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Heatmap: Cluster_245 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.47 -0.01 0.24 0.74 -0.38 -2.44 -2.47 0.1 0.47 0.14 0.41 -0.42 -0.51 -0.42 0.27 1.27 0.46 -0.49 -0.62 -2.26
-0.92 -1.01 -0.62 -0.75 -2.15 -0.95 -3.09 0.22 0.48 0.24 1.45 -0.25 0.96 0.55 1.2 0.55 0.7 -1.88 -1.24 -4.21
0.64 -0.01 0.29 0.5 -0.18 -0.93 -2.4 0.24 0.16 -0.32 0.34 -0.56 0.37 0.37 0.13 0.64 0.46 -0.48 -0.87 -1.81
0.51 0.04 0.32 0.65 -0.11 -1.42 -1.61 0.11 0.41 0.23 0.22 -0.4 -0.08 0.06 0.28 0.8 0.27 -0.62 -0.98 -1.75
0.92 -0.1 0.32 0.29 0.1 -1.65 -1.03 0.35 0.44 0.01 0.58 -0.29 -0.06 -0.27 0.42 0.71 -0.1 -0.99 -1.13 -2.24
0.57 -0.38 0.06 0.6 0.03 -1.91 -1.24 0.35 0.41 -0.04 0.56 -0.22 0.58 0.62 0.45 0.49 -0.28 -1.34 -1.52 -2.36
0.2 -0.65 -0.07 -0.01 -0.26 -0.5 -2.21 0.07 0.43 -0.08 -0.01 -0.51 0.16 0.22 -0.08 1.02 0.61 -0.21 -0.42 0.13
0.36 -0.11 -0.07 0.44 -0.32 -0.72 -2.56 0.31 0.59 0.07 0.17 -0.48 0.14 -0.04 0.12 1.19 0.38 -0.4 -1.05 -1.8
0.71 -0.82 0.01 1.09 -0.67 -1.91 -2.86 0.39 0.3 0.12 0.33 -0.4 0.06 0.31 0.07 1.03 0.57 -0.78 -1.41 -2.52
0.48 0.2 -0.01 0.58 -0.47 -2.07 -1.59 0.13 0.9 0.36 0.15 -0.97 -0.38 0.02 0.07 1.37 0.54 -0.98 -2.27 -2.08
0.62 -1.83 -0.31 0.3 -0.57 -2.15 -1.82 0.2 0.89 0.53 0.49 -0.89 0.04 0.16 0.34 1.33 0.42 -0.54 -2.23 -1.29
0.32 -0.3 -0.0 0.61 -0.64 -1.92 -2.95 0.35 0.67 0.21 0.31 -0.59 0.04 -0.12 0.44 1.49 0.46 -0.75 -1.68 -3.89
0.58 -0.46 0.1 0.47 0.02 -1.2 -0.3 0.14 0.44 0.25 0.41 -0.51 0.31 0.4 0.27 0.31 -0.3 -0.53 -1.26 -1.12
0.59 -1.17 -0.42 1.03 -0.49 -1.72 -2.32 0.21 0.35 -0.12 0.5 -0.64 0.39 0.34 0.37 1.28 0.4 -0.89 -1.77 -2.5
0.16 -0.51 -0.23 -0.1 -0.29 -0.45 -1.68 0.14 0.49 0.08 0.48 -0.7 0.31 0.54 0.25 1.2 0.42 -0.47 -1.61 -1.41
-0.12 0.03 0.09 0.11 -0.41 -0.65 -1.1 0.04 0.28 -0.02 0.58 -0.49 -0.39 -0.15 0.69 1.08 0.4 -0.48 -0.42 -1.19
0.56 -0.36 -0.25 -0.48 -0.74 -1.09 -2.01 0.28 0.75 0.25 0.9 -0.36 -0.28 -0.3 0.82 1.44 0.21 -0.89 -2.57 -2.59
0.52 -0.12 0.63 0.71 -0.08 -1.06 -1.28 -0.0 0.14 -0.12 0.19 -0.5 0.18 0.26 0.01 0.78 -0.01 -0.47 -1.42 -0.69
0.28 0.14 0.31 0.38 0.01 -1.58 -1.9 -0.03 0.43 0.09 0.34 -0.25 -0.42 0.14 0.23 1.25 0.39 -0.36 -1.58 -2.16
0.01 -0.54 -0.59 -0.36 -0.15 -0.96 -0.76 0.17 0.66 0.16 0.3 -0.36 0.55 0.29 0.34 1.13 0.28 -0.56 -1.22 -0.81
0.18 0.45 -0.31 0.2 -0.33 -1.0 -1.83 0.1 0.54 0.18 0.28 -0.56 0.38 0.33 0.4 1.15 0.2 -0.63 -1.57 -2.34
-0.21 0.29 -0.02 0.51 -0.25 -0.72 -0.6 0.21 0.2 -0.29 0.34 -0.68 0.01 0.27 0.18 1.16 0.42 -0.33 -1.35 -1.89
0.35 -0.23 -0.22 0.16 -0.71 -1.24 -2.58 0.29 0.72 0.15 0.25 -0.44 0.0 -0.01 0.42 1.4 0.51 -0.49 -1.96 -1.29
0.29 -0.43 0.34 0.21 -0.04 -1.9 -1.57 -0.06 0.66 0.42 0.32 -0.42 -0.47 -0.17 0.39 1.17 0.64 -0.74 -0.92 -1.7
-0.74 0.13 -0.71 -0.19 -0.73 -0.9 -1.32 0.18 0.45 0.05 0.44 -0.58 0.4 0.52 0.07 1.69 0.33 -0.63 -0.59 -3.08
0.94 -0.73 0.21 0.67 -0.33 -1.25 -2.07 0.34 0.13 -0.17 0.03 -0.76 0.63 0.58 0.02 0.69 0.22 -0.39 -1.09 -1.49
0.53 -1.16 -0.54 -0.05 0.01 -1.89 -1.6 0.23 0.43 -0.2 0.39 -0.55 0.69 0.65 -0.15 1.24 0.55 -0.18 -1.94 -1.21
0.3 -0.92 -0.57 0.47 -0.38 -1.49 -1.91 -0.11 0.2 0.03 0.52 -1.48 0.73 0.72 0.36 1.43 0.3 -0.35 -1.82 -1.62
0.56 -1.05 -0.3 0.79 0.16 -1.66 -2.35 -0.22 0.31 0.03 0.22 -1.49 0.39 0.28 0.02 1.61 0.26 -0.38 -1.59 -1.5
0.65 -0.18 -0.3 0.29 -0.04 -1.57 -1.82 0.04 0.37 0.16 0.53 -1.3 0.09 -0.12 0.46 1.33 0.16 -0.35 -0.84 -1.77
0.58 -0.06 0.31 0.33 -0.09 -1.05 -1.41 -0.04 0.17 -0.64 -0.23 -0.51 0.43 -0.02 0.03 1.2 0.68 -0.24 -1.09 -1.45
0.61 -0.23 -0.21 0.37 -0.29 -0.86 -0.9 0.2 0.53 0.34 0.14 -0.47 0.4 0.41 0.14 0.64 0.05 -0.53 -1.26 -1.27
0.66 0.1 0.57 0.6 -0.1 -1.19 -1.79 -0.0 -0.31 -0.87 0.51 -0.44 0.24 0.51 0.36 0.97 0.27 -0.78 -1.38 -2.58
0.12 0.36 -0.25 0.76 -0.84 -2.51 -0.36 0.09 0.74 0.14 -0.07 -0.4 0.55 0.6 -0.18 1.05 0.16 -1.95 -1.42 -1.52
0.56 0.29 0.15 0.25 -0.01 -1.48 -1.15 0.32 0.38 -0.01 0.44 -0.44 0.02 -0.15 0.38 0.89 0.08 -0.52 -1.19 -1.71
0.54 -0.48 -0.06 0.02 -0.27 -0.75 -1.8 0.38 0.01 -0.44 0.82 -0.55 -0.07 -0.32 0.68 1.15 0.43 -0.71 -0.34 -1.62
0.1 -1.16 -0.42 -0.08 -1.4 -0.76 -0.86 0.19 0.53 0.06 0.32 -0.58 1.18 0.82 0.1 0.93 0.65 -1.06 -1.68 -1.46
0.39 -0.04 0.28 0.18 0.2 -1.4 -1.36 0.33 0.2 0.15 0.45 0.05 0.64 0.48 0.4 -0.21 -0.43 -0.5 -0.96 -1.19
0.43 -0.44 -0.22 0.02 -0.43 -1.17 -1.61 0.29 0.45 0.1 0.15 -0.48 0.67 0.14 0.33 1.15 0.61 -0.84 -1.0 -1.7
0.29 -1.32 -0.83 0.22 -0.8 -1.14 -2.54 0.38 0.99 0.56 0.31 -0.79 0.14 0.25 0.51 1.72 0.01 -0.61 -3.24 -3.32
0.24 -0.09 0.51 0.77 -0.46 -1.49 -0.41 -0.06 0.34 0.02 0.37 -1.1 0.29 0.28 0.36 0.68 -0.07 -0.92 -1.4 -0.44
0.51 -0.19 -0.05 0.0 -0.46 -3.34 -1.71 -0.02 0.79 0.4 0.35 -1.12 0.51 0.82 0.13 1.36 0.18 -1.44 -2.06 -2.17
0.85 0.09 0.0 0.02 -0.76 -5.49 -1.73 0.13 0.78 0.36 0.29 -0.88 0.27 0.26 0.26 1.34 0.19 -1.4 -1.36 -1.66
0.74 0.6 0.07 0.17 -0.47 -3.7 -1.58 0.31 0.79 0.33 0.29 -0.84 -0.04 -0.06 0.21 1.14 0.12 -1.24 -1.02 -2.41
0.29 -0.94 -0.4 0.09 -0.58 -1.79 -2.06 0.28 0.58 0.1 0.8 -0.5 0.47 0.81 0.62 1.01 0.5 -1.53 -2.12 -1.58
0.13 -0.93 -0.62 -0.07 0.01 -1.44 -1.77 0.41 0.57 0.25 0.51 -0.16 0.71 0.71 0.51 0.67 0.14 -0.62 -1.62 -1.21
0.06 -0.48 -0.49 -0.46 0.19 -0.99 -1.89 0.14 0.69 0.38 0.16 -0.14 0.88 0.84 0.1 0.86 -0.03 -0.65 -2.18 -1.01
0.3 -0.82 -0.53 0.29 0.02 -1.11 -1.7 0.44 0.32 0.02 0.63 0.13 0.48 0.32 0.58 0.54 -0.29 -0.54 -0.73 -0.91
0.48 0.4 0.33 0.58 0.04 -1.12 -1.78 0.03 0.21 -0.24 -0.04 -0.64 -0.06 -0.04 -0.09 1.18 0.36 -0.18 -1.1 -1.58
0.36 0.21 -0.02 0.54 -0.39 -1.25 -1.13 0.08 0.18 -0.06 0.52 -0.04 -0.49 -0.39 0.38 0.91 0.62 -0.5 -0.81 -1.15
0.26 0.1 0.33 -0.3 -0.49 -0.59 -1.95 0.16 0.57 0.18 0.18 -0.67 0.41 0.49 0.31 1.01 0.47 -0.73 -2.12 -1.69
0.96 -3.43 -2.85 -0.58 -1.27 -0.51 -2.22 0.59 0.82 -0.07 1.1 -0.96 -1.13 -1.27 0.8 1.79 1.14 -1.37 -5.13 -2.06
-0.34 -1.58 -0.68 -0.33 -0.77 -1.25 -3.42 0.27 -0.07 -0.49 0.89 -0.25 0.33 0.28 0.75 1.79 1.31 -0.95 -3.03 -3.71
0.49 -0.5 0.08 0.01 -0.7 -1.26 -0.3 0.33 0.62 0.21 0.31 -0.49 0.77 0.58 0.21 0.5 0.47 -1.43 -1.73 -2.03
0.22 -2.28 -1.03 -0.31 -0.47 -1.09 -1.64 0.05 0.45 0.08 0.4 -0.23 0.34 0.58 0.16 1.47 1.15 -0.41 -1.95 -1.67
0.56 -0.32 -0.17 0.65 -0.01 -0.54 -1.78 0.49 0.25 -0.03 0.37 -0.64 -0.07 -0.32 0.28 0.74 0.12 -0.03 -0.81 -0.98
-0.51 -0.22 -0.37 -0.2 -0.61 -1.08 -0.87 0.2 0.78 0.29 -0.08 -0.77 0.41 0.46 0.01 1.49 0.73 -0.45 -2.04 -1.48
0.45 -0.44 -0.49 0.3 -0.85 -0.9 -2.54 0.38 0.86 0.41 0.08 -0.9 0.23 0.09 0.24 1.65 0.04 -0.36 -2.52 -3.0
0.87 -0.25 0.42 0.41 -0.62 -2.63 -2.78 -0.08 0.64 0.17 -0.04 -1.0 0.39 0.31 -0.22 1.44 0.46 -0.71 -2.1 -1.82
0.49 -0.55 0.13 1.15 -0.12 -0.99 -3.1 0.31 0.16 -0.41 0.15 -0.64 0.07 0.01 0.32 1.1 0.34 -0.19 -1.56 -1.87
0.01 -0.64 -0.19 0.33 -0.3 -1.14 -1.72 0.17 0.01 -0.27 0.82 0.13 -0.06 -0.03 0.71 1.22 0.37 -0.86 -0.42 -1.58
0.16 -0.64 -0.4 0.47 -0.58 -0.69 -0.9 0.02 0.54 0.35 0.18 -0.44 0.34 0.54 0.06 1.31 0.55 -1.3 -1.69 -2.07
0.08 -0.05 0.32 0.18 -0.32 -1.81 -0.58 0.27 0.25 0.01 0.03 -0.46 0.26 0.28 0.02 0.96 0.44 -0.45 -0.27 -1.28
0.44 0.22 0.36 0.57 -0.14 -1.22 -2.29 0.14 0.47 -0.28 0.1 -0.44 -0.58 -0.43 -0.06 1.29 0.66 -0.58 -0.8 -1.3
0.32 -0.29 0.2 0.69 -0.12 -0.61 -2.52 0.16 0.53 0.15 0.58 -0.72 -0.63 0.09 0.37 1.17 0.06 -0.17 -1.7 -2.5
0.74 -1.86 -0.38 0.41 -0.36 -2.71 -2.9 0.03 0.58 0.02 0.61 -1.07 -0.42 0.11 0.2 1.9 0.92 -1.07 -3.12 -2.51
0.82 -1.12 -0.16 0.48 -0.42 -1.92 -3.1 0.2 0.47 -0.07 0.36 -1.05 -0.14 0.05 0.18 1.63 0.8 -0.45 -1.87 -2.53
0.68 0.75 0.04 0.57 -0.09 -1.68 -1.62 0.16 0.39 -0.03 0.29 -0.76 -0.18 -0.35 0.19 0.93 -0.16 -0.47 -0.51 -1.41
-0.24 -0.02 -0.22 -0.06 -1.29 -0.64 -2.83 0.23 0.39 -0.03 1.01 -0.69 0.98 1.08 0.79 0.61 0.05 -1.2 -2.8 -3.61
0.47 -0.37 0.22 0.38 -0.03 -0.96 -1.87 0.29 0.51 0.12 0.31 -0.22 0.43 0.35 0.17 0.58 0.11 -0.51 -1.08 -1.82

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.