Heatmap: Cluster_219 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.83 0.7 0.98 1.0 0.82 0.59 0.74 0.49 0.33 0.28 0.35 0.37 0.45 0.44 0.38 0.34 0.43 0.63 0.46 0.55
0.68 0.3 0.64 0.9 1.0 0.79 0.11 0.69 0.51 0.42 0.6 0.5 0.17 0.15 0.59 0.57 0.54 0.72 0.37 0.24
0.26 0.46 0.36 0.38 0.33 0.64 0.27 0.49 0.57 0.46 1.0 0.37 0.45 0.53 0.95 0.66 0.58 0.27 0.48 0.22
0.54 1.0 0.67 0.28 0.57 0.14 1.0 0.16 0.07 0.07 0.04 0.06 0.02 0.01 0.06 0.17 0.04 0.24 0.59 0.19
0.2 0.18 0.34 0.06 0.38 1.0 0.53 0.32 0.17 0.2 0.59 0.38 0.31 0.27 0.45 0.06 0.04 0.2 0.17 0.08
0.53 0.31 0.16 0.39 0.72 0.08 0.93 0.13 0.11 0.08 0.14 0.04 0.03 0.07 0.16 0.13 0.09 0.48 1.0 0.7
0.42 0.94 0.39 0.38 0.39 0.08 1.0 0.02 0.0 0.01 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.02
0.35 0.72 0.31 0.56 0.7 1.0 0.4 0.42 0.27 0.26 0.64 0.31 0.14 0.15 0.75 0.27 0.25 0.55 0.94 0.5
0.15 0.9 1.0 0.43 0.37 0.04 0.94 0.05 0.02 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.07 0.14 0.12 0.08
0.36 0.49 0.43 0.76 0.93 0.33 1.0 0.15 0.04 0.04 0.07 0.14 0.08 0.08 0.09 0.18 0.27 0.67 0.57 0.65
0.08 0.11 0.06 0.1 0.4 0.52 0.04 0.3 0.29 0.31 0.8 0.42 0.26 0.22 1.0 0.23 0.19 0.15 0.18 0.58
0.3 0.58 0.38 0.43 0.88 1.0 0.57 0.49 0.5 0.45 0.77 0.47 0.37 0.32 0.82 0.39 0.39 0.54 0.66 0.52
0.38 0.58 0.3 0.36 0.66 1.0 0.36 0.38 0.3 0.34 0.45 0.33 0.19 0.21 0.53 0.3 0.24 0.62 0.44 0.61
0.15 0.0 0.0 0.48 0.33 0.8 0.46 0.17 0.11 0.13 1.0 0.18 0.0 0.03 0.47 0.21 0.26 0.2 0.87 0.07
0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.03 0.0 0.01 0.04 0.01 0.01 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03
0.68 0.65 0.77 0.72 0.79 1.0 0.74 0.61 0.59 0.64 0.84 0.39 0.39 0.3 0.79 0.46 0.55 0.57 0.99 0.82
0.02 0.01 0.01 0.2 0.02 0.99 1.0 0.37 0.69 0.44 0.75 0.23 0.95 0.52 0.47 0.6 0.38 0.09 0.09 0.01
0.55 0.65 0.5 0.57 1.0 0.69 0.74 0.46 0.21 0.27 0.59 0.37 0.59 0.52 0.59 0.17 0.22 0.33 0.13 0.41
0.29 0.42 0.42 0.39 0.63 0.47 0.36 0.63 0.67 0.61 1.0 0.56 0.28 0.43 0.95 0.73 0.56 0.15 0.31 0.2
0.36 0.15 0.27 0.17 0.55 0.07 0.11 0.32 0.31 0.35 1.0 0.23 0.39 0.4 0.74 0.15 0.24 0.21 0.04 0.49
0.47 0.41 0.29 0.47 0.47 0.17 0.16 0.4 0.23 0.17 1.0 0.57 0.17 0.2 0.73 0.96 0.49 0.4 0.08 0.17
0.77 0.92 0.9 0.57 0.93 1.0 0.45 0.73 0.65 0.62 0.72 0.6 0.9 0.82 0.81 0.59 0.52 0.82 0.76 0.53
0.24 0.3 0.27 0.29 1.0 0.43 0.04 0.48 0.6 0.61 0.65 0.42 0.42 0.61 0.64 0.45 0.38 0.68 0.11 0.22
0.05 0.05 0.12 0.04 0.31 1.0 0.4 0.21 0.16 0.17 0.13 0.14 0.01 0.05 0.13 0.08 0.34 0.43 0.63 0.15
0.0 0.01 0.0 0.01 0.07 0.04 1.0 0.57 0.79 0.85 0.41 0.28 0.45 0.39 0.5 0.24 0.31 0.19 0.39 0.04
0.63 0.71 0.39 0.71 0.8 0.61 1.0 0.39 0.28 0.2 0.24 0.38 0.36 0.31 0.24 0.63 0.35 0.63 0.68 0.5
0.47 0.49 0.34 0.48 0.77 1.0 0.72 0.56 0.3 0.39 0.64 0.45 0.47 0.31 0.59 0.12 0.24 0.41 0.4 0.74
0.98 0.84 1.0 1.0 0.95 0.8 0.36 0.79 0.49 0.48 0.7 0.63 0.89 0.77 0.72 0.71 0.6 0.71 0.75 0.28
0.44 0.4 0.34 0.46 0.27 0.04 1.0 0.05 0.02 0.03 0.05 0.0 0.03 0.02 0.03 0.11 0.29 0.05 0.03 0.0
0.44 0.83 0.6 0.45 0.73 1.0 0.68 0.62 0.53 0.48 0.6 0.52 0.65 0.71 0.68 0.56 0.72 0.64 0.62 0.66
0.4 0.83 0.61 0.34 0.74 1.0 0.54 0.49 0.4 0.32 0.36 0.38 0.33 0.42 0.48 0.48 0.55 0.67 0.58 0.5
0.12 0.07 0.14 0.13 0.62 0.35 0.05 0.26 0.24 0.2 1.0 0.21 0.05 0.05 0.84 0.12 0.25 0.32 0.04 0.24
0.16 0.26 0.26 0.39 1.0 0.92 0.09 0.43 0.38 0.41 0.81 0.32 0.17 0.14 0.75 0.16 0.37 0.56 0.12 0.33
0.75 0.76 0.78 0.68 0.66 0.27 0.97 0.27 0.12 0.1 0.3 0.05 0.11 0.08 0.27 0.13 0.17 1.0 0.84 0.34
0.26 0.55 0.31 0.62 0.39 0.2 1.0 0.27 0.19 0.16 0.25 0.16 0.21 0.25 0.24 0.28 0.31 0.21 0.27 0.22
0.36 0.36 0.3 0.31 0.41 0.11 1.0 0.25 0.29 0.22 0.07 0.22 0.03 0.07 0.07 0.34 0.01 0.37 0.15 0.23
0.47 0.55 1.0 0.13 0.71 0.04 0.9 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.43 0.15
0.66 0.4 0.54 0.81 0.66 0.25 1.0 0.6 0.65 0.58 0.9 0.52 0.39 0.44 0.94 0.54 0.41 0.78 0.7 0.57
0.82 1.0 0.35 0.57 0.27 0.01 0.67 0.06 0.08 0.08 0.02 0.06 0.02 0.03 0.03 0.07 0.09 0.24 0.13 0.09
0.85 0.89 0.47 0.0 0.3 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.86 0.31 0.51 0.15 0.81 0.89 1.0 0.43 0.42 0.4 0.7 0.46 0.54 0.69 0.61 0.33 0.41 0.32 0.42 0.39
0.83 0.74 0.79 0.13 1.0 0.17 0.85 0.22 0.15 0.27 0.25 0.07 0.2 0.14 0.21 0.02 0.05 0.27 0.37 0.34
0.4 0.59 1.0 0.57 0.38 0.0 0.86 0.02 0.11 0.15 0.0 0.03 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.4 0.25 0.31 0.34 0.55 0.55 0.66 0.31 0.29 0.31 1.0 0.2 0.04 0.04 0.81 0.32 0.27 0.31 0.14 0.27
0.52 0.54 0.42 0.54 0.6 0.55 1.0 0.39 0.39 0.33 0.99 0.19 0.23 0.22 0.95 0.37 0.16 0.46 0.32 0.31
0.36 0.45 0.39 0.33 0.59 0.27 0.94 0.22 0.23 0.28 1.0 0.15 0.01 0.01 0.84 0.43 0.05 0.49 0.14 0.09
0.49 0.54 0.38 0.4 0.79 0.36 1.0 0.32 0.56 0.33 0.91 0.24 0.45 0.46 0.92 0.75 0.32 0.19 0.22 0.33
0.39 0.47 0.69 0.55 0.69 0.0 1.0 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.04 0.06 0.01
0.23 0.26 0.12 0.08 0.56 0.87 0.99 0.53 0.46 0.41 0.52 0.36 0.46 0.47 0.61 0.4 0.48 1.0 0.75 0.4
0.26 0.31 0.17 0.12 0.56 1.0 0.89 0.54 0.44 0.37 0.46 0.32 0.25 0.27 0.49 0.4 0.45 0.96 0.84 0.51
0.43 0.33 0.23 0.32 0.34 0.76 1.0 0.58 0.39 0.5 0.86 0.32 0.48 0.33 0.83 0.45 0.43 0.4 0.46 0.33
0.91 0.52 0.56 0.91 1.0 0.02 0.66 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.07 0.02 0.06
0.74 0.44 0.61 0.64 0.85 0.62 1.0 0.6 0.43 0.41 0.78 0.43 0.43 0.41 0.73 0.52 0.62 0.66 0.57 0.7
0.37 0.31 0.43 1.0 0.92 0.08 0.94 0.1 0.06 0.05 0.1 0.05 0.01 0.02 0.11 0.28 0.09 0.37 0.26 0.11
0.51 0.26 0.59 0.59 0.38 0.18 1.0 0.19 0.08 0.09 0.15 0.09 0.07 0.06 0.14 0.11 0.1 0.21 0.5 0.02
0.27 0.33 0.3 0.32 0.84 0.51 0.64 0.85 0.68 0.74 0.96 0.71 0.73 0.65 1.0 0.34 0.38 0.58 0.58 0.95
0.31 0.3 0.26 0.36 0.49 0.72 1.0 0.57 0.5 0.52 0.82 0.42 0.56 0.44 0.8 0.41 0.39 0.33 0.36 0.35
0.62 0.55 0.44 0.4 0.47 0.15 1.0 0.06 0.03 0.04 0.0 0.04 0.02 0.02 0.01 0.09 0.08 0.06 0.0 0.33
0.79 0.38 0.62 0.51 0.88 0.85 0.45 0.61 0.52 0.6 1.0 0.59 0.4 0.39 0.98 0.64 0.68 0.67 0.26 0.44
0.4 0.31 0.2 0.64 0.89 0.72 0.76 0.57 0.34 0.4 1.0 0.47 0.48 0.34 0.88 0.09 0.23 0.43 0.29 0.94
0.89 0.78 0.6 0.79 0.87 0.9 1.0 0.61 0.53 0.45 0.91 0.4 0.24 0.23 0.89 0.63 0.41 0.54 0.41 0.43
0.03 0.26 0.1 0.25 0.82 0.5 0.74 0.45 0.54 0.5 0.43 0.36 0.39 0.52 0.52 0.44 0.28 0.98 0.89 1.0
0.84 0.93 0.77 0.63 0.85 0.2 1.0 0.2 0.14 0.22 0.14 0.07 0.15 0.12 0.15 0.03 0.02 0.37 0.4 0.14
0.24 0.21 0.28 0.14 0.02 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0
0.26 0.22 0.16 0.21 0.32 0.31 0.62 0.45 0.48 0.4 1.0 0.24 0.33 0.32 0.95 0.64 0.47 0.27 0.22 0.39
0.5 0.19 0.28 0.5 0.64 1.0 0.78 0.42 0.3 0.31 0.69 0.29 0.29 0.28 0.65 0.42 0.31 0.79 0.64 0.3
0.24 0.33 0.41 0.24 0.44 0.14 1.0 0.24 0.2 0.2 0.38 0.27 0.13 0.14 0.39 0.23 0.26 0.25 0.26 0.67
0.49 0.46 0.42 0.5 0.52 0.42 1.0 0.56 0.47 0.47 0.62 0.32 0.58 0.47 0.64 0.46 0.43 0.46 0.56 0.78
0.39 0.3 0.35 0.27 0.41 0.39 1.0 0.42 0.38 0.4 0.59 0.24 0.55 0.44 0.48 0.46 0.49 0.36 0.28 0.92
0.41 0.17 0.22 0.19 0.4 0.29 1.0 0.37 0.38 0.32 0.52 0.28 0.49 0.5 0.46 0.42 0.42 0.29 0.19 0.74
0.42 0.38 0.58 0.43 0.29 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.15
1.0 0.57 0.76 0.85 0.83 0.13 0.88 0.29 0.38 0.29 0.33 0.21 0.19 0.18 0.32 0.58 0.41 0.26 0.37 0.22
0.71 0.81 1.0 0.39 0.8 0.27 0.98 0.22 0.21 0.24 0.17 0.22 0.27 0.29 0.22 0.24 0.14 0.26 0.2 0.36
0.31 0.29 0.22 0.45 0.72 0.67 0.89 0.47 0.56 0.42 1.0 0.38 0.46 0.47 0.88 0.41 0.32 0.25 0.37 0.63
0.1 0.0 0.09 0.0 0.29 1.0 0.11 0.05 0.0 0.05 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.08 0.23 0.0
0.08 0.03 0.08 0.0 0.28 1.0 0.7 0.29 0.24 0.26 0.14 0.13 0.36 0.26 0.26 0.06 0.14 0.45 0.23 0.26
0.67 0.59 0.57 0.38 1.0 0.33 0.13 0.55 0.45 0.49 1.0 0.42 0.39 0.4 0.93 0.26 0.33 0.37 0.2 0.52

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)