1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_43 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.32 0.14 0.12 1.06 0.09 0.05 0.21 0.17 0.12 0.19 0.18 0.03 0.15 0.23 0.04 0.33 0.43 0.09 0.12 0.02
0.51 0.42 0.31 1.17 0.22 0.05 0.22 0.42 0.37 0.39 0.24 0.1 0.53 0.52 0.64 0.99 0.51 0.06 0.27 0.05
0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.04 0.26 0.04 0.0 0.03 0.07 0.1 0.2 0.0 0.02 0.14 0.02 0.07 0.2 0.0 0.0 0.14 0.0
0.04 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.02 0.18 0.04 0.07 0.44 0.05 0.04 0.04 0.37 0.05 0.06 0.05 0.14 0.06
0.8 6.96 0.18 1.85 4.74 1.61 2.45 1.91 3.95 2.76 0.81 3.35 3.42 2.79 0.86 0.27 0.15 3.83 0.49 1.35
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.17 0.1 0.07 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.65 0.45 0.02 0.14 0.02
0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.03 0.05 0.01 0.09 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.12 0.4 0.0 0.49
1.15 0.43 0.44 1.59 0.2 0.56 0.2 6.09 5.2 6.12 3.11 2.91 11.67 6.14 2.81 1.64 1.7 0.9 0.09 0.1
0.15 0.04 0.05 0.03 0.05 0.11 0.02 0.86 1.21 1.84 1.24 0.51 2.42 1.44 1.35 0.3 0.31 0.18 0.03 0.46
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.11 0.05 0.07 0.11 0.01 0.22 0.08 0.1 0.0 0.01 0.0 0.09 0.01
0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.34 0.0 0.02 2.77 0.0 0.0 3.13 1.04 0.1 0.0 3.63 0.0 0.12 0.54 1.91 0.0 0.0 0.29 4.92 1.31
0.19 0.0 0.0 1.22 0.0 0.0 0.22 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0
0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.16 0.08 0.6 0.19 0.06 0.27 0.08 0.2 0.09 0.04 0.12 0.09 0.02 0.0 0.05 0.15 0.02 0.04 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
2.92 5.04 2.91 0.0 6.64 1.55 4.66 3.24 2.79 2.31 2.63 3.01 3.08 2.46 2.78 1.1 1.91 2.9 3.0 4.74
2.98 1.22 1.6 3.48 1.51 0.54 0.97 1.21 0.64 0.74 1.72 0.38 1.99 1.21 1.19 0.43 0.49 0.64 2.48 0.83
0.49 0.1 0.53 0.29 0.75 0.78 0.19 1.12 2.07 1.8 3.35 1.94 0.29 0.56 3.13 6.22 4.16 0.64 0.42 0.08
0.33 0.17 0.23 0.24 0.18 0.04 0.0 0.12 0.22 0.17 0.11 0.02 0.14 0.18 0.03 0.06 0.15 0.02 0.12 0.05
1.38 1.15 0.67 4.42 0.89 0.18 0.43 0.48 0.43 0.39 0.95 0.08 0.57 0.52 0.4 1.32 0.76 0.31 0.65 0.25
0.59 0.0 0.0 2.72 0.0 0.0 0.06 0.19 0.08 0.0 0.26 0.13 0.94 0.64 0.0 0.07 0.0 0.5 0.0 0.0
1.28 0.48 1.11 7.03 1.86 0.37 1.07 1.53 2.42 3.0 2.92 0.2 2.6 3.02 1.99 5.35 2.27 0.81 0.69 0.47
0.24 0.0 0.2 0.3 0.27 0.02 0.06 0.29 0.18 0.12 0.35 0.18 0.5 0.25 0.23 0.21 0.1 0.28 0.13 0.0
0.39 0.0 0.12 0.81 0.0 0.0 0.0 0.14 0.23 0.07 0.36 0.0 0.21 0.27 0.21 0.66 0.27 0.0 0.17 0.0
1.28 0.0 1.53 6.4 0.0 0.0 5.24 0.21 0.19 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 1.28 0.44
0.73 0.29 0.02 0.36 0.38 0.35 0.27 0.45 0.52 0.45 0.4 0.08 0.07 0.11 0.44 0.19 0.17 0.44 0.38 0.37
0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.09 0.18 0.0 0.0 0.18 0.0 0.1 0.22 0.13 0.14 0.23 0.09 0.46 0.31 0.08 0.33 0.12 0.15 0.4 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.12 0.03 0.0 0.06 0.0 0.05 0.08 0.08 0.09 0.15 0.08 0.04 0.01 0.05 0.0 0.0 0.08 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.73 0.02 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.06 0.02 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.04 0.09 0.07 0.07 0.22 0.01 0.22 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07
1.47 0.97 0.71 3.11 0.57 0.13 0.4 1.0 0.83 0.64 0.71 0.11 1.74 1.23 0.55 1.03 0.81 0.21 0.51 0.24
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.78 6.01 5.3 18.19 0.96 0.43 1.37 6.95 1.84 2.86 4.06 3.27 10.95 9.09 6.47 2.6 6.88 3.08 1.65 0.03
0.08 1.11 0.05 3.2 5.39 1.05 3.69 1.75 3.97 3.79 0.9 4.23 3.26 1.47 0.13 0.0 0.0 4.14 0.23 1.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.08 0.35 0.85 2.06 0.45 0.44 0.66 0.66 0.44 0.51 0.36 0.03 0.65 0.34 0.46 0.79 0.56 0.28 0.4 0.18
0.04 0.0 0.02 1.71 0.11 0.0 0.45 0.18 0.24 0.18 0.03 0.1 0.28 0.21 0.07 0.21 0.15 0.05 0.04 0.1
0.17 0.38 0.3 2.05 0.29 0.02 0.16 0.48 0.57 0.61 0.78 0.07 0.69 0.73 0.34 1.71 0.73 0.17 0.28 0.08
0.02 0.15 0.0 0.34 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.13 0.0
0.53 0.77 0.56 0.56 0.24 0.03 0.23 0.43 0.32 0.48 0.38 0.06 0.63 0.59 0.35 0.88 0.74 0.04 0.25 0.04
0.4 0.12 0.17 0.23 0.1 0.41 0.01 6.5 8.9 12.45 4.62 1.25 7.39 6.72 4.17 2.83 2.46 0.69 0.13 0.68
0.0 6.76 0.62 0.0 7.58 2.79 0.23 21.69 8.33 8.0 2.08 11.42 31.47 25.26 0.88 0.0 0.0 0.16 0.0 1.27
0.33 0.71 0.52 1.48 0.24 0.0 0.32 0.32 0.36 0.23 0.49 0.05 0.07 0.09 0.29 0.59 0.45 0.13 0.36 0.09
2.4 1.51 0.4 2.97 2.08 0.12 0.39 1.11 1.54 1.89 1.26 0.31 1.4 1.62 1.08 1.85 1.52 0.04 0.77 0.4
0.6 0.62 0.43 1.22 0.39 0.1 0.24 0.41 0.27 0.3 0.42 0.09 0.56 0.59 0.46 0.8 0.53 0.22 0.3 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.09 0.47 0.64 0.28 0.01 0.75 0.07 0.25 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.29 0.12 0.14 0.91 0.11 0.05 0.19 0.27 0.23 0.27 0.31 0.01 0.55 0.24 0.18 0.35 0.45 0.0 0.26 0.0
0.68 1.07 0.71 0.0 0.8 0.22 0.22 0.65 0.68 0.44 1.91 0.28 0.0 0.0 1.21 0.35 0.24 0.61 0.17 0.24
0.15 0.43 0.14 0.0 0.39 0.47 0.36 0.48 0.41 0.81 0.25 0.1 0.04 0.08 0.93 0.36 0.27 0.29 0.33 0.12
0.02 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.01
0.66 0.79 0.68 0.0 0.7 0.1 0.48 0.37 0.74 0.7 0.34 0.09 0.71 0.73 0.47 1.0 1.06 0.08 0.15 0.15
0.45 0.17 0.06 0.85 0.24 0.09 0.09 0.27 0.13 0.13 0.19 0.01 0.2 0.27 0.4 0.73 0.28 0.08 0.2 0.08
0.0 0.0 0.02 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.08 0.0 0.12 0.04 0.0 0.0 0.15 0.02 0.08 0.48 0.01 0.14 0.09 0.39 0.16 0.05 0.0 0.06 0.0
0.07 0.0 0.09 0.34 0.0 0.0 0.3 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02
1.56 0.79 0.39 1.37 0.63 0.29 0.23 0.57 0.48 1.34 0.17 0.01 0.28 0.47 0.37 0.33 0.55 0.16 0.54 0.07
0.0 0.06 0.03 0.09 0.09 0.0 0.05 0.03 0.07 0.0 0.1 0.0 0.16 0.01 0.05 0.16 0.03 0.07 0.01 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.1 0.18 0.05 0.0 0.0 0.04 0.03 0.14 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.21 0.26 0.0 0.0 0.16 0.06 0.11 0.25 0.0 0.33 0.07 0.36 0.0 0.16 0.0 0.18 0.11
0.0 0.0 0.0 36.96 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0 0.0 1.04 0.0 0.0 0.0 1.71 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0
0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.39 1.09 1.81 6.64 1.39 0.45 0.59 2.45 3.94 3.58 3.26 0.72 2.28 1.9 5.31 8.66 7.62 0.74 1.62 0.08
2.02 1.0 0.4 3.12 1.05 0.55 0.36 2.0 3.04 2.29 2.82 0.49 2.11 1.46 2.88 5.45 3.48 0.92 1.85 0.11
0.78 0.8 0.49 3.98 1.07 0.39 0.32 1.73 2.57 2.27 2.16 0.46 3.0 3.31 3.14 7.14 4.83 0.53 0.42 0.09
0.17 0.0 0.0 4.54 0.04 0.0 0.08 0.37 0.11 0.16 1.19 0.02 0.71 0.73 0.4 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0
0.07 0.13 0.1 0.55 0.12 0.02 0.02 0.2 0.21 0.21 0.15 0.04 0.15 0.26 0.4 0.27 0.31 0.0 0.15 0.02
0.32 1.37 0.83 0.8 1.04 0.16 0.8 0.57 0.59 0.58 0.22 0.32 0.92 0.84 0.33 0.24 0.25 0.42 1.04 0.08
43.02 74.44 72.68 0.0 41.72 61.78 11.04 54.82 73.38 47.01 72.64 67.05 79.63 60.14 45.51 249.49 123.11 62.46 0.0 20.54
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.49 0.74 0.8 0.15 1.51 0.46 0.39 0.8 0.84 0.03 0.04 0.14 0.2 0.1
0.07 0.0 0.14 0.23 0.0 0.0 0.0 0.21 0.32 0.29 0.2 0.02 0.03 0.13 0.12 0.32 0.08 0.07 0.1 0.0
0.0 0.08 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02
0.12 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.03 0.05 0.12 0.03 0.1 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.18
0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)