Heatmap: Cluster_254 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.03 0.12 0.06 0.33 0.02 0.0 0.04 0.06 0.04 0.01 0.06 0.0 0.03 0.02 0.07 0.14 0.07 0.03 0.07 0.06
0.26 0.45 0.0 2.2 0.0 0.13 0.17 0.34 0.11 0.22 0.35 0.06 0.1 0.02 0.54 1.24 0.25 0.09 0.9 0.37
0.01 0.06 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.07 0.0 0.01 0.01 0.02 0.16 0.03 0.0 0.25 0.04
0.06 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.02 0.05 0.07 0.02 0.03 0.01 0.04 0.02 0.05 0.0 0.14 0.0 0.25 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0
0.04 0.03 0.03 0.16 0.0 0.0 0.02 0.05 0.03 0.04 0.08 0.0 0.05 0.02 0.09 0.29 0.04 0.0 0.08 0.02
0.0 0.32 0.08 0.61 0.0 0.04 0.0 0.02 0.01 0.02 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.02 0.0 0.07 0.0
0.03 0.07 0.04 0.21 0.02 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.04 0.07 0.0 0.0 0.07 0.01
0.15 0.16 0.0 0.37 0.0 0.17 0.01 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.31 0.11 0.0 0.39 0.13
0.02 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.07 0.06 0.1 0.0 0.05 0.0
0.06 0.0 0.01 0.26 0.04 0.0 0.01 0.05 0.01 0.02 0.04 0.0 0.1 0.08 0.0 0.16 0.19 0.03 0.18 0.0
0.02 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.03 0.06 0.03 0.03 0.13 0.0 0.02 0.02 0.0 0.19 0.0 0.0 0.12 0.05
0.18 0.0 0.04 0.46 0.08 0.0 0.0 0.15 0.11 0.02 0.2 0.0 0.03 0.0 0.07 0.07 0.1 0.0 0.39 0.0
0.03 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.0 0.06 0.0
0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.06 0.01
0.81 0.43 0.17 0.69 0.0 0.0 0.18 0.33 0.32 0.49 0.64 0.03 1.89 1.2 0.12 0.69 0.3 0.12 0.23 0.0
0.64 0.0 0.0 1.7 0.0 0.0 0.0 0.43 0.25 0.35 0.4 0.0 0.2 0.45 0.94 1.31 0.3 0.65 1.34 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.1 0.14 0.06 0.16 0.09 0.0 0.02 0.07 0.07 0.03 0.03 0.01 0.06 0.06 0.09 0.38 0.0 0.01 0.09 0.0
0.0 0.0 0.06 0.15 0.0 0.0 0.03 0.04 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.08 0.2 0.11
0.04 0.06 0.0 0.26 0.0 0.0 0.02 0.04 0.03 0.03 0.04 0.02 0.04 0.04 0.03 0.08 0.02 0.02 0.15 0.0
0.1 0.0 0.02 1.4 0.09 0.1 0.04 0.08 0.02 0.08 0.14 0.0 0.19 0.1 0.09 0.17 0.08 0.02 1.72 0.0
0.34 0.15 0.0 1.11 0.05 0.0 0.11 0.23 0.1 0.24 0.0 0.0 0.38 0.36 0.15 0.7 0.34 0.21 1.03 0.14
0.02 0.0 0.05 0.33 0.03 0.0 0.02 0.09 0.06 0.04 0.03 0.03 0.08 0.05 0.0 0.0 0.04 0.01 0.27 0.03
0.41 0.73 0.15 1.88 0.34 0.17 0.19 0.35 0.27 0.18 0.1 0.04 0.54 0.37 0.19 1.26 0.3 0.0 0.86 0.33
0.06 0.21 0.1 0.17 0.0 0.0 0.05 0.08 0.01 0.01 0.03 0.01 0.11 0.03 0.07 0.16 0.02 0.0 0.11 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.05 0.02
0.0 0.0 0.0 1.27 0.0 0.0 0.05 0.06 0.05 0.0 0.12 0.03 0.09 0.0 0.0 0.2 0.0 0.05 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0
0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.0 0.1 0.0
0.01 0.01 0.03 0.11 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.04 0.01 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.25 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.32 0.16 0.69 0.04 0.0 0.1 0.06 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.13 0.0 0.08 0.0 0.0 0.51 0.0
0.02 0.1 0.08 0.59 0.0 0.0 0.0 0.11 0.01 0.13 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.94 0.2 0.0 0.36 0.12
0.45 0.0 0.16 1.11 0.08 0.14 0.08 0.24 0.18 0.09 0.4 0.0 0.13 0.04 0.19 0.49 0.05 0.04 0.75 0.2
0.14 0.07 0.05 0.54 0.03 0.0 0.04 0.12 0.04 0.06 0.11 0.01 0.07 0.05 0.09 0.48 0.22 0.03 0.27 0.06
0.0 0.05 0.0 0.15 0.02 0.0 0.04 0.04 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.11 0.0 0.0 1.53 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.07 0.11 0.12 0.19 0.03 1.22 0.0
0.11 0.08 0.0 0.49 0.06 0.0 0.02 0.06 0.06 0.0 0.02 0.0 0.07 0.04 0.12 0.25 0.02 0.0 0.29 0.03
0.01 0.02 0.01 0.07 0.0 0.03 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.02 0.02 0.13 0.0
0.0 0.01 0.0 0.09 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.12 0.0
0.03 0.0 0.0 0.19 0.08 0.0 0.02 0.04 0.03 0.01 0.02 0.0 0.05 0.07 0.03 0.26 0.0 0.03 0.18 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.05 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.2 0.0
0.0 0.17 0.0 0.55 0.0 0.0 0.06 0.08 0.08 0.02 0.0 0.01 0.14 0.04 0.0 0.31 0.08 0.03 0.22 0.04
0.99 0.23 0.28 0.81 0.47 0.0 0.26 0.82 0.47 0.27 0.7 0.03 0.47 0.41 0.68 3.1 1.36 0.34 1.42 0.36
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.05 0.0
0.04 0.08 0.02 0.47 0.03 0.0 0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.09 0.18 0.04 0.0 0.14 0.02
0.26 0.18 0.08 2.34 0.0 0.93 0.58 0.23 0.0 0.05 0.61 0.0 0.58 0.51 0.3 1.55 0.17 0.0 0.92 0.0
0.36 0.05 0.05 0.89 0.17 0.0 0.1 0.16 0.1 0.17 0.07 0.02 0.23 0.12 0.0 0.42 0.25 0.13 0.28 0.09
0.04 0.21 0.05 1.04 0.0 0.0 0.03 0.08 0.06 0.03 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.4 0.0
0.3 0.53 0.06 1.67 0.1 0.09 0.09 0.2 0.11 0.13 0.27 0.02 0.08 0.09 0.17 0.63 0.1 0.0 0.56 0.09
0.42 0.0 0.0 1.83 0.1 0.0 0.05 0.15 0.17 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0
0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.04 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.04 0.09 0.0 0.02 0.22 0.06
0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.0
0.02 0.04 0.01 0.2 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.01 0.03 0.0 0.01 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.14 0.0
0.07 0.0 0.08 0.19 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0
0.03 0.04 0.04 0.18 0.04 0.05 0.03 0.04 0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 0.03 0.02 0.02 0.03 0.0 0.09 0.02
0.07 0.15 0.06 0.37 0.04 0.0 0.02 0.08 0.12 0.09 0.08 0.0 0.16 0.09 0.11 0.46 0.3 0.05 0.39 0.03
0.36 0.27 0.04 0.79 0.17 0.0 0.1 0.24 0.08 0.02 0.03 0.03 0.41 0.21 0.18 0.49 0.0 0.25 0.61 0.14
0.04 0.0 0.08 0.19 0.0 0.15 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.03 0.0 0.21 0.04
0.08 0.16 0.04 0.52 0.07 0.07 0.06 0.09 0.05 0.05 0.04 0.0 0.04 0.02 0.02 0.25 0.08 0.02 0.28 0.02
0.14 0.0 0.04 0.79 0.0 0.0 0.08 0.07 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.31 0.11 0.0 0.27 0.0
0.19 0.0 0.04 0.88 0.06 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.16 0.18 0.09 0.37 0.02
0.06 0.0 0.01 0.16 0.08 0.01 0.01 0.04 0.02 0.02 0.04 0.0 0.04 0.02 0.03 0.08 0.06 0.02 0.15 0.06
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.03 0.23 0.19 0.03 0.2 0.0
0.06 0.0 0.05 0.28 0.0 0.0 0.03 0.06 0.04 0.03 0.08 0.01 0.02 0.0 0.13 0.2 0.11 0.0 0.23 0.14

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)