Heatmap: Cluster_273 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00254	0.78	0.6	0.7	0.73	0.89	0.39	0.55	0.53	0.57	0.56	0.68	0.37	0.27	0.25	0.78	0.6	0.51	0.85	1.0	0.6
Gb_00397	0.63	0.72	0.7	1.0	1.0	0.17	0.46	0.43	0.37	0.37	0.6	0.4	0.41	0.44	0.58	0.41	0.25	0.62	0.82	0.61
Gb_00906	0.67	0.89	0.6	0.58	0.77	0.56	0.56	0.52	0.37	0.37	0.64	0.33	0.68	0.57	0.64	0.34	0.25	0.89	1.0	0.75
Gb_03432	0.72	0.96	0.61	0.56	0.67	0.29	0.53	0.51	0.5	0.53	0.7	0.28	0.36	0.27	0.69	0.37	0.31	0.61	1.0	0.49
Gb_04113	0.94	0.58	0.74	0.55	0.64	0.92	0.96	0.73	0.49	0.61	1.0	0.14	0.88	0.36	0.86	0.76	0.34	0.55	0.86	0.96
Gb_04143	0.41	0.88	0.56	0.59	1.0	0.12	0.26	0.27	0.18	0.15	0.27	0.27	0.07	0.1	0.29	0.4	0.39	0.6	0.53	0.53
Gb_05918	0.76	0.54	0.63	0.51	1.0	0.35	0.39	0.32	0.21	0.18	0.29	0.2	0.32	0.31	0.29	0.21	0.18	0.62	0.81	0.42
Gb_09168	0.88	0.69	0.68	0.56	0.62	0.31	0.28	0.35	0.33	0.32	0.28	0.12	0.58	0.46	0.28	0.25	0.19	0.61	1.0	0.84
Gb_09837	0.55	0.65	0.64	0.42	0.69	0.16	0.51	0.51	0.55	0.49	0.72	0.39	0.29	0.27	0.73	0.61	0.5	0.58	1.0	0.69
Gb_11454	0.71	0.77	0.93	0.8	0.77	0.32	0.25	0.43	0.44	0.35	0.47	0.3	0.35	0.34	0.39	0.58	0.63	0.68	1.0	0.47
Gb_11731	0.73	0.54	0.43	0.26	0.54	0.08	0.23	0.17	0.16	0.22	0.2	0.06	0.06	0.05	0.23	0.19	0.14	0.49	1.0	0.43
Gb_13615	0.7	0.56	0.72	0.94	0.95	0.44	0.26	0.52	0.35	0.33	0.44	0.42	0.39	0.41	0.45	0.37	0.45	0.78	1.0	0.47
Gb_14431	0.66	0.65	0.48	0.64	0.68	0.16	0.57	0.41	0.53	0.47	0.67	0.3	0.32	0.31	0.68	0.17	0.05	0.59	1.0	0.38
Gb_15527	1.0	0.56	1.0	0.9	0.97	0.43	0.56	0.46	0.38	0.35	0.67	0.32	0.19	0.19	0.64	0.62	0.85	0.76	0.87	0.62
Gb_15885	0.4	0.52	0.57	0.25	0.54	0.49	0.18	0.15	0.05	0.07	0.09	0.02	0.04	0.02	0.12	0.1	0.06	0.59	1.0	0.61
Gb_15995	0.43	0.61	0.41	0.56	0.6	0.47	0.56	0.42	0.33	0.37	0.63	0.4	0.14	0.13	0.69	0.33	0.49	0.73	1.0	0.45
Gb_16571	0.62	0.62	0.93	0.65	0.74	0.39	0.44	0.43	0.37	0.33	0.55	0.33	0.38	0.37	0.54	0.47	0.45	0.71	1.0	0.69
Gb_16853	0.81	0.52	0.92	0.74	1.0	0.27	0.53	0.15	0.06	0.1	0.13	0.07	0.07	0.07	0.15	0.03	0.04	0.48	0.89	0.42
Gb_17701	0.55	0.67	0.49	0.52	0.83	0.89	0.46	0.55	0.35	0.4	0.62	0.31	0.58	0.55	0.69	0.41	0.34	0.9	1.0	0.64
Gb_18016	0.72	1.0	0.63	0.32	0.83	0.22	0.51	0.38	0.32	0.36	0.63	0.24	0.24	0.26	0.66	0.35	0.16	0.49	0.87	0.37
Gb_18416	0.25	0.27	0.31	0.73	0.62	0.34	0.75	0.51	0.49	0.54	1.0	0.35	0.21	0.19	0.98	0.21	0.24	0.71	0.9	0.37
Gb_18674	0.45	0.63	0.66	0.54	0.54	0.27	0.33	0.32	0.18	0.18	0.37	0.15	0.22	0.2	0.41	0.13	0.1	0.53	1.0	0.26
Gb_20121	0.74	0.77	0.69	0.66	1.0	0.23	0.44	0.36	0.34	0.32	0.58	0.34	0.08	0.08	0.52	0.39	0.37	0.61	0.84	0.43
Gb_21548	0.53	0.31	0.19	0.49	0.3	0.38	0.69	0.46	0.31	0.39	0.99	0.12	0.48	0.32	1.0	0.53	0.39	0.42	0.55	0.6
Gb_21670	0.8	0.84	0.59	0.92	0.92	0.48	0.44	0.42	0.28	0.26	0.39	0.23	0.61	0.53	0.48	0.31	0.21	0.68	1.0	0.57
Gb_23268	0.66	0.97	1.0	0.77	0.69	0.42	0.38	0.38	0.36	0.37	0.5	0.28	0.39	0.36	0.48	0.35	0.3	0.84	0.76	0.68
Gb_23486	0.58	0.35	0.35	0.61	0.61	0.31	0.57	0.36	0.48	0.39	0.62	0.28	0.23	0.24	0.58	0.74	0.45	0.51	1.0	0.39
Gb_24058	0.79	0.35	0.49	1.0	0.99	0.14	0.18	0.19	0.12	0.16	0.38	0.16	0.06	0.06	0.32	0.27	0.14	0.56	0.94	0.54
Gb_24630	0.76	0.61	0.45	0.51	0.96	0.15	0.46	0.53	0.56	0.52	0.86	0.32	0.34	0.28	0.78	0.67	0.68	0.62	1.0	0.24
Gb_25777	0.6	0.62	0.73	0.71	1.0	0.23	0.25	0.38	0.29	0.27	0.37	0.23	0.31	0.28	0.4	0.26	0.26	0.72	0.89	0.41
Gb_26128	0.55	0.37	0.67	0.48	0.6	0.05	0.31	0.35	0.3	0.25	0.81	0.2	0.18	0.18	0.76	0.54	0.52	0.61	1.0	0.66
Gb_27473	0.76	0.58	0.64	1.0	0.78	0.35	0.59	0.48	0.47	0.41	0.69	0.28	0.25	0.19	0.71	0.44	0.53	0.71	0.83	0.34
Gb_28742	0.74	0.6	0.95	1.0	0.81	0.36	0.41	0.29	0.11	0.12	0.11	0.2	0.3	0.32	0.16	0.12	0.17	0.61	0.95	0.33
Gb_29090	0.15	0.17	0.15	0.17	0.39	0.05	0.26	0.26	0.32	0.3	0.42	0.09	0.11	0.1	0.36	0.24	0.18	0.46	1.0	0.15
Gb_29925	0.64	0.48	0.63	0.4	0.56	0.34	0.29	0.24	0.21	0.23	0.23	0.09	0.21	0.2	0.21	0.37	0.24	0.5	1.0	0.29
Gb_30063	0.5	0.41	0.32	0.43	0.68	0.4	0.66	0.42	0.35	0.41	0.97	0.27	0.16	0.14	0.91	0.53	0.36	0.71	1.0	0.3
Gb_30139	0.74	0.53	0.52	0.56	0.83	0.31	0.37	0.32	0.4	0.42	0.42	0.26	0.16	0.14	0.47	0.34	0.32	0.57	1.0	0.52
Gb_31958	0.77	0.84	0.79	0.64	0.99	0.21	0.46	0.37	0.37	0.34	0.39	0.25	0.49	0.48	0.42	0.35	0.31	0.73	1.0	0.38
Gb_32185	0.74	0.97	0.93	0.46	0.77	0.29	0.29	0.42	0.5	0.45	0.6	0.32	0.26	0.18	0.59	0.5	0.34	0.64	1.0	0.88
Gb_32436	0.88	0.58	0.7	0.79	0.88	0.19	0.46	0.4	0.42	0.41	0.53	0.17	0.55	0.51	0.5	0.34	0.38	0.66	1.0	0.56
Gb_33346	0.71	1.0	0.84	0.53	0.65	0.35	0.39	0.34	0.39	0.38	0.52	0.21	0.25	0.23	0.48	0.36	0.32	0.74	0.9	0.61
Gb_33452	0.9	0.79	0.65	0.46	0.78	0.12	0.28	0.28	0.22	0.21	0.36	0.23	0.17	0.17	0.43	0.4	0.21	0.54	1.0	0.24
Gb_35111	0.68	0.82	0.39	0.51	0.81	0.17	0.09	0.16	0.12	0.15	0.1	0.03	0.11	0.11	0.12	0.21	0.15	0.44	1.0	0.21
Gb_35374	0.74	0.74	0.75	0.98	0.9	0.47	0.54	0.59	0.49	0.48	0.53	0.5	0.74	0.61	0.71	0.47	0.57	0.7	1.0	0.63
Gb_35503	0.9	0.58	0.83	0.81	0.76	0.71	0.34	0.55	0.51	0.43	0.9	0.38	0.39	0.36	0.8	0.62	0.53	0.8	1.0	0.45
Gb_36023	0.7	0.41	0.59	0.56	0.73	0.48	0.42	0.5	0.42	0.4	0.53	0.42	0.32	0.29	0.53	0.43	0.63	0.7	1.0	0.6
Gb_36075	0.47	0.51	0.51	0.64	0.75	0.28	0.65	0.54	0.34	0.3	0.33	0.38	0.05	0.08	0.34	0.43	0.41	1.0	0.91	0.6
Gb_36076	0.31	0.5	0.26	0.32	0.56	0.24	0.37	0.39	0.23	0.2	0.29	0.22	0.24	0.2	0.26	0.18	0.19	0.74	1.0	0.35
Gb_36170	0.96	0.67	0.82	0.81	0.86	0.23	0.48	0.27	0.28	0.27	0.33	0.15	0.19	0.21	0.29	0.4	0.31	0.55	1.0	0.45
Gb_36379	0.75	1.0	0.6	0.58	0.75	0.41	0.4	0.41	0.47	0.41	0.65	0.29	0.4	0.34	0.61	0.42	0.46	0.46	0.79	0.56
Gb_36428	0.64	0.69	0.68	0.56	1.0	0.28	0.31	0.36	0.36	0.29	0.37	0.32	0.34	0.35	0.32	0.28	0.27	0.64	0.98	0.43
Gb_36605	0.8	0.78	0.72	0.74	1.0	0.43	0.85	0.4	0.3	0.28	0.4	0.27	0.41	0.39	0.45	0.26	0.26	0.61	0.77	0.59
Gb_37695	0.65	0.65	0.73	0.64	0.86	0.18	0.31	0.27	0.19	0.17	0.18	0.13	0.23	0.23	0.18	0.26	0.2	0.51	1.0	0.28
Gb_37697	0.74	0.78	0.88	0.81	1.0	0.12	0.31	0.31	0.21	0.21	0.35	0.14	0.12	0.16	0.38	0.37	0.19	0.47	0.7	0.3
Gb_38095	0.62	0.68	0.78	0.66	1.0	0.33	0.28	0.35	0.16	0.15	0.23	0.21	0.35	0.34	0.21	0.12	0.19	0.58	0.64	0.27
Gb_38399	0.84	0.98	0.61	0.6	0.84	0.13	0.39	0.39	0.36	0.35	0.58	0.28	0.15	0.2	0.57	0.58	0.4	0.84	1.0	0.17
Gb_38509	0.85	0.55	0.71	0.66	0.83	0.34	0.75	0.58	0.42	0.44	0.79	0.42	0.36	0.28	0.87	0.44	0.46	0.94	1.0	0.5
Gb_38826	0.97	0.82	0.94	0.76	0.9	0.47	0.59	0.64	0.58	0.57	0.65	0.46	0.53	0.5	0.6	0.56	0.47	0.8	1.0	0.62
Gb_38860	0.56	0.8	0.48	0.63	0.76	0.33	0.66	0.35	0.37	0.26	0.36	0.25	0.24	0.31	0.55	0.38	0.21	0.94	1.0	0.76
Gb_39140	0.58	0.79	0.79	0.56	1.0	0.14	0.26	0.18	0.18	0.17	0.16	0.09	0.07	0.09	0.19	0.23	0.16	0.51	0.84	0.12
Gb_41219	0.68	0.63	0.8	0.66	0.71	0.22	0.45	0.31	0.27	0.24	0.36	0.22	0.44	0.41	0.36	0.29	0.2	0.66	1.0	0.8

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)