Heatmap: Cluster_198 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00540	0.1	0.0	0.0	0.16	0.0	0.06	0.0	0.34	0.75	1.0	0.0	0.0	0.09	0.18	0.18	0.34	0.37	0.04	0.31	0.12
Gb_00688	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_00827	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.12	0.53	0.38	0.08	0.0	0.13	0.03	0.2	1.0	0.45	0.03	0.24	0.0
Gb_01034	0.7	0.0	0.11	0.0	0.06	0.94	0.03	0.3	1.0	0.67	0.18	0.03	0.44	0.52	0.26	0.0	0.0	0.0	0.61	0.8
Gb_01035	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.16	0.0	0.23	0.96	0.41	0.19	0.01	0.46	1.0	0.15	0.03	0.01	0.01	0.12	0.25
Gb_01343	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01690	0.18	0.0	0.08	0.0	0.99	0.0	0.0	1.0	0.42	0.24	0.1	0.09	0.54	0.79	0.29	0.4	0.0	0.67	0.51	0.22
Gb_03894	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.56	0.0	0.19	0.97	0.34	1.0	0.0	0.23	0.05	0.54	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0
Gb_06142	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0
Gb_06454	0.08	0.0	0.0	0.51	0.53	0.0	0.1	0.12	0.18	0.18	0.0	0.0	0.05	0.0	0.07	0.84	0.0	0.0	0.15	1.0
Gb_06801	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07114	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.86	0.6	1.0	0.0	0.27	0.2	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07815	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.38	0.15	0.0	0.23	0.0	0.19	0.0	0.0	0.77	1.0	0.21	0.43	0.0
Gb_08017	0.9	0.28	0.15	0.0	1.0	0.29	0.76	0.28	0.58	0.3	0.26	0.21	0.11	0.0	0.04	0.43	0.65	0.62	0.0	0.66
Gb_10085	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.61	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12254	0.15	0.69	0.31	1.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13030	0.0	0.0	0.0	1.0	0.33	0.0	0.34	0.24	0.0	0.0	0.0	0.08	0.36	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0
Gb_13727	0.24	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.38	0.35	0.0	0.0	0.06	0.36	0.25	0.0	0.36	0.0	0.0	1.0	0.21
Gb_13848	0.1	0.91	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.44	0.36	1.0	0.11	0.66	0.67	0.36	0.33	0.44	0.0	0.15	0.0
Gb_15466	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.21	0.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15850	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	1.0
Gb_15909	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0
Gb_16556	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16656	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.62	0.0	0.61	0.0	0.52	0.44	0.54	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17440	1.0	0.42	0.05	0.65	0.51	0.07	0.05	0.87	0.61	0.49	0.68	0.12	0.09	0.2	0.94	0.77	0.37	0.45	0.23	0.98
Gb_17609	0.45	0.0	0.9	0.0	0.0	0.0	1.0	0.39	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18323	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18413	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_18701	0.32	0.0	0.0	1.0	0.34	0.0	0.1	0.37	0.0	0.18	0.14	0.04	0.39	0.39	0.42	0.75	0.65	0.15	0.21	0.0
Gb_18702	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.18	0.0	1.0	0.0	0.42	0.19	0.45	0.83	0.0	0.0	0.91	0.0
Gb_19021	0.15	0.34	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.09	0.0	0.08	0.06	0.0	0.13	0.25	0.22	0.0	0.36	0.0
Gb_19070	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19287	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19482	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19658	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.86	1.0	0.95	0.14	0.49	0.24	0.77	0.0	0.0	0.92	0.14	0.0	0.4
Gb_21216	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21295	0.04	0.0	0.0	0.15	0.22	0.17	0.0	0.59	1.0	0.74	0.45	0.62	0.41	0.69	0.57	0.36	0.42	0.15	0.35	0.17
Gb_21336	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22353	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25185	0.08	0.03	0.06	0.08	0.1	0.0	0.02	0.34	0.83	1.0	0.56	0.5	0.34	0.28	0.54	0.05	0.18	0.02	0.03	0.09
Gb_25593	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.47	0.0	0.0	0.0	0.36	0.22	0.29	0.5	0.33	0.0	0.23	0.0
Gb_26205	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	1.0	0.7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26330	0.67	0.29	0.0	0.0	0.13	0.0	0.07	0.41	0.1	0.22	0.38	0.0	0.58	0.22	0.73	0.86	0.36	0.62	1.0	0.12
Gb_26436	0.1	0.0	0.0	0.16	0.0	0.06	0.0	0.34	0.75	1.0	0.0	0.0	0.09	0.18	0.18	0.34	0.37	0.04	0.31	0.12
Gb_26853	0.23	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.26	0.11	0.0	0.27	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.21	0.13
Gb_28748	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.69	0.0	0.67	0.4
Gb_30538	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.67	0.48	0.0	0.69	0.68	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.63	0.0
Gb_30959	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.14	1.0	0.42	0.65	0.08	0.06	0.1	0.12	0.0	0.0	0.07	0.0	0.06
Gb_30960	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.19	1.0	0.32	0.78	0.01	0.1	0.05	0.37	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_31339	0.61	0.0	0.82	0.65	0.86	0.23	0.24	0.51	0.78	0.11	0.0	0.05	0.89	0.37	0.0	0.24	1.0	0.0	0.63	0.17
Gb_31553	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31828	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32039	0.41	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.41	0.19	0.37	0.0	0.36	0.22	0.0	0.0	0.39	0.0	0.4	0.88	0.0	1.0
Gb_32270	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32729	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	1.0	0.47	0.43	0.29	0.11	0.13	0.06	0.53	0.79	0.58	0.14	0.0	0.0
Gb_33052	0.0	0.79	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77	0.24	0.4	0.34	0.1	0.14	0.38	0.0	1.0	0.88	0.0	0.39	0.33
Gb_33728	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33967	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.98	1.0	0.42	0.0	0.9	0.81	0.38	0.0	0.47	0.0	0.15	0.0
Gb_34156	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.16	0.75	0.41	0.24	0.02	0.81	1.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34158	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.15	0.0	0.37	0.57	0.64	0.49	0.2	0.89	1.0	0.55	0.04	0.04	0.01	0.01	0.19
Gb_35280	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.39	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.0
Gb_35819	0.16	0.23	0.2	1.0	0.0	0.0	0.19	0.25	0.13	0.18	0.39	0.08	0.13	0.08	0.72	0.54	0.37	0.0	0.21	0.09
Gb_36180	0.5	0.0	0.0	0.35	0.36	0.0	0.3	0.4	0.76	0.69	0.41	0.06	0.5	0.63	0.87	0.93	0.42	0.0	0.44	1.0
Gb_36578	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36708	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36744	0.35	0.0	0.06	0.24	0.22	0.06	0.19	0.34	0.29	0.19	0.33	0.02	0.0	0.0	1.0	0.09	0.09	0.17	0.17	0.06
Gb_37128	0.0	0.9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.36	0.0	0.0
Gb_38238	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38768	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	1.0	0.12	0.18	0.04	0.36	0.54	0.26	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0
Gb_38774	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.29	1.0	0.57	0.15	0.16	0.58	0.69	0.22	0.02	0.07	0.0	0.03	0.0
Gb_38944	0.82	0.0	0.35	1.0	0.25	0.42	0.53	0.35	0.1	0.51	0.11	0.0	0.28	0.48	0.5	0.0	0.24	0.0	0.18	0.49
Gb_39193	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.15	0.24	0.14	0.0	0.22	0.0	0.18	0.0	0.41	1.0	0.24	0.0	0.23	0.59
Gb_40516	0.61	0.0	0.15	0.48	0.07	0.09	0.14	0.16	0.11	0.08	1.0	0.04	0.17	0.4	0.46	0.51	0.0	0.56	0.15	0.36
Gb_41106	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.15	0.09	0.04	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.38	0.0	0.22	0.0	0.0
Gb_41129	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)