Heatmap: Cluster_6 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
4.03 4.83 - - - - - - - - - 1.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.67 - - - - 4.95 - - - - 1.75 - - - - - - - - - - - 2.55 - - - - - - - - - - 0.63 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.06 -0.97 0.38 0.15 -3.32 0.66 - -3.27 - - -1.79 - 0.46 2.89 2.4 -1.43 0.41 -0.5 0.11 -0.38 1.17 -1.86 1.99 -2.34 2.5 -0.1 -2.82 - -4.68 -2.77 -4.58 0.64 -2.24 -1.41 1.77 - 1.41 -0.46 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.9 2.38 - - - - - - - - -
AT1G55330 (AGP21)
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.42 - - - - - - - - - 5.29 - - - 2.93 - - - - - - - - - -
3.58 - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.8 -2.4 - -1.01 -2.4 - - - - - -0.08 0.63 0.32 1.15 3.41 - -0.38 0.52 -2.52 -0.54 1.1 - 1.45 -1.18 0.97 1.41 - - - 2.1 -0.28 1.85 -0.21 -5.81 0.66 - 0.78 0.1 -0.88 -1.5 - 0.17 - -0.24 - - -3.02
2.29 - - - - - - - - - - 5.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.77 - - - 4.63 2.45 - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 2.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.33 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.97 3.15 - 4.48 1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.1 - - - - - - - - -0.25 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.71 - - - - - - 3.49 - 3.18 - 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.57 - - - - - - - - - - 5.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.86 2.91 - - - - - - - - - - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.94 - - - 1.08 - - - - - - - - - 3.84
-0.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.02 - - - - 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.39 4.1 - - - - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.48 - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.2 - - - - 1.15 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.02 1.19 0.43 0.79 0.43 -2.22 0.78 - -4.66 -6.39 -4.65 -7.57 - 0.76 0.54 0.34 -0.5 -0.38 -1.81 1.21 0.42 0.91 1.12 -0.05 -2.19 -0.08 -1.83 1.38 0.34 -2.28 0.98 0.47 -0.01 -0.49 1.07 0.03 0.65 0.29 -0.26 -4.46 - -1.76 -0.38 1.31 0.48 - - 0.15
AT3G01150 (PTB)
0.3 0.34 0.93 0.98 0.57 0.13 0.87 -2.8 -2.92 -6.53 -4.59 -10.4 -2.54 0.17 0.17 -0.13 0.07 -0.35 -1.41 0.37 -0.22 -0.11 0.16 -0.23 -1.63 -0.2 0.16 0.47 -0.98 -1.9 0.07 0.1 -0.07 0.4 0.15 0.1 0.82 0.32 0.43 -1.72 -0.98 0.59 0.9 0.66 0.56 0.66 -0.95 0.63
-0.96 2.09 - - - - - - - - - - - 1.24 1.5 1.1 0.45 1.76 - -0.8 -2.51 0.11 0.22 -0.46 - -0.68 - - - - -0.03 0.95 2.27 1.28 0.31 1.53 -1.55 1.1 -0.52 0.47 - 2.2 1.16 - -0.3 - - -1.93
3.22 - - - - - - - - - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.16 - - - - - - - - - -
1.53 1.13 0.91 1.1 0.97 -3.55 0.23 -2.64 - - - -0.23 - 0.2 -0.72 0.48 0.22 -1.16 -1.01 1.24 0.44 0.98 1.31 -0.42 0.45 -0.94 -1.04 0.39 -1.29 0.41 0.48 0.05 -0.85 -0.94 0.91 -0.31 0.33 0.42 -0.61 -3.92 -2.69 -3.12 -1.47 1.72 -2.03 - - 0.49
3.68 4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - 2.62 2.63 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.19 3.36 - - - - - - - - - - - 4.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.28 - - - - - - - - - -
AT3G18518 (DVL7)
- 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT3G23637 (DVL21)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.68 - - - 4.48 - - - - - - - - - -
4.13 - - - - - - - - - - 4.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.42 - - - - - - - - 2.36 - 1.25 - - - - - - -2.01 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.07 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.2 - - - - - - - - - 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.88 - - - - - - - - - - 5.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.67 - - - - - - - - - - 5.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.21 2.65 - - - - - - - - - 4.85 - 1.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - -
3.33 -0.44 - - - - - - - - - 5.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.86 - - 1.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.24 - 1.18 - - - - - - - -0.87 - - - - - - - - - -
2.17 - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.79 - - - - - - - - - - - - - -
1.89 1.05 0.69 -0.5 -0.43 -2.75 -1.38 - - - - - - 0.83 0.74 -0.39 -0.33 0.61 -1.7 0.49 -0.37 -0.01 0.34 0.66 -2.34 0.18 1.41 0.86 -1.24 -5.52 0.68 0.69 0.03 0.28 1.09 0.68 -0.26 0.51 0.66 -5.29 - -0.87 0.47 0.59 0.81 - - 0.37
AT3G56700 (FAR6)
- -2.05 - -5.29 -3.86 -0.87 -4.62 -4.2 - - - - -3.77 -5.25 -3.6 - - -4.08 -3.66 -4.74 - -4.77 -3.92 -3.86 - -3.43 - - -0.56 - -2.94 -6.08 -6.51 -5.72 -6.95 5.36 0.05 1.67 -7.85 - - -3.26 - - -5.17 - - -
0.83 1.05 0.46 0.71 1.4 2.53 0.5 3.17 - -2.35 -3.73 - - 0.39 0.39 -0.19 0.32 1.34 -1.52 0.09 -1.01 -2.78 -1.78 -0.61 -1.39 -0.68 -0.46 -0.45 -2.56 -1.19 0.34 -2.65 -1.81 -1.31 1.11 -1.96 -0.71 -0.35 -1.77 - -1.26 -0.3 -3.51 -0.81 -1.98 - - -1.62
AT3G63088 (DVL14)
- 2.7 - - - - - - - - - - - 4.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.38 3.76 - - - 1.1 - - - - - - - - - -
1.78 -1.65 2.06 0.78 1.55 1.91 0.8 -1.73 0.64 -0.79 -0.18 -5.78 - 2.05 - -2.11 - -1.51 - -2.57 -1.32 - - -1.98 - -3.19 - 0.51 2.04 -1.39 - -2.88 -0.24 1.24 -1.8 - -1.36 0.18 -1.84 -1.15 0.66 - 0.47 1.07 - - -1.51 1.89
0.75 - - - - - - - - - - 5.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.4 3.44 - - - - - - - -2.47 - 0.8 - -1.3 - - - - -3.58 -1.82 - - - 4.03 - 0.67 -0.5 -1.84 3.44 - 1.84 - -3.05 - - - -1.84 -4.26 -5.0 - - - - - - - - -2.09
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
2.9 -0.56 3.95 - 2.99 2.28 - -0.26 - -1.2 - - -0.07 -2.42 -1.16 -1.41 -3.43 - -1.36 -1.24 - -1.99 -1.42 -1.77 -4.5 -3.52 - 0.34 -0.69 -1.63 -1.12 -1.3 -3.1 -1.58 -1.43 - -0.21 -0.67 -1.55 -4.04 -4.06 - - -1.98 -3.14 - - -3.32
1.02 0.95 0.62 -0.14 0.33 -2.05 -0.37 -3.61 -2.41 -2.66 -1.81 0.51 -0.8 0.55 0.2 -0.01 -0.13 -0.49 -1.24 1.19 0.41 0.44 1.03 -0.21 -0.8 -0.56 -2.08 0.46 -1.17 -1.36 0.89 0.65 -0.83 -0.19 1.12 -0.62 -0.24 0.21 -1.47 -3.27 -0.84 -1.18 -0.15 1.91 1.2 - - 0.36
3.14 - - - - - - - - - - 5.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.02 5.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT5G16023 (DVL1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.93 - - - - - - - - - - - - - 4.13
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.63 - - - - - - - - - - - 3.24 - - - - 3.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.65 0.93 - - - - - - - - - - - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.76 - - - - - - - - - -
AT5G44140 (PHB7)
3.17 0.11 -0.37 -0.17 -0.7 -1.11 -0.64 - - - - - - -0.29 - -0.38 - - -2.5 -2.99 -1.86 0.91 -1.75 -1.12 - -1.48 - - 1.4 - -4.17 -3.42 0.73 -0.48 -0.49 1.28 -0.21 -0.3 -0.91 3.31 3.15 - - - - - -3.85 -
4.4 4.27 - - - - - - - - - - - -1.31 1.23 - - - - 1.03 - - - - - - - - - - 1.5 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.21 - - - - - - - - - - 0.37 - 4.0 4.2 - - - - - - - - -1.22 - - - - - - - - - - - - - 0.81 - - - - - - - - - 3.17
0.59 - - - - - - - - - - 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.09 - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.29 -1.8 2.76 1.96 2.33 -1.57 2.67 - -3.08 -4.33 - -0.37 - -1.79 - -3.66 -1.88 -2.07 0.77 -1.9 - -3.18 - -1.2 -0.3 -1.66 - -2.63 0.38 1.17 -5.16 -1.62 -0.73 -0.89 -3.19 0.06 3.21 -1.46 1.0 - - -1.75 -1.68 - -1.66 - - -2.86
0.46 - - - - - - - - - - 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.15 - - - - - - - - - -
ATCG00700 (PSBN)
4.81 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.96 - - - - - - - - - -
ATCG01020 (RPL32)
2.68 -0.68 -0.66 -0.97 -1.0 -0.77 -1.11 - - -4.45 - -8.31 - -0.24 2.96 - - - - - - - - -2.75 - - - - -0.37 - - - 2.85 3.66 - - - 3.12 -4.55 - - - - - - - - -3.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.