Heatmap: Cluster_210 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
AT1G02940 (GSTF5)
-1.2 1.33 - -5.07 - - - - - - - - - 0.15 -0.18 -4.85 - - -2.27 -0.5 1.98 - -1.45 2.98 - 0.4 - -4.04 3.97 -7.9 3.53 -2.56 -2.27 -5.6 -1.97 -3.83 -1.97 -2.1 -6.76 - - -5.16 - - - - - -
0.69 -1.14 -0.48 - 1.07 - 0.09 0.46 0.63 - - -0.83 1.22 - - - - - -0.94 - - - - 4.67 0.74 2.44 - - 1.0 - -0.38 - - -2.07 -2.96 - - -3.7 - - - - - - - - - -
- -0.92 - - - - - - - - -0.48 -4.12 -1.32 -4.05 - - - - -2.96 -3.37 -3.23 - - 4.25 - 1.67 - - 4.52 - -0.39 - - -4.26 - - - - - - - - - - - - - -
-0.66 2.03 - - - - - - -4.15 - -3.1 - - 0.46 - - - - -5.43 -0.14 - - - 3.85 - 1.77 - - 2.91 - 3.93 - - -2.58 - -3.82 - -8.71 - - - - - - - - - -
0.25 2.71 - - - - - - - - - - - -0.95 -2.31 -5.4 -5.58 - -6.38 0.17 -2.7 - -5.18 3.65 -3.79 1.98 - -1.39 3.03 - 3.68 -4.33 - -7.37 -6.57 -3.57 -3.55 - - - - - - - -5.29 - - -
1.36 1.29 -3.11 - - - - - - -6.1 - - -1.15 0.38 -0.28 -5.44 - -4.98 -3.5 0.94 - -1.35 1.75 2.03 - -0.3 - - 4.35 -6.32 2.47 -5.11 -4.19 -5.39 0.64 -1.52 -3.69 0.01 - - - - -2.11 - -2.43 - - -4.63
- - - - - - - - - - - - - -0.61 - - - - - - - - - 3.85 - 0.8 - - 4.55 - 2.95 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.49 0.93 - - - - - - - - - - - 1.4 - - - - - -0.91 - - -5.64 3.96 - 1.45 - - 3.0 - 4.04 -6.62 - -5.87 -9.51 - - - - - - - - - - - - -
- -4.96 -3.24 - - - -5.28 - - - - - - 1.73 - - - - -2.38 -5.38 -3.55 - - 3.99 - 1.68 -5.5 -4.25 3.18 -6.12 3.99 - -5.78 - -7.07 - - -3.2 - - - - - - - - - -
- -2.93 - - - - - - - - - -0.91 - - - - - - - - - - - 5.18 - 2.16 - - 1.52 - 1.67 -1.35 - - - - - - -3.46 - - - - - - - - -
- - - -2.4 - - - - - - - - - - - - - - -3.99 - -2.73 - - 4.81 - 2.62 - - 3.66 - -1.45 -4.07 -4.21 -2.12 -6.69 - - - - - - - - - - - - -3.51
- -8.03 - -4.18 - - - - - - - -2.26 -3.38 -2.51 -3.2 - - - -3.75 -5.94 -4.62 - -4.2 3.85 -0.56 0.64 - - 4.52 -0.96 2.45 -5.91 -4.59 -2.09 -7.35 -4.27 -2.06 -2.05 -0.62 - - -3.27 -4.18 - - - - -
- 2.35 - - - - - -0.72 0.42 - - - - - 0.86 - - - - -1.8 - - - 4.7 - 2.51 - - 1.53 - 1.93 - - -1.46 - - - - - - - - - - - - - -
-0.48 2.34 - - - - - - - - - - - 0.05 - - - - -4.33 0.55 - - - 3.42 - 1.07 - - 3.39 - 4.0 - - -2.38 - -2.71 - - - - - - - - - - - -
-1.3 2.74 - - - - - - - - - - - 1.26 0.05 - - - - -0.13 -2.96 - - 4.11 - 1.64 - - 0.52 - 3.86 - - - -3.82 - - -7.0 - - - - - - - - - -
- -3.39 - -4.41 - - - - - - - - - -1.1 - -5.42 - - - -5.02 -3.76 - - 4.77 - 2.75 - - 3.3 - 1.76 -6.4 - -6.65 - - - -10.23 - - - - - - - - - -
AT2G04425 (LCR82)
- -5.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.86 - - - 4.9 - 2.54 - - 3.15 - 1.7 -3.83 - - - - - -6.15 - - - - - - - - - -
- 1.21 - - - - - - - - - - - 1.28 - - - - - -2.94 -3.61 - - 4.51 -3.89 2.19 - - 0.7 -6.23 3.78 -6.48 - -4.41 -4.25 - - -9.06 -5.24 - - -3.48 -4.39 - - - - -
AT2G12465 (LCR50)
0.08 3.27 - -2.6 - - - - - - - - - -1.31 -1.5 -4.58 - - - 1.79 - - - 3.12 - 1.6 - -1.86 1.5 - 4.17 - -4.83 - -7.13 - - - - - - - - - - - - -
- -2.0 - - - - - - - - - - - -2.99 - - - - - - - - - 4.5 - 2.18 - - 4.11 - 1.62 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT2G20208 (LCR60)
- -3.03 - -2.57 - - - - - - - -7.46 - 1.42 - - - - - -5.51 -4.49 - - 3.24 - 0.3 - - 4.64 - 3.22 - - - -7.22 - - -9.26 - - - - - - - - - -
- -2.04 -0.14 -1.85 -2.71 - - -3.98 - - - - - -0.93 -2.37 - - - -1.1 -5.03 - - - 4.32 - 2.01 - - 4.17 - 1.57 -5.87 - - -6.76 -3.45 - - - - - - - - - - - -
-5.45 -0.71 - - - - - -2.71 - - - - - -2.46 - - - - -3.3 -4.52 -3.53 - - 5.15 - 2.45 - - 0.94 - 1.92 - - - - -3.16 - - - - - - - - - - - -
- 1.56 - -2.95 - - - - - - - - - 2.09 - - - - - -1.86 -4.28 - - 3.76 - 1.14 -4.05 - 3.5 - 3.69 - - -4.92 -7.62 -3.93 - -8.43 - - - - - -2.25 - - - -
- -3.93 - -4.88 - - -5.1 - - - -6.3 -10.15 - -1.83 - - - - -7.46 -5.96 -3.03 - -6.49 4.88 -6.92 2.49 - -5.81 3.26 -8.34 1.46 -5.45 - - -8.97 -5.93 - - - - - - - - - - - -
-0.88 3.4 - -4.54 -5.09 -5.01 -4.59 -3.47 -1.63 -5.14 -2.56 - -2.48 -0.38 1.3 - - - -4.04 1.82 -4.98 - - 2.72 - 0.52 - -4.51 2.91 -6.4 3.74 -6.63 - -4.51 - -4.63 - -8.94 - - - - - - - - - -
- 1.6 - - - - - - -0.36 - - -0.01 0.29 0.35 1.05 - - - -1.63 -0.95 - - - 2.91 - 0.12 - - 3.71 - 4.01 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-6.4 1.14 - -5.14 - - - - - - - - - 1.54 -4.16 - - - - -1.83 -4.36 - -4.21 4.13 - 1.9 - - 1.24 - 4.23 -6.43 - -5.16 - - - - -8.84 - - - - - - - - -
-4.84 -2.63 - - - - - - - - - - - 0.54 - - - - - -5.6 -1.8 - - 4.42 -2.97 1.39 - - 3.67 -5.31 3.16 -4.56 - - -7.87 -3.55 - - - - - - - - - - - -
- -5.17 - - - - - - - - - - - -4.72 - - - - - -6.29 -1.94 - -3.18 5.11 - 2.94 - - 2.0 - 0.45 - - - -6.21 - - -7.49 - - - - - - - - - -
-0.66 1.83 - - - - -2.7 - - - - -2.55 - 0.71 -1.72 - - - - -0.25 - - - 4.07 -4.06 2.03 -2.16 - 1.92 - 3.96 -5.79 - -3.28 - - - - - - - - - -3.12 - - - -
- 1.07 -3.43 - -4.2 - -4.01 - -4.21 - - -6.76 - -1.18 -3.03 - - - -6.04 -1.15 -4.46 - -3.12 4.7 - 2.68 - - 2.49 -5.96 2.63 -4.52 - -4.25 - -4.09 - - - - - - - - - - - -
AT3G19160 (IPT8)
2.5 2.65 2.32 0.74 0.94 - -0.21 - - - - - -0.52 0.97 - - - - -1.24 1.26 -1.61 - - 1.72 - -1.74 - - 3.04 - 3.13 - - - -4.14 - - - - - - - - - - - - -2.26
-1.55 0.05 -4.74 - - - -4.22 - - - - - -2.96 1.63 - - - - -4.62 -5.51 - - - 3.94 - 1.66 - - 3.5 - 3.74 -6.26 - - -7.58 - - - - - - - - - - - - -
-7.8 -3.2 - - - - -1.38 - - - - - - -1.76 - -3.44 - - -6.04 -3.08 -0.78 - -0.55 4.77 - 2.63 - - 3.41 - 0.17 -3.67 - - -5.13 -2.84 -2.31 - - - - - - - - - - -
AT3G42473 (LCR47)
3.16 3.18 -0.01 - 0.34 0.65 - -0.67 - -3.66 - - - - -1.07 - - - -3.69 1.24 - - - 3.4 - 1.81 - 0.29 1.4 - 2.21 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -2.62 -0.57 -0.1 - - - - - - - - 1.21 1.77 - - - - 1.8 - - - - 2.94 - 0.84 - - 4.21 - 3.13 -2.29 - - - - - -4.33 -4.13 - - - - - - - - -
- -1.82 -1.91 - -1.46 - -2.62 - - - - -4.3 - 1.6 -0.32 -3.73 1.34 2.23 -5.26 -2.63 -2.33 -4.15 -2.12 2.62 - -0.1 - - 4.22 - 3.15 - - -4.31 -7.7 -2.7 - -2.73 -5.18 - - - - - - - - -4.85
-1.89 2.66 - -3.96 - - -3.9 - - - -3.98 - - -0.2 -2.86 -27.5 -18.28 - -23.58 -0.19 - - -3.29 4.42 -3.2 2.3 0.68 -1.41 1.24 -5.71 3.08 -16.2 - - -21.64 -22.51 -27.28 -8.28 - - - - - - -28.84 - - -
-3.67 -4.39 - - - - - - - - - - - -0.27 -0.85 - - - -3.54 -2.49 - - - 4.78 - 0.97 - -0.8 -1.63 - 3.96 - - -1.41 - - - - - - - - - - - - - -
AT4G09153 (LCR36)
2.31 4.01 - -3.22 - - - - - - - - - -2.52 -2.14 - - - - 1.36 -3.57 - - 2.62 - 0.15 -3.09 - 2.81 - 3.23 - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.88 2.34 - -2.53 - - -1.61 - - - -4.25 - - -1.05 0.19 - - - -5.75 0.17 - - - 2.05 -4.47 0.45 - -1.5 3.62 - 2.53 -1.48 - -6.19 - - - -3.3 - - - - -4.11 - -1.79 - - -4.32
AT4G13095 (LCR37)
- -2.0 - -2.99 - - -1.33 - - - - - - 1.89 - - - - - - -3.32 - - 3.53 - 1.62 - - 3.23 - 3.98 -0.59 -5.02 -1.85 - - - - -6.72 - - 1.04 -0.87 - - - - -
-2.24 3.35 -1.32 -2.21 -2.59 -3.05 -1.45 - -2.55 - - - - -0.6 0.11 - -3.84 - -3.87 1.87 - - - 2.77 - 0.24 - - 3.11 - 3.79 - - -2.57 - - - - - - - - - - - - - -
AT4G39917 (LCR45)
-1.43 1.54 - -3.17 - - - -3.58 - - - - - 0.34 -4.13 -6.22 - - - -0.6 -3.75 - - 4.13 - 2.15 - -4.09 3.13 - 3.5 -6.21 - -5.45 -6.89 -5.19 - - - - - - - - - -2.19 - -6.34
- -0.16 - -4.0 - - - - - - - - - -2.29 - -3.99 - - - -3.08 -4.33 - -3.9 4.26 - 2.07 -4.1 -1.53 4.38 - 0.78 -4.98 -5.23 -4.57 - -3.97 -4.14 -6.72 - - - - - - - - - -
2.09 1.88 - - - - - - - - - - -3.43 0.79 - - - - - 0.24 - - - 3.2 -1.98 0.23 - - 2.74 - 4.3 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -3.9 - - - - - - - - - - -1.58 - - - - - - -4.91 -1.42 - - 5.15 - 2.77 - - 1.75 - 0.5 -5.3 - - - - - - - - - - - - - - - -
- -4.86 - - - - - - - - - -5.5 -2.76 -0.22 - -4.93 - - -1.02 -6.15 -2.15 - -3.84 4.73 -1.02 2.48 2.03 - 3.13 - -0.7 - - - -6.6 - - -4.68 -5.09 - - - - - - - - -
- -3.85 - - - - - - - - - - - 0.66 -0.26 - - - - -3.61 - - - 3.57 - 0.69 - - 4.45 - 3.2 - - -1.21 -1.32 - - - - - - - - - - - - -
AT5G47175 (LCR3)
0.69 0.77 -0.27 -2.26 -0.74 0.39 -2.14 2.77 2.27 1.99 2.21 -5.31 0.68 0.91 -0.16 - - -2.55 0.12 -0.99 - - - 1.71 - -1.31 -1.36 - -0.09 - 3.24 - - - - - - - -3.98 - - - - - - -0.81 -6.72 -
- -5.94 - - - - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - 1.43 - -1.24 - - 4.87 - 3.84 - - -2.78 - - - -9.47 - - - - - - - - - -
0.16 3.37 - - - - - - - - - - - 0.41 -0.74 - - - -5.25 1.59 -3.75 - - 3.27 - 1.07 - - 1.68 - 4.04 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.09 - - - - - -5.38 - - - 2.78 - -0.66 - - 4.84 - 3.25 - - - - - -2.08 - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.