Heatmap: Cluster_233 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00494	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.07	0.04	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.05	0.17	1.0	0.13
Gb_00537	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	1.0	0.07
Gb_00873	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	1.0	0.04
Gb_00888	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.04	0.0	0.06	0.05	0.05	0.06	0.05	0.05	0.05	0.06	0.04	0.08	0.1	1.0	0.09
Gb_00889	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.06	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.02	0.05	0.11	1.0	0.12
Gb_00931	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.07	0.08	0.05	0.05	0.07	0.07	0.06	0.02	0.09	0.02	1.0	0.03
Gb_00934	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.05	0.05	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	1.0	0.05
Gb_01383	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.02	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.06	1.0	0.03
Gb_01595	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02	0.07	1.0	0.01
Gb_02153	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.18	1.0	0.07
Gb_02178	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.16	0.01	0.08	0.07	0.07	0.03	0.05	0.09	0.13	0.02	0.03	0.11	0.03	1.0	0.08
Gb_02184	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.09	0.0	0.05	0.05	0.04	0.0	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.13	0.05	1.0	0.09
Gb_02988	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	1.0	0.05
Gb_04531	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	1.0	0.05
Gb_05677	0.01	0.0	0.0	0.03	0.05	0.03	0.0	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.06	1.0	0.02
Gb_05905	0.24	0.15	0.13	0.19	0.2	0.06	0.08	0.09	0.07	0.06	0.13	0.06	0.02	0.02	0.13	0.07	0.05	0.15	1.0	0.1
Gb_06463	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.06	0.11	0.07	0.02	0.01	0.03	0.09	0.03	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0
Gb_06680	0.01	0.0	0.0	0.01	0.06	0.01	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.05	0.08	0.27	1.0	0.04
Gb_06798	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.08	0.01	0.01	0.07	1.0	0.65
Gb_07010	0.01	0.0	0.0	0.04	0.1	0.08	0.01	0.05	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.06	0.05	0.07	0.13	1.0	0.26
Gb_07273	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.05	1.0	0.05
Gb_07275	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	0.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.05	1.0	0.04
Gb_07276	0.02	0.01	0.0	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.09	1.0	0.07
Gb_07277	0.02	0.0	0.0	0.02	0.06	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.1	1.0	0.09
Gb_07278	0.03	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.1	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.13	1.0	0.14
Gb_07884	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.01	0.04	1.0	0.07
Gb_07938	0.14	0.07	0.12	0.13	0.24	0.1	0.04	0.19	0.16	0.16	0.13	0.14	0.22	0.24	0.12	0.09	0.25	0.26	1.0	0.15
Gb_08232	0.04	0.02	0.01	0.06	0.15	0.02	0.0	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.08	0.09	1.0	0.04
Gb_08259	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.03	0.21	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.09	1.0	0.1
Gb_10288	0.04	0.03	0.05	0.1	0.19	0.05	0.0	0.04	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.03	0.0	0.26	1.0	0.02
Gb_10844	0.08	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	1.0	0.07
Gb_10845	0.04	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.03	1.0	0.02
Gb_11250	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.1	1.0	0.36
Gb_11326	0.02	0.02	0.01	0.03	0.07	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.23	1.0	0.13
Gb_11789	0.01	0.0	0.0	0.02	0.07	0.05	0.0	0.03	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.04	0.16	1.0	0.03
Gb_11797	0.02	0.0	0.0	0.02	0.16	0.05	0.0	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.08	0.15	1.0	0.03
Gb_11798	0.02	0.0	0.0	0.02	0.07	0.11	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.02	0.01	0.18	1.0	0.05
Gb_12390	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.07	0.05	0.06	0.06	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	1.0	0.0
Gb_12864	0.03	0.04	0.07	0.01	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.09	1.0	0.04
Gb_13076	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.02	0.03	1.0	0.08
Gb_13439	0.02	0.01	0.0	0.11	0.11	0.13	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.14
Gb_13629	0.05	0.05	0.04	0.07	0.08	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.22	1.0	0.14
Gb_14113	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0	0.24
Gb_16213	0.01	0.0	0.0	0.04	0.07	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.14	1.0	0.06
Gb_16401	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.03
Gb_16970	0.11	0.05	0.07	0.07	0.14	0.23	0.1	0.1	0.04	0.04	0.09	0.05	0.02	0.02	0.1	0.07	0.08	0.25	1.0	0.17
Gb_17363	0.01	0.0	0.0	0.02	0.05	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.06	1.0	0.03
Gb_19147	0.0	0.0	0.0	0.04	0.24	0.46	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.21	1.0	0.5
Gb_19189	0.09	0.11	0.08	0.04	0.04	0.01	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	1.0	0.34
Gb_19190	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.05	0.23	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0	0.3
Gb_19196	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0	0.18
Gb_21079	0.01	0.01	0.0	0.04	0.08	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.11	1.0	0.06
Gb_21839	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_22492	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.04	0.04	0.04	0.08	0.03	0.05	0.05	0.11	0.02	0.01	0.04	1.0	0.04
Gb_24079	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.0
Gb_25338	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.05	1.0	0.01
Gb_25799	0.01	0.01	0.0	0.01	0.07	0.11	0.0	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.11	1.0	0.03
Gb_25801	0.0	0.01	0.03	0.02	0.07	0.08	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.08	1.0	0.07
Gb_25803	0.01	0.0	0.0	0.04	0.06	0.05	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	1.0	0.03
Gb_25804	0.01	0.0	0.0	0.05	0.04	0.04	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.14	1.0	0.09
Gb_27391	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	1.0	0.02
Gb_28424	0.07	0.09	0.08	0.19	0.13	0.0	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.02	0.1	0.1	1.0	0.04
Gb_28898	0.01	0.02	0.01	0.05	0.09	0.1	0.03	0.09	0.06	0.05	0.02	0.05	0.06	0.1	0.03	0.04	0.09	0.19	1.0	0.06
Gb_30173	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	0.06	0.0	0.02	0.06	0.04	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.06	0.01	0.12	0.96	1.0
Gb_30945	0.01	0.0	0.0	0.01	0.03	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.06	1.0	0.02
Gb_31362	0.09	0.07	0.06	0.1	0.15	0.07	0.12	0.07	0.08	0.06	0.09	0.04	0.05	0.04	0.08	0.11	0.05	0.16	1.0	0.12
Gb_31712	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.01	0.02	1.0	0.01
Gb_32281	0.01	0.0	0.0	0.02	0.06	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.02	0.05	1.0	0.12
Gb_32662	0.03	0.0	0.02	0.0	0.02	0.07	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	1.0	0.02
Gb_33941	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.1
Gb_34293	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.08	0.05	0.04	0.03	0.03	0.11	0.07	0.02	0.04	0.07	0.04	1.0	0.01
Gb_34752	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	1.0	0.08
Gb_34914	0.01	0.0	0.0	0.03	0.03	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.01	0.07	1.0	0.05
Gb_35120	0.01	0.0	0.0	0.06	0.05	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0	0.04
Gb_35121	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.02	0.0	0.02	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.05	1.0	0.06
Gb_36225	0.18	0.1	0.18	0.12	0.18	0.09	0.05	0.07	0.04	0.04	0.09	0.07	0.01	0.01	0.09	0.07	0.07	0.17	1.0	0.23
Gb_36452	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.1	0.0	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.07	0.07	0.02	0.03	0.08	0.08	1.0	0.07
Gb_36453	0.01	0.01	0.0	0.03	0.11	0.08	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.09	0.11	1.0	0.13
Gb_36455	0.01	0.0	0.0	0.04	0.05	0.13	0.01	0.07	0.03	0.03	0.05	0.04	0.04	0.05	0.05	0.05	0.13	0.18	1.0	0.13
Gb_36958	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.01
Gb_37171	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.07	1.0	0.13
Gb_37289	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	1.0	0.03
Gb_39761	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0
Gb_40279	0.0	0.0	0.0	0.04	0.12	0.07	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.04	0.08	1.0	0.07
Gb_40281	0.01	0.0	0.0	0.03	0.24	0.14	0.01	0.1	0.07	0.07	0.07	0.06	0.11	0.13	0.09	0.02	0.11	0.13	1.0	0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)