Heatmap: Cluster_264 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
AT1G04520 (PDLP2)
0.13 0.35 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.12 0.23 0.05 0.13 0.25 0.04 0.32 0.09 0.1 0.26 0.13 0.0 0.07 0.0 0.92 0.06 0.0 0.19 0.26 0.14 0.13 1.0 0.09 0.0 0.2 0.03 0.0 0.0 0.06 0.53 0.8 0.26 0.03 0.07 0.58
0.2 0.48 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.09 0.15 0.1 0.32 0.51 0.04 0.83 0.25 0.34 0.47 0.05 0.0 0.02 0.0 0.22 0.12 0.01 0.48 0.09 0.2 0.6 1.0 0.08 0.0 0.34 0.04 0.02 0.04 0.01 0.13 0.08 0.02 0.0 0.0 0.06
AT1G11600 (CYP77B1)
0.03 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.28 0.02 0.01 0.02 0.05 0.93 0.01 0.08 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.41 0.22 0.51 1.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.03 0.18 0.03 0.05 0.03 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.11 0.02 0.01 0.05 0.02 0.28 0.02 0.18 0.37 0.06 0.0 0.04 0.0 0.43 0.0 0.0 0.08 0.09 0.03 0.11 0.76 0.23 0.02 0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.57 0.23 1.0 0.0 0.18
AT1G16070 (TLP8)
0.04 0.22 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.19 0.04 0.01 0.01 0.01 0.3 0.01 0.42 1.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.7 0.1 0.0 0.1 0.04 0.08 0.02 0.86 0.26 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.41 0.06 0.0 0.0 0.13
AT1G28290 (AGP31)
0.01 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.06 0.01 0.01 0.0 0.01 0.48 0.01 0.17 0.82 0.03 0.0 0.01 0.0 0.56 0.01 0.0 0.08 0.14 0.12 0.15 1.0 0.2 0.01 0.2 0.0 0.0 0.0 0.02 0.31 0.6 0.59 0.28 0.1 0.72
0.08 0.8 0.04 0.03 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.19 0.18 0.19 0.21 0.15 0.76 0.29 0.27 0.53 0.21 0.0 0.16 0.01 0.93 0.47 0.01 0.52 0.17 0.17 0.12 1.0 0.17 0.06 0.3 0.02 0.05 0.0 0.06 0.25 0.53 0.19 0.59 0.28 0.27
0.02 0.66 0.03 0.02 0.06 0.11 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.35 0.08 0.18 0.24 0.15 0.09 0.75 0.21 0.42 0.64 0.09 0.03 0.08 0.06 0.6 0.07 0.03 0.23 0.24 0.12 0.08 1.0 0.16 0.06 0.36 0.03 0.0 0.0 0.05 0.12 0.48 0.13 0.0 0.0 0.22
0.04 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.24 0.1 0.07 0.15 0.08 0.47 0.03 0.38 0.63 0.08 0.0 0.05 0.0 0.17 0.0 0.0 0.65 0.21 0.15 0.09 1.0 0.84 0.03 0.24 0.02 0.0 0.0 0.28 0.26 0.48 0.3 0.0 0.0 0.21
0.22 0.34 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.12 0.19 0.14 0.19 0.03 0.44 0.09 0.34 0.64 0.13 0.05 0.14 0.01 0.4 0.17 0.04 0.21 0.16 0.16 0.16 1.0 0.35 0.23 0.31 0.21 0.01 0.08 0.07 0.22 0.33 0.2 0.54 0.27 0.18
0.02 0.37 0.05 0.03 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.1 0.05 0.03 0.01 0.06 0.47 0.02 0.15 0.35 0.06 0.0 0.03 0.0 1.0 0.08 0.0 0.31 0.04 0.06 0.04 0.46 0.04 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.35 0.24 0.0 0.01 0.13
AT1G78430 (RIP2)
0.02 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.17 0.03 0.01 0.02 0.02 0.37 0.02 0.38 0.63 0.09 0.0 0.07 0.01 0.43 0.04 0.0 0.14 0.05 0.07 0.03 1.0 0.42 0.01 0.23 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.15 0.04 0.13 0.0 0.07
0.01 0.22 0.02 0.04 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.11 0.06 0.04 0.02 0.03 0.02 0.26 0.03 0.11 0.22 0.08 0.0 0.05 0.0 1.0 0.19 0.0 0.17 0.06 0.07 0.05 0.85 0.12 0.01 0.21 0.01 0.02 0.0 0.04 0.08 0.38 0.15 0.14 0.0 0.18
0.09 0.59 0.05 0.07 0.08 0.08 0.09 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.34 0.25 0.2 0.14 0.16 0.08 0.65 0.1 0.28 0.54 0.18 0.04 0.15 0.08 0.91 0.45 0.02 0.5 0.37 0.28 0.21 1.0 0.23 0.26 0.3 0.2 0.03 0.0 0.13 0.26 0.69 0.34 0.0 0.05 0.38
0.16 0.69 0.04 0.02 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.52 0.36 1.0 0.99 0.18 0.85 0.4 0.31 0.3 0.24 0.02 0.23 0.04 0.49 0.11 0.01 0.66 0.18 0.39 0.13 0.53 0.12 0.02 0.28 0.11 0.03 0.1 0.0 0.02 0.04 0.02 0.36 0.0 0.02
0.02 0.35 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.19 0.07 0.05 0.07 0.04 0.48 0.01 0.22 0.64 0.06 0.0 0.04 0.01 1.0 0.11 0.0 0.18 0.1 0.1 0.07 0.84 0.13 0.05 0.17 0.01 0.01 0.0 0.08 0.1 0.42 0.2 0.0 0.0 0.15
0.03 0.24 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.06 0.03 0.04 0.01 0.24 0.06 0.08 0.23 0.03 0.02 0.01 0.0 0.31 0.01 0.01 0.12 0.22 0.05 0.05 0.4 0.03 0.0 0.09 0.01 0.0 0.0 0.05 0.56 1.0 0.52 0.1 0.09 0.5
0.17 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.07 0.09 0.09 0.14 0.07 0.49 0.04 0.22 0.4 0.22 0.02 0.16 0.06 0.58 0.07 0.01 0.51 0.21 0.18 0.16 1.0 0.41 0.13 0.32 0.18 0.01 0.0 0.06 0.17 0.18 0.22 0.02 0.01 0.12
AT2G42800 (RLP29)
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.01 0.0 0.01 0.01 0.23 0.01 0.26 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.09 0.03 0.0 0.09 0.0 0.01 0.02 0.4 0.08 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT2G42840 (PDF1)
0.05 0.68 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.03 0.0 0.0 0.04 0.91 0.01 0.15 0.37 0.05 0.05 0.01 0.0 1.0 0.2 0.01 0.55 0.25 0.13 0.34 0.76 0.0 0.0 0.19 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.02 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.16 0.1 0.01 0.01 0.04 0.48 0.03 0.18 0.67 0.08 0.01 0.07 0.01 0.43 0.13 0.0 0.19 0.16 0.15 0.04 1.0 0.2 0.06 0.22 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 0.14 0.07 0.0 0.0 0.09
0.07 0.61 0.05 0.04 0.06 0.07 0.05 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.23 0.2 0.13 0.08 0.13 0.07 0.74 0.12 0.35 0.85 0.15 0.0 0.12 0.01 0.57 0.14 0.0 0.46 0.23 0.15 0.12 1.0 0.2 0.03 0.3 0.02 0.02 0.0 0.17 0.46 0.69 0.56 0.42 0.0 0.47
0.09 1.0 0.1 0.06 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.39 0.51 0.25 0.21 0.04 0.74 0.05 0.27 0.27 0.3 0.05 0.48 0.03 0.96 0.13 0.04 0.5 0.08 0.25 0.13 0.87 0.13 0.05 0.34 0.04 0.05 0.04 0.08 0.14 0.37 0.09 0.0 0.15 0.15
0.04 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.25 0.11 0.13 0.2 0.1 0.73 0.2 0.24 0.39 0.15 0.01 0.12 0.01 0.22 0.09 0.0 0.41 0.07 0.1 0.1 1.0 0.3 0.09 0.18 0.02 0.02 0.0 0.05 0.02 0.08 0.04 0.0 0.82 0.04
0.07 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.42 0.21 0.17 0.23 0.17 0.6 0.14 0.36 0.59 0.17 0.01 0.13 0.01 0.56 0.12 0.0 0.41 0.26 0.29 0.22 1.0 0.26 0.06 0.31 0.05 0.0 0.0 0.09 0.09 0.15 0.11 0.15 0.31 0.07
0.04 0.3 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.16 0.06 0.0 0.01 0.04 0.57 0.02 0.43 0.66 0.06 0.0 0.02 0.0 0.55 0.02 0.0 0.18 0.18 0.08 0.07 1.0 0.08 0.01 0.24 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.16 0.03 0.01 0.0 0.06
0.03 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.15 0.06 0.02 0.04 0.02 0.5 0.02 0.16 0.57 0.06 0.0 0.03 0.0 0.64 0.04 0.0 0.18 0.04 0.12 0.04 1.0 0.19 0.01 0.25 0.01 0.01 0.0 0.01 0.05 0.44 0.11 0.0 0.1 0.14
0.06 0.49 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.21 0.11 0.19 0.21 0.08 0.43 0.08 0.16 0.24 0.18 0.0 0.12 0.0 1.0 0.07 0.0 0.71 0.09 0.11 0.13 0.54 0.14 0.01 0.14 0.02 0.01 0.0 0.07 0.18 0.34 0.26 0.11 0.14 0.17
0.07 0.37 0.05 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.17 0.23 0.25 0.06 0.06 0.05 0.52 0.07 0.45 0.83 0.13 0.0 0.11 0.0 0.55 0.05 0.0 0.18 0.17 0.14 0.09 1.0 0.24 0.03 0.18 0.06 0.01 0.0 0.02 0.17 0.31 0.12 0.0 0.0 0.18
0.07 0.77 0.1 0.16 0.09 0.01 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.13 0.09 0.07 0.05 0.1 0.53 0.06 0.12 0.24 0.12 0.01 0.08 0.04 1.0 0.08 0.0 0.39 0.06 0.13 0.07 0.78 0.09 0.02 0.28 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT3G63300 (FKD1)
0.08 0.39 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12 0.1 0.1 0.02 0.04 0.02 0.73 0.06 0.12 0.13 0.1 0.01 0.07 0.01 1.0 0.03 0.01 0.33 0.11 0.12 0.08 0.51 0.15 0.05 0.21 0.04 0.02 0.01 0.38 0.35 0.06 0.26 0.31 0.03 0.06
0.03 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.08 0.12 0.13 0.09 0.05 0.4 0.05 0.15 0.24 0.11 0.0 0.07 0.0 1.0 0.07 0.0 0.28 0.11 0.08 0.09 0.58 0.1 0.0 0.09 0.01 0.01 0.0 0.01 0.04 0.28 0.12 0.0 0.08 0.14
0.08 0.39 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.46 0.0 0.02 0.15 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.33 0.02 0.05 0.01 1.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.07 0.08 0.03 0.05 0.04 0.58 0.03 0.2 0.39 0.08 0.0 0.04 0.0 0.91 0.02 0.0 0.44 0.11 0.14 0.09 1.0 0.19 0.01 0.19 0.01 0.0 0.0 0.09 0.13 0.49 0.14 0.11 0.02 0.19
0.07 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.06 0.61 0.14 0.05 0.07 0.49 0.11 0.22 0.33 0.18 0.01 0.17 0.04 0.73 0.11 0.0 0.4 0.11 0.19 0.06 0.94 0.12 0.05 0.2 0.08 0.0 0.0 0.02 0.02 0.09 0.05 0.0 0.0 0.03
0.13 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.29 0.28 0.88 1.0 0.16 0.79 0.06 0.63 0.95 0.25 0.06 0.3 0.01 0.68 0.13 0.08 0.47 0.18 0.31 0.27 0.74 0.17 0.05 0.34 0.04 0.0 0.0 0.03 0.04 0.13 0.06 0.0 0.23 0.05
0.02 0.46 0.15 0.66 0.17 0.05 0.68 0.0 0.04 0.01 0.02 0.02 0.0 0.1 0.13 0.03 0.04 0.03 0.05 0.4 0.01 0.13 0.48 0.05 0.0 0.02 0.0 0.72 0.02 0.0 0.3 0.11 0.03 0.07 1.0 0.06 0.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.77 0.37 0.0 0.0 0.26
0.08 0.81 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.12 0.16 0.15 0.05 0.03 0.11 1.0 0.03 0.21 0.49 0.12 0.01 0.06 0.0 0.9 0.04 0.0 0.62 0.14 0.12 0.09 0.95 0.06 0.0 0.17 0.01 0.01 0.0 0.01 0.13 0.34 0.23 0.01 0.22 0.18
0.02 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.14 0.05 0.06 0.03 0.03 0.26 0.07 0.08 0.23 0.04 0.0 0.02 0.0 1.0 0.02 0.0 0.1 0.04 0.05 0.02 0.46 0.02 0.01 0.07 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.19 0.05 0.0 0.1 0.08
AT5G48485 (DIR1)
0.07 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.25 0.12 0.09 0.02 0.09 0.48 0.08 0.11 0.03 0.15 0.0 0.13 0.03 0.07 0.02 0.0 0.21 0.07 0.2 0.03 1.0 0.02 0.01 0.11 0.03 0.01 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.3 0.2 0.13 0.08 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.1 0.09 0.07 0.11 0.04 0.26 0.06 0.33 0.51 0.05 0.1 0.02 0.04 0.15 0.02 0.11 0.31 0.3 0.18 0.25 0.57 0.05 0.21 0.28 0.03 0.13 0.0 0.09 0.22 1.0 0.45 0.0 0.04 0.65
AT5G51550 (EXL3)
0.04 0.44 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.18 0.14 0.05 0.06 0.09 0.54 0.06 0.34 0.52 0.14 0.01 0.11 0.0 0.19 0.07 0.01 0.43 0.22 0.14 0.09 1.0 0.27 0.02 0.44 0.12 0.0 0.0 0.09 0.01 0.08 0.06 0.0 0.55 0.03
0.04 0.48 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.19 0.16 0.09 0.11 0.07 0.72 0.09 0.35 0.63 0.06 0.0 0.04 0.0 0.98 0.05 0.0 0.31 0.2 0.16 0.14 1.0 0.12 0.0 0.2 0.03 0.07 0.0 0.03 0.17 0.45 0.22 0.51 0.32 0.24
0.0 0.1 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.02 0.0 0.0 0.03 0.12 0.0 0.32 0.53 0.01 0.0 0.0 0.0 0.15 0.02 0.0 0.01 0.32 0.07 0.16 1.0 0.02 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.18 0.47 0.21 0.15 0.13 0.05 0.21 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.09 0.12 0.04 0.0 0.0 0.06 0.54 0.01 0.25 0.41 0.13 0.0 0.04 0.0 1.0 0.2 0.0 0.27 0.06 0.05 0.03 0.97 0.02 0.0 0.21 0.0 0.11 0.0 0.01 0.04 0.63 0.13 0.02 0.0 0.24
AT5G61130 (PDCB1)
0.19 0.83 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.08 0.13 0.05 0.08 0.08 0.68 0.13 0.3 0.64 0.11 0.0 0.07 0.0 0.7 0.12 0.0 0.51 0.28 0.24 0.22 1.0 0.21 0.04 0.33 0.04 0.04 0.0 0.04 0.2 0.59 0.19 0.0 0.22 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)