Heatmap: Cluster_268 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.71 1.0 0.67 0.2 0.66 0.26 0.48 0.08 0.05 0.05 0.02 0.08 0.05 0.04 0.03 0.08 0.07 0.54 0.22 0.65
0.95 0.68 0.82 0.8 1.0 0.99 0.74 0.45 0.25 0.27 0.26 0.38 0.21 0.21 0.28 0.29 0.35 0.79 0.52 0.53
0.47 1.0 0.92 0.54 0.47 0.13 0.35 0.23 0.15 0.14 0.17 0.23 0.14 0.13 0.18 0.06 0.11 0.18 0.41 0.41
0.47 1.0 0.57 0.4 0.39 0.15 0.19 0.15 0.13 0.09 0.05 0.11 0.1 0.05 0.04 0.17 0.11 0.33 0.29 0.13
0.96 0.54 0.66 0.88 1.0 0.83 0.49 0.37 0.22 0.22 0.28 0.22 0.19 0.21 0.28 0.3 0.36 0.86 0.37 0.37
0.34 0.29 0.69 0.43 0.45 0.07 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.78 0.13 1.0
0.31 0.36 0.29 0.4 0.88 0.12 0.46 0.16 0.08 0.02 0.06 0.14 0.08 0.1 0.15 0.09 0.12 1.0 0.67 0.79
0.53 0.42 0.49 0.38 0.83 0.1 0.55 0.23 0.1 0.04 0.1 0.16 0.05 0.1 0.14 0.24 0.22 1.0 0.72 0.77
0.73 0.87 1.0 0.55 0.85 0.02 0.27 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.62 0.45 0.39
0.83 0.78 1.0 0.62 0.81 0.5 0.38 0.45 0.27 0.28 0.4 0.37 0.31 0.38 0.45 0.33 0.44 0.63 0.5 0.5
0.36 0.47 1.0 0.32 0.57 0.01 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.4 0.2 0.08
0.21 0.19 0.29 0.26 0.36 0.15 0.18 0.21 0.11 0.14 0.11 0.09 0.07 0.06 0.12 0.12 0.25 0.7 0.51 1.0
0.64 1.0 0.82 0.57 0.69 0.22 0.24 0.28 0.11 0.12 0.26 0.11 0.2 0.18 0.29 0.11 0.09 0.6 0.48 0.35
0.87 0.61 0.75 0.69 0.72 0.29 0.27 0.36 0.17 0.16 0.21 0.21 0.09 0.09 0.19 0.37 0.2 0.95 0.55 1.0
0.82 0.89 0.98 1.0 0.83 0.79 0.32 0.4 0.22 0.18 0.21 0.21 0.27 0.26 0.21 0.4 0.35 0.79 0.55 0.28
0.73 0.39 0.72 0.81 0.72 0.7 0.11 0.33 0.22 0.15 0.12 0.14 0.17 0.26 0.17 0.63 0.35 1.0 0.19 0.34
0.69 0.38 0.77 0.68 0.79 0.65 0.49 0.48 0.24 0.25 0.46 0.41 0.23 0.23 0.51 0.32 0.59 1.0 0.38 0.35
0.67 0.71 1.0 0.22 1.0 0.33 0.25 0.17 0.12 0.13 0.09 0.12 0.18 0.1 0.13 0.19 0.18 0.77 0.65 0.37
0.5 1.0 0.44 0.55 0.66 0.28 0.14 0.15 0.06 0.05 0.04 0.11 0.2 0.1 0.06 0.26 0.16 0.47 0.2 0.1
0.72 0.73 1.0 0.58 0.81 0.31 0.18 0.25 0.08 0.05 0.08 0.14 0.24 0.12 0.08 0.3 0.16 0.49 0.16 0.12
0.24 0.27 0.37 0.24 0.45 0.22 0.08 0.23 0.07 0.08 0.07 0.11 0.22 0.18 0.07 0.12 0.15 1.0 0.14 0.56
0.99 0.52 0.73 0.29 1.0 0.41 0.48 0.26 0.08 0.16 0.17 0.15 0.04 0.01 0.16 0.0 0.03 1.0 0.21 0.36
0.42 1.0 0.7 0.38 0.44 0.12 0.26 0.19 0.16 0.15 0.16 0.11 0.07 0.06 0.2 0.11 0.08 0.27 0.41 0.31
0.83 1.0 0.95 0.31 0.81 0.28 0.51 0.38 0.33 0.28 0.38 0.27 0.32 0.24 0.45 0.25 0.18 0.55 0.57 0.57
0.58 0.79 0.65 0.52 0.68 0.74 0.46 0.49 0.25 0.29 0.4 0.27 0.21 0.16 0.39 0.47 0.68 0.77 1.0 0.65
0.94 0.99 1.0 0.53 0.9 0.17 0.43 0.32 0.4 0.33 0.36 0.31 0.33 0.23 0.26 0.49 0.33 0.61 0.5 0.55
1.0 0.65 0.9 0.58 0.81 0.37 0.59 0.22 0.13 0.12 0.09 0.15 0.12 0.15 0.12 0.2 0.14 0.7 0.2 0.59
0.75 0.62 0.7 0.3 1.0 0.13 0.22 0.12 0.01 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.07 0.06 0.78 0.38 0.5
0.72 0.46 0.59 0.63 0.77 0.33 0.5 0.27 0.1 0.13 0.13 0.13 0.02 0.04 0.18 0.32 0.4 1.0 0.44 0.94
0.68 0.35 0.46 0.42 0.85 0.38 0.18 0.18 0.07 0.06 0.0 0.05 0.01 0.03 0.06 0.08 0.05 1.0 0.46 0.25
0.88 1.0 0.81 0.61 0.99 0.4 0.54 0.47 0.41 0.38 0.27 0.43 0.58 0.48 0.27 0.31 0.42 0.92 0.89 0.77
0.79 0.58 0.42 0.49 1.0 0.35 0.24 0.18 0.08 0.05 0.08 0.03 0.02 0.04 0.1 0.17 0.12 0.88 0.5 0.49
0.3 1.0 0.5 0.25 0.45 0.17 0.24 0.1 0.07 0.07 0.03 0.09 0.04 0.04 0.05 0.09 0.07 0.26 0.36 0.2
0.56 0.46 0.61 0.58 0.89 1.0 0.23 0.1 0.03 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.13 0.09 0.53 0.04 0.33
0.99 0.88 0.9 0.76 0.98 0.87 0.68 0.54 0.32 0.28 0.43 0.35 0.35 0.33 0.47 0.5 0.49 1.0 0.32 0.61
0.31 0.38 0.32 0.14 0.22 0.11 0.2 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.47 0.03 1.0
0.74 1.0 0.91 0.55 0.68 0.18 0.28 0.21 0.16 0.14 0.08 0.18 0.13 0.13 0.1 0.35 0.24 0.66 0.42 0.46
1.0 0.17 0.83 0.34 0.81 0.14 0.15 0.22 0.13 0.13 0.01 0.03 0.07 0.15 0.02 0.21 0.21 0.81 0.1 0.14
0.56 1.0 0.88 0.35 0.59 0.17 0.2 0.15 0.18 0.15 0.06 0.07 0.07 0.07 0.06 0.25 0.19 0.35 0.36 0.1
0.9 0.6 1.0 0.95 0.9 0.82 0.4 0.48 0.26 0.23 0.39 0.27 0.26 0.33 0.36 0.38 0.41 0.97 0.43 0.55
0.36 1.0 0.59 0.45 0.87 0.16 0.18 0.26 0.26 0.24 0.2 0.06 0.2 0.12 0.17 0.08 0.14 0.59 0.57 0.82
0.45 1.0 0.43 0.47 0.95 0.1 0.15 0.25 0.17 0.2 0.17 0.04 0.22 0.14 0.21 0.06 0.09 0.67 0.76 0.51
0.74 0.27 1.0 0.59 0.96 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.06 0.02
0.62 0.3 1.0 0.36 0.81 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.11 0.02
0.86 0.71 1.0 0.55 0.72 0.01 0.01 0.13 0.03 0.05 0.08 0.08 0.09 0.05 0.08 0.07 0.01 0.75 0.27 0.1
0.33 0.64 0.33 0.46 0.62 0.15 0.26 0.2 0.09 0.09 0.09 0.11 0.05 0.07 0.11 0.17 0.08 0.61 0.39 1.0
0.81 0.82 0.63 0.84 1.0 0.65 0.2 0.39 0.21 0.23 0.31 0.33 0.33 0.3 0.29 0.28 0.28 0.85 0.34 0.44
0.53 0.6 0.38 0.43 0.67 0.5 0.14 0.25 0.08 0.08 0.11 0.14 0.04 0.05 0.13 0.17 0.19 0.9 0.82 1.0
0.82 1.0 0.98 0.33 0.8 0.22 0.32 0.29 0.16 0.15 0.18 0.14 0.16 0.12 0.19 0.21 0.19 0.76 0.42 0.55
1.0 0.51 0.82 0.67 0.62 0.67 0.55 0.19 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.09 0.32 0.98 0.2 0.01
0.33 1.0 0.66 0.29 0.28 0.11 0.16 0.09 0.06 0.07 0.11 0.06 0.05 0.04 0.15 0.06 0.1 0.12 0.29 0.08
0.59 1.0 0.4 0.64 0.7 0.5 0.35 0.32 0.26 0.23 0.29 0.24 0.28 0.28 0.28 0.28 0.25 0.73 0.23 0.37
0.39 1.0 0.37 0.39 0.5 0.41 0.23 0.25 0.17 0.18 0.22 0.19 0.14 0.12 0.19 0.2 0.18 0.47 0.41 0.3
0.82 0.59 1.0 0.65 0.84 0.5 0.35 0.43 0.3 0.3 0.46 0.33 0.4 0.36 0.46 0.3 0.35 0.58 0.41 0.42
0.72 0.93 0.81 0.89 1.0 0.55 0.19 0.38 0.17 0.17 0.3 0.3 0.36 0.3 0.27 0.26 0.24 0.81 0.4 0.25
0.97 0.88 0.94 1.0 0.87 0.8 0.6 0.36 0.24 0.23 0.19 0.29 0.21 0.22 0.18 0.32 0.34 0.73 0.44 0.53
0.69 1.0 0.67 0.32 0.71 0.37 0.2 0.22 0.15 0.2 0.1 0.21 0.06 0.09 0.13 0.31 0.29 0.47 0.31 0.34
0.39 0.53 0.53 0.39 0.54 0.54 0.32 0.44 0.3 0.31 0.43 0.29 0.25 0.17 0.45 0.31 0.42 0.73 0.73 1.0
0.66 1.0 0.84 0.0 0.59 0.1 0.04 0.08 0.0 0.01 0.03 0.05 0.01 0.01 0.01 0.08 0.06 0.41 0.0 0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)