Heatmap: Cluster_198 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.25 0.0 0.0 0.4 0.0 0.14 0.0 0.84 1.87 2.5 0.0 0.0 0.24 0.46 0.44 0.85 0.92 0.11 0.77 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 1.03 4.52 3.27 0.7 0.0 1.11 0.23 1.7 8.52 3.84 0.27 2.05 0.0
0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.07 0.05 0.01 0.0 0.03 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06
0.01 0.0 0.03 0.0 0.05 0.36 0.0 0.53 2.19 0.92 0.43 0.02 1.05 2.27 0.34 0.06 0.01 0.02 0.27 0.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.0 0.09 0.0 1.18 0.0 0.0 1.19 0.5 0.28 0.12 0.11 0.64 0.94 0.35 0.48 0.0 0.79 0.61 0.26
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.31 0.0 0.1 0.53 0.19 0.55 0.0 0.13 0.03 0.3 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.06 0.0 0.0 0.36 0.37 0.0 0.07 0.09 0.12 0.13 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.59 0.0 0.0 0.11 0.7
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.57 0.4 0.66 0.0 0.18 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.06 0.0 0.09 0.0 0.07 0.0 0.0 0.3 0.39 0.08 0.17 0.0
2.79 0.87 0.45 0.0 3.12 0.91 2.36 0.89 1.81 0.93 0.81 0.66 0.34 0.0 0.13 1.33 2.04 1.94 0.0 2.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.04 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.14 0.05 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.12 0.11 0.0 0.0 0.02 0.11 0.08 0.0 0.11 0.0 0.0 0.31 0.06
0.04 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.15 0.12 0.34 0.04 0.23 0.23 0.12 0.11 0.15 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 1.4 0.0 0.0 0.0 2.21 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.64 0.27 0.03 0.42 0.33 0.05 0.03 0.56 0.39 0.32 0.44 0.08 0.05 0.13 0.6 0.5 0.24 0.29 0.15 0.63
1.24 0.0 2.46 0.0 0.0 0.0 2.73 1.05 0.0 0.0 2.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.23 0.0 0.0 0.7 0.24 0.0 0.07 0.26 0.0 0.12 0.1 0.03 0.28 0.27 0.3 0.53 0.46 0.1 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0
0.02 0.04 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.22 0.25 0.24 0.04 0.12 0.06 0.19 0.0 0.0 0.23 0.03 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.71 0.0 0.06 13.47 19.51 15.13 0.35 52.06 88.52 65.19 39.86 54.96 36.47 60.85 50.1 31.85 37.52 13.19 30.85 15.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.58 0.22 0.43 0.61 0.73 0.0 0.12 2.56 6.22 7.53 4.23 3.75 2.54 2.09 4.06 0.38 1.33 0.18 0.22 0.68
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.15 0.5 0.0 0.0 0.22 0.0 0.12 0.71 0.17 0.38 0.65 0.0 1.01 0.39 1.27 1.5 0.63 1.08 1.73 0.21
0.25 0.0 0.0 0.4 0.0 0.14 0.0 0.84 1.87 2.5 0.0 0.0 0.24 0.46 0.44 0.85 0.92 0.11 0.77 0.3
0.03 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.05 0.03
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.12 0.91 0.38 0.59 0.07 0.06 0.09 0.11 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.43 0.14 0.34 0.0 0.04 0.02 0.16 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.09 0.0 0.13 0.1 0.13 0.04 0.04 0.08 0.12 0.02 0.0 0.01 0.14 0.06 0.0 0.04 0.15 0.0 0.1 0.03
0.0 0.0 1.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.13 0.06 0.12 0.0 0.12 0.07 0.0 0.0 0.13 0.0 0.13 0.29 0.0 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.24 0.11 0.1 0.07 0.03 0.03 0.01 0.13 0.19 0.14 0.03 0.0 0.0
0.0 0.21 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.07 0.11 0.09 0.03 0.04 0.1 0.0 0.27 0.24 0.0 0.1 0.09
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.19 0.19 0.08 0.0 0.17 0.16 0.07 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 2.6 11.95 6.59 3.81 0.37 12.95 15.99 4.15 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03
0.37 0.24 0.56 0.19 0.79 16.93 0.05 42.0 64.46 71.64 55.69 23.04 100.86 112.73 62.07 4.3 4.76 0.88 0.59 21.45
0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0
0.03 0.05 0.04 0.21 0.0 0.0 0.04 0.05 0.03 0.04 0.08 0.02 0.03 0.02 0.15 0.12 0.08 0.0 0.05 0.02
0.63 0.0 0.0 0.44 0.45 0.0 0.37 0.5 0.95 0.86 0.51 0.07 0.62 0.79 1.08 1.15 0.53 0.0 0.55 1.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.0 0.04 0.16 0.14 0.04 0.12 0.22 0.19 0.12 0.22 0.01 0.0 0.0 0.65 0.06 0.06 0.11 0.11 0.04
0.0 3.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.36 1.56 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13.54 89.85 10.61 15.83 3.54 31.94 48.2 23.03 0.92 1.8 0.1 0.44 0.0
0.0 0.17 0.0 0.75 0.24 1.02 0.18 32.77 112.86 64.71 16.96 17.64 65.45 78.11 25.3 2.4 7.66 0.22 3.18 0.03
0.29 0.0 0.12 0.35 0.09 0.15 0.19 0.12 0.04 0.18 0.04 0.0 0.1 0.17 0.18 0.0 0.09 0.0 0.06 0.17
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.1 0.06 0.0 0.09 0.0 0.08 0.0 0.18 0.43 0.11 0.0 0.1 0.25
0.24 0.0 0.06 0.19 0.03 0.04 0.06 0.06 0.05 0.03 0.4 0.02 0.07 0.16 0.19 0.2 0.0 0.23 0.06 0.15
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.12 0.07 0.03 0.05 0.76 0.0 0.0 0.0 0.62 0.29 0.0 0.17 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)