Heatmap: Cluster_216 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.0 0.63 0.6 0.89 0.73 0.43 0.65 0.46 0.35 0.33 0.5 0.32 0.39 0.35 0.46 0.27 0.3 0.56 0.59 0.47
1.0 0.29 0.7 0.51 0.7 0.19 0.66 0.36 0.38 0.32 0.29 0.29 0.26 0.32 0.26 0.34 0.39 0.5 0.41 0.64
1.0 0.48 0.67 0.61 0.69 0.27 0.61 0.36 0.25 0.2 0.25 0.2 0.2 0.17 0.27 0.26 0.3 0.5 0.55 0.59
0.33 0.3 0.31 0.29 0.41 0.16 1.0 0.15 0.07 0.07 0.12 0.11 0.08 0.06 0.1 0.09 0.11 0.29 0.34 0.27
1.0 0.71 0.86 0.67 0.57 0.11 0.67 0.28 0.26 0.24 0.58 0.19 0.21 0.19 0.52 0.44 0.3 0.33 0.61 0.19
0.84 0.75 0.62 0.64 0.81 0.41 1.0 0.4 0.31 0.27 0.45 0.21 0.31 0.26 0.46 0.35 0.25 0.58 0.62 0.51
0.91 0.58 0.65 0.78 0.84 0.48 1.0 0.5 0.7 0.68 0.76 0.31 0.48 0.5 0.79 0.51 0.49 0.74 0.77 0.78
0.71 0.7 0.3 0.34 0.31 0.26 1.0 0.16 0.18 0.2 0.26 0.06 0.12 0.11 0.27 0.39 0.11 0.32 0.33 0.37
0.91 1.0 0.67 0.68 0.6 0.3 1.0 0.42 0.48 0.43 0.72 0.28 0.63 0.37 0.82 0.63 0.24 0.44 0.38 0.36
1.0 0.91 0.77 0.68 0.85 0.22 0.58 0.34 0.31 0.29 0.42 0.25 0.28 0.26 0.43 0.42 0.35 0.75 0.45 0.72
0.21 0.19 0.2 0.41 0.37 0.33 1.0 0.23 0.16 0.15 0.22 0.23 0.16 0.19 0.27 0.12 0.18 0.47 0.39 0.36
1.0 0.72 0.73 0.92 0.83 0.34 0.76 0.51 0.29 0.3 0.52 0.22 0.49 0.43 0.48 0.37 0.32 0.48 0.83 0.36
1.0 0.58 0.79 0.91 0.76 0.54 0.73 0.61 0.39 0.42 0.49 0.38 0.61 0.52 0.45 0.34 0.38 0.64 0.84 0.73
0.77 0.77 0.46 0.69 0.63 0.34 1.0 0.41 0.55 0.49 0.78 0.33 0.41 0.34 0.83 0.64 0.39 0.74 0.56 0.75
0.63 0.61 0.62 0.63 0.63 0.29 1.0 0.3 0.33 0.32 0.36 0.2 0.24 0.28 0.36 0.25 0.18 0.35 0.31 0.38
1.0 0.8 0.75 0.87 0.77 0.64 0.78 0.5 0.46 0.41 0.76 0.36 0.34 0.35 0.72 0.51 0.49 0.59 0.85 0.63
0.83 0.35 0.54 0.91 0.89 0.28 1.0 0.36 0.4 0.3 0.53 0.17 0.34 0.29 0.55 0.37 0.25 0.42 0.51 0.74
1.0 0.5 0.54 0.65 0.79 0.26 0.9 0.36 0.39 0.32 0.39 0.22 0.46 0.48 0.37 0.49 0.22 0.72 0.4 0.71
1.0 0.58 0.65 0.71 0.99 0.3 0.88 0.39 0.41 0.4 0.46 0.19 0.28 0.27 0.45 0.37 0.23 0.75 0.58 0.62
1.0 0.65 0.63 0.72 0.89 0.24 0.77 0.35 0.35 0.33 0.38 0.16 0.24 0.23 0.45 0.43 0.19 0.53 0.56 0.55
1.0 0.71 0.77 0.7 0.87 0.66 0.61 0.66 0.43 0.42 0.7 0.41 0.77 0.63 0.75 0.37 0.45 0.59 0.85 0.51
1.0 0.66 0.86 0.72 0.72 0.61 0.67 0.27 0.19 0.16 0.27 0.21 0.23 0.2 0.3 0.27 0.22 0.47 0.51 0.42
0.95 0.78 0.69 0.81 0.74 0.4 1.0 0.48 0.53 0.45 0.65 0.35 0.34 0.33 0.67 0.63 0.31 0.69 0.66 0.45
0.99 0.43 0.42 0.97 0.95 0.36 1.0 0.6 0.49 0.43 0.75 0.43 0.47 0.53 0.61 0.77 0.49 0.76 0.6 0.45
0.9 0.56 0.6 0.79 1.0 0.4 0.9 0.54 0.37 0.36 0.59 0.43 0.27 0.26 0.38 0.26 0.51 0.59 0.98 0.5
0.82 0.47 0.62 0.58 0.97 0.39 1.0 0.55 0.45 0.42 0.55 0.37 0.46 0.42 0.49 0.34 0.47 0.61 0.63 0.57
0.93 0.51 0.59 0.72 0.59 0.29 1.0 0.31 0.27 0.21 0.31 0.16 0.21 0.16 0.31 0.3 0.22 0.43 0.67 0.37
0.41 0.64 0.38 0.39 0.52 0.41 1.0 0.23 0.14 0.14 0.16 0.14 0.14 0.14 0.17 0.2 0.2 0.44 0.33 0.27
1.0 0.79 0.82 0.85 0.8 0.6 0.95 0.53 0.46 0.41 0.77 0.42 0.44 0.45 0.77 0.42 0.39 0.69 0.96 0.64
1.0 0.64 0.6 0.66 0.58 0.33 0.78 0.33 0.4 0.32 0.39 0.2 0.16 0.17 0.41 0.29 0.24 0.44 0.8 0.49
0.77 0.93 1.0 0.92 0.6 0.1 0.46 0.2 0.2 0.27 0.32 0.19 0.1 0.15 0.32 0.27 0.24 0.3 0.3 0.33
0.7 0.74 0.68 0.63 1.0 0.25 0.75 0.38 0.47 0.48 0.51 0.35 0.53 0.52 0.47 0.39 0.46 0.7 0.62 0.89
0.97 0.44 0.66 0.62 0.75 0.2 1.0 0.42 0.4 0.37 0.64 0.27 0.22 0.19 0.52 0.43 0.46 0.45 0.83 0.52
0.76 0.31 0.53 0.74 1.0 0.3 0.74 0.52 0.5 0.43 0.64 0.31 0.49 0.42 0.59 0.53 0.65 0.56 0.77 0.64
1.0 0.44 0.48 0.67 0.54 0.47 0.92 0.41 0.36 0.3 0.5 0.26 0.36 0.32 0.46 0.47 0.36 0.64 0.53 0.58
1.0 0.55 0.67 0.59 0.56 0.27 0.53 0.29 0.28 0.26 0.32 0.16 0.3 0.27 0.33 0.25 0.17 0.38 0.64 0.34
0.74 1.0 0.56 0.73 0.92 0.53 0.57 0.44 0.45 0.34 0.51 0.25 0.64 0.54 0.53 0.4 0.33 0.4 0.45 0.67
0.49 1.0 0.54 0.44 0.58 0.37 0.39 0.36 0.25 0.22 0.49 0.21 0.25 0.21 0.48 0.31 0.2 0.29 0.29 0.42
0.77 0.8 0.64 0.55 1.0 0.35 0.66 0.48 0.43 0.45 0.55 0.26 0.5 0.51 0.57 0.44 0.43 0.34 0.39 0.62
0.91 0.39 0.68 0.81 0.68 0.44 1.0 0.46 0.31 0.29 0.42 0.25 0.29 0.28 0.42 0.35 0.29 0.65 0.65 0.74
1.0 0.86 0.82 0.85 0.77 0.35 0.77 0.46 0.35 0.33 0.46 0.26 0.38 0.33 0.44 0.29 0.22 0.59 0.8 0.48
1.0 0.78 0.62 0.86 0.88 0.57 0.79 0.35 0.32 0.29 0.47 0.26 0.27 0.23 0.48 0.52 0.36 0.66 0.86 0.69
0.7 0.9 0.73 0.79 0.7 0.35 1.0 0.34 0.25 0.25 0.19 0.16 0.2 0.24 0.3 0.42 0.2 0.56 0.99 0.38
1.0 0.6 0.6 0.67 0.89 0.43 0.59 0.54 0.45 0.48 0.47 0.38 0.4 0.43 0.46 0.37 0.4 0.89 0.57 0.81
1.0 0.65 0.83 0.8 0.59 0.42 0.84 0.42 0.39 0.36 0.4 0.28 0.35 0.34 0.44 0.42 0.49 0.5 0.76 0.51
0.57 0.65 0.58 0.53 0.5 0.38 1.0 0.24 0.2 0.18 0.29 0.14 0.19 0.2 0.3 0.21 0.2 0.32 0.62 0.36
0.81 1.0 0.66 0.48 0.75 0.23 1.0 0.46 0.6 0.57 0.55 0.37 0.42 0.36 0.63 0.59 0.38 0.44 0.47 0.52
0.94 0.57 0.4 0.8 0.69 0.59 1.0 0.3 0.28 0.25 0.53 0.2 0.3 0.25 0.56 0.35 0.31 0.63 0.93 0.47
0.32 0.55 0.45 0.33 0.24 0.03 1.0 0.06 0.03 0.04 0.04 0.04 0.02 0.03 0.05 0.09 0.11 0.29 0.31 0.23
0.65 0.47 0.4 0.47 0.52 0.17 1.0 0.18 0.15 0.14 0.12 0.14 0.14 0.15 0.14 0.2 0.19 0.49 0.7 0.35
1.0 0.55 0.53 0.77 0.68 0.44 0.79 0.49 0.43 0.43 0.62 0.31 0.51 0.42 0.69 0.41 0.28 0.63 0.64 0.52
1.0 0.87 0.71 0.73 0.61 0.35 0.7 0.26 0.28 0.21 0.34 0.22 0.22 0.21 0.36 0.31 0.28 0.38 0.64 0.24
0.79 0.19 0.97 1.0 0.55 0.26 0.11 0.11 0.01 0.01 0.03 0.06 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.26 0.2 0.31
1.0 0.57 0.59 0.98 0.97 0.77 0.81 0.79 0.55 0.57 0.58 0.59 0.56 0.59 0.6 0.31 0.56 0.76 0.8 0.56
1.0 0.34 0.54 0.56 0.58 0.37 0.73 0.28 0.24 0.21 0.62 0.17 0.19 0.16 0.56 0.34 0.24 0.42 0.49 0.57
0.35 0.45 0.32 0.36 0.35 0.3 1.0 0.21 0.14 0.1 0.23 0.14 0.27 0.2 0.18 0.2 0.12 0.3 0.3 0.31
1.0 0.55 0.45 0.68 0.54 0.59 0.67 0.25 0.11 0.1 0.2 0.14 0.15 0.12 0.23 0.1 0.11 0.32 0.53 0.17
1.0 0.46 0.74 0.89 0.76 0.62 0.81 0.45 0.38 0.37 0.6 0.29 0.32 0.3 0.62 0.3 0.33 0.54 0.7 0.42
0.44 0.54 0.32 0.39 0.52 0.21 1.0 0.22 0.27 0.27 0.32 0.16 0.18 0.16 0.32 0.36 0.24 0.36 0.47 0.43
1.0 0.78 0.66 0.79 0.71 0.36 0.66 0.35 0.33 0.3 0.54 0.22 0.25 0.24 0.49 0.48 0.32 0.54 0.71 0.37
0.92 0.49 0.58 0.56 1.0 0.37 0.74 0.35 0.33 0.29 0.64 0.15 0.27 0.29 0.51 0.35 0.2 0.44 0.69 0.6
1.0 0.68 0.79 0.76 0.69 0.31 0.59 0.36 0.33 0.28 0.44 0.3 0.21 0.21 0.39 0.31 0.32 0.35 0.66 0.37
1.0 0.45 0.59 0.76 0.77 0.48 0.83 0.28 0.21 0.18 0.34 0.17 0.24 0.24 0.32 0.23 0.2 0.55 0.69 0.65
0.72 0.78 0.51 0.58 0.58 0.34 1.0 0.34 0.4 0.36 0.37 0.14 0.51 0.38 0.38 0.32 0.17 0.41 0.63 0.36
1.0 0.75 0.72 0.85 0.66 0.35 0.51 0.44 0.37 0.32 0.46 0.25 0.3 0.25 0.49 0.39 0.28 0.54 0.58 0.41
0.93 1.0 0.67 0.82 0.78 0.62 0.81 0.48 0.37 0.32 0.39 0.24 0.5 0.42 0.45 0.39 0.26 0.78 0.79 0.49
1.0 0.77 0.8 0.82 0.57 0.2 0.93 0.36 0.28 0.23 0.34 0.23 0.22 0.19 0.33 0.24 0.24 0.28 0.28 0.29
0.98 0.6 0.62 0.79 1.0 0.52 0.74 0.41 0.34 0.3 0.43 0.22 0.5 0.46 0.43 0.28 0.18 0.61 0.68 0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)