Heatmap: Cluster_51 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00325	-0.59	-4.73	-0.17	1.79	-1.4	-2.13	-0.93	0.87	-0.44	-1.24	-1.74	-1.68	-1.01	1.35	-0.45	1.43	0.66	-1.81	0.91	-
Gb_00434	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_00596	-	-	-	-	-	-	-	-0.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.29	-
Gb_01000	-0.86	-	0.92	2.32	-	-0.74	-1.15	-0.17	-2.64	-	-1.17	-2.05	-	-0.92	-1.16	2.34	-	-	1.91	-
Gb_01020	-	-	-	2.28	-	1.73	-	0.11	-0.97	-	-	-	-	-	-	1.52	0.64	-	2.54	-
Gb_01103	-	4.31	-	-	-	-	-	-2.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_01122	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-	-	-	-
Gb_01123	0.13	-0.1	-0.85	2.12	0.99	-	-2.61	-0.68	-2.48	-	1.28	-	-	-	0.26	-1.47	-1.35	-	2.22	0.08
Gb_01159	-	-	1.82	-	-3.75	-	1.21	0.6	-	-	1.72	-	1.46	-	-	-	-	-	2.7	-
Gb_01558	2.29	-	-	-	-	-	-	-1.05	-	-	1.32	-	-	-	1.15	1.98	-	-	2.57	-
Gb_01729	-	-	-	-	-	-	3.42	-0.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.1	-
Gb_02085	0.69	0.28	-	0.53	-0.41	-	-0.45	-0.12	-1.25	-0.64	0.36	-	-0.2	-0.46	0.76	0.69	-1.57	-0.98	2.28	-1.48
Gb_02493	-1.15	-	-	4.13	-	-	-	-1.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.79	-
Gb_02787	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_02932	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_03429	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-
Gb_03729	-	-	3.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.45	-
Gb_04010	-	-	-	-	-	-	-	-0.35	0.1	-	1.58	-	-	-	1.45	-	2.17	-	2.98	-
Gb_04187	-	-	-	-	-	-	-	-0.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.28	-
Gb_04188	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_04615	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.01	-	-	1.95	-
Gb_04792	-0.74	-	-	2.98	-	-	-0.39	-0.57	-	0.54	-	-	1.66	-	-	1.29	-	0.18	0.91	-
Gb_05012	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_05628	-0.94	-	-	2.22	-	-	-0.86	-0.57	0.36	-0.82	-0.01	-1.94	-1.74	-0.36	1.95	0.81	0.78	-	1.04	-
Gb_05676	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-
Gb_05901	-	-	-	-	-	-	0.68	0.14	-	-	-	0.51	-	-	-	2.58	-	-	3.3	-
Gb_05907	-1.31	-	-1.3	1.43	-	-	-0.8	-0.29	-2.35	-1.01	1.49	-	-	-	1.49	2.45	-	-	1.53	-1.08
Gb_05975	-	-	-	-	-	-	-	1.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.12	-
Gb_06579	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-
Gb_06627	0.28	-0.36	-1.53	1.92	-1.37	-0.33	-2.23	-0.08	-0.78	-2.38	0.07	-3.5	-1.83	-1.37	0.92	1.45	-1.32	-1.57	1.52	-0.45
Gb_06715	-2.06	-	-	-	-	-	-0.7	-3.98	-1.57	-	-	-	-2.76	-2.23	-	-	-	-	3.25	3.15
Gb_06979	-14.47	-	0.29	1.19	-	-	0.4	-0.7	-10.12	-0.3	1.41	-7.86	-0.88	-	-0.73	0.59	0.11	0.28	2.48	-0.83
Gb_07227	-	-	-	1.66	0.93	-	0.87	-0.01	-2.21	-	-	-	-	-1.47	-0.24	2.04	-	-	2.72	-
Gb_07892	-0.63	-	-0.56	2.41	-	-	0.97	-0.19	-	-1.64	0.19	-	-7.4	-2.18	-	1.11	-	0.0	2.5	-
Gb_08024	-	-	-	-	-	-	-	-0.7	1.62	-	2.34	-	-	-	2.21	-	-	-	2.73	-
Gb_08225	-	-	-	-	-	-	0.04	0.73	-	0.91	1.71	-	-0.65	-	0.52	2.66	-	-	1.91	-
Gb_08317	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-
Gb_08899	-	-	-	-	-	-	-	3.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.91	-
Gb_09100	-	-	-	-	-	-	-	0.46	-	-	-	-	3.33	-	-	-	-	-	3.1	-
Gb_09166	0.67	-	0.4	2.24	1.22	-	-1.81	-0.16	0.2	-	-0.14	-2.15	-1.48	-0.23	-1.18	0.21	-	-	1.91	-
Gb_09574	-	-	-	-	-	-	-	0.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.22
Gb_10346	1.7	-	1.19	-	-	-	-	-1.3	1.67	0.23	0.94	-	-	-	0.96	2.55	-	-	-	-
Gb_10491	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_10548	-	-	1.33	-	-	1.18	0.57	0.88	1.29	0.02	0.25	-8.76	-0.23	-	-	-	1.39	-	1.92	-
Gb_10593	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_10781	0.66	-	-	-	-	-	-	-1.4	0.05	-0.19	2.13	-	-	-	0.54	-	2.9	-	1.48	-
Gb_11005	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_11015	1.75	1.45	-	-	-	-	-	0.6	-1.33	-	-	-1.27	-	-1.36	-	-	0.24	-	2.91	1.32
Gb_11660	-	-	-	-	-	-	0.4	-1.02	0.36	0.2	0.99	-	-	-0.38	1.82	-	1.51	-	2.73	-
Gb_11910	-	3.07	-	-	-	-	-	-1.88	-	-	-	-	-	-	-	2.14	-	-	2.79	-
Gb_11953	-	-	2.69	-	-	-	-	-0.57	-	-	-	-	-	1.23	-	3.39	-	-	-	-
Gb_12125	-	-	-	-	-	-	0.44	0.21	-	0.81	-	-22.62	-	-25.38	1.61	-	-	-19.79	3.66	-
Gb_12173	0.83	-	-	-	-	-	-	0.84	1.34	-	-	-	-	-	1.22	-	-	0.38	3.0	1.18
Gb_12535	-	-	-	-	-	-	-	-0.5	-	-	-	-	-	-	-	4.11	-	-	1.01	-
Gb_13404	-0.36	-	-	3.06	-	-	-1.02	0.67	0.52	-1.84	-	-	-0.26	-0.79	-0.5	1.35	-	-	1.26	-13.99
Gb_13551	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-
Gb_13603	1.46	-	-	1.81	-	-0.61	0.0	0.33	-0.53	-1.69	0.66	-0.86	-	-	0.49	0.56	-	-0.06	1.75	-1.03
Gb_14284	-	-	3.83	-	-	-	-	1.06	-	-	-	1.89	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_15273	1.17	-	-	3.88	-	-20.84	-	-0.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.26	-
Gb_15999	-0.35	0.04	-	2.88	-	-	-	-1.86	-	-0.76	0.82	-2.28	-	-	-	2.04	-	-0.22	1.17	-0.35
Gb_16873	0.54	-	-	-	-0.32	-	-	0.41	0.91	0.6	0.65	-1.01	-1.42	-0.64	0.6	-	1.72	1.29	1.42	-
Gb_16945	0.59	-	-	-	-	-	-	1.11	-	-	2.45	-	1.77	-	-	-	-	0.14	2.67	-
Gb_18033	-	-	-	4.29	-	-	-	-1.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_18155	1.92	-	-	-	-	-	1.23	0.87	-	1.11	-	-	-	-0.57	-	-	1.26	-	2.77	-
Gb_18576	-	-	-	3.66	-	-	-	0.68	-	-	-	-	-	-	-	2.12	-	-	0.46	-
Gb_18633	-	-	-	-	-	-	-	0.94	0.57	-	-	1.89	2.01	0.71	2.02	-	-	-	1.66	-
Gb_18921	-0.7	0.44	-	3.18	-0.72	-	-	-2.13	-	-	-	-2.5	-	-2.12	-	1.57	-	1.51	0.95	-
Gb_19407	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_19460	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-
Gb_21017	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_21518	-	-	-	-	-	-	-	-0.63	-	-	-	-2.76	-	-	-	0.93	-	-	1.72	3.81
Gb_22384	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_22414	-1.72	1.95	-	3.32	-	-	-1.38	-0.41	0.21	0.67	-1.88	-	-	-	-	-	-	-	0.78	-
Gb_22806	-	-	-	-	-	-	-	-1.77	-	-	-	-	1.04	0.84	-	-	-	-	3.99	-
Gb_22939	-	-	-	-	-	-	-	0.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.22	-
Gb_23035	-0.69	-	-	2.18	-0.59	-	-0.57	0.17	-0.1	-2.29	0.86	-2.82	-	-4.34	-1.86	-0.45	-1.13	-0.88	2.79	-1.48
Gb_23270	-	-0.3	-	2.64	1.54	-	-1.31	-0.28	-	-	-	-	-1.8	-	-	1.39	-	0.89	1.78	-0.75
Gb_23541	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_23778	-0.02	-	-0.65	2.47	-	-	-1.39	0.54	-0.91	-0.5	0.27	-	-	-	-0.95	-0.37	-0.65	-0.92	2.35	0.0
Gb_24254	-1.05	-	-	3.1	-	-	-0.39	-1.39	-	-1.11	-1.21	-	-	-	-0.35	1.53	-0.54	-1.32	2.05	-
Gb_24441	-	-	-	-	-	-	-	0.06	2.05	-	-	-	-	2.14	-	-	-	-	3.38	-
Gb_24660	1.02	-	-	-	-	-	-	-3.38	0.44	-	-	-	-	-	-	-	3.51	1.83	0.66	-
Gb_25305	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_25466	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-
Gb_25933	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_26028	1.25	1.6	0.06	-	-	-	-0.04	1.28	0.57	-	1.1	-	0.89	-	1.26	-	-	-	1.18	-
Gb_26742	1.01	-	1.42	-	-	-	-0.57	0.13	-	-0.69	-	-1.97	-	-	-	3.11	-	-	2.01	-
Gb_26876	-	3.47	-	-	-	-	-	-1.34	-	-	-	-	-	-	-	3.1	-	-	-	-
Gb_26933	-	-	-	-	-	-	1.08	0.04	-0.39	-	-	-11.19	-	-	0.61	2.26	2.39	-	2.19	-
Gb_27666	-	-	2.83	-	-	-	-	-0.65	-	-	-	-	-	-	3.61	-	-	-	-	-
Gb_28000	-	-	-	-	-	-	-	-0.24	-	-	-	-	-	-	-	4.0	-	-	1.67	-
Gb_28796	-0.07	-2.66	-2.43	-	-0.24	0.8	-0.05	-0.26	-	-1.21	0.05	-	0.72	-1.79	2.14	1.76	0.68	-0.45	-0.33	-
Gb_28999	-1.02	-	0.36	3.04	-0.31	-	-0.57	0.12	-3.19	-2.33	1.19	-2.57	-12.52	-2.77	1.52	-	-	-	0.71	-
Gb_29361	-	-	-	-	0.99	3.17	-	0.62	1.03	0.02	-	-	0.66	-	-	-	-	-	1.5	-
Gb_30070	-0.29	-0.54	-	-	-	-	-	-0.12	-1.35	-	-	-	-	-0.88	-	2.2	0.92	-	3.35	-
Gb_30149	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-
Gb_30194	-	-	-	-	-	-	-	0.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.22	-
Gb_30430	-	-	-	-	-	-	-	-0.49	-	-	-	-	-	-	-	3.78	-	-	2.48	-
Gb_30773	0.33	0.54	0.45	2.71	-	1.18	-	-0.68	-1.29	-	-0.46	-	-0.2	-0.3	-0.6	-	-0.49	-	1.21	-
Gb_30851	-	-	-	-	-	-	-	-0.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.27	-
Gb_31014	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_31466	0.51	-	-	3.59	-	-	-0.14	-1.06	0.0	-3.05	-	-	-	-	0.26	-	-	-	1.39	-2.23
Gb_31693	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_31778	-	-	-	2.66	-	-10.89	-1.44	-1.07	-1.34	-17.58	2.69	-2.05	0.53	-	-	-	0.0	-0.89	1.47	-
Gb_32186	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_32872	-	-	-	4.14	-	-	-	-1.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.02	-
Gb_33386	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_33420	-1.24	0.95	-	2.67	-	-	-1.26	-0.31	-1.34	-0.36	-	-	-	-4.32	1.67	-	-0.41	-1.84	2.2	-
Gb_33469	0.04	-	-	-	-	0.14	-0.91	-0.03	1.06	0.2	-0.11	-0.44	0.88	0.13	-0.25	2.81	-	-	-0.52	-
Gb_34145	2.02	-	-	3.07	-	-	-	0.68	-0.4	-	-	-	-	-0.24	-	-	-	-	2.1	-
Gb_34728	2.22	-	-	-	-	-	-0.04	-0.87	0.34	0.0	0.61	0.2	0.67	-	-	-	1.56	1.87	-0.56	-
Gb_35167	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_35393	-	-	-	-	-	-	-	0.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.79	2.1	-
Gb_35527	-	-	-	-	-	-	-	-0.19	-	-	-	-	-	1.77	-	2.28	3.28	-	0.17	-
Gb_35872	-	-	-	2.02	2.07	-0.03	-	-0.26	-0.79	-8.05	0.06	-9.17	-	-0.37	-	-	-	0.03	2.16	1.03
Gb_35913	0.32	1.34	-	-	0.27	-	-0.25	1.09	-1.43	1.07	0.16	-0.6	0.66	-	-	-	-	-	1.79	1.47
Gb_35979	0.54	-	-	2.05	-	-	0.56	-2.09	-2.16	-	1.24	-2.53	-0.94	-	-0.12	1.49	-	1.72	1.26	-
Gb_36149	-0.35	-	-	-18.21	-	-	-	0.04	-1.02	0.1	-0.65	-2.51	-	-1.17	-	3.36	-0.41	-0.86	1.93	-
Gb_36325	1.46	-	2.01	-	1.47	-	-0.28	-0.3	-1.15	-	-	-1.36	0.51	-	-	-	-	-	2.41	0.33
Gb_36505	0.12	-	-	2.05	-0.69	-	0.17	-0.07	-3.39	-0.79	0.44	-1.53	-0.62	-	0.22	-	-1.52	-1.99	2.55	0.51
Gb_36519	-	-	-	3.56	-	-	-	-1.15	-	-	-	-	-	0.46	-	-	-	-	2.68	-
Gb_36623	-	0.61	-	2.61	-	-	-0.16	-0.17	0.53	-1.31	-0.57	-0.92	-	-1.7	-	-	0.94	-0.6	2.22	-
Gb_36737	0.38	-	-4.03	2.12	-	-	-1.89	-0.09	0.6	-0.26	-0.07	-3.01	-4.49	-	-0.23	1.92	-	-0.2	2.03	-
Gb_36925	0.78	-1.97	-2.18	-3.68	-0.04	0.68	-2.71	-0.79	-1.93	-1.49	-0.72	-0.39	-1.81	-2.9	-1.14	-3.95	-4.34	1.37	2.66	1.34
Gb_37021	0.98	-	-	-	-	-	-	0.59	-0.18	-	-	-0.09	1.62	1.29	1.63	-	-	-	2.6	-
Gb_37369	-	-	-	-	-25.1	-	-	1.44	-	-	-	-	-	-	2.7	-	-	-	3.43	-
Gb_37870	-	-	-	-	-	-	-	2.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.75	-
Gb_38048	-	-	-	-	-	-	1.33	-1.41	0.29	-	-6.65	-	-	-	3.37	-	-	-	2.47	-
Gb_38053	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_38120	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_38299	-	-	-	-	-	-	-26.61	-0.64	-0.91	-	0.48	-	-	-	-	1.22	1.88	-	3.51	-
Gb_38341	2.83	-	-	-	-	-	-	-0.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.6	-	-
Gb_38380	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-
Gb_38544	-1.44	-	-	2.39	-	1.8	0.28	-0.98	-	-	-	-1.42	-	-	1.32	-	-	-	2.66	-8.35
Gb_38915	-	-	-	-	-	-	-	-0.63	2.89	3.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_39221	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-	-	-	-
Gb_39701	0.16	-	-	-	-	-	-	-0.11	-0.16	-	0.22	-	-	-1.86	1.78	1.03	-	-	3.09	0.7
Gb_40033	0.92	2.09	-	-	-	-	-2.14	-2.12	-	-	-	-	0.12	-	1.04	2.63	-	-	1.33	0.63
Gb_40078	-	-	-	-	0.49	-	-0.19	0.76	0.93	-	-	-1.46	-	-	0.31	2.61	-	-	2.35	0.4
Gb_40224	2.72	-	-	-	-	-	-	0.91	-	-	-	-	-	-	3.53	-	-	-	-	-
Gb_40384	-	-	-	-	-	-	-	2.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.93	-
Gb_40496	-1.48	1.86	-	3.09	0.64	-	-	-1.91	-2.2	-	-	-	-	-	0.98	0.14	-	-	1.25	-
Gb_40566	-	-	-	3.18	-	2.15	1.42	1.81	-1.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_40582	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Gb_40993	-3.36	-	-13.37	-	-	-2.81	-3.49	-0.59	-	-13.0	0.72	-	-0.38	-	-	3.75	-	-	1.67	-
Gb_41335	-	-	-	-	-	-	-	-1.61	-	-	-	-	-	-	-	4.3	-	-	-	-
Gb_41587	-0.05	-	-	3.69	-	-	-	-0.59	-	-	-	-	-	-	-	1.11	-	-	1.71	-
Gb_41681	1.61	-	-0.43	1.87	-0.44	-	-2.28	-1.39	-0.75	-2.41	0.04	-3.65	-0.41	-0.6	-	1.04	0.57	-	1.95	-0.97

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.