Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.0 0.59 0.74 0.84 0.73 0.35 0.23 0.21 0.15 0.14 0.14 0.15 0.08 0.11 0.14 0.22 0.23 0.66 0.32 0.32
0.72 0.29 0.75 1.0 0.86 0.47 0.32 0.42 0.32 0.31 0.29 0.33 0.43 0.41 0.31 0.45 0.53 0.68 0.31 0.75
0.62 0.14 0.58 0.65 1.0 0.02 0.01 0.35 0.47 0.49 0.26 0.42 0.35 0.31 0.28 0.2 0.78 0.15 0.05 0.2
0.63 0.04 0.38 1.0 0.93 0.01 0.0 0.05 0.01 0.02 0.01 0.18 0.0 0.01 0.01 0.02 0.23 0.09 0.03 0.07
1.0 0.61 0.59 0.92 0.64 0.46 0.11 0.29 0.15 0.13 0.13 0.24 0.07 0.07 0.12 0.19 0.33 0.64 0.5 0.51
1.0 0.3 0.66 0.73 0.56 0.23 0.2 0.25 0.18 0.19 0.2 0.17 0.28 0.27 0.21 0.21 0.19 0.39 0.09 0.17
0.89 0.52 1.0 0.67 0.66 0.06 0.25 0.15 0.13 0.11 0.16 0.13 0.02 0.03 0.18 0.08 0.12 0.58 0.77 0.4
1.0 0.28 0.54 0.66 0.97 0.33 0.13 0.27 0.11 0.12 0.13 0.2 0.1 0.09 0.13 0.09 0.19 0.76 0.37 0.33
1.0 0.42 0.9 0.91 0.76 0.45 0.35 0.22 0.14 0.12 0.14 0.15 0.13 0.13 0.14 0.21 0.21 0.41 0.22 0.4
0.95 0.51 0.57 1.0 0.67 0.28 0.39 0.33 0.22 0.21 0.23 0.2 0.27 0.32 0.23 0.25 0.31 0.65 0.36 0.67
0.83 0.45 0.6 1.0 0.44 0.26 0.14 0.21 0.16 0.15 0.12 0.12 0.23 0.23 0.11 0.16 0.2 0.34 0.16 0.24
0.45 0.03 0.37 1.0 0.81 0.14 0.0 0.08 0.03 0.03 0.04 0.24 0.03 0.03 0.02 0.05 0.62 0.08 0.02 0.08
0.89 0.65 0.64 1.0 0.77 0.39 0.13 0.28 0.2 0.19 0.22 0.3 0.1 0.11 0.25 0.38 0.4 0.49 0.28 0.59
0.96 0.55 0.94 1.0 0.82 0.81 0.13 0.33 0.21 0.13 0.16 0.16 0.04 0.05 0.15 0.5 0.34 0.94 0.22 0.38
0.88 0.65 0.74 1.0 0.89 0.27 0.19 0.28 0.28 0.22 0.29 0.17 0.27 0.22 0.26 0.38 0.3 0.61 0.38 0.55
1.0 0.3 0.57 0.74 0.57 0.38 0.06 0.27 0.17 0.17 0.11 0.15 0.2 0.2 0.12 0.13 0.21 0.43 0.18 0.28
0.91 1.0 0.95 0.53 0.89 0.17 0.17 0.3 0.21 0.2 0.17 0.3 0.2 0.18 0.18 0.47 0.45 0.69 0.36 0.67
0.8 0.46 0.67 1.0 0.95 0.35 0.2 0.35 0.16 0.15 0.23 0.37 0.17 0.19 0.25 0.38 0.58 0.41 0.19 0.34
0.68 0.2 0.54 0.7 1.0 0.15 0.13 0.29 0.22 0.22 0.23 0.62 0.29 0.31 0.23 0.45 0.87 0.17 0.05 0.2
1.0 0.44 0.68 0.92 0.87 0.35 0.37 0.36 0.25 0.24 0.36 0.29 0.19 0.18 0.41 0.29 0.26 0.68 0.37 0.49
0.63 0.05 0.52 1.0 1.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.02 0.44 0.11 0.05 0.09
0.53 0.11 0.53 0.98 1.0 0.05 0.01 0.15 0.06 0.06 0.05 0.41 0.04 0.04 0.05 0.1 0.59 0.15 0.11 0.24
0.83 0.27 0.63 1.0 0.52 0.2 0.25 0.26 0.21 0.19 0.21 0.14 0.17 0.15 0.22 0.36 0.38 0.71 0.27 0.59
1.0 0.24 0.64 0.65 0.93 0.33 0.26 0.29 0.2 0.19 0.3 0.2 0.28 0.34 0.28 0.32 0.27 0.62 0.23 0.51
0.7 0.05 0.44 1.0 0.88 0.03 0.0 0.11 0.05 0.05 0.02 0.18 0.02 0.02 0.02 0.14 0.5 0.14 0.04 0.12
0.65 0.02 0.49 0.7 1.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.02 0.63 0.08 0.01 0.18
1.0 0.82 0.6 0.86 0.76 0.46 0.22 0.24 0.12 0.09 0.22 0.12 0.15 0.13 0.23 0.19 0.16 0.61 0.54 0.42
0.45 0.04 0.49 1.0 0.7 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.03 0.47 0.07 0.05 0.07
0.38 0.17 0.42 0.67 1.0 0.05 0.11 0.17 0.13 0.13 0.15 0.29 0.12 0.13 0.15 0.17 0.29 0.2 0.14 0.12
0.96 0.3 0.68 1.0 0.8 0.17 0.08 0.19 0.09 0.09 0.07 0.08 0.05 0.06 0.06 0.26 0.31 0.49 0.02 0.28
0.95 0.4 0.7 1.0 0.73 0.22 0.32 0.33 0.26 0.27 0.37 0.27 0.23 0.24 0.38 0.37 0.31 0.45 0.54 0.53
0.73 0.05 0.44 0.91 0.86 0.04 0.0 0.12 0.03 0.03 0.04 0.36 0.02 0.01 0.03 0.07 1.0 0.08 0.02 0.06
0.58 0.01 0.3 1.0 0.59 0.01 0.0 0.06 0.03 0.03 0.02 0.27 0.02 0.02 0.02 0.05 0.75 0.04 0.0 0.03
1.0 0.33 0.73 0.99 0.8 0.6 0.27 0.24 0.12 0.12 0.13 0.28 0.06 0.07 0.12 0.14 0.24 0.41 0.25 0.64
0.82 0.56 0.87 1.0 0.91 0.26 0.34 0.32 0.22 0.18 0.26 0.22 0.11 0.13 0.2 0.34 0.43 0.73 0.55 0.73
1.0 0.31 0.48 0.69 0.86 0.25 0.11 0.24 0.11 0.11 0.08 0.15 0.05 0.04 0.1 0.24 0.22 0.55 0.29 0.33
0.53 0.81 0.83 1.0 0.54 0.4 0.02 0.24 0.05 0.07 0.07 0.08 0.03 0.06 0.09 0.28 0.21 0.94 0.2 0.34
1.0 0.45 0.94 0.87 0.68 0.43 0.39 0.43 0.36 0.4 0.37 0.25 0.29 0.35 0.44 0.63 0.56 0.7 0.46 0.62
0.77 0.18 0.44 1.0 0.93 0.33 0.05 0.12 0.04 0.06 0.02 0.55 0.0 0.01 0.02 0.25 0.92 0.28 0.14 0.24
0.76 0.18 0.45 1.0 0.41 0.28 0.2 0.18 0.12 0.12 0.12 0.13 0.12 0.12 0.13 0.17 0.22 0.32 0.08 0.37
0.78 0.18 0.56 1.0 0.74 0.58 0.14 0.42 0.28 0.25 0.33 0.37 0.32 0.32 0.34 0.39 0.45 0.46 0.12 0.37
0.49 0.05 0.24 1.0 0.54 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.41 0.01 0.02 0.01 0.1 0.63 0.07 0.05 0.14
0.46 0.04 0.41 0.69 0.76 0.2 0.0 0.15 0.04 0.02 0.02 0.44 0.01 0.03 0.01 0.23 1.0 0.12 0.03 0.1
0.39 0.03 0.4 1.0 0.97 0.01 0.0 0.09 0.09 0.02 0.07 0.38 0.05 0.06 0.06 0.09 0.56 0.09 0.02 0.07
0.8 0.19 0.69 1.0 0.94 0.14 0.08 0.06 0.07 0.02 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.1 0.17 0.35 0.03 0.64
0.71 0.17 0.68 0.95 1.0 0.21 0.05 0.07 0.03 0.03 0.04 0.03 0.02 0.02 0.04 0.13 0.06 0.41 0.03 0.49
1.0 0.21 0.85 0.92 0.92 0.27 0.06 0.09 0.05 0.05 0.06 0.04 0.04 0.04 0.03 0.12 0.19 0.51 0.05 0.59
1.0 0.3 0.7 0.96 0.77 0.41 0.21 0.32 0.19 0.15 0.24 0.25 0.24 0.24 0.23 0.28 0.35 0.52 0.21 0.66
0.58 0.21 0.46 0.66 1.0 0.29 0.02 0.13 0.04 0.04 0.04 0.27 0.02 0.03 0.03 0.06 0.23 0.15 0.04 0.18
0.52 0.18 0.42 0.58 1.0 0.28 0.01 0.08 0.05 0.04 0.01 0.15 0.01 0.03 0.01 0.06 0.24 0.12 0.02 0.2
1.0 0.28 0.67 1.0 0.91 0.48 0.18 0.35 0.17 0.15 0.22 0.24 0.23 0.24 0.21 0.36 0.43 0.58 0.19 0.57
0.89 0.79 0.77 1.0 0.63 0.44 0.3 0.3 0.18 0.19 0.11 0.15 0.26 0.24 0.12 0.18 0.19 0.45 0.43 0.28
0.46 0.04 0.51 0.73 0.89 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.13 0.03 0.13
1.0 0.42 0.56 0.87 0.91 0.49 0.28 0.39 0.22 0.19 0.38 0.34 0.27 0.23 0.37 0.28 0.23 0.75 0.28 0.33
1.0 0.63 0.74 0.78 0.75 0.2 0.28 0.26 0.17 0.17 0.17 0.21 0.26 0.13 0.2 0.1 0.1 0.51 0.63 0.36
0.61 0.29 0.48 0.68 0.42 0.14 0.12 0.18 0.03 0.03 0.02 0.04 0.02 0.02 0.02 0.13 0.07 1.0 0.34 0.61
0.78 0.31 0.75 1.0 0.67 0.09 0.22 0.21 0.02 0.06 0.06 0.05 0.07 0.06 0.05 0.18 0.08 0.88 0.19 0.61
1.0 0.3 0.61 0.81 0.82 0.18 0.2 0.15 0.11 0.1 0.14 0.06 0.1 0.11 0.13 0.15 0.13 0.78 0.24 0.3
1.0 0.47 0.7 0.71 0.77 0.18 0.15 0.18 0.09 0.09 0.13 0.06 0.05 0.04 0.13 0.12 0.13 0.79 0.44 0.18
1.0 0.32 0.56 0.99 0.69 0.58 0.35 0.35 0.2 0.15 0.4 0.23 0.13 0.14 0.37 0.35 0.35 0.6 0.3 0.59
0.79 0.4 0.62 1.0 0.62 0.59 0.23 0.28 0.15 0.13 0.17 0.2 0.21 0.19 0.17 0.26 0.28 0.56 0.34 0.44
0.93 0.19 0.35 1.0 0.67 0.56 0.35 0.35 0.22 0.17 0.43 0.2 0.35 0.37 0.36 0.32 0.33 0.54 0.19 0.62
0.61 0.04 0.3 1.0 0.87 0.01 0.0 0.07 0.01 0.01 0.01 0.16 0.0 0.01 0.02 0.05 0.2 0.13 0.06 0.05
0.9 0.34 0.71 1.0 0.85 0.2 0.32 0.26 0.15 0.13 0.18 0.16 0.2 0.18 0.2 0.31 0.25 0.33 0.21 0.31
0.78 0.27 0.67 1.0 0.63 0.21 0.1 0.19 0.11 0.12 0.14 0.18 0.09 0.11 0.14 0.31 0.29 0.36 0.13 0.36
0.47 0.26 0.4 0.62 0.48 0.23 0.13 0.07 0.03 0.03 0.04 0.09 0.02 0.02 0.04 0.02 0.08 0.19 0.09 1.0
0.86 0.42 0.63 0.8 1.0 0.31 0.25 0.29 0.16 0.13 0.14 0.22 0.17 0.15 0.16 0.17 0.11 0.49 0.4 0.49
1.0 0.2 0.44 0.69 0.57 0.26 0.22 0.31 0.16 0.15 0.23 0.18 0.03 0.04 0.2 0.17 0.16 0.47 0.16 0.3
1.0 0.24 0.5 0.81 0.54 0.3 0.22 0.39 0.15 0.15 0.2 0.2 0.1 0.14 0.17 0.15 0.2 0.4 0.3 0.29
0.18 0.15 0.28 0.22 0.2 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.07 0.0 1.0
0.87 0.86 0.75 0.67 1.0 0.54 0.08 0.46 0.37 0.38 0.52 0.35 0.44 0.36 0.58 0.4 0.3 0.52 0.15 0.4
1.0 0.56 0.63 0.86 1.0 0.4 0.28 0.5 0.35 0.3 0.55 0.36 0.45 0.43 0.54 0.36 0.39 0.85 0.61 0.58
1.0 0.58 0.82 0.86 0.68 0.23 0.18 0.26 0.19 0.23 0.34 0.16 0.14 0.13 0.34 0.33 0.36 0.55 0.42 0.62
1.0 0.2 0.8 0.94 0.95 0.31 0.34 0.45 0.33 0.36 0.43 0.25 0.42 0.37 0.48 0.35 0.47 0.68 0.27 0.93
0.44 0.14 0.44 0.68 1.0 0.02 0.01 0.07 0.04 0.04 0.04 0.04 0.02 0.02 0.05 0.1 0.36 0.06 0.01 0.01
0.57 0.37 0.43 1.0 0.64 0.1 0.1 0.18 0.07 0.07 0.08 0.15 0.11 0.12 0.09 0.14 0.21 0.42 0.1 0.28
0.79 0.32 0.63 0.58 1.0 0.04 0.07 0.25 0.07 0.1 0.04 0.19 0.02 0.02 0.03 0.08 0.15 0.82 0.31 0.22
1.0 0.29 0.43 0.98 0.82 0.25 0.16 0.28 0.24 0.23 0.3 0.34 0.22 0.21 0.35 0.58 0.58 0.42 0.26 0.29
0.9 0.53 0.54 1.0 0.98 0.28 0.22 0.29 0.17 0.17 0.17 0.16 0.17 0.13 0.17 0.44 0.48 0.63 0.39 0.73
0.55 1.0 0.6 0.82 0.82 0.43 0.23 0.48 0.3 0.34 0.41 0.31 0.3 0.3 0.47 0.39 0.32 0.85 0.39 0.49
1.0 0.27 0.77 0.94 0.78 0.19 0.3 0.18 0.15 0.13 0.15 0.18 0.15 0.15 0.17 0.18 0.23 0.34 0.14 0.29
1.0 0.66 0.62 0.88 0.85 0.37 0.2 0.26 0.14 0.12 0.31 0.15 0.1 0.06 0.25 0.3 0.21 0.66 0.4 0.43
1.0 0.51 0.51 0.64 0.69 0.42 0.2 0.24 0.13 0.14 0.24 0.13 0.08 0.1 0.19 0.19 0.16 0.62 0.33 0.41
0.53 0.04 0.58 0.88 1.0 0.01 0.0 0.06 0.04 0.01 0.01 0.32 0.01 0.01 0.01 0.07 0.64 0.1 0.03 0.11
0.81 0.46 0.52 1.0 0.87 0.59 0.36 0.38 0.21 0.19 0.35 0.25 0.25 0.27 0.35 0.31 0.42 0.66 0.33 0.42
0.99 0.44 0.63 1.0 0.71 0.5 0.33 0.36 0.35 0.32 0.23 0.28 0.37 0.34 0.26 0.41 0.43 0.62 0.24 0.42
1.0 0.25 0.48 0.7 0.59 0.32 0.15 0.3 0.22 0.23 0.33 0.18 0.32 0.34 0.29 0.25 0.24 0.37 0.25 0.31
0.88 0.4 0.64 1.0 0.87 0.52 0.32 0.53 0.43 0.35 0.41 0.34 0.51 0.48 0.38 0.57 0.55 0.58 0.23 0.55
1.0 0.32 0.64 0.73 0.79 0.31 0.15 0.37 0.26 0.24 0.36 0.26 0.31 0.36 0.34 0.25 0.28 0.63 0.22 0.39
0.59 0.44 0.76 0.45 0.25 0.17 0.03 0.1 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.05 1.0 0.22 0.35
0.8 0.11 0.67 1.0 0.89 0.07 0.01 0.11 0.06 0.05 0.05 0.35 0.05 0.05 0.04 0.21 0.41 0.15 0.05 0.11
0.74 0.54 1.0 0.39 0.66 0.02 0.15 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.07 0.0 0.75
1.0 0.23 0.75 1.0 0.86 0.67 0.28 0.45 0.34 0.35 0.33 0.41 0.34 0.29 0.36 0.45 0.69 0.69 0.26 0.65
0.92 0.51 0.76 1.0 0.93 0.57 0.48 0.52 0.39 0.4 0.49 0.33 0.35 0.33 0.54 0.42 0.41 0.89 0.5 0.71
0.77 0.21 0.48 1.0 0.66 0.54 0.02 0.26 0.13 0.09 0.13 0.21 0.08 0.11 0.1 0.27 0.48 0.59 0.25 0.32
1.0 0.41 0.6 0.87 0.67 0.4 0.26 0.38 0.3 0.29 0.21 0.2 0.33 0.28 0.23 0.3 0.29 0.48 0.34 0.39
1.0 0.41 0.69 0.98 0.86 0.65 0.29 0.46 0.19 0.19 0.27 0.31 0.22 0.27 0.25 0.24 0.24 0.62 0.34 0.3
0.64 0.03 0.37 0.69 1.0 0.06 0.01 0.29 0.37 0.35 0.37 0.38 0.4 0.31 0.35 0.26 0.41 0.16 0.05 0.16
0.39 0.26 0.27 0.58 1.0 0.26 0.05 0.27 0.13 0.1 0.24 0.34 0.29 0.22 0.25 0.26 0.34 0.37 0.15 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)