Heatmap: Cluster_245 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.57 0.41 0.49 0.69 0.32 0.08 0.07 0.44 0.57 0.46 0.55 0.31 0.29 0.31 0.5 1.0 0.57 0.3 0.27 0.09
0.19 0.18 0.24 0.22 0.08 0.19 0.04 0.43 0.51 0.43 1.0 0.31 0.71 0.54 0.84 0.54 0.59 0.1 0.16 0.02
1.0 0.64 0.78 0.9 0.57 0.34 0.12 0.76 0.72 0.51 0.81 0.44 0.83 0.83 0.7 1.0 0.88 0.46 0.35 0.18
0.82 0.59 0.72 0.9 0.53 0.21 0.19 0.62 0.76 0.67 0.67 0.44 0.54 0.6 0.7 1.0 0.69 0.37 0.29 0.17
1.0 0.49 0.66 0.64 0.57 0.17 0.26 0.67 0.72 0.53 0.78 0.43 0.5 0.44 0.71 0.86 0.49 0.26 0.24 0.11
0.96 0.5 0.68 0.99 0.67 0.17 0.27 0.83 0.86 0.63 0.96 0.56 0.97 1.0 0.89 0.91 0.53 0.26 0.23 0.13
0.57 0.32 0.47 0.49 0.41 0.35 0.11 0.52 0.66 0.47 0.49 0.35 0.55 0.58 0.47 1.0 0.75 0.43 0.37 0.54
0.57 0.41 0.42 0.6 0.35 0.27 0.07 0.55 0.66 0.46 0.49 0.31 0.48 0.43 0.48 1.0 0.57 0.33 0.21 0.13
0.77 0.27 0.47 1.0 0.29 0.13 0.06 0.62 0.58 0.51 0.59 0.36 0.49 0.58 0.49 0.96 0.7 0.27 0.18 0.08
0.54 0.44 0.38 0.58 0.28 0.09 0.13 0.42 0.72 0.5 0.43 0.2 0.3 0.39 0.41 1.0 0.57 0.2 0.08 0.09
0.61 0.11 0.32 0.49 0.27 0.09 0.11 0.46 0.74 0.58 0.56 0.21 0.41 0.45 0.51 1.0 0.53 0.28 0.09 0.16
0.45 0.29 0.36 0.55 0.23 0.09 0.05 0.45 0.57 0.41 0.44 0.24 0.37 0.33 0.48 1.0 0.49 0.21 0.11 0.02
1.0 0.49 0.71 0.93 0.68 0.29 0.54 0.73 0.91 0.79 0.89 0.47 0.83 0.88 0.8 0.83 0.54 0.46 0.28 0.31
0.62 0.18 0.31 0.84 0.29 0.12 0.08 0.47 0.52 0.38 0.58 0.26 0.54 0.52 0.53 1.0 0.54 0.22 0.12 0.07
0.49 0.31 0.37 0.41 0.36 0.32 0.14 0.48 0.61 0.46 0.61 0.27 0.54 0.63 0.52 1.0 0.58 0.31 0.14 0.16
0.44 0.48 0.5 0.51 0.35 0.3 0.22 0.49 0.57 0.47 0.71 0.34 0.36 0.43 0.76 1.0 0.62 0.34 0.35 0.21
0.54 0.29 0.31 0.26 0.22 0.17 0.09 0.44 0.62 0.44 0.68 0.29 0.3 0.3 0.65 1.0 0.42 0.2 0.06 0.06
0.83 0.54 0.9 0.95 0.55 0.28 0.24 0.58 0.64 0.53 0.66 0.41 0.66 0.7 0.59 1.0 0.58 0.42 0.22 0.36
0.51 0.46 0.52 0.55 0.42 0.14 0.11 0.41 0.56 0.45 0.53 0.35 0.31 0.46 0.49 1.0 0.55 0.33 0.14 0.09
0.46 0.31 0.3 0.36 0.41 0.24 0.27 0.52 0.72 0.51 0.56 0.36 0.67 0.56 0.58 1.0 0.55 0.31 0.2 0.26
0.51 0.62 0.36 0.52 0.36 0.23 0.13 0.48 0.66 0.51 0.55 0.31 0.59 0.57 0.6 1.0 0.52 0.29 0.15 0.09
0.39 0.55 0.44 0.64 0.38 0.27 0.3 0.52 0.51 0.37 0.57 0.28 0.45 0.54 0.51 1.0 0.6 0.35 0.18 0.12
0.48 0.32 0.33 0.42 0.23 0.16 0.06 0.46 0.62 0.42 0.45 0.28 0.38 0.37 0.51 1.0 0.54 0.27 0.1 0.15
0.54 0.33 0.56 0.51 0.43 0.12 0.15 0.42 0.7 0.59 0.55 0.33 0.32 0.39 0.58 1.0 0.69 0.27 0.23 0.14
0.19 0.34 0.19 0.27 0.19 0.17 0.12 0.35 0.42 0.32 0.42 0.21 0.41 0.45 0.32 1.0 0.39 0.2 0.21 0.04
1.0 0.32 0.6 0.83 0.42 0.22 0.12 0.66 0.57 0.46 0.53 0.31 0.81 0.78 0.53 0.84 0.61 0.4 0.25 0.19
0.61 0.19 0.29 0.41 0.43 0.11 0.14 0.5 0.57 0.37 0.56 0.29 0.68 0.67 0.38 1.0 0.62 0.38 0.11 0.18
0.46 0.2 0.25 0.51 0.29 0.13 0.1 0.34 0.43 0.38 0.53 0.13 0.61 0.61 0.48 1.0 0.46 0.29 0.1 0.12
0.48 0.16 0.27 0.57 0.37 0.1 0.06 0.28 0.41 0.34 0.38 0.12 0.43 0.4 0.33 1.0 0.39 0.25 0.11 0.12
0.62 0.35 0.32 0.49 0.39 0.13 0.11 0.41 0.51 0.44 0.57 0.16 0.42 0.37 0.55 1.0 0.44 0.31 0.22 0.12
0.65 0.42 0.54 0.55 0.41 0.21 0.16 0.42 0.49 0.28 0.37 0.31 0.59 0.43 0.45 1.0 0.7 0.37 0.2 0.16
0.98 0.55 0.55 0.83 0.52 0.35 0.34 0.74 0.93 0.81 0.71 0.46 0.85 0.85 0.71 1.0 0.66 0.44 0.27 0.27
0.81 0.55 0.76 0.77 0.47 0.22 0.15 0.51 0.41 0.28 0.73 0.38 0.6 0.73 0.65 1.0 0.61 0.3 0.2 0.08
0.52 0.62 0.41 0.82 0.27 0.08 0.38 0.51 0.8 0.53 0.46 0.37 0.71 0.73 0.43 1.0 0.54 0.12 0.18 0.17
0.8 0.66 0.6 0.64 0.54 0.19 0.24 0.68 0.7 0.54 0.73 0.4 0.55 0.49 0.7 1.0 0.57 0.38 0.24 0.16
0.66 0.32 0.43 0.46 0.37 0.27 0.13 0.59 0.45 0.33 0.8 0.31 0.43 0.36 0.72 1.0 0.61 0.28 0.36 0.15
0.47 0.2 0.33 0.42 0.17 0.26 0.24 0.5 0.64 0.46 0.55 0.29 1.0 0.78 0.47 0.84 0.69 0.21 0.14 0.16
0.84 0.63 0.78 0.73 0.74 0.24 0.25 0.81 0.74 0.71 0.88 0.67 1.0 0.9 0.85 0.56 0.48 0.46 0.33 0.28
0.61 0.33 0.39 0.46 0.34 0.2 0.15 0.55 0.62 0.48 0.5 0.32 0.72 0.5 0.57 1.0 0.69 0.25 0.23 0.14
0.37 0.12 0.17 0.35 0.18 0.14 0.05 0.4 0.6 0.45 0.38 0.18 0.33 0.36 0.43 1.0 0.31 0.2 0.03 0.03
0.69 0.55 0.83 1.0 0.43 0.21 0.44 0.56 0.74 0.59 0.76 0.27 0.72 0.71 0.75 0.94 0.56 0.31 0.22 0.43
0.56 0.34 0.37 0.39 0.28 0.04 0.12 0.38 0.67 0.51 0.5 0.18 0.56 0.69 0.43 1.0 0.44 0.14 0.09 0.09
0.71 0.42 0.4 0.4 0.23 0.01 0.12 0.43 0.68 0.51 0.48 0.22 0.48 0.47 0.47 1.0 0.45 0.15 0.15 0.13
0.76 0.69 0.48 0.51 0.33 0.03 0.15 0.56 0.79 0.57 0.55 0.25 0.44 0.43 0.52 1.0 0.49 0.19 0.22 0.09
0.61 0.26 0.38 0.53 0.33 0.14 0.12 0.6 0.75 0.53 0.86 0.35 0.69 0.87 0.77 1.0 0.71 0.17 0.11 0.17
0.67 0.32 0.4 0.58 0.61 0.22 0.18 0.81 0.91 0.72 0.87 0.55 1.0 1.0 0.87 0.97 0.67 0.4 0.2 0.26
0.57 0.39 0.39 0.4 0.62 0.27 0.15 0.6 0.88 0.71 0.61 0.49 1.0 0.98 0.58 0.99 0.53 0.35 0.12 0.27
0.8 0.37 0.45 0.79 0.66 0.3 0.2 0.88 0.81 0.65 1.0 0.71 0.9 0.81 0.97 0.94 0.53 0.44 0.39 0.34
0.61 0.58 0.55 0.66 0.45 0.2 0.13 0.45 0.51 0.37 0.43 0.28 0.42 0.43 0.41 1.0 0.56 0.39 0.2 0.15
0.69 0.62 0.53 0.78 0.41 0.22 0.24 0.56 0.6 0.51 0.77 0.52 0.38 0.41 0.69 1.0 0.82 0.38 0.3 0.24
0.59 0.53 0.62 0.4 0.35 0.33 0.13 0.55 0.74 0.56 0.56 0.31 0.66 0.7 0.62 1.0 0.69 0.3 0.11 0.15
0.56 0.03 0.04 0.19 0.12 0.2 0.06 0.43 0.51 0.27 0.62 0.15 0.13 0.12 0.5 1.0 0.64 0.11 0.01 0.07
0.23 0.1 0.18 0.23 0.17 0.12 0.03 0.35 0.28 0.21 0.54 0.24 0.36 0.35 0.49 1.0 0.72 0.15 0.04 0.02
0.82 0.41 0.62 0.59 0.36 0.24 0.48 0.74 0.9 0.68 0.73 0.42 1.0 0.88 0.68 0.83 0.81 0.22 0.18 0.14
0.42 0.07 0.18 0.29 0.26 0.17 0.12 0.37 0.5 0.38 0.48 0.31 0.46 0.54 0.4 1.0 0.8 0.27 0.09 0.11
0.89 0.48 0.54 0.94 0.6 0.41 0.17 0.84 0.72 0.59 0.77 0.38 0.57 0.48 0.73 1.0 0.65 0.59 0.34 0.3
0.25 0.31 0.28 0.31 0.23 0.17 0.2 0.41 0.61 0.44 0.34 0.21 0.47 0.49 0.36 1.0 0.59 0.26 0.09 0.13
0.44 0.24 0.23 0.39 0.18 0.17 0.06 0.41 0.58 0.42 0.34 0.17 0.37 0.34 0.38 1.0 0.33 0.25 0.06 0.04
0.67 0.31 0.49 0.49 0.24 0.06 0.05 0.35 0.57 0.41 0.36 0.18 0.48 0.46 0.32 1.0 0.51 0.23 0.09 0.1
0.63 0.31 0.49 1.0 0.42 0.23 0.05 0.56 0.5 0.34 0.5 0.29 0.47 0.46 0.56 0.97 0.57 0.4 0.15 0.12
0.43 0.27 0.38 0.54 0.35 0.19 0.13 0.48 0.43 0.36 0.76 0.47 0.41 0.42 0.7 1.0 0.55 0.24 0.32 0.14
0.45 0.26 0.31 0.56 0.27 0.25 0.22 0.41 0.59 0.51 0.46 0.3 0.51 0.59 0.42 1.0 0.59 0.16 0.13 0.1
0.54 0.49 0.64 0.58 0.41 0.15 0.34 0.62 0.61 0.52 0.52 0.37 0.61 0.62 0.52 1.0 0.69 0.37 0.42 0.21
0.56 0.48 0.53 0.61 0.37 0.18 0.08 0.45 0.57 0.34 0.44 0.3 0.27 0.3 0.39 1.0 0.65 0.27 0.24 0.17
0.55 0.36 0.51 0.72 0.41 0.29 0.08 0.5 0.64 0.49 0.66 0.27 0.29 0.47 0.57 1.0 0.46 0.39 0.14 0.08
0.45 0.07 0.21 0.36 0.21 0.04 0.04 0.27 0.4 0.27 0.41 0.13 0.2 0.29 0.31 1.0 0.51 0.13 0.03 0.05
0.57 0.15 0.29 0.45 0.24 0.09 0.04 0.37 0.45 0.31 0.41 0.16 0.29 0.33 0.37 1.0 0.56 0.24 0.09 0.06
0.84 0.88 0.54 0.78 0.49 0.16 0.17 0.58 0.68 0.51 0.64 0.31 0.46 0.41 0.6 1.0 0.47 0.38 0.37 0.2
0.4 0.47 0.41 0.45 0.19 0.3 0.07 0.55 0.62 0.46 0.95 0.29 0.93 1.0 0.82 0.72 0.49 0.21 0.07 0.04
0.92 0.52 0.78 0.87 0.66 0.34 0.18 0.81 0.95 0.72 0.83 0.57 0.9 0.85 0.75 1.0 0.72 0.47 0.32 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)