1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_243 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.09 0.9 0.31 0.92 0.0 0.0 0.2 0.19 0.06 0.17 0.11 0.03 0.44 0.29 0.31 0.39 0.05 0.24 0.54 0.19
0.15 1.09 0.38 2.14 0.0 0.0 0.17 0.23 0.02 0.03 0.15 0.0 0.05 0.05 0.06 1.05 0.37 0.0 0.19 0.03
0.13 0.6 0.56 2.8 0.0 0.0 0.41 0.27 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.91 0.64 0.03 0.26 0.0
0.13 0.56 0.14 0.79 0.0 0.0 0.3 0.16 0.01 0.03 0.0 0.0 0.06 0.01 0.03 0.25 0.2 0.03 0.08 0.0
0.05 0.43 0.1 0.57 0.0 0.0 0.26 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.04 0.03 0.2 0.23 0.0 0.12 0.09
0.17 0.81 0.76 0.99 0.07 0.0 0.29 0.25 0.03 0.0 0.03 0.01 0.18 0.04 0.17 0.71 0.35 0.0 0.35 0.0
0.15 0.19 0.21 0.74 0.03 0.0 0.08 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.26 0.18 0.0 0.1 0.0
0.02 0.06 0.07 0.08 0.02 0.0 0.01 0.02 0.03 0.02 0.07 0.01 0.01 0.01 0.0 0.06 0.05 0.01 0.01 0.03
0.18 2.4 0.44 0.72 0.04 0.04 0.42 0.34 0.08 0.04 0.03 0.01 0.08 0.04 0.1 0.68 0.36 0.05 0.32 0.03
0.5 1.68 0.86 4.69 0.0 0.0 0.4 0.64 0.14 0.0 0.0 0.0 0.13 0.11 0.0 2.15 0.79 0.0 2.27 0.07
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0
1.66 11.52 3.44 14.97 0.24 0.27 2.57 1.86 0.47 0.55 0.62 0.04 0.59 0.3 0.47 5.25 3.7 0.44 3.01 0.29
0.12 0.0 0.16 0.9 0.0 0.13 0.05 0.08 0.02 0.07 0.18 0.0 0.07 0.0 0.01 0.25 0.0 0.0 0.3 0.0
0.03 1.29 0.06 1.5 0.0 0.0 0.17 0.15 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.16 1.05 0.29 0.06 0.06 0.0
0.04 0.99 0.22 1.73 0.03 0.04 0.17 0.26 0.01 0.0 0.17 0.0 0.06 0.0 0.0 0.44 0.39 0.0 0.53 0.0
0.35 1.42 1.12 2.07 0.1 0.11 0.46 0.33 0.04 0.08 0.0 0.03 0.2 0.15 0.2 0.72 0.44 0.0 0.52 0.04
0.01 0.16 0.01 0.17 0.0 0.0 0.05 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.05 0.01
0.06 0.35 0.12 0.26 0.0 0.05 0.07 0.09 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.13 0.09 0.0 0.11 0.0
0.0 0.57 1.09 0.83 0.0 0.0 0.16 0.18 0.08 0.0 0.24 0.0 0.32 0.0 0.44 0.43 0.14 0.47 0.27 0.2
0.08 2.77 0.54 3.86 0.0 0.0 0.36 0.37 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.77 0.42 0.0 0.25 0.0
0.16 0.67 0.14 0.86 0.11 0.04 0.06 0.16 0.08 0.08 0.06 0.02 0.04 0.09 0.03 0.45 0.08 0.0 0.41 0.11
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.41 0.06 0.0 0.06 0.0
1.0 5.14 2.81 11.81 0.07 0.0 1.79 1.39 0.15 0.31 0.4 0.02 0.33 0.25 0.43 5.2 2.76 0.23 1.09 0.08
0.03 0.1 0.06 0.52 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.04 0.0
0.03 0.3 0.17 0.28 0.0 0.0 0.12 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.49 0.13 0.0 0.05 0.03
0.02 0.23 0.14 0.69 0.0 0.0 0.13 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.18 1.84 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
0.0 0.41 0.12 0.71 0.02 0.0 0.01 0.04 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.24 0.02 0.06 0.0
0.07 0.82 0.22 1.1 0.0 0.0 0.3 0.1 0.02 0.01 0.04 0.0 0.02 0.02 0.03 0.23 0.27 0.0 0.14 0.0
0.0 0.19 0.07 0.21 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.06 0.0 0.02 0.0
0.09 0.13 0.06 0.49 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.22 0.14 0.0 0.22 0.02
0.07 0.2 0.28 0.44 0.0 0.06 0.17 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.0 0.12 0.0
0.14 0.59 0.28 1.55 0.0 0.07 0.48 0.18 0.02 0.03 0.03 0.0 0.02 0.03 0.05 0.92 0.26 0.05 0.11 0.02
0.09 0.29 0.09 0.12 0.0 0.0 0.12 0.08 0.03 0.01 0.04 0.0 0.03 0.02 0.14 0.17 0.13 0.0 0.09 0.0
0.31 1.72 0.91 4.32 0.0 0.06 1.02 0.6 0.1 0.11 0.31 0.0 0.24 0.19 0.28 2.32 0.99 0.0 0.64 0.08
0.04 0.73 0.2 0.88 0.0 0.0 0.15 0.11 0.01 0.05 0.05 0.0 0.01 0.09 0.0 0.32 0.19 0.0 0.12 0.0
0.06 0.69 0.12 2.2 0.0 0.0 0.04 0.13 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.05 0.05 0.55 0.29 0.0 0.04 0.0
0.06 0.51 0.04 0.37 0.0 0.0 0.09 0.11 0.03 0.02 0.0 0.01 0.04 0.03 0.04 0.49 0.14 0.0 0.02 0.0
0.36 2.29 1.22 2.77 0.18 0.0 0.56 0.73 0.35 0.2 0.58 0.02 0.0 0.0 0.53 3.94 1.24 0.23 0.94 0.16
0.5 2.93 1.15 10.29 0.19 0.04 1.45 0.96 0.2 0.11 0.16 0.03 0.19 0.17 0.2 3.42 1.78 0.1 1.04 0.14
0.02 0.33 0.1 1.13 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.14 0.0 0.06 0.15 0.05 0.22 0.28 0.0 0.0 0.0
0.0 0.9 0.18 0.77 0.0 0.0 0.13 0.11 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.14 0.0
0.15 1.12 0.52 1.26 0.04 0.0 0.3 0.24 0.04 0.05 0.02 0.0 0.09 0.0 0.03 1.05 0.39 0.06 0.37 0.05
0.05 0.42 0.03 0.27 0.04 0.04 0.06 0.01 0.01 0.05 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.01 0.0
0.03 1.16 0.28 3.04 0.0 0.0 0.12 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.47 0.0 0.35 0.0
0.35 2.07 0.82 5.33 0.12 0.0 0.69 0.44 0.11 0.16 0.2 0.0 0.23 0.06 0.11 1.57 0.62 0.2 0.51 0.11
0.06 0.36 0.08 0.99 0.0 0.0 0.22 0.12 0.01 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.04 0.68 0.22 0.0 0.14 0.0
0.09 0.5 0.08 0.84 0.04 0.0 0.16 0.15 0.06 0.1 0.07 0.0 0.09 0.08 0.04 0.47 0.18 0.01 0.26 0.07
0.07 0.53 0.08 2.45 0.0 0.0 0.11 0.23 0.05 0.0 0.1 0.0 0.08 0.04 0.12 0.34 0.3 0.0 0.21 0.0
0.0 0.0 0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0
0.03 0.33 0.2 0.82 0.1 0.0 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.38 2.83 1.27 15.39 0.19 0.11 1.03 1.01 0.08 0.0 0.18 0.02 0.16 0.04 0.08 5.99 2.59 0.09 1.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.19 1.01 0.18 2.28 0.0 0.09 0.47 0.28 0.0 0.08 0.04 0.0 0.14 0.08 0.1 0.74 0.64 0.03 0.28 0.0
0.02 0.31 0.05 0.81 0.0 0.0 0.08 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.06 0.0 0.12 0.0
0.04 0.17 0.24 0.4 0.08 0.1 0.02 0.11 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.14 0.23 0.31 0.0 0.16 0.0
0.03 0.28 0.12 1.61 0.0 0.0 0.05 0.12 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.02 0.39 0.26 0.0 0.08 0.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)