Heatmap: Cluster_72 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00174	0.02	0.08	0.01	0.04	0.02	0.02	1.0	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.04
Gb_00557	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11
Gb_00714	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.1	1.0	0.13	0.12	0.11	0.16	0.13	0.0	0.0	0.15	0.0	0.03	0.0	0.0	0.04
Gb_00955	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_01168	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01766	0.09	0.09	0.04	0.06	0.06	0.07	1.0	0.09	0.16	0.17	0.21	0.09	0.13	0.06	0.21	0.14	0.15	0.03	0.0	0.0
Gb_01859	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02118	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02574	0.31	0.47	0.33	0.29	0.23	0.03	1.0	0.21	0.33	0.32	0.2	0.13	0.25	0.23	0.15	0.47	0.24	0.05	0.11	0.14
Gb_02834	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03882	0.02	0.03	0.03	0.03	0.1	0.03	1.0	0.05	0.06	0.06	0.07	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.09	0.08	0.03
Gb_04631	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
Gb_06748	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_07170	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07171	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07173	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07906	0.28	0.46	0.39	0.09	0.11	0.05	1.0	0.04	0.05	0.03	0.09	0.05	0.05	0.06	0.09	0.05	0.02	0.01	0.0	0.09
Gb_08480	0.27	0.23	0.15	0.08	0.1	0.21	1.0	0.03	0.06	0.05	0.07	0.02	0.01	0.01	0.1	0.23	0.27	0.11	0.09	0.24
Gb_09080	0.03	0.07	0.05	0.04	0.07	0.08	1.0	0.08	0.05	0.08	0.06	0.1	0.05	0.04	0.08	0.05	0.05	0.15	0.16	0.17
Gb_09379	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.12	0.01	0.03
Gb_09442	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09492	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09530	0.03	0.0	0.03	0.0	0.05	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05
Gb_09543	0.0	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01
Gb_09544	0.03	0.05	0.08	0.03	0.05	0.06	1.0	0.08	0.05	0.05	0.06	0.03	0.05	0.05	0.06	0.04	0.02	0.06	0.11	0.07
Gb_09545	0.01	0.05	0.01	0.02	0.0	0.01	1.0	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0
Gb_10002	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10395	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11719	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_12425	0.04	0.04	0.04	0.06	0.05	0.08	1.0	0.06	0.02	0.03	0.01	0.11	0.0	0.0	0.01	0.04	0.08	0.04	0.09	0.26
Gb_12448	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
Gb_13112	0.01	0.01	0.03	0.02	0.0	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_14063	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0
Gb_15558	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15813	0.02	0.0	0.02	0.0	0.03	0.01	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.08	0.02
Gb_15834	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46
Gb_16188	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16284	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18506	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19571	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	1.0	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.22	0.1	0.0	0.0	0.0
Gb_21050	0.11	0.16	0.09	0.09	0.08	0.37	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.43
Gb_21455	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21519	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.0	1.0	0.03	0.03	0.05	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.0	0.01	0.05	0.01	0.0
Gb_22438	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22450	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
Gb_22916	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
Gb_23032	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24653	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_25061	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0
Gb_25967	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26167	0.09	0.41	0.21	0.1	0.18	0.54	1.0	0.2	0.35	0.36	0.23	0.21	0.17	0.16	0.34	0.43	0.32	0.1	0.08	0.04
Gb_27654	0.02	0.04	0.01	0.06	0.02	0.03	1.0	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.09	0.0	0.0	0.11
Gb_27852	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.09	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.02	0.01
Gb_28274	0.05	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	1.0	0.04	0.15	0.04	0.39	0.02	0.08	0.04	0.03	0.1	0.0	0.03	0.13	0.0
Gb_29244	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.0	1.0	0.04	0.08	0.08	0.09	0.06	0.02	0.04	0.05	0.06	0.09	0.02	0.02	0.01
Gb_29245	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	1.0	0.1	0.2	0.16	0.21	0.13	0.07	0.12	0.1	0.16	0.24	0.01	0.0	0.0
Gb_29249	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	1.0	0.05	0.09	0.08	0.14	0.08	0.04	0.08	0.07	0.07	0.11	0.0	0.0	0.0
Gb_30035	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33847	0.33	0.15	0.26	0.22	0.17	0.07	1.0	0.1	0.07	0.08	0.25	0.17	0.14	0.11	0.22	0.2	0.16	0.09	0.04	0.13
Gb_33942	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34495	0.08	0.02	0.09	0.03	0.03	0.02	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.12	0.36
Gb_34625	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.15	0.08	0.01	0.05	0.01	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36656	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38700	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38821	0.18	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.06
Gb_39500	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39597	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	1.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.05
Gb_40301	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41467	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)