Heatmap: Cluster_204 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00660	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.61	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.07	0.01	1.0
Gb_01002	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	1.0
Gb_01723	0.18	0.02	0.11	0.14	0.04	0.12	0.13	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	1.0
Gb_01958	0.08	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	1.0
Gb_02300	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	1.0
Gb_03183	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.05	0.15	0.03	0.03	0.02	0.07	0.01	0.06	0.04	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_04786	0.45	0.15	0.03	0.29	0.15	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_05078	0.06	0.04	0.02	0.0	0.01	0.01	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.17	0.0	0.03	0.02	0.01	0.11	1.0
Gb_05591	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.48
Gb_05762	0.03	0.03	0.01	0.13	0.08	0.33	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.07	0.19	0.12	1.0
Gb_05786	0.03	0.01	0.0	0.01	0.23	0.31	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0
Gb_05789	0.02	0.04	0.0	0.01	0.09	0.5	0.08	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_06013	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03	1.0
Gb_07502	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.08	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_08837	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_10155	0.07	0.15	0.03	0.02	0.04	0.04	0.63	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.0	0.0	0.2	0.26	1.0
Gb_10461	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_11194	0.03	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	1.0
Gb_11720	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	1.0
Gb_11907	0.03	0.0	0.0	0.07	0.1	0.14	0.17	0.04	0.02	0.02	0.02	0.05	0.05	0.02	0.01	0.06	0.13	0.13	0.01	1.0
Gb_12391	0.04	0.03	0.08	0.03	0.07	0.06	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.13	1.0
Gb_12580	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_13004	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_13035	0.02	0.11	0.04	0.0	0.0	0.13	0.22	0.0	0.0	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_14119	0.13	0.31	0.11	0.03	0.15	0.13	0.38	0.04	0.01	0.0	0.0	0.05	0.02	0.04	0.04	0.01	0.03	0.09	0.11	1.0
Gb_14460	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	1.0
Gb_14502	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.04	0.08	0.01	0.01	0.03	0.1	0.0	0.01	0.01	0.01	1.0
Gb_17692	0.03	0.02	0.01	0.06	0.04	0.11	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.02	0.12	0.11	1.0
Gb_18134	0.02	0.0	0.05	0.04	0.03	0.27	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.1	0.07	0.0	1.0
Gb_18427	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_19150	0.03	0.07	0.01	0.02	0.11	0.11	0.13	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.1	0.02	1.0
Gb_19220	0.16	0.11	0.05	0.12	0.04	0.03	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_19273	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.03	0.01	0.0	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.0	0.01	0.04	0.31	1.0
Gb_19770	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.12	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.02	0.0	0.01	0.14	0.02	1.0
Gb_20799	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_20871	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_22627	0.01	0.0	0.01	0.0	0.03	0.02	0.07	0.03	0.01	0.0	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.0	0.01	0.02	0.02	1.0
Gb_24311	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_24548	0.15	0.0	0.0	0.98	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_24570	0.07	0.02	0.06	0.06	0.04	0.18	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.05	1.0
Gb_24923	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_25806	0.08	0.04	0.08	0.0	0.03	0.04	0.08	0.02	0.01	0.02	0.12	0.0	0.08	0.01	0.07	0.04	0.0	0.03	0.07	1.0
Gb_26062	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.06	0.0	0.05	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.03	0.0	0.0	0.02	0.02	1.0
Gb_26231	0.02	0.02	0.03	0.01	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_26588	0.1	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.04	0.01	1.0
Gb_26741	0.0	0.05	0.06	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.26	0.6	1.0
Gb_26972	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	0.04	0.02	0.0	0.0	0.05	1.0
Gb_27270	0.52	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.23	0.08	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.09	0.25	0.14	1.0
Gb_27961	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_28210	0.01	0.0	0.02	0.08	0.05	0.06	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.38	0.13	1.0
Gb_28211	0.02	0.01	0.04	0.04	0.03	0.1	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.28	0.06	1.0
Gb_28387	0.09	0.16	0.0	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.03	0.0	0.08	0.14	1.0
Gb_28784	0.06	0.0	0.02	0.03	0.03	0.02	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.15	1.0
Gb_30320	0.03	0.18	0.02	0.01	0.0	0.24	0.0	0.03	0.03	0.08	0.0	0.04	0.05	0.17	0.0	0.08	0.18	0.07	0.0	1.0
Gb_30856	0.01	0.0	0.0	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.04	0.08	1.0
Gb_31026	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.1	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_33065	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	1.0
Gb_33122	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_33858	0.07	0.05	0.02	0.05	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_34042	0.06	0.2	0.16	0.13	0.04	0.01	0.16	0.04	0.02	0.02	0.02	0.12	0.04	0.1	0.01	0.02	0.0	0.23	0.06	1.0
Gb_34617	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_34618	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_34619	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_36105	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_36972	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.1	0.05	0.05	0.06	0.05	0.16	0.04	0.06	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0
Gb_37713	0.02	0.04	0.07	0.04	0.06	0.15	0.02	0.02	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.07	1.0
Gb_39399	0.09	0.11	0.15	0.12	0.08	0.05	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	1.0
Gb_40244	0.19	0.0	0.0	0.78	0.14	0.24	0.98	0.05	0.06	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.35	0.05	1.0
Gb_40359	0.03	0.21	0.32	0.04	0.11	0.1	0.49	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_40546	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.18	0.05	0.08	0.05	0.11	0.02	0.02	0.03	0.13	0.02	0.02	0.07	0.14	1.0
Gb_40653	0.07	0.04	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_40803	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_40991	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.16	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)