1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_281 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.36 0.29 0.29 0.23 0.12 0.04 0.21 0.06 0.12 0.05 0.09 0.04 0.1 0.26 0.34 0.16 0.21 0.18 0.18 0.29 0.18 0.15 0.21 0.13 0.07 0.13 0.23 0.38 0.27 0.06 0.21 0.16 0.13 0.17 0.19 0.13 0.23 0.16 0.47 0.17 1.0 0.2 0.27 0.25 0.19 0.63 0.13 0.19
0.55 0.99 1.0 0.98 0.98 0.58 0.73 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.07 0.41 0.12 0.16 0.14 0.1 0.08 0.68 0.29 0.19 0.39 0.18 0.23 0.11 0.17 0.29 0.08 0.18 0.47 0.25 0.09 0.12 0.26 0.31 0.26 0.34 0.1 0.16 0.0 0.11 0.27 0.64 0.17 0.0 0.03 0.28
0.17 0.4 0.02 0.02 0.08 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 1.0 0.73 0.56 0.56 0.33 0.48 0.22 0.27 0.29 0.36 0.17 0.55 0.39 0.06 0.13 0.15 0.2 0.25 0.51 0.56 0.37 0.25 0.6 0.37 0.5 0.03 0.0 0.69 0.35 0.0 0.26 0.02 0.07 0.04
AT1G15520 (PDR12)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.12 0.05 0.03 0.11 0.08 0.03 0.04 0.08 0.01 0.03 0.02 0.25 0.02 0.28 0.21 0.03 0.09 0.0 0.01 0.04 0.06 0.06 0.0 0.24 0.51 0.06 0.6 0.89 0.09 0.17 0.05 0.01 0.04 0.19 1.0 0.02
AT1G27720 (TAF4)
 0.94 0.1 0.35 0.39 0.47 0.26 0.4 0.34 0.4 0.31 0.43 0.18 0.36 0.13 0.14 0.05 0.02 0.02 0.21 0.08 0.02 0.06 0.07 0.04 0.01 0.03 0.1 0.03 0.41 0.01 0.04 0.08 0.04 0.03 0.07 0.03 0.06 0.04 0.05 0.44 0.19 0.23 0.11 0.22 0.04 0.02 1.0 0.08
0.21 0.45 0.2 0.23 0.18 0.12 0.2 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.3 0.27 0.25 0.24 0.24 0.08 0.38 0.18 0.24 0.32 0.25 0.07 0.29 0.25 0.36 0.38 0.07 0.27 0.19 0.22 0.27 0.28 0.29 0.4 0.27 0.3 0.09 0.16 0.28 0.35 0.21 0.31 1.0 0.1 0.14
0.84 0.14 0.25 0.31 0.19 0.1 0.24 0.06 0.1 0.1 0.09 0.33 0.07 0.2 0.25 0.2 0.17 0.11 0.2 0.17 0.19 0.15 0.13 0.12 0.23 0.14 0.34 0.09 1.0 0.19 0.14 0.2 0.14 0.13 0.09 0.15 0.29 0.13 0.26 0.16 0.72 0.15 0.1 0.13 0.1 0.01 0.09 0.07
0.05 0.07 0.08 0.06 0.06 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.07 0.01 0.01 0.01 0.06 0.03 0.07 0.07 0.02 0.07 0.02 1.0 0.06 0.01 0.01 0.04 0.04 0.03 0.03 0.04 0.03 0.08 0.06 0.29 0.03 0.0 0.07 0.03 0.1 0.02 0.0 0.0 0.04
AT1G66670 (CLPP3)
 0.18 0.28 0.12 0.15 0.11 0.07 0.14 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.49 0.52 0.99 0.46 0.47 0.14 0.32 0.41 1.0 0.72 0.54 0.18 0.74 0.74 0.76 0.17 0.12 0.26 0.63 0.3 0.23 0.34 0.34 0.28 0.46 0.9 0.06 0.2 0.16 0.15 0.24 0.2 0.0 0.64 0.18
0.41 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.05 0.11 0.05 0.2 0.05 0.02 0.02 0.03 0.08 0.05 0.07 0.05 0.04 0.41 0.04 0.05 0.04 0.02 0.07 0.03 0.17 0.07 0.05 0.16 0.06 0.07 0.13 0.08 0.03 0.07 1.0 0.04 0.05
0.53 1.0 0.14 0.17 0.15 0.16 0.19 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.4 0.49 0.25 0.24 0.13 0.09 0.63 0.34 0.28 0.34 0.26 0.18 0.25 0.17 0.27 0.38 0.21 0.41 0.15 0.33 0.2 0.24 0.34 0.53 0.47 0.36 0.42 0.12 0.38 0.43 0.56 0.17 0.08 0.52 0.3
0.2 0.13 0.37 0.27 0.19 0.05 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.05 0.05 0.07 0.06 0.14 0.1 0.09 0.14 0.07 0.05 0.05 0.05 0.22 0.1 0.03 0.15 0.1 0.06 0.08 0.17 0.08 0.06 0.1 0.06 0.05 0.04 0.05 0.07 0.18 0.11 0.36 1.0 0.16
0.07 0.12 0.05 0.03 0.05 0.04 0.04 0.08 0.13 0.07 0.12 0.14 0.04 0.17 0.12 0.11 0.11 0.09 0.27 0.13 0.11 0.09 0.08 0.09 0.06 0.12 0.53 0.07 0.08 0.03 0.07 0.04 0.15 0.14 0.09 0.15 0.53 0.15 0.23 1.0 0.27 0.29 0.11 0.06 0.1 0.13 0.4 0.03
AT1G75850 (VPS35B)
 0.7 0.54 0.42 0.59 0.46 0.43 0.56 0.34 0.31 0.13 0.24 0.0 0.18 0.54 0.54 0.4 0.48 0.39 0.31 0.46 0.23 0.32 0.44 0.34 0.32 0.38 1.0 0.47 0.43 0.16 0.37 0.45 0.34 0.57 0.34 0.51 0.85 0.44 0.8 0.31 0.36 0.99 0.77 0.51 0.63 0.27 0.51 0.34
AT1G76150 (ECH2)
 0.05 0.12 0.26 0.25 0.23 0.35 0.31 0.08 0.05 0.01 0.01 0.0 0.01 0.27 0.08 0.23 0.13 0.11 0.07 0.15 0.15 0.12 0.12 0.12 0.15 0.12 1.0 0.06 0.06 0.09 0.11 0.24 0.08 0.16 0.09 0.12 0.27 0.15 0.33 0.07 0.27 0.22 0.12 0.07 0.08 0.03 0.36 0.06
AT1G78700 (BEH4)
 0.79 0.29 0.03 0.08 0.04 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.2 0.24 0.21 0.64 0.34 0.06 0.37 0.12 0.11 0.2 0.24 0.03 0.23 0.15 0.34 0.79 0.05 0.12 0.25 0.23 0.33 0.18 0.21 0.34 0.2 0.65 0.3 1.0 0.12 0.62 0.34 0.36 0.29 0.02 0.38
0.33 0.34 0.52 0.69 0.33 0.08 0.62 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.3 0.15 0.18 0.16 0.09 0.2 0.34 0.18 0.09 0.13 0.23 0.15 0.17 0.33 0.26 0.31 0.14 0.36 0.14 0.08 0.18 0.17 0.13 0.57 0.21 0.6 0.04 0.17 0.73 0.19 0.19 0.15 0.18 1.0 0.07
AT2G02810 (UTR1)
 0.08 0.13 0.04 0.07 0.08 0.24 0.08 0.42 0.82 0.26 1.0 0.0 0.07 0.16 0.06 0.07 0.11 0.08 0.15 0.1 0.53 0.05 0.06 0.07 0.01 0.04 0.05 0.07 0.16 0.01 0.12 0.08 0.03 0.03 0.06 0.03 0.03 0.08 0.03 0.02 0.01 0.04 0.11 0.06 0.06 0.18 0.06 0.09
AT2G19800 (MIOX2)
 0.04 0.05 0.06 0.05 0.1 0.15 0.08 0.11 0.09 0.08 0.09 0.0 0.56 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.2 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.31 0.0 0.02 0.07 0.04 0.08 0.0 0.01 0.0 0.05 0.09 0.1 1.0 0.03 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01
0.17 0.38 1.0 0.68 0.83 0.42 0.54 0.06 0.12 0.02 0.06 0.0 0.06 0.31 0.07 0.25 0.38 0.28 0.19 0.31 0.22 0.19 0.16 0.2 0.13 0.22 0.37 0.12 0.4 0.16 0.28 0.19 0.1 0.24 0.2 0.21 0.26 0.21 0.16 0.16 0.18 0.3 0.26 0.18 0.17 0.97 0.28 0.16
AT2G26700 (PID2)
 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 0.01 0.02 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.22 0.02 0.0 0.06 0.04 0.05 0.04 0.11 0.01 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.02 0.08 0.21 0.04 1.0 0.0 0.07
0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.13 0.13 0.51 0.13 0.24 0.03 0.01 0.08 0.05 0.03 0.02 0.01 0.19 0.02 0.01 0.07 0.01 0.28 0.2 0.25 0.07 0.36 1.0 0.2 0.98 0.0 0.0 0.79 0.45 0.09 0.56 0.0 0.0 0.06
AT3G09520 (EXO70H4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.19 0.04 0.05 0.0 0.02 0.02 0.01 0.04 0.21 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.39 0.98 0.54 0.66 0.1 0.59 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.03 0.19 0.09 0.07 0.02 0.01 0.18 0.31 0.07 0.14 0.29 0.15 0.11 0.08 0.02 1.0 0.17 0.21 0.22 0.14 0.12 0.09 0.51 0.17 0.11 0.2 0.04 0.81 0.04 0.08 0.12 0.32 0.11 0.0 0.01 0.13
AT3G28910 (MYB30)
 0.33 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.14 0.21 0.25 0.01 0.11 0.23 0.03 0.02 0.09 0.03 0.09 0.01 0.12 0.11 0.01 0.12 0.06 0.04 0.12 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.13 1.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04
AT3G55610 (P5CS2)
 0.07 0.05 0.12 0.11 0.08 0.03 0.1 0.02 0.01 0.01 0.01 0.3 0.03 0.09 0.13 0.1 0.04 0.03 0.06 0.06 0.03 0.05 0.04 0.04 0.12 0.04 1.0 0.06 0.07 0.06 0.04 0.07 0.09 0.18 0.03 0.03 0.32 0.06 0.34 0.13 0.03 0.31 0.16 0.1 0.15 0.08 0.04 0.05
0.79 0.6 0.37 0.39 0.43 0.34 0.37 0.08 0.05 0.02 0.02 0.0 0.01 0.47 0.49 0.45 0.37 0.3 0.12 0.56 0.37 0.4 0.52 0.33 0.05 0.37 0.25 0.38 0.36 0.04 0.34 0.36 0.37 0.56 0.29 0.38 0.5 0.46 1.0 0.09 0.46 0.51 0.81 0.52 0.47 0.83 0.26 0.4
0.08 0.13 0.27 0.23 0.22 0.19 0.24 0.2 0.2 0.09 0.17 1.0 0.07 0.2 0.04 0.2 0.13 0.1 0.17 0.12 0.13 0.11 0.1 0.13 0.11 0.19 0.53 0.08 0.24 0.09 0.14 0.1 0.1 0.11 0.09 0.11 0.27 0.16 0.42 0.03 0.41 0.12 0.06 0.1 0.08 0.14 0.24 0.04
0.27 0.07 0.42 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.15 0.01 0.04 0.0 0.14 0.08 0.02 0.0 0.05 0.01 0.0 0.01 1.0 0.26 0.11 0.28 0.0 0.04 0.07 0.07 0.02 0.0 0.17 0.04 0.28 0.03 0.0 0.1 0.03 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0
AT4G09570 (CPK4)
 0.6 0.13 0.29 0.34 0.23 0.17 0.32 0.14 0.14 0.04 0.07 0.0 0.03 0.12 0.12 0.14 0.04 0.04 0.08 0.21 0.17 0.08 0.12 0.13 0.03 0.12 0.06 0.39 0.14 0.02 0.19 0.19 0.12 0.16 0.14 0.11 0.12 0.14 0.13 0.11 0.02 0.55 0.31 0.18 0.3 0.01 1.0 0.18
AT4G11660 (HSFB2B)
 0.48 0.23 0.03 0.04 0.05 0.04 0.04 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.15 0.09 0.23 0.58 0.2 0.1 0.29 0.19 0.13 0.14 0.37 0.36 0.34 0.16 0.2 0.47 0.23 0.27 0.11 0.1 0.11 0.12 0.23 0.27 0.08 0.08 0.17 0.81 0.15 0.16 0.1 0.11 1.0 0.11 0.08
0.0 0.01 0.78 0.87 0.98 0.12 1.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.06 0.0 0.05 0.11 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT4G19020 (CMT2)
 0.08 0.41 0.2 0.23 0.22 0.16 0.24 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.23 0.2 0.14 0.19 0.13 0.05 0.31 0.16 0.31 0.5 0.18 0.0 0.15 0.02 1.0 0.57 0.0 0.16 0.35 0.19 0.12 0.4 0.24 0.09 0.19 0.03 0.03 0.01 0.03 0.3 0.48 0.41 0.05 0.01 0.25
0.36 0.16 0.12 0.11 0.14 0.1 0.13 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.11 0.14 0.09 0.1 0.08 0.05 0.18 0.14 0.08 0.11 0.09 0.13 0.08 0.1 0.1 1.0 0.15 0.15 0.11 0.06 0.08 0.12 0.1 0.17 0.1 0.09 0.03 0.06 0.09 0.09 0.15 0.08 0.12 0.07 0.07
1.0 0.21 0.1 0.11 0.08 0.05 0.09 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.14 0.11 0.09 0.08 0.08 0.1 0.23 0.13 0.14 0.17 0.08 0.12 0.09 0.18 0.22 0.17 0.09 0.16 0.11 0.11 0.13 0.16 0.12 0.18 0.12 0.26 0.41 0.18 0.1 0.11 0.23 0.19 0.14 0.3 0.13
AT5G55310 (TOP1)
 1.0 0.48 0.42 0.49 0.38 0.39 0.48 0.53 0.53 0.22 0.36 0.53 0.11 0.51 0.8 0.42 0.57 0.27 0.42 0.46 0.55 0.39 0.4 0.36 0.38 0.38 0.67 0.25 1.0 0.27 0.37 0.46 0.29 0.28 0.19 0.3 0.47 0.33 0.4 0.23 0.43 0.45 0.43 0.42 0.4 0.53 0.1 0.21
AT5G65670 (IAA9)
 0.13 0.3 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.23 0.14 0.49 0.36 0.11 0.29 0.33 0.21 0.33 0.38 0.04 0.4 0.3 0.16 0.17 0.03 0.35 0.15 0.11 0.21 0.29 0.39 0.26 0.38 0.1 0.01 0.01 0.6 0.38 0.17 0.23 1.0 0.4 0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)