Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00059	1.0	0.22	0.38	0.95	0.34	0.11	0.19	0.17	0.09	0.09	0.1	0.1	0.08	0.07	0.1	0.07	0.09	0.27	0.45	0.11
Gb_00523	1.0	0.41	0.87	0.81	0.51	0.07	0.4	0.13	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.13	0.43	0.09	0.1
Gb_01298	1.0	0.21	0.55	0.32	0.08	0.06	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0
Gb_03371	1.0	0.17	0.47	0.59	0.45	0.08	0.21	0.18	0.08	0.05	0.03	0.12	0.09	0.1	0.02	0.05	0.17	0.13	0.08	0.01
Gb_06006	0.88	0.21	0.21	1.0	0.41	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.04	0.03	0.0	0.0
Gb_06009	0.89	0.58	0.57	1.0	0.2	0.1	0.24	0.1	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.03	0.0	0.29	0.11	0.31	0.33	0.09
Gb_07139	0.55	0.04	0.22	1.0	0.45	0.0	0.01	0.03	0.02	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.04	0.07	0.0	0.02
Gb_07440	1.0	0.52	0.59	0.65	0.51	0.13	0.23	0.09	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.17	0.1	0.33	0.04	0.02
Gb_07795	0.74	0.51	0.78	1.0	0.42	0.09	0.01	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.3	0.0	0.01
Gb_09959	1.0	0.89	0.52	0.81	0.65	0.17	0.14	0.11	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.1	0.09	0.26	0.0	0.0
Gb_10604	1.0	0.15	0.35	0.66	0.61	0.13	0.02	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.11	0.1	0.0	0.0
Gb_10605	1.0	0.15	0.35	0.66	0.61	0.13	0.02	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.11	0.1	0.0	0.0
Gb_11174	1.0	0.2	0.6	0.49	0.08	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_11253	1.0	0.31	0.95	0.84	0.46	0.26	0.21	0.18	0.15	0.13	0.39	0.1	0.02	0.07	0.43	0.37	0.16	0.25	0.27	0.31
Gb_11786	1.0	0.09	0.49	0.57	0.24	0.03	0.08	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.0	0.01	0.09	0.05	0.4	0.22	0.03
Gb_11872	1.0	0.89	0.82	0.99	0.66	0.08	0.84	0.09	0.05	0.08	0.04	0.07	0.04	0.02	0.04	0.05	0.09	0.08	0.01	0.02
Gb_12140	1.0	0.27	0.6	0.83	0.45	0.02	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_12314	1.0	0.4	0.61	0.32	0.36	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_13649	1.0	0.39	0.71	0.58	0.38	0.59	0.22	0.22	0.21	0.17	0.18	0.1	0.18	0.19	0.19	0.28	0.17	0.48	0.15	0.2
Gb_14024	0.7	0.26	0.45	1.0	0.49	0.04	0.01	0.1	0.08	0.14	0.04	0.06	0.1	0.1	0.03	0.1	0.11	0.07	0.01	0.0
Gb_14026	0.62	0.19	0.37	1.0	0.48	0.04	0.01	0.09	0.06	0.1	0.03	0.06	0.08	0.07	0.02	0.08	0.11	0.06	0.01	0.0
Gb_14361	0.96	0.49	1.0	0.59	0.53	0.02	0.19	0.11	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.28	0.06	0.26	0.0	0.02
Gb_15886	1.0	0.25	0.2	0.71	0.13	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.04
Gb_16066	1.0	0.38	0.53	0.88	0.58	0.3	0.04	0.21	0.13	0.22	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.18	0.2	0.01	0.0
Gb_17405	1.0	0.45	0.93	0.53	0.58	0.14	0.24	0.28	0.36	0.35	0.45	0.23	0.19	0.15	0.45	0.3	0.33	0.36	0.34	0.33
Gb_17645	0.85	0.64	1.0	0.62	0.53	0.14	0.19	0.25	0.24	0.2	0.14	0.3	0.16	0.13	0.11	0.33	0.36	0.35	0.0	0.02
Gb_18483	0.85	0.21	0.48	1.0	0.4	0.18	0.3	0.08	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.06	0.15	0.04	0.0
Gb_19057	1.0	0.34	0.37	0.37	0.25	0.0	0.0	0.07	0.02	0.01	0.01	0.0	0.03	0.04	0.04	0.07	0.08	0.2	0.01	0.01
Gb_19823	1.0	0.36	0.17	0.44	0.3	0.01	0.1	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01
Gb_22067	0.79	0.74	0.36	1.0	0.6	0.01	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.12	0.2	0.0	0.02
Gb_23286	1.0	0.37	0.56	0.82	0.42	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0
Gb_23964	1.0	0.5	0.42	0.8	0.57	0.74	0.03	0.12	0.06	0.11	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.47	0.33	0.31	0.0	0.02
Gb_23968	1.0	0.45	0.42	0.73	0.51	0.89	0.03	0.12	0.07	0.11	0.01	0.2	0.01	0.01	0.01	0.47	0.35	0.31	0.0	0.0
Gb_24287	1.0	0.38	0.47	0.65	0.15	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0
Gb_26480	1.0	0.65	0.44	0.64	0.28	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.01	0.0
Gb_26481	1.0	0.67	0.59	0.69	0.38	0.13	0.42	0.12	0.11	0.26	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.64	0.65	0.11	0.0	0.0
Gb_27185	1.0	0.56	0.56	0.39	0.17	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0
Gb_27764	1.0	0.44	0.6	0.45	0.38	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_27908	1.0	0.5	0.83	0.79	0.2	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_29821	1.0	0.1	0.25	0.8	0.32	0.09	0.19	0.17	0.09	0.1	0.1	0.1	0.11	0.1	0.12	0.07	0.08	0.24	0.22	0.11
Gb_30534	0.97	0.52	1.0	0.36	0.08	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.11	0.22	0.03
Gb_32308	1.0	0.76	0.57	0.56	0.33	0.01	0.22	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.06	0.04
Gb_33043	1.0	0.07	0.24	0.53	0.15	0.0	0.12	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_33044	1.0	0.06	0.24	0.35	0.2	0.0	0.13	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33599	1.0	0.42	0.31	0.51	0.12	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_34117	0.89	1.0	0.83	0.61	0.47	0.22	0.32	0.02	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.05	0.09
Gb_34388	0.82	0.5	0.54	1.0	0.42	0.01	0.0	0.09	0.04	0.03	0.0	0.03	0.0	0.0	0.01	0.08	0.05	0.08	0.0	0.0
Gb_35390	1.0	0.12	0.42	0.68	0.31	0.02	0.05	0.12	0.11	0.14	0.37	0.06	0.07	0.07	0.37	0.15	0.25	0.23	0.17	0.15
Gb_36213	1.0	0.29	0.31	0.92	0.67	0.11	0.06	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.09	0.11	0.0	0.01
Gb_36221	1.0	0.62	0.81	0.73	0.31	0.12	0.11	0.13	0.11	0.14	0.02	0.11	0.02	0.01	0.01	0.09	0.13	0.11	0.0	0.0
Gb_38532	1.0	0.44	0.69	0.56	0.14	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.0	0.0
Gb_38581	1.0	0.31	0.33	0.54	0.14	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_40035	1.0	0.11	0.39	0.44	0.13	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_41009	1.0	0.3	0.48	0.59	0.13	0.1	0.01	0.07	0.03	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.07	0.07	0.0	0.02
Gb_41164	1.0	0.38	0.81	0.4	0.44	0.0	0.2	0.08	0.07	0.1	0.13	0.12	0.05	0.03	0.01	0.21	0.27	0.0	0.03	0.03
Gb_41258	1.0	0.19	0.7	0.89	0.4	0.05	0.18	0.14	0.12	0.15	0.39	0.08	0.09	0.09	0.47	0.23	0.32	0.27	0.26	0.25
Gb_41480	1.0	0.45	0.71	0.87	0.58	0.13	0.03	0.1	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.18	0.08	0.08	0.01	0.0
Gb_41483	0.87	0.31	0.47	1.0	0.49	0.11	0.03	0.08	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.18	0.07	0.07	0.0	0.0
Gb_41484	0.98	0.45	0.66	1.0	0.55	0.13	0.03	0.1	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.16	0.09	0.09	0.0	0.0
Gb_41803	0.74	0.35	0.28	1.0	0.17	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)