Heatmap: Cluster_292 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.51 0.63 0.47 0.62 0.47 0.18 0.19 0.18 0.09 0.07 0.1 0.07 0.14 0.1 0.13 0.13 0.08 0.8 1.0 0.36
0.4 0.39 0.55 0.42 0.7 0.16 0.29 0.22 0.11 0.1 0.32 0.2 0.08 0.1 0.38 0.2 0.15 1.0 0.99 0.42
0.24 0.31 0.13 0.14 0.29 0.12 0.1 0.16 0.19 0.2 0.37 0.18 0.07 0.06 0.4 0.25 0.16 0.32 1.0 0.29
0.09 0.03 0.03 0.13 0.23 0.47 0.02 0.22 0.1 0.09 0.35 0.14 0.04 0.06 0.37 0.23 0.16 0.44 1.0 0.28
0.3 0.32 0.26 0.23 0.42 0.42 0.11 0.28 0.23 0.21 0.32 0.19 0.26 0.25 0.34 0.24 0.25 0.64 1.0 0.53
0.22 0.05 0.07 0.1 0.19 0.03 0.35 0.18 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.09 0.04 1.0 0.16 0.33
0.22 0.05 0.08 0.17 0.18 0.07 0.73 0.21 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.04 0.06 1.0 0.3 0.39
0.14 0.06 0.12 0.14 0.18 0.03 0.57 0.17 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.03 1.0 0.26 0.22
0.7 0.26 0.43 0.8 0.72 0.54 0.18 0.28 0.09 0.11 0.12 0.1 0.12 0.12 0.15 0.14 0.18 1.0 1.0 0.19
0.8 0.21 0.42 0.64 0.42 0.23 0.12 0.22 0.12 0.1 0.19 0.15 0.21 0.19 0.15 0.11 0.13 0.36 1.0 0.17
0.57 0.31 0.42 0.56 0.44 0.24 0.25 0.34 0.24 0.22 0.38 0.18 0.28 0.24 0.4 0.17 0.19 0.45 1.0 0.48
0.36 0.35 0.3 0.29 0.57 0.17 0.57 0.24 0.05 0.05 0.07 0.09 0.05 0.07 0.09 0.08 0.1 1.0 0.86 0.6
0.39 0.23 0.3 0.29 0.6 0.15 0.47 0.22 0.05 0.04 0.07 0.08 0.05 0.05 0.07 0.09 0.11 1.0 0.84 0.52
0.11 0.1 0.19 0.13 0.3 0.03 0.01 0.09 0.07 0.08 0.05 0.12 0.06 0.06 0.07 0.14 0.13 0.14 1.0 0.57
0.46 0.56 0.42 0.53 0.78 0.3 0.56 0.32 0.19 0.24 0.15 0.18 0.2 0.17 0.2 0.19 0.19 0.79 1.0 0.49
0.43 0.53 0.53 0.64 0.65 0.24 0.47 0.34 0.28 0.24 0.44 0.25 0.15 0.12 0.45 0.35 0.33 0.78 1.0 0.63
0.54 0.25 0.25 0.33 0.39 0.22 0.23 0.35 0.29 0.26 0.46 0.21 0.36 0.29 0.47 0.25 0.25 0.48 1.0 0.51
0.7 0.55 0.66 0.57 0.82 0.09 0.14 0.23 0.23 0.25 0.33 0.24 0.12 0.14 0.32 0.39 0.3 0.54 1.0 0.46
0.77 0.74 0.92 0.87 0.79 0.55 0.38 0.45 0.36 0.37 0.34 0.37 0.43 0.43 0.38 0.35 0.55 0.74 1.0 0.65
0.35 0.2 0.18 0.44 0.73 0.14 0.1 0.09 0.08 0.06 0.11 0.1 0.04 0.03 0.18 0.17 0.15 0.19 1.0 0.08
0.65 0.38 0.48 0.56 0.43 0.35 0.45 0.48 0.39 0.38 0.46 0.32 0.34 0.36 0.41 0.48 0.57 0.5 1.0 0.49
0.66 0.42 0.37 0.53 0.61 0.15 0.19 0.27 0.16 0.17 0.19 0.13 0.16 0.14 0.22 0.21 0.22 0.61 1.0 0.36
0.29 0.19 0.28 0.35 0.43 0.04 0.01 0.19 0.1 0.09 0.08 0.14 0.04 0.07 0.06 0.14 0.33 0.36 1.0 0.38
0.95 0.36 0.54 0.83 0.81 0.53 0.17 0.23 0.11 0.09 0.13 0.14 0.03 0.05 0.16 0.42 0.32 0.87 1.0 0.52
1.0 0.68 0.9 0.29 0.52 0.13 0.02 0.14 0.01 0.03 0.05 0.07 0.05 0.02 0.06 0.03 0.05 0.62 0.91 0.09
0.24 0.09 0.15 0.22 0.2 0.04 0.68 0.32 0.09 0.07 0.43 0.12 0.17 0.11 0.38 0.34 0.21 1.0 0.32 0.46
0.41 0.38 0.29 0.41 0.62 0.38 0.24 0.31 0.25 0.24 0.51 0.24 0.12 0.13 0.48 0.31 0.35 0.65 1.0 0.66
0.52 0.36 0.44 0.54 0.6 0.16 0.05 0.21 0.08 0.1 0.09 0.11 0.1 0.11 0.07 0.09 0.12 0.87 1.0 0.4
0.51 0.65 0.45 0.57 0.87 0.43 0.48 0.46 0.35 0.32 0.56 0.4 0.49 0.44 0.56 0.38 0.46 1.0 0.99 0.7
0.17 0.08 0.12 0.25 0.32 0.06 0.01 0.22 0.08 0.07 0.09 0.22 0.07 0.08 0.1 0.09 0.1 0.71 1.0 0.54
0.98 0.58 0.65 0.63 0.9 0.24 0.25 0.22 0.17 0.15 0.26 0.25 0.16 0.2 0.27 0.24 0.19 0.75 1.0 0.36
0.44 0.49 0.51 0.52 0.58 0.02 0.05 0.07 0.04 0.05 0.03 0.02 0.01 0.01 0.04 0.05 0.06 0.65 1.0 0.1
0.72 0.53 0.63 0.76 1.0 0.04 0.06 0.12 0.06 0.06 0.08 0.02 0.03 0.02 0.08 0.1 0.1 0.88 0.92 0.14
0.32 0.41 0.3 0.28 0.45 0.3 0.37 0.4 0.35 0.41 0.75 0.22 0.25 0.18 0.69 0.17 0.17 0.63 1.0 0.41
0.65 0.4 0.48 0.58 0.72 0.36 0.3 0.35 0.28 0.28 0.35 0.23 0.19 0.16 0.34 0.4 0.43 0.61 1.0 0.38
0.47 0.3 0.23 0.71 0.5 0.43 0.24 0.41 0.38 0.43 0.47 0.2 0.25 0.21 0.55 0.3 0.24 0.68 1.0 0.42
0.36 0.19 0.34 0.29 0.5 0.07 0.05 0.12 0.07 0.07 0.18 0.05 0.02 0.02 0.18 0.12 0.11 0.45 1.0 0.52
0.5 0.23 0.46 0.46 0.72 0.08 0.03 0.16 0.15 0.08 0.15 0.07 0.03 0.05 0.2 0.3 0.34 0.72 1.0 0.99
0.06 0.12 0.11 0.07 0.2 0.04 0.04 0.19 0.14 0.14 0.3 0.16 0.04 0.05 0.32 0.07 0.09 0.45 1.0 0.41
0.56 0.25 0.49 0.54 0.42 0.23 0.24 0.38 0.26 0.23 0.43 0.21 0.27 0.29 0.49 0.28 0.23 0.62 1.0 0.44
0.57 0.62 0.55 0.51 0.6 0.38 0.44 0.34 0.27 0.24 0.48 0.29 0.25 0.2 0.48 0.34 0.38 0.52 1.0 0.55
0.86 0.79 0.76 0.93 1.0 0.31 0.46 0.49 0.54 0.49 0.66 0.26 0.31 0.27 0.64 0.45 0.36 0.48 0.9 0.25
0.57 0.85 0.96 0.55 0.54 0.06 0.01 0.1 0.04 0.04 0.06 0.05 0.01 0.01 0.07 0.25 0.14 0.45 1.0 0.81
0.75 0.63 0.62 0.73 0.85 0.35 0.15 0.35 0.21 0.19 0.18 0.18 0.29 0.29 0.2 0.25 0.2 0.9 1.0 0.68
0.32 0.59 0.24 0.34 0.53 0.26 0.21 0.33 0.27 0.25 0.26 0.12 0.17 0.16 0.32 0.26 0.13 1.0 0.65 0.39
0.36 0.78 0.3 0.29 0.53 0.28 0.16 0.3 0.23 0.22 0.23 0.1 0.18 0.17 0.33 0.19 0.13 1.0 0.79 0.34
0.41 0.25 0.2 0.18 0.34 0.21 0.49 0.19 0.03 0.04 0.03 0.04 0.02 0.05 0.05 0.21 0.21 1.0 0.34 0.31
0.08 0.05 0.1 0.15 0.25 0.13 0.76 0.17 0.04 0.03 0.06 0.03 0.02 0.01 0.13 0.08 0.1 0.93 1.0 0.34
0.9 1.0 0.93 0.59 0.71 0.63 0.42 0.35 0.25 0.24 0.38 0.26 0.19 0.14 0.45 0.21 0.25 0.73 1.0 0.63
0.51 0.33 0.4 0.48 0.54 0.09 0.21 0.17 0.09 0.1 0.16 0.09 0.13 0.12 0.18 0.09 0.1 0.37 1.0 0.19
0.34 0.52 0.36 0.34 0.44 0.18 0.3 0.21 0.1 0.13 0.22 0.23 0.14 0.2 0.17 0.1 0.08 0.26 1.0 0.89
0.32 0.22 0.28 0.48 0.43 0.29 0.05 0.32 0.22 0.23 0.35 0.15 0.33 0.27 0.39 0.22 0.16 0.9 1.0 0.33
0.32 0.26 0.36 0.41 0.52 0.18 0.06 0.32 0.11 0.09 0.33 0.3 0.12 0.09 0.37 0.08 0.08 0.52 0.92 1.0
0.29 0.18 0.26 0.57 1.0 0.07 0.02 0.1 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.11 0.04 0.71 0.78 0.61
0.32 0.21 0.24 0.42 0.54 0.67 0.19 0.25 0.19 0.21 0.49 0.24 0.21 0.16 0.4 0.07 0.1 0.42 1.0 0.67
0.25 0.18 0.12 0.16 0.37 0.07 0.08 0.22 0.1 0.1 0.07 0.06 0.1 0.09 0.09 0.02 0.03 0.82 1.0 0.2
0.76 0.46 0.57 0.87 0.86 0.35 0.31 0.44 0.33 0.32 0.52 0.26 0.53 0.45 0.56 0.4 0.35 0.73 1.0 0.63
0.93 0.92 0.69 0.77 0.7 0.15 0.52 0.31 0.19 0.19 0.31 0.22 0.2 0.19 0.28 0.22 0.27 1.0 0.97 0.54
0.23 0.17 0.25 0.31 0.34 0.1 0.07 0.21 0.18 0.19 0.18 0.16 0.2 0.17 0.17 0.25 0.29 0.6 1.0 0.62
0.35 0.25 0.26 0.36 0.81 0.12 0.05 0.16 0.1 0.1 0.28 0.12 0.09 0.06 0.27 0.05 0.12 0.49 1.0 0.3
0.67 1.0 0.8 0.68 0.65 0.18 0.23 0.22 0.15 0.17 0.18 0.11 0.16 0.15 0.19 0.18 0.18 0.7 0.81 0.35
0.6 0.42 0.51 0.72 0.65 0.46 0.27 0.42 0.24 0.21 0.35 0.25 0.33 0.31 0.37 0.2 0.25 0.68 1.0 0.53
0.43 0.26 0.34 0.53 0.58 0.13 0.13 0.2 0.16 0.14 0.16 0.11 0.12 0.1 0.17 0.24 0.16 0.61 1.0 0.41
0.52 0.68 0.33 0.37 0.45 0.16 0.12 0.2 0.2 0.17 0.34 0.16 0.09 0.07 0.32 0.25 0.16 0.31 1.0 0.34
0.41 0.37 0.49 0.63 0.69 0.38 0.19 0.32 0.22 0.21 0.2 0.28 0.14 0.13 0.2 0.15 0.38 0.8 1.0 0.74
0.9 0.8 0.84 0.84 1.0 0.37 0.43 0.45 0.33 0.29 0.4 0.31 0.17 0.18 0.43 0.34 0.51 0.66 0.4 0.42
0.4 0.42 0.33 0.42 0.67 0.26 0.18 0.35 0.17 0.18 0.24 0.21 0.24 0.19 0.24 0.13 0.14 0.65 1.0 0.3
0.33 0.27 0.32 0.31 0.54 0.26 0.19 0.21 0.07 0.08 0.14 0.1 0.14 0.09 0.14 0.02 0.03 0.6 1.0 0.58
0.14 0.27 0.12 0.23 0.42 0.08 0.2 0.14 0.02 0.03 0.05 0.05 0.01 0.01 0.08 0.07 0.04 0.78 1.0 0.57
0.38 0.61 0.2 0.21 0.5 0.07 0.22 0.27 0.27 0.21 0.44 0.29 0.19 0.21 0.48 0.28 0.15 0.6 1.0 0.83
0.24 0.12 0.12 0.32 0.33 0.41 0.34 0.37 0.21 0.21 0.44 0.24 0.24 0.19 0.42 0.23 0.43 0.91 1.0 0.26
0.48 0.34 0.39 0.62 0.69 0.47 0.06 0.34 0.26 0.23 0.29 0.15 0.39 0.34 0.31 0.22 0.15 1.0 0.86 0.72
0.24 0.25 0.21 0.4 0.38 0.33 0.03 0.2 0.12 0.11 0.2 0.07 0.2 0.13 0.25 0.09 0.05 0.67 1.0 0.35
0.92 0.68 0.6 0.65 0.75 0.04 0.11 0.23 0.05 0.05 0.12 0.06 0.03 0.01 0.1 0.06 0.04 1.0 0.82 0.24
0.59 0.36 0.38 0.7 0.45 0.26 0.28 0.31 0.24 0.22 0.5 0.19 0.24 0.17 0.49 0.31 0.24 0.46 1.0 0.33
0.67 0.22 0.28 0.62 0.44 0.28 0.12 0.35 0.24 0.24 0.37 0.18 0.25 0.19 0.38 0.2 0.2 0.39 1.0 0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)