Heatmap: Cluster_67 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_02766	0.99	0.65	0.12	0.4	1.0	0.22	0.43	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.35	0.05
Gb_04458	0.97	0.46	0.46	0.75	0.6	0.04	0.06	0.11	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.12	0.05	0.34	0.54	1.0
Gb_04459	0.61	0.05	0.15	0.55	0.51	0.0	0.06	0.07	0.03	0.03	0.0	0.03	0.0	0.0	0.02	0.14	0.02	0.69	0.28	1.0
Gb_06239	0.28	1.0	0.8	0.11	0.5	0.12	0.08	0.04	0.01	0.0	0.07	0.23	0.04	0.01	0.0	0.06	0.1	0.15	0.0	0.2
Gb_07662	0.31	0.22	0.5	0.37	0.22	0.04	0.17	0.04	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.17	0.25	1.0
Gb_07699	1.0	0.02	0.0	0.01	0.3	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.14	0.0	0.59
Gb_07811	0.56	0.0	0.17	1.0	0.33	0.0	0.1	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.21	0.0
Gb_08892	0.56	1.0	0.33	0.81	0.66	0.01	0.53	0.02	0.02	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.0	0.33
Gb_10631	0.23	0.0	0.07	0.09	0.08	1.0	0.1	0.06	0.02	0.03	0.09	0.07	0.03	0.02	0.04	0.0	0.0	0.04	0.11	0.62
Gb_11323	0.35	0.55	0.3	0.34	0.26	0.7	0.41	0.14	0.09	0.06	0.07	0.03	0.01	0.03	0.07	0.19	0.04	0.66	0.57	1.0
Gb_12576	0.32	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.17	0.3	0.36	0.0
Gb_13412	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0
Gb_13711	1.0	0.44	0.55	0.62	0.46	0.13	0.47	0.15	0.1	0.1	0.11	0.06	0.04	0.03	0.13	0.06	0.04	0.42	0.46	0.46
Gb_14087	0.39	1.0	0.62	0.4	0.51	0.02	0.27	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.03	0.02	0.45
Gb_14088	0.43	0.84	1.0	0.45	0.47	0.06	0.23	0.02	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.01	0.03	0.07	0.0	0.04	0.02	0.85
Gb_14457	0.57	0.59	0.58	0.67	1.0	0.02	0.59	0.05	0.07	0.07	0.03	0.05	0.05	0.02	0.03	0.11	0.23	0.0	0.0	0.11
Gb_14766	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.22	0.0
Gb_14825	0.52	0.83	1.0	0.36	0.37	0.09	0.02	0.06	0.07	0.05	0.12	0.02	0.03	0.1	0.02	0.0	0.04	0.06	0.0	0.58
Gb_15117	0.33	0.37	0.44	0.0	0.18	1.0	0.2	0.06	0.04	0.03	0.05	0.13	0.02	0.0	0.0	0.33	0.0	0.2	0.5	0.05
Gb_16027	0.97	0.24	0.55	0.2	1.0	0.25	0.16	0.1	0.03	0.02	0.01	0.03	0.0	0.03	0.0	0.02	0.0	0.75	0.58	0.91
Gb_16028	1.0	0.26	0.85	0.7	0.73	0.46	0.15	0.1	0.01	0.0	0.01	0.04	0.01	0.0	0.01	0.01	0.05	0.71	0.87	0.68
Gb_17195	0.51	0.16	0.41	0.85	0.26	0.01	0.21	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_17794	1.0	0.04	0.0	0.0	0.35	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.15	0.0	0.52
Gb_17893	0.18	0.0	0.04	0.07	0.09	1.0	0.08	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.02	0.56
Gb_18558	0.99	1.0	0.16	0.49	0.48	0.0	0.1	0.03	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.26
Gb_18766	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.93	0.57	0.94	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19082	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_19310	0.37	1.0	0.64	0.29	0.58	0.0	0.62	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.03	0.08	0.0	0.0	0.0	0.32	0.15
Gb_19905	0.64	1.0	0.23	0.65	0.7	0.22	0.22	0.07	0.06	0.1	0.03	0.04	0.04	0.01	0.03	0.12	0.0	0.19	0.07	0.08
Gb_20119	0.6	0.37	0.59	0.44	1.0	0.0	0.52	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.35	0.14
Gb_20469	0.5	0.27	0.07	1.0	0.13	0.29	0.12	0.22	0.04	0.07	0.3	0.02	0.13	0.27	0.38	0.9	0.21	0.0	0.46	0.17
Gb_21706	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22153	0.0	0.0	0.21	0.21	0.0	0.85	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23455	0.11	0.22	0.15	0.14	0.18	0.8	0.26	0.12	0.09	0.11	0.23	0.16	0.06	0.08	0.22	0.12	0.14	0.38	0.55	1.0
Gb_23620	0.63	1.0	0.66	0.63	0.92	0.43	0.46	0.24	0.17	0.16	0.21	0.29	0.1	0.15	0.22	0.42	0.33	0.5	0.25	0.89
Gb_24099	0.47	0.45	0.28	0.18	0.27	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_24267	0.25	0.53	1.0	0.1	0.45	0.07	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24516	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.68	0.97
Gb_25709	1.0	0.21	0.83	0.72	0.47	0.03	0.21	0.19	0.25	0.2	0.65	0.09	0.26	0.17	0.66	0.15	0.16	0.01	0.02	0.18
Gb_25938	0.21	0.14	0.15	0.07	0.19	1.0	0.13	0.09	0.04	0.04	0.1	0.04	0.06	0.04	0.1	0.05	0.05	0.16	0.33	0.75
Gb_26217	0.34	0.4	0.33	0.29	1.0	0.02	0.08	0.09	0.05	0.06	0.01	0.01	0.09	0.1	0.02	0.0	0.01	0.79	0.25	0.8
Gb_29106	0.31	0.0	0.0	0.0	0.96	0.0	0.0	0.26	0.16	0.34	0.29	0.0	0.37	1.0	0.76	0.96	0.32	0.28	0.84	0.0
Gb_30109	0.34	0.31	0.34	0.41	0.45	0.02	0.15	0.1	0.04	0.05	0.04	0.1	0.1	0.09	0.03	0.0	0.03	0.26	0.23	1.0
Gb_31583	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32192	0.93	0.65	0.57	1.0	0.22	0.08	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.0	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.25
Gb_32193	1.0	0.72	0.63	0.99	0.27	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.04	0.04	0.06	0.03	0.32
Gb_32499	0.31	1.0	0.93	0.0	0.71	0.0	0.22	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.07	0.03
Gb_32507	0.66	0.73	1.0	0.36	0.58	0.0	0.46	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.06	0.05
Gb_33460	0.7	0.94	0.77	0.36	1.0	0.12	0.72	0.17	0.31	0.11	0.12	0.45	0.08	0.14	0.1	0.23	0.25	0.01	0.0	0.78
Gb_34640	0.26	1.0	0.28	0.17	0.15	0.09	0.21	0.04	0.03	0.04	0.05	0.07	0.04	0.05	0.05	0.01	0.02	0.05	0.03	0.24
Gb_34833	0.63	0.46	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.37	0.5	0.35	0.38	0.17	0.25	0.23	0.19	1.0	0.29	0.38	0.15	0.0
Gb_34843	0.14	1.0	0.45	0.0	0.1	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36485	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36589	0.4	0.39	1.0	0.0	0.36	0.05	0.04	0.05	0.18	0.11	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.07	0.07	0.11	0.03	0.2
Gb_37161	0.11	0.09	0.05	0.23	0.29	0.07	0.04	0.06	0.06	0.06	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.1	0.18	0.08	0.16	1.0
Gb_37513	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.61	0.0
Gb_38868	1.0	0.59	0.91	0.75	0.73	0.04	0.1	0.14	0.17	0.26	0.24	0.21	0.09	0.05	0.21	0.46	0.7	0.28	0.47	0.44
Gb_38871	1.0	0.32	0.62	0.47	0.51	0.03	0.32	0.23	0.23	0.23	0.42	0.18	0.24	0.17	0.42	0.17	0.28	0.45	0.3	0.38
Gb_40689	0.62	1.0	0.61	0.28	0.53	0.53	0.02	0.06	0.14	0.13	0.13	0.03	0.01	0.04	0.21	0.0	0.02	0.21	0.07	0.73
Gb_40750	0.44	0.77	0.57	0.36	1.0	0.11	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.05	0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)