Heatmap: Cluster_317 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.28 0.25 0.3 0.23 0.21 0.2 0.76 0.22 0.27 0.29 0.33 0.14 0.26 0.22 0.37 0.19 0.14 0.28 1.0 0.43
0.31 0.65 0.22 0.25 0.36 0.15 0.59 0.32 0.6 0.55 0.95 0.22 0.5 0.37 1.0 0.49 0.28 0.33 0.53 0.48
0.64 0.58 0.61 0.64 0.74 0.61 1.0 0.48 0.43 0.45 0.85 0.37 0.4 0.37 0.92 0.4 0.37 0.69 0.74 0.7
0.77 0.79 0.74 0.86 0.89 0.55 0.58 0.65 0.57 0.47 0.75 0.39 0.5 0.46 0.75 0.47 0.37 0.66 1.0 0.71
0.66 0.12 0.21 0.35 0.51 0.41 1.0 0.6 0.5 0.5 0.71 0.57 0.61 0.41 0.77 0.29 0.47 0.67 0.91 0.41
0.31 0.21 0.19 0.24 0.45 0.36 0.66 0.28 0.23 0.23 0.43 0.2 0.17 0.15 0.45 0.27 0.26 0.36 0.66 1.0
0.31 0.33 0.24 0.41 0.39 0.26 0.55 0.15 0.06 0.06 0.05 0.07 0.04 0.05 0.07 0.07 0.1 0.65 1.0 0.77
0.35 0.1 0.08 0.19 0.06 0.01 0.52 0.1 0.06 0.04 0.09 0.06 0.03 0.05 0.09 0.08 0.05 0.63 1.0 0.96
0.3 0.44 0.27 0.27 0.51 0.49 0.74 0.64 0.77 0.78 0.91 0.48 0.71 0.6 1.0 0.64 0.54 0.53 0.99 0.76
0.35 0.42 0.24 0.26 0.15 0.11 1.0 0.38 0.47 0.45 0.65 0.2 0.09 0.08 0.76 0.52 0.22 0.29 0.96 0.23
0.6 0.37 0.41 0.8 0.96 0.52 0.5 0.4 0.27 0.26 0.38 0.33 0.45 0.34 0.35 0.15 0.19 0.71 0.87 1.0
0.31 0.41 0.28 0.38 0.47 0.54 0.69 0.48 0.44 0.45 0.51 0.24 0.49 0.44 0.54 0.46 0.31 0.58 0.96 1.0
0.19 0.19 0.16 0.19 0.37 0.32 0.57 0.34 0.4 0.38 0.47 0.22 0.33 0.29 0.43 0.46 0.32 0.49 0.59 1.0
0.36 0.25 0.26 0.5 0.47 0.45 0.77 0.38 0.28 0.29 0.3 0.28 0.31 0.27 0.3 0.22 0.36 0.49 1.0 0.51
0.62 0.53 0.4 0.55 0.93 0.69 1.0 0.64 0.59 0.56 0.69 0.46 0.89 0.85 0.74 0.51 0.43 0.96 0.84 0.74
0.41 0.57 0.48 0.57 0.56 0.5 0.39 0.54 0.38 0.35 0.62 0.31 0.55 0.54 0.69 0.36 0.4 0.54 1.0 0.44
0.91 0.73 0.66 0.6 0.91 0.65 0.77 0.51 0.35 0.3 0.44 0.36 0.61 0.53 0.41 0.27 0.27 0.69 1.0 0.62
0.25 0.32 0.2 0.37 0.51 0.4 0.97 0.3 0.27 0.29 0.4 0.19 0.31 0.29 0.47 0.18 0.22 0.59 1.0 0.63
0.12 0.34 0.15 0.18 0.32 0.38 0.72 0.28 0.21 0.23 0.33 0.27 0.15 0.18 0.36 0.38 0.39 0.45 1.0 0.5
0.58 0.64 0.32 0.25 1.0 0.54 0.89 0.47 0.52 0.64 0.69 0.44 0.43 0.34 0.79 0.3 0.26 0.78 0.82 0.55
0.2 0.05 0.17 0.25 0.15 0.07 1.0 0.42 0.64 0.69 0.75 0.25 0.08 0.1 0.91 0.61 0.61 0.15 0.69 0.1
0.33 0.48 0.26 0.27 0.6 0.64 1.0 0.45 0.34 0.37 0.56 0.26 0.33 0.29 0.66 0.33 0.21 0.53 0.81 0.97
0.9 0.71 0.6 0.78 0.84 0.61 1.0 0.72 0.51 0.5 0.75 0.44 0.48 0.4 0.75 0.53 0.47 0.63 0.94 0.64
0.33 0.69 0.25 0.33 0.33 0.23 0.73 0.44 0.56 0.53 0.89 0.26 0.63 0.48 1.0 0.45 0.35 0.38 0.77 0.63
0.69 0.28 0.53 0.51 0.43 0.6 0.8 0.41 0.81 0.56 0.35 0.35 0.54 0.34 0.39 0.32 0.4 0.32 1.0 0.95
0.47 0.64 0.37 0.47 0.49 0.5 1.0 0.29 0.35 0.37 0.82 0.23 0.17 0.16 0.91 0.35 0.41 0.34 0.8 0.51
0.99 0.52 0.43 0.3 0.66 0.44 0.83 0.61 0.57 0.59 0.88 0.46 0.59 0.51 0.87 0.32 0.36 0.69 1.0 0.81
0.65 0.67 0.43 0.64 0.81 0.91 1.0 0.58 0.62 0.58 0.74 0.44 0.78 0.73 0.72 0.58 0.48 0.73 0.9 0.95
0.29 0.29 0.29 0.36 0.37 0.31 0.55 0.43 0.4 0.45 0.84 0.31 0.44 0.38 0.84 0.35 0.34 0.45 1.0 0.41
0.04 0.05 0.12 0.16 0.05 0.12 1.0 0.27 0.17 0.22 0.39 0.1 0.31 0.26 0.36 0.04 0.05 0.04 0.29 0.28
0.34 0.42 0.24 0.38 0.41 0.38 0.6 0.45 0.45 0.4 0.67 0.29 0.54 0.44 0.73 0.34 0.27 0.41 1.0 0.58
0.29 0.74 0.29 0.28 0.39 0.4 0.9 0.41 0.51 0.47 0.59 0.39 0.44 0.34 0.72 0.47 0.35 0.41 1.0 0.49
0.48 0.92 0.43 0.56 0.62 0.59 0.89 0.46 0.36 0.33 0.49 0.31 0.38 0.32 0.57 0.24 0.25 0.55 1.0 0.74
0.08 0.01 0.02 0.18 0.65 0.11 0.98 0.13 0.08 0.09 0.08 0.07 0.07 0.07 0.11 0.14 0.07 0.43 1.0 0.69
0.4 0.55 0.23 0.54 0.38 0.8 0.38 0.37 0.32 0.27 0.35 0.23 0.3 0.17 0.38 0.31 0.22 0.33 1.0 0.24
0.62 0.63 0.45 0.57 0.78 0.57 0.7 0.56 0.46 0.42 0.6 0.35 0.56 0.41 0.77 0.63 0.38 0.76 1.0 0.55
0.72 0.52 0.38 0.48 0.7 0.36 1.0 0.46 0.37 0.35 0.52 0.29 0.45 0.39 0.57 0.5 0.27 0.53 0.62 0.7
0.22 0.23 0.21 0.11 0.26 0.22 0.61 0.14 0.18 0.15 0.16 0.13 0.1 0.09 0.12 0.2 0.07 0.28 1.0 0.65
0.12 0.22 0.13 0.21 0.2 0.26 1.0 0.34 0.47 0.47 0.44 0.33 0.24 0.17 0.5 0.39 0.45 0.28 0.43 0.42
0.24 0.51 0.23 0.21 0.33 0.2 1.0 0.36 0.51 0.4 0.66 0.27 0.44 0.39 0.67 0.47 0.4 0.35 0.86 0.55
1.0 0.48 0.71 0.89 0.76 0.66 0.76 0.33 0.19 0.21 0.17 0.26 0.28 0.25 0.19 0.41 0.3 0.67 0.84 0.34
0.79 0.84 0.5 0.83 0.76 0.48 0.84 0.57 0.5 0.42 0.57 0.29 0.67 0.63 0.56 0.42 0.34 0.65 1.0 0.47
0.34 0.6 0.41 0.3 0.34 0.39 0.9 0.63 0.68 0.61 0.84 0.34 0.72 0.6 0.81 0.65 0.61 0.3 1.0 0.22
0.62 0.77 0.5 0.65 0.64 0.52 0.74 0.52 0.34 0.32 0.55 0.36 0.49 0.42 0.53 0.32 0.25 0.39 1.0 0.65
0.18 0.29 0.22 0.37 0.52 0.42 0.87 0.57 0.6 0.65 0.84 0.65 0.39 0.39 0.8 0.39 0.61 0.55 1.0 0.45
0.12 0.16 0.1 0.19 0.17 0.1 0.33 0.17 0.11 0.12 0.22 0.07 0.25 0.23 0.25 0.12 0.1 0.14 1.0 0.18
0.77 0.93 0.82 0.94 0.83 0.66 0.67 0.64 0.55 0.51 0.62 0.38 0.75 0.67 0.64 0.43 0.44 0.71 1.0 0.61
0.58 0.56 0.42 0.27 0.42 0.65 0.98 0.28 0.26 0.26 0.33 0.26 0.2 0.19 0.36 0.23 0.25 0.44 0.88 1.0
0.33 0.6 0.3 0.44 0.58 0.71 1.0 0.83 0.72 0.79 0.93 0.47 0.64 0.47 0.88 0.7 0.71 0.66 0.72 0.59
0.39 0.43 0.31 0.4 0.68 0.21 0.95 0.33 0.37 0.39 0.41 0.25 0.5 0.57 0.46 0.27 0.17 0.43 1.0 0.57
0.3 0.52 0.49 0.4 0.42 0.3 1.0 0.46 0.81 0.76 0.96 0.44 0.48 0.46 0.99 0.62 0.53 0.24 0.96 0.41
0.75 0.96 0.57 0.57 0.76 0.39 1.0 0.54 0.51 0.49 0.64 0.33 0.52 0.43 0.68 0.5 0.3 0.52 0.99 0.66
0.47 0.55 0.26 0.32 0.44 0.32 1.0 0.32 0.3 0.27 0.43 0.2 0.24 0.18 0.42 0.25 0.19 0.46 0.79 0.4
0.35 0.62 0.31 0.29 0.31 0.2 0.71 0.25 0.27 0.25 0.28 0.13 0.36 0.34 0.33 0.29 0.13 0.3 1.0 0.44
0.4 0.64 0.45 0.58 1.0 0.7 0.89 0.48 0.4 0.41 0.68 0.31 0.38 0.33 0.67 0.4 0.36 0.68 0.93 0.73
0.38 0.63 0.35 0.3 0.4 0.32 1.0 0.51 0.69 0.66 0.64 0.34 0.37 0.32 0.6 0.85 0.65 0.38 0.83 0.36
0.42 0.44 0.38 0.42 0.58 0.54 1.0 0.46 0.3 0.36 0.46 0.26 0.39 0.36 0.5 0.25 0.28 0.69 0.89 0.98
0.18 0.23 0.19 0.19 0.4 0.19 0.85 0.14 0.06 0.07 0.2 0.12 0.06 0.09 0.18 0.07 0.09 0.48 1.0 0.83
0.2 0.19 0.16 0.22 0.22 0.58 0.72 0.2 0.14 0.15 0.22 0.38 0.2 0.25 0.19 0.21 0.28 0.38 0.92 1.0
0.12 0.75 0.07 0.07 0.13 0.11 0.9 0.06 0.05 0.05 0.07 0.05 0.07 0.04 0.09 0.04 0.03 0.11 1.0 0.33
0.14 0.65 0.22 0.14 0.43 0.25 0.73 0.4 0.52 0.5 0.68 0.32 0.49 0.41 0.76 0.37 0.21 0.37 1.0 0.48
0.08 0.13 0.08 0.09 0.37 0.17 1.0 0.1 0.08 0.09 0.26 0.2 0.03 0.05 0.23 0.09 0.09 0.2 0.38 0.27
0.08 0.18 0.1 0.17 0.42 0.23 1.0 0.14 0.09 0.09 0.3 0.2 0.07 0.11 0.27 0.1 0.08 0.23 0.64 0.22
0.75 0.85 0.61 0.82 0.72 0.52 0.77 0.58 0.37 0.35 0.62 0.34 0.37 0.3 0.65 0.28 0.27 0.5 1.0 0.36
0.62 0.64 0.4 0.53 0.57 0.4 0.77 0.42 0.32 0.3 0.4 0.23 0.39 0.3 0.44 0.29 0.21 0.51 1.0 0.5
0.3 0.41 0.25 0.35 0.51 0.42 0.62 0.45 0.46 0.48 0.52 0.26 0.37 0.36 0.6 0.59 0.35 0.53 1.0 0.67
0.36 0.25 0.11 0.2 0.39 0.18 0.25 0.39 0.33 0.44 0.45 0.37 0.27 0.28 0.48 0.43 0.72 1.0 0.74 0.57
0.39 0.69 0.31 0.18 0.39 0.37 0.76 0.31 0.37 0.38 0.28 0.21 0.26 0.2 0.27 0.33 0.19 0.32 0.84 1.0
0.31 0.58 0.36 0.42 0.31 0.59 0.61 0.25 0.25 0.17 0.29 0.16 0.14 0.18 0.26 0.18 0.22 0.34 1.0 0.85
0.12 0.23 0.17 0.18 0.27 0.46 0.82 0.31 0.19 0.18 0.4 0.18 0.39 0.35 0.4 0.14 0.22 0.26 1.0 0.33
0.31 0.49 0.17 0.41 0.71 0.49 0.61 0.13 0.08 0.08 0.12 0.13 0.1 0.1 0.09 0.08 0.1 0.47 1.0 0.43
0.46 0.35 0.31 0.52 0.65 0.56 1.0 0.57 0.54 0.52 0.7 0.34 0.8 0.62 0.75 0.44 0.4 0.7 0.76 0.78
0.28 0.84 0.25 0.37 0.64 0.24 0.55 0.3 0.34 0.35 0.46 0.2 0.33 0.26 0.49 0.26 0.17 0.47 1.0 0.54
0.41 0.98 0.44 0.32 0.56 0.41 1.0 0.56 0.57 0.56 0.58 0.47 0.55 0.45 0.55 0.59 0.44 0.36 0.77 0.33
0.31 0.26 0.31 0.2 0.3 0.4 1.0 0.17 0.13 0.1 0.07 0.06 0.15 0.09 0.12 0.04 0.04 0.41 0.86 0.85
0.56 0.48 0.35 0.49 0.64 0.57 1.0 0.47 0.41 0.38 0.45 0.32 0.48 0.39 0.48 0.37 0.31 0.57 0.88 0.64
0.41 0.95 0.22 0.22 0.37 0.16 0.96 0.22 0.33 0.31 0.62 0.18 0.33 0.22 0.65 0.41 0.19 0.32 1.0 0.43
0.16 0.45 0.18 0.29 0.43 0.39 0.57 0.51 0.46 0.43 0.48 0.42 0.67 0.64 0.5 0.32 0.35 0.51 1.0 0.46
0.24 0.36 0.22 0.39 0.52 0.27 1.0 0.68 0.57 0.63 0.6 0.63 0.56 0.51 0.62 0.88 0.59 0.87 0.92 0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)