0.71 0.61 0.62 1.0 0.98 0.64 0.59 0.63 0.42 0.38 0.7 0.51 0.14 0.15 0.93 0.18 0.29 0.49 0.45 0.35
0.63 0.46 0.5 1.0 0.69 0.23 0.24 0.46 0.27 0.26 0.33 0.16 0.28 0.25 0.27 0.27 0.15 0.54 0.75 0.2
0.62 0.75 0.66 0.38 0.67 0.28 0.36 0.72 0.39 0.38 0.55 0.33 0.44 0.3 0.5 0.26 0.23 0.67 1.0 0.11
1.0 0.64 0.8 0.85 0.76 0.58 0.54 0.53 0.35 0.32 0.33 0.31 0.26 0.22 0.34 0.29 0.43 0.54 0.5 0.29
0.63 0.54 0.6 1.0 0.9 0.87 0.83 0.72 0.51 0.6 0.78 0.58 0.25 0.23 0.81 0.36 0.54 0.82 0.72 0.89
0.44 0.64 1.0 0.63 0.55 0.33 0.37 0.67 0.75 0.7 0.6 0.71 0.3 0.28 0.52 0.63 0.85 0.51 0.92 0.5
0.67 0.75 0.79 1.0 0.62 0.6 0.38 0.77 0.53 0.58 0.9 0.44 0.36 0.26 0.84 0.33 0.38 0.68 1.0 0.35
0.88 0.95 0.75 0.78 0.93 1.0 0.41 0.61 0.31 0.23 0.57 0.34 0.46 0.32 0.61 0.33 0.27 0.71 0.95 0.34
0.33 0.73 0.28 0.35 0.86 0.7 0.64 0.53 0.45 0.47 0.83 0.4 0.1 0.09 0.87 0.32 0.26 0.97 1.0 0.69
1.0 0.47 0.56 0.49 0.67 0.65 0.36 0.58 0.4 0.34 0.57 0.4 0.24 0.21 0.58 0.51 0.48 0.84 0.53 0.41
0.49 1.0 0.63 0.52 0.62 0.4 0.62 0.48 0.52 0.49 0.78 0.4 0.38 0.35 0.8 0.35 0.38 0.6 0.8 0.61
0.78 0.48 0.99 0.41 0.74 0.38 0.49 0.72 0.46 0.48 1.0 0.54 0.39 0.28 0.88 0.32 0.5 0.56 0.74 0.44
0.75 1.0 0.92 0.5 0.8 0.58 0.25 0.61 0.51 0.56 0.87 0.46 0.1 0.08 0.74 0.36 0.56 0.7 0.49 0.32
0.44 0.71 0.37 0.45 0.66 0.53 0.46 0.6 0.44 0.49 0.95 0.34 0.35 0.3 1.0 0.36 0.32 0.91 0.91 0.41
0.66 0.89 0.8 0.57 0.61 0.45 0.43 0.51 0.48 0.45 0.59 0.37 0.33 0.25 0.6 0.37 0.42 0.49 1.0 0.37
0.35 0.99 0.63 0.3 0.54 0.38 0.46 0.51 0.41 0.46 0.57 0.36 0.47 0.38 0.59 0.39 0.44 0.53 1.0 0.59
0.35 1.0 0.67 0.47 0.6 0.37 0.56 0.5 0.43 0.46 0.88 0.36 0.25 0.17 0.78 0.28 0.39 0.51 0.97 0.55
0.52 0.38 0.44 0.44 0.4 0.37 0.32 0.5 0.44 0.48 1.0 0.31 0.41 0.47 0.98 0.42 0.43 0.66 0.42 0.81
0.71 0.79 0.87 0.65 1.0 0.29 0.36 0.5 0.28 0.28 0.26 0.18 0.52 0.4 0.28 0.19 0.19 0.48 0.83 0.26
0.46 0.3 0.41 0.48 0.62 0.63 0.24 0.49 0.47 0.43 0.39 0.36 0.26 0.3 0.47 0.62 0.48 1.0 0.48 0.49
0.37 0.2 0.62 1.0 0.56 0.1 0.06 0.21 0.11 0.11 0.08 0.24 0.01 0.02 0.05 0.08 0.1 0.42 0.45 0.02
0.79 0.32 0.37 1.0 0.79 0.32 0.2 0.6 0.31 0.19 0.36 0.23 0.48 0.46 0.32 0.21 0.22 0.54 0.66 0.12
0.9 0.41 0.88 0.91 0.98 0.53 0.24 0.64 0.28 0.31 0.34 0.36 0.46 0.35 0.41 0.23 0.45 1.0 0.44 0.4
0.51 0.84 0.71 0.75 1.0 0.24 0.32 0.47 0.41 0.35 0.37 0.43 0.55 0.49 0.34 0.28 0.28 0.51 0.81 0.28
0.66 0.25 0.41 0.47 0.53 0.19 0.05 0.51 0.49 0.43 0.38 0.21 0.23 0.23 0.35 0.61 0.48 1.0 0.44 0.35
1.0 0.46 0.53 0.47 0.75 0.46 0.32 0.63 0.46 0.48 0.35 0.4 0.23 0.19 0.46 0.28 0.28 0.6 0.7 0.18
0.34 0.36 0.21 0.66 0.75 0.44 0.14 0.48 0.25 0.27 0.5 0.22 0.55 0.48 0.45 0.13 0.23 0.73 1.0 0.09
0.5 0.49 0.92 0.86 0.71 0.36 0.35 0.53 0.35 0.47 0.49 0.38 0.28 0.16 0.47 0.29 0.39 0.8 1.0 0.55
0.84 0.84 0.98 0.67 0.65 0.65 0.7 0.81 0.63 0.65 1.0 0.71 0.48 0.42 0.93 0.6 0.7 0.72 0.93 0.58
0.67 1.0 0.82 0.79 0.73 0.16 0.24 0.51 0.45 0.39 0.65 0.34 0.19 0.06 0.64 0.24 0.22 0.62 0.58 0.38

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)