Heatmap: Cluster_336 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_01320	0.41	0.34	0.25	0.38	0.76	0.53	0.54	0.33	0.24	0.24	0.3	0.32	0.28	0.29	0.31	0.27	0.26	0.62	1.0	0.44
Gb_01550	0.53	0.49	0.42	0.46	0.7	0.78	0.46	0.47	0.33	0.32	0.53	0.3	0.29	0.25	0.56	0.37	0.34	0.82	1.0	0.65
Gb_02352	0.45	0.42	0.37	0.48	0.6	0.5	0.26	0.43	0.3	0.28	0.59	0.27	0.22	0.2	0.58	0.35	0.25	0.47	1.0	0.44
Gb_02768	0.45	0.29	0.43	0.35	0.56	0.32	0.27	0.26	0.24	0.25	0.42	0.19	0.25	0.22	0.45	0.19	0.25	0.31	1.0	0.37
Gb_03019	0.29	0.83	0.33	0.37	0.65	0.53	0.46	0.25	0.26	0.23	0.38	0.22	0.11	0.12	0.43	0.32	0.26	0.48	1.0	0.32
Gb_03171	0.75	0.74	0.51	0.76	0.99	0.76	0.82	0.59	0.44	0.42	0.59	0.43	0.83	0.65	0.6	0.42	0.36	0.7	1.0	0.52
Gb_03734	0.67	0.62	0.43	0.57	0.66	0.55	0.33	0.48	0.36	0.32	0.28	0.31	0.42	0.42	0.26	0.38	0.27	0.65	1.0	0.58
Gb_04222	0.62	0.68	0.54	0.59	0.98	0.54	0.55	0.53	0.41	0.37	0.77	0.45	0.26	0.25	0.74	0.34	0.33	0.71	1.0	0.84
Gb_05365	0.7	0.99	0.62	0.53	0.83	0.63	0.69	0.53	0.51	0.48	0.73	0.48	0.39	0.34	0.72	0.38	0.37	0.72	1.0	0.62
Gb_05700	0.24	0.32	0.17	0.38	0.4	0.41	0.32	0.28	0.19	0.17	0.3	0.18	0.22	0.2	0.29	0.12	0.15	0.34	1.0	0.19
Gb_06534	0.64	0.45	0.5	0.59	0.56	0.45	0.44	0.5	0.37	0.32	0.51	0.3	0.37	0.36	0.51	0.25	0.27	0.58	1.0	0.69
Gb_07226	0.57	0.42	0.24	0.51	1.0	0.02	0.37	0.07	0.05	0.05	0.18	0.09	0.04	0.04	0.16	0.06	0.06	0.11	0.93	0.32
Gb_09019	0.66	0.63	0.49	0.8	0.81	0.63	0.58	0.51	0.36	0.33	0.58	0.32	0.32	0.29	0.62	0.34	0.31	0.77	1.0	0.54
Gb_10192	0.68	0.54	0.51	0.58	0.85	0.76	0.84	0.27	0.09	0.1	0.4	0.35	0.09	0.09	0.44	0.11	0.13	0.46	1.0	0.45
Gb_10793	0.18	0.32	0.14	0.42	0.78	0.7	0.69	0.29	0.13	0.14	0.26	0.23	0.04	0.05	0.28	0.07	0.14	0.49	1.0	0.36
Gb_10869	0.68	0.79	0.52	0.7	0.81	0.73	0.95	0.61	0.44	0.44	0.51	0.49	0.7	0.61	0.54	0.48	0.53	1.0	0.69	0.8
Gb_11559	0.21	0.48	0.25	0.25	0.37	0.25	0.27	0.26	0.2	0.21	0.3	0.17	0.31	0.28	0.33	0.16	0.14	0.41	1.0	0.47
Gb_11974	0.7	0.46	0.39	0.5	0.62	0.49	0.5	0.41	0.27	0.32	0.53	0.35	0.23	0.18	0.52	0.35	0.36	0.5	1.0	0.43
Gb_12869	0.37	0.4	0.63	0.31	0.52	0.23	0.52	0.27	0.16	0.16	0.12	0.13	0.16	0.14	0.15	0.2	0.18	0.33	1.0	0.35
Gb_13176	0.53	0.68	0.5	0.76	0.79	0.5	0.69	0.51	0.46	0.44	0.33	0.3	0.38	0.49	0.35	0.49	0.24	0.79	1.0	0.75
Gb_13857	0.31	0.58	0.32	0.55	0.55	0.41	0.16	0.41	0.17	0.16	0.27	0.22	0.45	0.3	0.26	0.15	0.14	0.5	1.0	0.43
Gb_13955	0.47	0.41	0.36	0.54	0.64	0.88	0.54	0.53	0.35	0.37	0.42	0.4	0.4	0.37	0.51	0.34	0.41	0.76	1.0	0.72
Gb_14768	0.56	0.48	0.52	0.67	1.0	0.06	0.29	0.12	0.12	0.04	0.3	0.08	0.09	0.1	0.22	0.22	0.07	0.26	0.56	0.11
Gb_15214	0.68	0.56	0.46	0.71	1.0	0.64	0.36	0.4	0.19	0.2	0.26	0.26	0.16	0.16	0.27	0.18	0.13	0.54	0.82	0.31
Gb_16528	0.64	0.71	0.59	0.75	0.81	0.7	0.6	0.52	0.32	0.31	0.41	0.36	0.56	0.56	0.47	0.27	0.3	0.74	1.0	0.68
Gb_17726	0.23	0.2	0.1	0.26	0.73	0.24	0.48	0.18	0.14	0.14	0.1	0.13	0.11	0.15	0.12	0.19	0.15	0.54	1.0	0.46
Gb_18007	0.5	0.78	0.44	0.82	1.0	0.64	0.69	0.49	0.38	0.32	0.35	0.52	0.44	0.45	0.29	0.21	0.27	0.91	0.87	0.44
Gb_19551	0.63	0.74	0.54	0.49	0.64	0.53	0.53	0.48	0.43	0.39	0.72	0.33	0.42	0.35	0.74	0.39	0.36	0.53	1.0	0.6
Gb_19769	0.52	0.3	0.75	0.68	0.8	0.43	0.42	0.41	0.39	0.45	0.76	0.3	0.25	0.26	0.77	0.26	0.61	0.36	1.0	0.86
Gb_20198	0.59	0.29	0.4	0.55	0.6	0.55	0.49	0.44	0.32	0.29	0.65	0.31	0.34	0.34	0.71	0.33	0.34	1.0	0.95	0.81
Gb_22571	0.55	0.46	0.47	0.47	0.46	0.28	0.47	0.28	0.3	0.31	0.4	0.2	0.21	0.21	0.36	0.36	0.23	0.42	1.0	0.54
Gb_23313	0.5	0.74	0.47	0.54	0.97	0.67	0.52	0.51	0.37	0.45	0.47	0.44	0.49	0.47	0.56	0.24	0.33	1.0	0.76	1.0
Gb_24230	0.54	0.52	0.39	0.53	0.57	0.08	0.84	0.29	0.21	0.27	0.72	0.28	0.29	0.29	0.57	0.22	0.15	0.38	1.0	0.47
Gb_24275	0.43	0.43	0.26	0.34	0.49	0.62	0.43	0.34	0.26	0.28	0.5	0.26	0.32	0.22	0.52	0.33	0.26	0.59	1.0	0.54
Gb_24547	0.75	0.82	0.91	0.67	0.86	0.59	0.74	0.64	0.53	0.52	0.69	0.47	0.47	0.39	0.65	0.42	0.47	0.58	0.97	1.0
Gb_26005	0.3	0.45	0.25	0.44	0.7	0.35	0.26	0.29	0.19	0.2	0.16	0.15	0.24	0.25	0.2	0.13	0.26	1.0	0.72	0.21
Gb_27309	0.33	0.17	0.21	0.47	0.83	0.51	0.46	0.36	0.28	0.27	0.46	0.26	0.32	0.33	0.46	0.3	0.33	0.56	1.0	0.62
Gb_29305	0.4	0.21	0.32	0.47	0.52	0.37	0.52	0.39	0.33	0.33	0.55	0.26	0.23	0.19	0.55	0.3	0.36	0.49	1.0	0.62
Gb_29758	0.12	0.19	0.33	0.35	0.39	0.2	0.24	0.12	0.1	0.12	0.21	0.13	0.05	0.05	0.23	0.11	0.23	0.24	1.0	0.19
Gb_30357	0.38	0.76	0.34	0.51	0.8	0.54	0.8	0.42	0.25	0.27	0.39	0.17	0.38	0.3	0.43	0.22	0.17	1.0	0.93	0.27
Gb_30865	0.24	0.14	0.18	0.56	0.63	0.66	0.11	0.16	0.01	0.02	0.02	0.07	0.03	0.05	0.04	0.1	0.13	1.0	0.83	0.31
Gb_31058	0.49	0.34	0.34	0.72	0.76	0.27	0.27	0.37	0.23	0.21	0.3	0.22	0.26	0.27	0.33	0.24	0.28	0.85	1.0	0.32
Gb_31297	0.53	0.47	0.36	0.56	0.81	0.46	0.53	0.4	0.31	0.32	0.47	0.28	0.29	0.25	0.52	0.26	0.29	0.76	1.0	0.64
Gb_31444	0.3	0.39	0.29	0.53	0.9	0.33	0.3	0.34	0.27	0.26	0.38	0.18	0.27	0.27	0.44	0.28	0.3	0.56	1.0	0.42
Gb_32028	0.35	0.78	0.33	0.4	0.99	0.5	0.56	0.35	0.23	0.24	0.27	0.18	0.3	0.3	0.28	0.16	0.14	0.61	1.0	0.39
Gb_32114	0.52	0.67	0.48	0.47	0.8	0.45	0.49	0.5	0.37	0.33	0.53	0.37	0.4	0.36	0.53	0.36	0.3	0.72	1.0	0.59
Gb_32286	0.57	0.69	0.6	0.71	0.83	0.39	0.35	0.37	0.31	0.35	0.38	0.3	0.28	0.3	0.4	0.27	0.26	0.54	1.0	0.43
Gb_32404	0.68	0.31	0.36	0.47	0.49	0.16	0.12	0.31	0.23	0.18	0.39	0.16	0.32	0.31	0.36	0.17	0.11	0.25	1.0	0.24
Gb_32589	0.6	0.68	0.44	0.54	1.0	0.67	0.66	0.42	0.2	0.21	0.26	0.33	0.63	0.6	0.24	0.19	0.23	0.73	0.98	0.76
Gb_32675	0.26	0.45	0.24	0.38	0.44	0.38	0.23	0.34	0.25	0.23	0.36	0.19	0.34	0.28	0.36	0.23	0.22	0.51	1.0	0.59
Gb_35172	0.52	0.68	0.53	0.49	0.61	0.49	0.44	0.46	0.37	0.35	0.39	0.43	0.2	0.18	0.45	0.24	0.21	0.56	1.0	0.58
Gb_35652	0.53	0.31	0.33	0.36	0.58	0.55	0.44	0.52	0.36	0.32	0.32	0.32	0.17	0.16	0.32	0.32	0.34	0.59	1.0	0.39
Gb_35734	0.76	0.17	0.47	0.91	0.89	0.81	0.62	0.36	0.12	0.1	0.19	0.35	0.17	0.22	0.16	0.26	0.56	1.0	0.72	0.84
Gb_35817	0.54	0.7	0.52	0.58	1.0	0.67	0.66	0.45	0.33	0.33	0.37	0.34	0.46	0.47	0.4	0.24	0.21	0.84	0.8	0.53
Gb_36273	0.12	0.36	0.18	0.14	0.4	0.08	0.18	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.24	1.0	0.25
Gb_36406	0.39	0.43	0.28	0.44	0.62	0.41	0.42	0.36	0.32	0.32	0.5	0.25	0.29	0.25	0.54	0.47	0.47	0.66	0.5	1.0
Gb_36441	0.71	0.43	0.57	0.61	0.66	0.36	0.23	0.36	0.22	0.22	0.4	0.21	0.26	0.23	0.39	0.22	0.26	0.51	1.0	0.3
Gb_37388	0.21	0.25	0.18	0.32	0.51	0.45	0.32	0.32	0.19	0.18	0.37	0.13	0.29	0.21	0.35	0.2	0.19	0.29	1.0	0.32
Gb_38670	0.67	0.38	0.48	0.67	0.71	0.71	0.57	0.47	0.34	0.36	0.95	0.31	0.33	0.3	1.0	0.36	0.47	0.98	0.81	0.91
Gb_39547	0.16	0.38	0.25	0.45	0.36	0.45	0.43	0.26	0.13	0.17	0.4	0.13	0.09	0.08	0.42	0.14	0.13	0.45	1.0	0.31
Gb_40184	0.56	0.58	0.42	0.67	0.89	0.46	0.58	0.45	0.32	0.31	0.37	0.34	0.4	0.38	0.38	0.21	0.19	0.6	1.0	0.27
Gb_40475	0.52	0.61	0.5	0.5	0.75	0.78	0.72	0.41	0.29	0.32	0.34	0.35	0.29	0.31	0.36	0.24	0.4	0.55	1.0	0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)