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Heatmap: Cluster_71 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
-0.46 -0.4 -0.21 -0.81 -0.22 1.37 0.25 -0.19 -0.77 -0.86 0.26 -0.25 -0.82 -0.27 0.16 -0.72 -0.15 -1.25 1.46 0.27
-0.71 -0.69 -0.92 -0.06 0.4 2.23 -1.57 -0.17 -2.42 -2.4 -0.38 -0.85 -0.58 -0.76 -0.03 -2.3 -2.01 1.21 0.73 0.74
0.01 0.37 0.36 -0.19 0.3 0.98 -0.32 -0.14 -0.39 -0.49 -0.14 -0.91 -1.52 -1.86 0.12 -0.73 -0.52 0.5 0.79 0.63
-1.58 -1.29 -2.0 -0.9 0.69 1.17 -0.45 0.41 -0.47 -0.36 0.07 0.09 0.64 0.5 0.15 -1.0 -0.63 0.26 0.89 -0.65
-0.34 0.27 0.34 -0.14 0.49 0.79 -0.78 0.12 -0.93 -1.07 -0.13 -0.36 -0.69 -1.04 -0.21 -1.29 -0.78 0.86 1.15 0.42
0.02 -0.27 -0.87 -0.4 0.12 1.78 -2.56 0.14 -1.39 -1.17 0.16 -0.4 -0.97 -0.62 0.13 -0.84 0.12 0.22 0.5 0.91
-0.35 -0.24 -0.46 -0.47 0.12 0.71 0.53 -0.1 -0.5 -0.41 -0.24 -0.57 0.04 -0.02 -0.07 -0.35 0.07 0.3 0.49 0.49
-1.53 -3.1 -1.39 -0.23 -1.18 0.64 -1.2 0.35 -1.59 -1.26 0.85 1.11 0.87 1.35 1.02 -3.56 -0.9 -0.52 -1.15 0.77
-2.56 - -3.45 - -2.44 1.04 -1.75 0.35 -0.64 -0.9 1.44 1.58 0.51 1.08 1.45 -1.31 -1.38 -0.55 -4.06 0.32
-0.79 -0.09 -0.3 -0.06 0.22 0.71 -0.18 0.17 -0.08 -0.37 -0.5 -0.51 -0.38 -0.39 -0.48 -0.29 0.41 0.6 0.93 -0.07
-0.68 0.29 -0.42 0.04 0.73 1.54 -0.39 0.07 -1.56 -1.45 -1.42 -0.69 -1.59 -1.64 -1.33 -0.92 -1.07 1.69 0.1 0.96
0.35 -0.11 0.11 0.13 0.56 0.47 -1.21 -0.06 -0.95 -0.72 -0.13 -0.86 -0.13 -0.3 -0.13 -0.93 -0.66 0.77 1.09 0.2
0.7 -0.23 -0.43 0.11 0.16 0.81 -1.15 0.34 -0.7 -0.78 0.27 -0.93 -0.1 -0.75 0.39 -1.36 -0.94 0.36 0.31 0.94
0.39 0.17 -0.05 0.28 0.47 0.8 -1.45 -0.06 -1.14 -1.2 -0.44 -1.19 -1.52 -1.81 -0.55 -0.51 -0.43 0.85 1.36 0.81
-0.38 -0.22 -0.1 0.04 0.04 0.15 -0.17 0.04 -1.31 -1.14 -0.18 -0.29 -0.98 -0.8 -0.22 -1.1 -0.37 0.32 1.31 1.53
-0.46 0.43 0.19 -0.57 0.35 0.45 -0.53 -0.26 -0.33 -0.2 -1.19 -0.02 -2.58 -2.26 -1.04 -1.33 -0.18 0.56 1.1 1.63
0.3 -0.1 -0.14 0.33 0.77 1.03 -1.41 0.32 -0.53 -0.68 -0.68 -0.23 -0.31 -0.48 -0.51 -0.79 -0.83 0.75 0.58 -0.04
1.27 0.32 0.37 -0.65 0.31 -0.24 -0.78 0.31 -0.43 -0.28 -0.42 -0.07 -0.19 0.27 -1.15 -2.13 -1.2 0.3 1.13 -0.65
-0.36 0.16 -0.11 0.04 0.49 0.37 -0.04 -0.05 -0.53 -0.53 -0.49 0.0 -0.15 -0.13 -0.43 -0.88 -0.4 0.53 0.96 0.23
0.27 -0.33 -0.38 0.31 0.4 0.48 0.48 0.07 -0.66 -0.65 0.2 -0.36 -0.75 -0.98 0.23 -1.08 -0.67 0.31 0.96 0.1
-1.25 -1.93 -2.84 -4.3 -1.74 2.29 -0.72 0.46 -0.49 -0.86 0.78 -1.5 0.48 -0.57 0.78 -3.91 -1.92 -1.24 0.28 1.52
0.58 -1.27 -0.4 0.19 0.51 1.09 0.47 -0.44 -1.47 -2.04 -2.67 -0.67 -3.42 -3.86 -1.4 -0.35 -0.36 1.52 1.39 0.61
0.54 -0.51 -0.69 -0.02 0.14 0.24 -0.57 0.24 -0.65 -0.57 -0.21 0.13 -1.26 -1.37 -0.37 -1.31 -0.92 0.75 1.49 0.87
-0.63 -0.31 -0.03 -0.05 -0.12 0.7 -0.28 0.07 -0.65 -0.7 0.43 -0.17 -0.1 -0.27 0.31 -0.54 -0.23 0.26 0.62 0.51
0.61 -1.29 -0.26 0.1 0.07 1.73 -4.46 0.33 -1.34 -1.29 -0.09 0.56 -2.64 -2.47 -0.65 -2.22 -0.81 0.24 -2.14 2.05
0.18 -0.35 -0.14 -0.02 0.64 1.3 -0.26 0.0 -0.83 -0.96 -0.51 -0.45 -0.34 -0.26 -0.48 -1.04 -0.51 0.74 0.45 0.33
-0.41 -0.55 -0.5 -0.32 0.41 1.78 0.89 -0.37 -1.61 -1.56 -1.53 -0.87 -1.56 -1.79 -1.61 -1.95 -1.16 0.96 0.92 1.38
0.79 -0.03 0.38 0.29 -0.21 0.21 -0.39 0.13 -1.08 -1.02 -0.47 -0.25 -0.53 -0.59 -0.41 -1.03 -0.52 0.53 1.05 0.62
0.3 -2.01 -0.31 0.47 0.01 1.68 0.15 0.42 -1.2 -1.0 -0.77 -0.3 -0.26 -0.34 -1.08 -1.59 -1.02 0.3 -0.12 1.17
-0.76 -0.13 -0.76 -1.35 0.25 1.28 -0.99 -0.3 -1.2 -1.14 0.79 -0.27 -2.11 -2.41 0.82 -1.15 -1.66 1.03 0.97 1.13
0.63 0.69 0.23 -0.35 0.31 -0.18 0.4 -0.03 -0.24 0.24 -0.5 -0.59 -0.12 -0.32 -0.53 -0.35 -0.74 -0.12 -0.06 0.48
0.91 -0.16 -0.02 0.65 0.27 -0.05 -0.88 0.4 -0.68 -0.79 -0.16 -1.2 -0.27 -0.54 -0.18 -0.98 -0.83 0.67 1.17 -0.35
0.2 -0.04 -0.11 -0.17 0.03 0.94 -1.24 0.16 -0.62 -0.69 0.2 -0.35 0.29 -0.07 0.09 -0.59 -0.47 -0.03 0.3 0.62
-0.09 -0.0 0.24 0.42 0.04 0.32 0.18 -0.05 -0.63 -0.59 -0.45 -0.41 -0.5 -0.44 -0.36 -0.62 -0.37 0.36 0.97 0.56
-1.58 -0.53 -2.33 -1.46 -0.14 1.61 -2.47 -0.52 -0.91 -0.6 1.05 -1.24 -1.59 -1.57 1.26 -0.42 -1.46 1.19 1.16 0.25
-1.27 -0.14 -2.01 -1.19 -0.05 1.32 -1.79 -0.61 -0.56 -0.82 0.79 -1.27 -0.92 -1.11 0.96 0.05 -0.99 1.4 0.67 0.59
-0.79 -0.85 -0.66 -0.19 0.29 1.91 -3.49 -0.36 -0.84 -0.65 0.26 -0.46 -1.48 -1.25 -0.05 -0.74 -0.32 0.78 1.17 0.36
-2.85 - - - -1.07 0.46 0.3 -2.78 - - - - - - - - - -0.89 -0.63 3.95
0.88 -1.23 0.07 -0.93 0.44 1.29 -2.53 0.37 -1.07 -1.52 -1.16 -0.81 -0.83 -1.13 -0.73 -2.0 -1.43 1.26 0.39 1.63
-0.07 0.83 -0.07 -0.35 -0.0 1.3 0.36 -0.13 -0.62 -0.68 -0.41 -1.21 -1.33 -1.57 -0.16 -0.94 -1.14 -0.39 1.01 1.03
-0.08 0.24 0.07 0.35 0.37 0.65 0.05 -0.2 -0.85 -0.88 -0.32 -0.8 -0.81 -0.79 -0.17 -0.63 -0.33 0.59 0.94 0.49
-0.91 -0.54 -0.84 -0.29 0.32 0.49 -0.67 0.38 -0.53 -0.54 0.43 -0.36 0.13 -0.11 0.6 -0.83 -0.52 0.35 0.96 0.38
0.11 -0.16 -0.71 0.04 0.49 0.87 0.39 0.07 -0.6 -0.75 -0.02 -0.68 -0.05 -0.25 0.11 -0.26 -0.89 0.35 0.54 -0.09
-0.26 -1.79 -1.03 0.17 0.13 -0.8 -0.09 0.28 -0.07 -0.25 0.53 -0.94 0.53 0.25 0.39 -0.74 -0.28 -0.03 0.29 1.08
-0.19 -0.73 -0.28 -0.07 -0.39 0.51 -0.4 -0.02 -0.28 -0.22 0.51 -0.9 0.16 0.01 0.64 -0.5 -0.33 0.33 0.72 0.12
0.18 -0.32 -0.28 0.13 1.01 2.0 0.03 -0.25 -2.72 -2.64 -1.91 -1.51 -2.9 -2.59 -1.32 -3.37 -1.32 1.22 1.55 -0.18
-0.31 -0.27 -0.41 0.37 0.47 0.87 0.09 0.0 -0.56 -0.74 0.34 -0.68 -1.35 -1.31 0.33 -0.62 -0.42 0.61 1.02 -0.16
0.17 -0.65 -0.53 0.19 0.64 0.8 -0.35 0.26 -0.41 -0.48 0.61 -0.56 -0.31 -0.81 0.37 -0.21 -1.02 -0.07 0.52 0.03
0.07 -0.26 -0.94 0.13 0.57 1.11 -0.4 0.24 -0.39 -0.58 -0.12 -0.71 0.59 0.16 -0.03 -0.8 -1.12 -0.17 0.81 -0.6
0.07 0.48 -0.18 -0.59 0.66 1.15 -0.69 0.35 -0.55 -0.87 -0.38 -0.93 0.66 0.15 -0.03 -1.04 -0.93 0.04 0.62 -0.85
-0.01 -0.13 0.2 0.22 0.07 -0.43 -0.63 0.19 -0.41 -0.46 0.46 -0.62 -0.07 -0.59 0.68 -0.58 -0.45 0.26 0.91 0.0
0.37 0.63 0.83 0.22 0.67 0.52 0.1 -0.14 -0.68 -1.0 -1.07 -0.78 -0.78 -1.13 -0.89 -0.8 -1.03 0.44 1.17 -0.38
0.19 -0.44 -0.37 -0.3 0.87 0.41 -0.61 0.09 -0.07 -0.38 -0.59 -0.68 -0.62 -0.91 -0.61 -0.41 -0.52 0.81 0.72 0.97
0.02 -0.22 -0.4 -0.14 0.69 0.19 -0.65 0.08 -0.51 -0.56 0.06 -0.6 -0.05 -0.04 -0.09 -0.68 -0.47 0.55 0.86 0.51
-0.11 0.4 -0.14 -0.05 0.41 0.4 -0.69 0.13 -0.62 -0.71 -0.42 -0.4 -1.12 -1.5 -0.55 -0.92 -0.3 0.78 1.41 0.63
-0.66 -1.36 -0.79 -0.53 -1.25 1.7 -1.26 0.1 -0.19 -0.49 -0.24 -1.48 -0.18 -0.32 -0.23 0.62 -0.14 0.04 0.98 0.82
-0.41 -0.8 -1.8 -2.69 -0.65 2.5 -0.82 -1.06 -1.63 -1.65 -0.01 -1.44 -4.26 -4.24 0.38 -2.01 -1.77 -0.84 1.55 1.79
-1.02 -0.9 -2.02 -0.12 0.39 0.71 -1.67 -0.03 -0.54 -0.85 -0.07 -0.3 -0.03 -0.18 -0.06 0.03 -0.53 1.07 1.86 -1.72
-1.09 -0.61 0.31 -1.0 -0.42 1.49 -0.9 -0.4 -1.69 -1.18 -1.26 -0.73 -7.28 -4.78 -0.88 -2.32 -1.52 0.41 0.58 2.71
0.09 -1.88 -0.82 -0.24 -0.08 -1.41 -0.56 0.06 -0.46 -0.83 -0.24 -0.58 -0.56 -0.28 -0.01 -0.54 -0.38 0.45 1.7 1.5
0.09 -2.45 -0.78 0.09 -0.85 -0.88 -0.87 -0.01 -0.39 -0.96 -0.17 -0.25 -0.18 0.11 0.42 -0.23 -0.13 0.44 1.01 1.61
-0.26 0.35 0.61 0.61 0.67 0.54 0.14 -0.12 -0.56 -0.55 -0.83 -0.24 -0.96 -1.34 -0.57 -0.86 -0.18 0.46 0.64 0.09
0.13 0.99 0.98 -0.19 -0.32 0.57 0.28 0.07 -0.66 -0.67 -0.34 -0.54 -0.29 -0.23 -0.34 -0.88 -0.67 -0.72 0.69 -0.09
-0.02 0.19 0.46 0.15 0.04 1.01 0.37 0.02 -0.75 -0.73 -0.21 -0.75 -0.45 -0.46 -0.38 -1.23 -0.53 0.31 0.77 0.12
-1.27 -0.98 -1.4 -0.5 0.09 1.43 -1.23 0.02 -0.86 -0.59 0.02 -0.27 -1.17 -1.22 0.28 -0.79 -0.6 0.1 1.38 1.45
-0.02 -1.49 -0.26 0.24 -0.23 2.07 1.51 0.01 -2.07 -1.84 0.09 -1.89 -2.56 -2.57 0.45 -3.16 -2.39 -0.54 0.71 0.63
-1.76 -2.64 -4.65 - -0.73 1.72 -2.1 1.04 0.55 0.19 -0.72 -1.44 -0.34 -0.98 -0.13 -2.62 -2.01 -1.63 2.05 1.42
-1.24 -1.91 -4.08 - -0.82 1.7 -1.93 0.83 0.14 0.3 -1.56 -1.89 -0.66 -0.97 -0.77 - -3.96 -1.6 1.87 2.22
0.48 -0.39 0.01 -0.06 -0.52 1.22 -0.14 -0.02 -1.0 -0.91 -0.77 -0.41 -1.38 -1.68 -0.63 -0.97 -0.96 0.99 1.28 0.84
-0.23 -0.11 -0.44 -0.8 0.31 1.49 -1.71 0.25 -1.05 -1.03 -0.17 -0.2 -0.06 0.16 0.07 -1.03 -1.11 0.82 0.69 0.23
-0.23 -0.56 -0.75 -0.55 0.17 -0.99 -2.09 0.28 -0.59 -0.33 -0.16 -0.48 -0.12 -0.55 -0.29 -1.15 -0.11 0.77 1.23 1.67
-0.31 -0.59 -0.79 0.18 0.77 1.19 -1.01 -0.08 -1.8 -1.77 -1.01 -0.14 0.35 -0.01 -0.92 -1.74 -0.84 0.92 0.77 1.12
-0.46 -0.19 0.55 0.53 0.3 0.74 0.69 0.09 -1.0 -0.91 -0.06 -0.77 -0.19 -0.68 -0.13 -2.04 -0.74 0.26 1.1 -0.41
-0.28 -0.46 0.65 0.18 0.35 0.27 1.2 0.04 -0.27 -0.41 0.15 -1.11 -0.63 -0.82 -0.07 -1.53 -1.06 0.3 0.63 0.02
0.06 0.45 -0.16 0.1 -0.25 0.45 0.15 0.03 -0.08 -0.08 -0.02 -0.28 -0.49 -0.76 -0.05 -0.25 -0.22 -0.42 0.55 0.49
0.62 -0.43 -0.14 0.34 0.43 1.15 -0.44 0.01 -1.04 -1.0 -0.32 -0.97 -0.75 -0.81 -0.1 -1.34 -1.23 1.0 0.41 0.76
-0.32 0.66 0.14 -0.32 1.4 2.26 -0.82 0.1 -1.77 -2.28 -1.52 -0.33 -3.2 -3.92 -1.83 -5.64 -2.83 0.82 -0.94 1.06
-0.47 -0.09 0.11 -0.54 0.86 2.14 -0.77 0.03 -1.75 -1.95 -0.88 -0.35 -0.91 -2.27 -2.64 -3.03 -4.56 0.43 -2.27 2.08
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0.26 -0.92 -0.14 0.17 0.21 1.21 -1.14 0.13 -0.35 -0.28 0.12 -0.68 0.05 -0.13 -0.02 -0.55 -0.28 0.35 0.42 -0.23
-0.45 -0.53 -0.57 -0.68 0.64 1.13 -0.74 0.15 -0.54 -0.66 -0.3 -0.47 -1.11 -1.07 -0.19 -0.93 -0.79 0.84 1.67 0.1
0.36 -0.41 0.13 0.22 0.46 1.29 -0.92 0.31 -0.84 -0.92 0.1 -0.51 -0.73 -0.88 0.12 -0.91 -0.68 -0.17 0.79 0.31
- - - -0.95 -0.85 2.48 - 0.66 -0.38 -0.29 -0.34 -0.56 1.04 1.32 0.02 0.14 0.2 -0.72 -1.81 -
-6.45 -8.45 -8.61 -2.06 -0.31 2.54 -7.7 0.58 -0.35 -0.22 -0.81 -0.81 0.89 1.46 -0.62 0.49 0.01 -0.19 -2.59 -3.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.