Heatmap: Cluster_316 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.18 0.26 0.42 0.16 0.29 0.03 0.05 0.72 0.55 0.61 0.46 0.63 0.56 0.74 0.33 0.53 1.0 0.03 0.18 0.48
0.49 0.35 0.33 0.26 0.36 0.32 0.12 0.57 0.61 0.64 1.0 0.39 0.47 0.4 1.0 0.51 0.49 0.55 0.29 0.38
0.33 0.45 0.28 0.29 0.53 0.33 0.31 0.76 0.54 0.54 1.0 0.69 0.39 0.34 0.85 0.31 0.41 0.35 0.5 0.34
0.01 0.05 0.04 0.15 0.84 0.49 0.0 1.0 0.65 0.71 0.77 0.71 0.92 0.58 0.74 0.5 0.55 0.66 0.0 0.01
0.24 0.21 0.33 0.28 0.19 0.19 0.09 0.58 0.38 0.43 0.46 0.49 0.95 0.79 0.5 0.21 0.54 0.28 0.16 1.0
0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.79 1.0 0.31 0.29 0.02 0.09 0.09 0.04 0.05 0.12 0.34 0.02 0.0
0.14 0.02 0.04 0.04 0.11 0.05 0.0 1.0 0.36 0.38 0.4 0.36 0.53 0.58 0.16 0.01 0.38 0.09 0.01 0.15
0.01 0.01 0.01 0.03 0.05 0.3 0.04 0.49 0.38 0.49 0.85 0.46 0.49 0.32 1.0 0.11 0.1 0.1 0.14 0.05
0.22 0.2 0.3 0.06 0.11 0.24 0.0 0.8 0.74 1.0 0.47 0.71 0.42 0.54 0.25 0.09 0.41 0.21 0.06 0.84
0.48 0.06 0.09 0.11 0.09 0.1 0.01 0.52 0.44 0.42 0.61 0.31 0.93 1.0 0.55 0.1 0.12 0.03 0.01 0.13
0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 1.0 0.43 0.23 0.47 0.21 0.67 0.34 0.31 0.06 0.18 0.01 0.0 0.01
0.36 0.2 0.18 0.42 0.34 0.3 0.18 0.86 0.75 0.68 1.0 0.31 0.96 0.85 0.99 0.73 0.62 0.38 0.22 0.4
0.05 0.06 0.02 0.08 0.14 0.11 0.07 0.39 0.33 0.29 1.0 0.3 0.43 0.36 0.93 0.18 0.13 0.12 0.15 0.22
0.1 0.03 0.02 0.1 0.05 0.09 0.07 0.98 0.79 0.74 1.0 0.66 0.77 0.43 0.78 0.23 0.38 0.13 0.08 0.34
0.13 0.11 0.17 0.23 0.15 0.1 0.65 0.77 0.9 1.0 0.8 0.62 0.28 0.2 0.92 0.67 0.73 0.91 0.35 0.09
0.08 0.05 0.0 0.07 0.06 0.05 0.01 0.57 0.53 0.68 0.41 0.23 1.0 0.58 0.35 0.38 0.29 0.22 0.1 0.25
0.36 0.25 0.18 0.37 0.41 0.21 0.31 0.71 0.6 0.53 0.89 0.55 1.0 0.96 0.82 0.44 0.55 0.33 0.28 0.33
0.17 0.03 0.04 0.0 0.09 0.1 0.01 1.0 0.17 0.07 0.4 0.97 0.43 0.19 0.83 0.0 0.0 0.01 0.23 0.09
0.09 0.13 0.08 0.11 0.22 0.13 0.0 0.63 0.18 0.16 0.18 0.35 0.79 1.0 0.09 0.06 0.2 0.07 0.01 0.06
0.01 0.04 0.05 0.02 0.07 0.06 0.0 0.52 0.91 1.0 0.15 0.72 0.3 0.85 0.03 0.07 0.42 0.1 0.0 0.23
0.09 0.16 0.03 0.06 0.03 0.33 0.02 0.46 0.09 0.1 0.07 0.13 0.46 1.0 0.04 0.01 0.01 0.04 0.0 0.69
0.17 0.18 0.28 0.18 0.13 0.3 0.15 0.56 0.64 0.49 0.9 0.58 0.06 0.09 1.0 0.47 0.48 0.27 0.24 0.27
0.25 0.38 0.49 0.48 0.29 0.21 0.1 0.45 0.61 0.55 0.55 0.35 0.13 0.04 0.48 1.0 0.53 0.17 0.49 0.31
0.21 0.09 0.08 0.17 0.24 0.16 0.04 0.57 0.47 0.48 0.82 0.52 1.0 0.65 0.69 0.33 0.12 0.13 0.23 0.11
0.03 0.06 0.0 0.0 0.01 0.08 0.02 0.75 0.48 0.45 0.49 0.26 1.0 0.8 0.19 0.01 0.03 0.01 0.0 0.04
0.13 0.17 0.25 0.29 0.33 0.15 0.02 1.0 0.55 0.63 0.76 0.64 0.9 0.61 0.4 0.3 0.75 0.23 0.19 0.0
0.2 0.25 0.08 0.18 0.2 0.27 0.17 0.55 0.45 0.47 1.0 0.39 0.48 0.39 0.85 0.39 0.43 0.28 0.29 0.48
0.12 0.03 0.03 0.09 0.06 0.11 0.02 1.0 0.49 0.52 0.82 0.64 0.64 0.45 0.63 0.27 0.48 0.21 0.1 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.91 0.7 0.52 0.1 0.79 0.54 0.49 0.22 0.33 0.26 0.06 0.0
0.61 0.24 0.24 0.18 0.17 0.11 0.26 0.88 0.46 0.52 1.0 0.53 0.48 0.28 0.61 0.07 0.16 0.43 0.3 0.41
0.11 0.03 0.07 0.0 0.09 0.63 0.04 0.52 0.4 0.35 1.0 0.47 0.48 0.26 0.66 0.09 0.07 0.17 0.11 0.43
0.7 0.27 0.18 0.38 0.29 0.57 0.1 0.93 0.66 0.67 1.0 0.27 0.44 0.25 0.67 0.19 0.27 0.23 0.07 0.46
0.04 0.03 0.05 0.05 0.13 0.11 0.06 0.71 0.76 0.66 0.85 0.43 1.0 0.65 0.93 0.33 0.21 0.07 0.42 0.13
0.1 0.0 0.02 0.03 0.13 0.14 0.01 0.53 0.19 0.15 0.13 0.35 0.58 1.0 0.05 0.03 0.1 0.07 0.01 0.36
0.52 0.37 0.0 0.27 0.43 0.6 0.0 1.0 0.47 0.64 0.42 0.26 0.45 0.13 0.37 0.0 0.09 0.16 0.17 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.84 0.3 0.21 0.32 0.84 0.75 1.0 0.22 0.03 0.03 0.05 0.0 0.01
0.31 0.21 0.17 1.0 0.33 0.21 0.01 0.53 0.46 0.84 0.71 0.16 0.05 0.02 0.42 0.21 0.22 0.24 0.01 0.28
0.0 0.0 0.15 1.0 0.11 0.44 0.0 0.26 0.23 0.47 0.0 0.08 0.0 0.0 0.1 0.16 0.25 0.0 0.0 0.0
0.65 0.11 0.15 0.2 0.13 0.12 0.01 0.69 0.46 0.59 0.75 0.45 1.0 0.98 0.64 0.16 0.22 0.06 0.03 0.18
0.05 0.04 0.06 0.05 0.09 0.03 0.47 0.46 0.41 0.52 1.0 0.45 0.35 0.33 0.81 0.08 0.12 0.05 0.08 0.21
0.6 0.44 0.48 0.69 0.69 0.76 0.31 0.78 0.63 0.63 0.93 0.46 0.61 0.52 1.0 0.65 0.68 0.64 0.55 0.39
0.07 0.23 0.13 0.06 0.14 0.25 0.0 0.85 0.38 0.47 0.62 0.95 1.0 0.96 0.41 0.21 0.31 0.11 0.0 0.11
0.29 0.41 0.21 0.24 0.39 0.42 0.31 0.59 0.41 0.4 0.89 0.53 0.73 0.62 1.0 0.21 0.32 0.5 0.39 0.35
0.11 0.2 0.13 0.12 0.15 0.21 0.29 0.84 0.38 0.27 0.31 0.51 1.0 0.73 0.32 0.18 0.19 0.33 0.51 0.44
0.05 0.0 0.0 0.05 0.05 0.03 0.02 0.5 0.45 0.28 0.45 0.2 1.0 0.52 0.34 0.03 0.05 0.08 0.02 0.02
0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.03 0.04 0.32 0.26 0.24 0.55 0.15 0.56 0.36 0.53 0.32 0.17 0.13 0.17 1.0
0.42 0.28 0.33 0.42 0.44 0.37 0.19 0.67 0.48 0.45 1.0 0.4 0.55 0.43 0.93 0.44 0.51 0.58 0.38 0.24
0.21 0.0 0.1 0.36 0.11 0.0 0.08 0.56 0.8 0.98 0.74 0.44 1.0 0.42 0.3 0.21 0.1 0.08 0.02 0.21
0.2 0.05 0.07 0.08 0.13 1.0 0.13 0.5 0.22 0.18 0.11 0.08 0.19 0.14 0.04 0.06 0.07 0.09 0.07 0.26
0.14 0.23 0.17 0.2 0.3 0.24 0.06 0.51 0.48 0.58 0.54 0.54 1.0 0.91 0.64 0.18 0.17 0.34 0.16 0.36
0.17 0.1 0.14 0.12 0.15 0.09 0.08 0.46 0.44 0.37 0.75 0.29 0.54 0.36 0.59 0.21 0.29 0.24 0.17 1.0
0.39 0.34 0.37 0.42 0.58 0.78 0.42 0.78 0.64 0.65 1.0 0.6 0.74 0.57 0.92 0.44 0.49 0.69 0.46 0.69
0.19 0.27 0.17 0.29 0.19 0.23 0.28 0.72 0.66 0.47 1.0 0.43 0.59 0.46 0.9 0.36 0.28 0.24 0.26 0.09
0.03 0.07 0.03 0.2 0.09 0.09 0.0 1.0 0.64 0.61 0.52 0.36 0.44 0.33 0.33 0.24 0.37 0.37 0.0 0.0
0.17 0.07 0.06 0.45 0.66 0.44 0.01 1.0 0.54 0.45 0.35 0.2 0.83 0.5 0.12 0.1 0.28 0.27 0.11 0.11
0.08 0.07 0.11 0.18 0.09 0.34 0.0 1.0 0.33 0.4 0.79 0.56 0.81 0.66 0.54 0.34 0.52 0.37 0.02 0.31
0.28 0.27 0.13 0.24 0.41 0.27 0.03 0.77 0.92 1.0 0.66 0.77 0.83 0.8 0.69 0.54 0.49 0.28 0.24 0.23
0.15 0.06 0.02 0.05 0.05 0.24 0.05 1.0 0.42 0.49 0.94 0.46 0.93 0.68 0.53 0.09 0.27 0.09 0.04 0.69
0.07 0.04 0.04 0.21 0.04 0.02 0.03 0.46 0.67 0.76 1.0 0.41 0.52 0.44 0.71 0.43 0.41 0.03 0.0 0.87
0.1 0.15 0.02 0.12 0.16 0.12 0.01 1.0 0.86 0.94 0.41 0.52 0.93 0.74 0.42 0.88 0.65 0.21 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.28 0.33 0.43 0.36 0.15 1.0 0.51 0.28 0.1 0.11 0.04 0.01 0.05
0.12 0.07 0.08 0.06 0.06 0.15 0.01 0.41 0.31 0.35 1.0 0.37 0.75 0.51 0.82 0.1 0.1 0.08 0.11 0.22
0.46 0.7 0.67 0.7 0.35 0.33 0.18 0.8 0.65 0.62 1.0 0.79 0.57 0.52 0.87 0.72 0.82 0.29 0.19 0.16
0.09 0.02 0.05 0.04 0.07 0.06 0.0 0.91 0.37 0.48 0.51 0.55 0.88 0.51 0.32 0.03 0.19 0.07 0.0 1.0
0.23 0.16 0.14 0.23 0.25 0.37 0.25 0.6 0.31 0.3 1.0 0.6 0.53 0.38 0.96 0.2 0.27 0.25 0.19 0.38
0.31 0.0 0.01 0.06 0.06 0.07 0.03 1.0 0.22 0.14 0.15 0.3 0.36 0.33 0.18 0.02 0.11 0.1 0.0 0.81

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)