Heatmap: Cluster_321 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.17 0.13 0.12 0.1 0.15 1.0 0.04 0.4 0.27 0.27 0.63 0.3 0.14 0.12 0.52 0.2 0.41 0.18 0.01 0.27
0.49 0.56 0.63 0.34 0.5 1.0 0.62 0.46 0.25 0.28 0.35 0.26 0.35 0.27 0.38 0.15 0.3 0.46 0.18 0.53
0.63 0.39 0.46 0.49 0.44 1.0 0.3 0.58 0.31 0.3 0.52 0.29 0.31 0.24 0.57 0.26 0.28 0.54 0.45 0.45
0.64 0.26 0.46 0.28 0.69 1.0 0.36 0.57 0.43 0.32 0.52 0.37 0.55 0.57 0.54 0.32 0.33 0.59 0.29 0.61
0.62 0.38 0.64 0.63 0.67 0.72 0.44 0.7 0.5 0.47 0.96 0.45 0.49 0.39 1.0 0.5 0.71 0.58 0.9 0.76
0.26 0.67 0.27 0.35 0.72 0.76 0.5 0.73 0.53 0.44 1.0 0.6 0.69 0.58 0.93 0.3 0.38 0.62 0.9 0.52
0.43 0.18 0.45 0.26 0.63 1.0 0.13 0.39 0.2 0.16 0.43 0.39 0.19 0.14 0.34 0.07 0.32 0.17 0.04 0.11
0.05 0.0 0.04 0.0 0.08 1.0 0.21 0.39 0.16 0.19 0.2 0.11 0.05 0.03 0.05 0.09 0.14 0.18 0.28 0.16
0.4 0.41 0.3 0.39 0.43 0.5 0.27 0.66 0.47 0.41 1.0 0.44 0.26 0.23 0.89 0.46 0.53 0.31 0.28 0.17
1.0 0.2 0.34 0.63 0.42 0.51 0.01 0.49 0.11 0.17 0.1 0.3 0.23 0.17 0.12 0.07 0.29 0.07 0.01 0.15
0.24 0.39 0.21 0.27 0.48 1.0 0.46 0.47 0.27 0.24 0.3 0.36 0.32 0.31 0.29 0.2 0.3 0.53 0.49 0.51
0.42 0.34 0.29 0.44 0.53 0.96 0.68 0.54 0.32 0.35 0.95 0.44 0.3 0.26 1.0 0.35 0.38 0.45 0.41 0.64
0.64 0.59 0.53 0.68 0.64 1.0 0.31 0.64 0.28 0.27 0.72 0.58 0.3 0.26 0.66 0.18 0.24 0.55 0.62 0.55
0.4 0.5 0.29 0.0 0.47 1.0 0.26 0.29 0.21 0.21 0.23 0.21 0.04 0.04 0.27 0.18 0.28 0.24 0.0 0.53
0.66 0.72 1.0 0.44 0.65 0.94 0.08 0.64 0.22 0.22 0.63 0.46 0.26 0.14 0.53 0.15 0.33 0.46 0.49 0.43
0.68 0.45 0.52 0.56 0.72 0.97 0.49 0.74 0.34 0.42 1.0 0.52 0.35 0.31 0.95 0.39 0.57 0.46 0.61 0.47
0.61 0.68 0.84 0.89 0.8 0.99 0.36 1.0 0.6 0.63 0.93 0.85 0.46 0.39 0.9 0.45 0.73 0.59 0.7 0.8
0.72 0.35 0.29 0.54 0.89 0.54 1.0 0.9 0.81 0.7 0.75 0.56 0.7 0.8 0.74 0.66 0.43 0.66 0.3 0.56
0.49 0.54 0.44 0.53 0.69 1.0 0.28 0.62 0.32 0.3 0.51 0.33 0.4 0.34 0.45 0.27 0.33 0.64 0.57 0.44
1.0 0.71 0.9 0.79 0.76 0.78 0.23 0.7 0.3 0.25 0.55 0.46 0.39 0.41 0.5 0.42 0.68 0.67 0.73 0.41
0.35 0.46 0.15 0.33 0.48 1.0 0.16 0.88 0.5 0.59 0.99 0.51 0.44 0.26 0.71 0.36 0.65 0.52 0.01 0.13
0.01 0.0 0.01 0.13 0.09 1.0 0.01 0.54 0.37 0.49 0.9 0.62 0.21 0.23 0.93 0.31 0.49 0.29 0.0 0.08
0.1 0.12 0.16 0.17 0.31 1.0 0.27 0.37 0.11 0.11 0.29 0.2 0.12 0.13 0.29 0.1 0.15 0.4 0.33 0.34
0.94 1.0 0.86 0.12 0.31 0.5 0.47 0.59 0.14 0.23 0.47 0.25 0.37 0.32 0.39 0.23 0.04 0.18 0.58 0.34
0.45 0.79 0.93 0.51 0.36 1.0 0.26 0.46 0.22 0.23 0.41 0.32 0.31 0.27 0.41 0.15 0.25 0.2 0.06 0.38
0.02 0.01 0.0 0.02 0.07 0.93 0.03 0.79 1.0 0.83 0.82 0.21 0.67 0.52 0.98 0.31 0.09 0.0 0.0 0.27
0.18 0.24 0.2 0.31 0.48 1.0 0.13 0.29 0.06 0.08 0.23 0.29 0.04 0.07 0.17 0.1 0.26 0.4 0.32 0.35
0.34 0.14 0.28 0.31 0.28 1.0 0.24 0.44 0.18 0.19 0.23 0.37 0.18 0.19 0.24 0.29 0.37 0.38 0.26 0.78
0.4 0.42 0.47 0.4 0.63 1.0 0.06 0.51 0.13 0.16 0.35 0.15 0.24 0.14 0.31 0.04 0.06 0.75 0.43 0.29
0.46 0.61 0.47 0.45 0.41 0.58 0.07 0.34 0.24 0.2 0.34 0.18 0.14 0.15 0.3 0.39 0.32 0.49 0.29 1.0
0.35 0.32 0.31 0.31 0.47 1.0 0.22 0.42 0.29 0.31 0.24 0.42 0.3 0.34 0.23 0.19 0.25 0.47 0.38 0.41
0.64 0.56 0.58 0.37 0.45 1.0 0.35 0.87 0.26 0.21 0.46 0.53 0.53 0.58 0.35 0.14 0.39 0.36 0.38 0.3
0.41 0.43 0.32 0.53 0.62 1.0 0.31 0.38 0.21 0.22 0.03 0.28 0.18 0.13 0.03 0.19 0.29 0.27 0.06 0.36
0.27 0.24 0.26 0.27 0.34 1.0 0.22 0.35 0.17 0.17 0.34 0.21 0.2 0.19 0.36 0.19 0.22 0.43 0.38 0.61
0.53 0.18 0.16 0.66 0.74 1.0 0.07 0.6 0.23 0.19 0.54 0.35 0.21 0.25 0.45 0.23 0.33 0.4 0.25 0.22
0.32 0.15 0.22 0.37 0.65 0.7 0.04 0.68 0.4 0.3 1.0 0.41 0.39 0.34 0.78 0.11 0.46 0.47 0.21 0.34
0.2 0.15 0.23 0.28 0.43 0.43 0.02 0.48 0.18 0.17 1.0 0.35 0.03 0.02 0.87 0.04 0.34 0.34 0.34 0.15
0.4 0.67 0.37 0.68 0.74 1.0 0.14 0.88 0.49 0.47 0.95 0.64 0.57 0.5 0.84 0.32 0.61 0.74 0.28 0.31
0.47 0.42 0.41 0.37 0.44 0.97 0.37 0.51 0.38 0.37 0.99 0.3 0.33 0.25 1.0 0.31 0.3 0.49 0.65 0.57
0.92 0.5 0.46 0.52 0.57 1.0 0.38 0.64 0.46 0.44 0.9 0.34 0.36 0.23 0.75 0.61 0.69 0.74 0.99 0.87
0.61 0.56 0.46 0.71 0.75 1.0 0.44 0.54 0.3 0.25 0.55 0.25 0.21 0.17 0.64 0.35 0.34 0.84 0.64 0.6
0.5 0.63 0.69 0.59 0.67 0.92 0.18 1.0 0.44 0.43 0.73 0.89 0.42 0.34 0.58 0.33 0.63 0.52 0.24 0.33
0.5 0.42 0.39 0.33 0.47 0.33 0.27 0.48 0.37 0.4 1.0 0.34 0.19 0.14 0.98 0.42 0.45 0.4 0.66 0.4
0.36 0.12 0.22 0.1 0.5 1.0 0.08 0.39 0.12 0.16 0.41 0.42 0.05 0.11 0.24 0.08 0.28 0.16 0.05 0.07
0.41 0.0 0.22 0.46 0.79 1.0 0.1 0.55 0.21 0.27 0.43 0.49 0.44 0.2 0.3 0.24 0.69 0.26 0.03 0.21
0.39 0.23 0.46 0.11 0.69 1.0 0.16 0.57 0.19 0.19 0.48 0.61 0.31 0.18 0.59 0.07 0.46 0.36 0.05 0.12
0.84 0.64 0.96 0.5 0.33 0.23 0.2 0.33 0.01 0.01 0.18 0.04 0.01 0.02 0.25 0.01 0.01 0.04 0.04 1.0
0.45 0.4 0.5 0.53 0.55 1.0 0.22 0.42 0.17 0.18 0.32 0.23 0.15 0.18 0.29 0.26 0.28 0.6 0.38 0.27
0.64 0.46 0.57 0.5 0.64 1.0 0.4 0.53 0.29 0.38 0.3 0.33 0.25 0.24 0.33 0.46 0.61 0.61 0.38 0.53
0.56 0.39 0.37 0.59 0.53 1.0 0.33 0.56 0.28 0.31 0.57 0.29 0.27 0.19 0.55 0.33 0.55 0.61 0.54 0.48
0.38 0.67 0.4 0.27 0.33 1.0 0.14 0.42 0.12 0.16 0.26 0.27 0.43 0.25 0.25 0.06 0.07 0.05 0.01 0.18
0.52 0.88 0.53 0.4 0.58 1.0 0.48 0.64 0.42 0.5 0.69 0.46 0.08 0.09 0.94 0.55 0.45 0.47 0.53 0.62
0.18 0.08 0.1 0.17 0.14 1.0 0.4 0.4 0.11 0.12 0.21 0.11 0.09 0.09 0.13 0.04 0.05 0.16 0.2 0.32
0.83 0.39 0.69 0.69 0.56 1.0 0.49 0.83 0.42 0.42 0.82 0.53 0.72 0.55 0.68 0.3 0.51 0.29 0.18 0.37
0.6 0.43 0.49 0.54 0.63 1.0 0.59 0.87 0.59 0.6 0.87 0.66 0.55 0.45 0.89 0.52 0.67 0.89 0.66 0.48
0.33 0.43 0.29 0.29 0.6 0.55 0.22 0.63 0.26 0.28 0.9 0.43 0.28 0.2 1.0 0.17 0.32 0.76 0.76 0.42
0.24 0.24 0.14 0.21 0.28 0.3 0.16 0.52 0.28 0.19 0.94 0.33 0.21 0.17 1.0 0.15 0.29 0.73 0.35 0.27
0.52 0.64 0.52 0.39 0.62 1.0 0.47 0.49 0.44 0.42 0.67 0.3 0.32 0.24 0.64 0.37 0.37 0.49 0.58 0.39
0.93 0.62 0.64 0.78 0.99 1.0 0.32 1.0 0.56 0.49 0.97 0.7 0.85 0.74 0.84 0.46 0.52 0.9 0.59 0.62
0.43 0.35 0.29 0.37 0.6 0.99 0.43 0.58 0.47 0.48 0.77 0.37 0.07 0.08 1.0 0.45 0.38 0.6 0.65 0.64
1.0 0.14 0.11 0.0 0.69 0.43 0.22 0.44 0.04 0.07 0.07 0.16 0.07 0.06 0.07 0.0 0.08 0.11 0.0 0.59
0.6 0.41 0.54 0.46 0.68 1.0 0.43 0.63 0.37 0.38 0.57 0.42 0.6 0.56 0.6 0.35 0.48 0.68 0.83 0.8
0.34 0.51 0.27 0.2 0.38 1.0 0.12 0.46 0.2 0.18 0.18 0.37 0.11 0.16 0.19 0.54 0.53 0.7 0.24 0.23

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)