Heatmap: Cluster_266 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.77 0.46 0.65 0.56 0.39 0.56 0.22 0.76 0.66 0.6 1.0 0.55 0.61 0.73 0.71 0.64 0.67 0.42 0.6 0.48
0.64 0.65 0.54 0.73 0.93 1.0 0.36 0.92 0.59 0.56 0.72 0.77 0.76 0.67 0.79 0.83 0.77 0.8 0.49 0.5
0.34 0.19 0.19 0.21 0.2 0.42 0.12 0.35 0.36 0.39 1.0 0.24 0.33 0.28 0.99 0.28 0.32 0.16 0.1 0.2
0.03 0.16 0.07 0.07 0.24 0.1 0.04 0.48 0.59 0.53 1.0 0.32 0.31 0.2 0.99 0.36 0.16 0.27 0.11 0.05
0.49 0.48 0.51 0.45 0.86 0.83 0.35 0.63 0.5 0.46 0.74 0.45 0.43 0.44 0.76 0.46 0.5 1.0 0.55 0.63
0.27 0.25 0.27 0.47 0.59 0.86 0.1 0.7 0.65 0.68 1.0 0.61 0.75 0.65 0.88 0.54 0.75 0.69 0.35 0.28
0.52 0.13 0.24 0.43 0.35 0.35 0.18 0.48 0.31 0.26 1.0 0.35 0.15 0.18 0.88 0.87 0.56 0.47 0.01 0.02
0.59 0.26 0.27 0.71 0.37 0.49 0.1 0.76 0.62 0.74 0.95 0.43 0.57 0.35 1.0 0.64 0.76 0.19 0.0 0.1
0.48 0.23 0.57 0.86 1.0 0.72 0.04 0.43 0.33 0.39 0.83 0.44 0.56 0.6 0.53 0.21 0.3 0.4 0.19 0.57
0.46 0.79 0.88 1.0 0.75 0.38 0.06 0.29 0.43 0.35 0.52 0.38 0.35 0.43 0.43 0.12 0.38 0.46 0.16 0.63
0.96 0.53 0.48 0.77 0.82 0.72 0.53 0.8 0.63 0.63 0.76 0.6 0.79 0.82 0.75 0.66 0.67 1.0 0.37 0.47
0.23 0.32 0.24 0.19 0.27 0.35 0.35 0.61 0.61 0.62 1.0 0.39 0.56 0.42 0.97 0.76 0.65 0.44 0.34 0.31
0.46 0.58 0.3 0.35 0.65 0.38 0.26 0.59 0.74 0.75 0.9 0.38 0.67 0.45 1.0 0.53 0.41 0.57 0.46 0.25
0.8 0.51 0.56 0.56 0.71 0.47 0.37 0.76 0.77 0.77 1.0 0.6 0.97 0.74 0.85 0.68 0.56 0.77 0.52 0.41
0.97 0.65 0.74 0.84 1.0 0.67 0.42 0.83 0.77 0.74 0.74 0.57 0.74 0.64 0.74 0.26 0.41 0.87 0.88 0.46
0.04 0.0 0.02 0.38 0.65 1.0 0.0 0.37 0.41 0.7 0.44 0.23 0.45 0.24 0.51 0.23 0.32 0.07 0.0 0.01
0.5 0.22 0.24 0.56 0.48 1.0 0.21 0.85 0.67 0.53 0.6 0.57 0.57 0.53 0.52 0.8 0.73 0.45 0.12 0.39
0.35 0.46 0.18 0.4 0.67 0.22 0.06 0.87 1.0 0.9 0.66 0.27 0.66 0.45 0.84 0.4 0.39 0.66 0.07 0.14
0.48 0.05 0.25 0.49 0.28 0.7 0.23 0.56 0.48 0.52 0.48 0.47 0.27 0.32 0.31 0.87 1.0 0.08 0.01 0.16
0.7 0.61 0.46 0.67 0.49 0.55 0.53 0.92 0.82 0.78 0.78 0.64 0.24 0.21 0.88 0.67 1.0 0.56 0.55 0.36
0.45 0.36 0.28 0.6 0.65 0.43 0.3 0.94 0.76 0.71 1.0 0.48 0.92 0.72 0.99 0.42 0.43 0.7 0.51 0.35
0.93 0.57 0.7 0.41 0.4 0.98 0.09 1.0 0.78 0.55 0.54 0.86 0.27 0.26 0.23 0.12 0.49 0.78 0.34 0.42
0.41 0.86 0.22 1.0 0.75 0.36 0.0 0.76 0.69 0.57 0.34 0.16 0.41 0.47 0.21 0.3 0.27 0.96 0.0 0.01
0.63 0.42 0.41 0.45 0.5 0.29 0.01 0.73 0.4 0.31 1.0 0.5 0.51 0.48 0.85 0.37 0.45 0.32 0.11 0.15
0.44 0.27 0.37 0.56 0.64 0.99 0.34 0.91 0.78 0.73 1.0 0.48 0.96 0.88 0.99 0.81 0.78 0.82 0.43 0.35
0.82 0.84 0.49 0.75 1.0 0.48 0.62 0.86 0.72 0.8 0.92 0.33 0.68 0.48 0.95 0.52 0.33 0.52 0.75 0.43
0.44 0.28 0.26 0.49 0.25 0.3 0.14 0.44 0.37 0.34 1.0 0.13 0.3 0.27 0.72 0.39 0.3 0.22 0.06 0.04
1.0 0.95 0.72 0.84 0.71 0.58 0.3 0.7 0.66 0.59 0.98 0.25 0.71 0.55 0.92 0.8 0.57 0.48 0.11 0.11
0.81 0.77 0.57 0.96 0.49 0.65 0.24 0.64 0.64 0.52 1.0 0.24 0.23 0.17 0.77 0.65 0.53 0.4 0.14 0.07
0.13 0.37 0.17 0.38 0.79 1.0 0.19 0.33 0.45 0.46 0.16 0.48 0.33 0.36 0.18 0.22 0.31 0.44 0.2 0.25
0.23 0.15 0.21 0.25 0.2 0.18 0.22 0.6 0.67 0.8 0.95 0.56 0.3 0.26 1.0 0.54 0.68 0.1 0.01 0.03
0.11 0.05 0.07 0.35 0.72 0.6 0.03 0.56 0.51 0.49 0.99 0.59 1.0 0.84 0.99 0.34 0.52 0.58 0.0 0.05
0.16 0.13 0.34 0.36 0.56 1.0 0.08 0.39 0.24 0.33 0.37 0.33 0.39 0.36 0.31 0.29 0.53 0.48 0.01 0.78
0.52 0.81 0.62 0.72 1.0 0.73 0.34 0.6 0.45 0.46 0.69 0.59 0.59 0.5 0.67 0.43 0.34 0.84 0.48 0.37
0.69 0.36 0.59 0.6 0.85 0.18 0.3 0.65 0.61 0.59 1.0 0.41 0.46 0.44 0.99 0.62 0.53 0.61 0.4 0.47
0.75 0.91 0.49 0.69 0.68 0.28 0.54 0.88 1.0 0.69 0.87 0.47 0.67 0.5 0.99 0.95 0.83 0.69 0.35 0.31
0.81 0.49 0.76 0.82 1.0 0.63 0.18 0.98 0.65 0.64 0.77 0.7 0.49 0.44 0.64 0.69 0.8 0.47 0.49 0.29
0.69 0.36 0.58 0.51 0.62 0.65 0.18 0.76 0.54 0.5 0.84 0.51 0.27 0.24 0.77 0.53 1.0 0.39 0.46 0.32
0.52 0.53 0.5 0.52 0.83 0.19 0.27 0.75 0.78 0.71 1.0 0.52 0.41 0.33 0.96 0.43 0.35 0.65 0.53 0.32
1.0 0.4 0.39 0.79 0.79 0.31 0.38 0.72 0.85 0.67 0.91 0.63 0.57 0.53 0.81 0.87 0.69 0.39 0.2 0.54
0.91 0.32 0.31 0.65 0.81 0.38 0.38 0.72 0.88 0.71 0.95 0.56 0.88 0.7 0.93 1.0 0.91 0.46 0.24 0.47
0.8 0.43 0.3 0.85 0.78 0.31 0.29 0.71 0.69 0.55 0.95 0.6 1.0 0.75 0.99 0.69 0.84 0.42 0.36 0.41
1.0 0.71 0.43 0.8 0.82 0.47 0.3 0.88 0.66 0.57 0.91 0.65 0.96 0.77 0.94 0.74 0.82 0.62 0.5 0.48
0.47 0.23 0.32 0.56 0.64 0.93 0.32 1.0 0.67 0.57 0.95 0.73 0.65 0.62 0.86 0.71 0.91 0.86 0.46 0.42
0.75 0.38 0.75 0.4 0.43 0.44 0.98 0.8 0.68 0.55 0.86 0.51 0.5 0.39 0.78 1.0 0.79 0.3 0.79 0.37
0.06 0.07 0.08 0.07 0.21 0.08 0.03 0.54 0.53 0.47 1.0 0.28 0.34 0.23 0.96 0.34 0.3 0.17 0.05 0.05
0.48 0.25 0.27 0.63 1.0 0.2 0.15 0.49 0.37 0.41 0.58 0.65 0.09 0.08 0.54 0.3 0.43 0.44 0.52 0.16
0.53 0.43 0.36 0.71 0.96 0.47 0.18 0.61 0.48 0.42 0.92 1.0 0.05 0.07 0.67 0.37 0.57 0.46 0.86 0.19
0.38 0.62 0.34 0.33 0.48 0.95 0.21 0.95 0.5 0.61 1.0 0.77 0.89 0.6 0.79 0.29 0.66 0.33 0.49 0.18
0.03 0.01 0.02 0.06 0.4 1.0 0.01 0.3 0.29 0.35 0.4 0.35 0.13 0.17 0.45 0.19 0.3 0.52 0.14 0.25
0.78 0.63 0.73 0.87 0.92 0.9 0.51 0.74 0.58 0.56 0.93 0.43 0.67 0.57 0.88 0.64 0.58 1.0 0.84 0.75
0.66 0.42 0.49 0.67 0.82 0.31 0.33 0.86 0.97 1.0 1.0 0.52 0.8 0.75 0.99 0.94 0.92 0.78 0.25 0.94
0.91 0.73 0.7 0.66 0.75 0.77 0.42 0.91 0.79 0.6 1.0 0.49 0.73 0.58 0.96 0.64 0.63 0.66 0.48 0.49
0.7 0.76 0.46 0.71 0.67 0.61 0.23 0.95 0.77 0.72 0.94 0.51 0.85 0.75 1.0 0.71 0.59 0.78 0.32 0.31
0.37 0.31 0.15 0.46 0.48 0.17 0.08 0.73 0.46 0.45 1.0 0.4 0.61 0.38 0.89 0.29 0.33 0.34 0.07 0.15
0.6 0.2 0.42 0.4 1.0 0.19 0.12 0.74 0.75 0.8 0.76 0.78 0.79 0.67 0.39 0.44 0.33 0.28 0.0 0.0
0.7 0.55 0.4 0.71 1.0 0.73 0.35 0.63 0.34 0.35 0.96 0.79 0.15 0.18 0.85 0.28 0.6 0.61 0.45 0.63
0.72 0.43 0.36 0.64 0.69 0.58 0.23 0.84 0.76 0.68 0.96 0.48 0.88 0.64 0.92 1.0 0.75 0.74 0.25 0.28
0.24 0.18 0.16 0.29 0.33 0.74 0.04 0.5 0.4 0.38 1.0 0.19 0.23 0.18 0.9 0.47 0.45 0.45 0.2 0.1
0.58 0.63 0.54 0.57 0.75 0.51 0.36 0.59 0.48 0.46 0.9 0.61 0.3 0.29 1.0 0.45 0.51 0.7 0.5 0.53
0.59 0.36 0.48 0.36 0.34 0.26 0.85 0.8 0.36 0.3 1.0 0.44 0.8 0.58 0.72 0.95 0.38 0.48 0.39 0.39
0.59 0.85 0.73 0.6 0.85 0.6 0.71 0.67 0.65 0.63 0.87 0.57 0.25 0.21 0.87 0.51 0.69 0.75 0.71 1.0
0.65 0.17 0.26 0.41 0.43 0.62 0.06 0.74 0.61 0.81 0.55 0.43 1.0 0.52 0.51 0.54 0.77 0.14 0.0 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)