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Heatmap: Cluster_232 (HCCA)

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Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
5.15 4.21 4.64 8.25 3.13 1.93 6.34 0.45 0.6 0.3 0.45 0.54 0.82 3.22 4.93 2.08 1.58 2.09 1.64 4.27 2.83 2.74 3.62 2.17 1.57 1.83 1.53 4.36 8.85 1.42 4.82 4.04 2.59 2.51 6.04 1.85 2.85 2.48 2.19 2.28 0.93 3.37 1.9 5.52 3.97 0.0 0.0 2.91
4.36 2.69 4.02 3.87 2.77 2.31 2.78 0.1 0.03 0.04 0.04 0.02 1.6 1.93 1.36 1.88 1.02 1.74 0.72 3.61 1.31 2.66 3.36 1.52 1.25 1.02 0.19 3.62 7.22 1.41 2.14 2.87 0.92 1.15 2.45 1.07 1.41 1.83 0.8 0.14 0.0 0.7 0.97 4.17 0.96 0.0 0.01 1.36
2.16 1.52 5.07 4.04 3.12 1.38 3.56 0.35 0.09 0.1 0.22 0.23 0.0 1.15 1.4 1.05 0.54 0.82 0.48 2.24 1.54 2.23 2.8 0.66 0.53 0.5 0.35 2.33 0.87 0.36 1.58 1.56 0.67 0.66 2.34 0.68 1.44 0.86 1.35 0.69 0.59 0.54 0.5 3.45 2.0 0.0 0.0 1.54
8.59 2.66 4.46 5.0 3.0 0.45 3.71 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 1.95 2.86 2.47 1.26 1.18 0.68 2.82 1.37 2.29 2.78 1.33 0.98 1.15 0.48 3.2 7.54 0.7 2.54 3.96 1.32 0.96 3.65 1.47 2.32 1.92 1.82 0.35 0.07 0.41 1.06 5.99 2.15 0.0 0.0 4.31
6.7 4.74 7.68 6.62 5.26 1.2 5.81 0.27 0.32 0.11 0.34 3.02 0.12 3.21 1.92 2.84 1.76 1.83 1.7 5.94 2.97 5.63 6.56 1.89 1.73 1.34 0.85 11.24 4.5 1.07 5.49 6.98 1.92 1.65 9.03 1.75 2.66 2.85 0.99 0.84 0.11 0.54 1.27 8.45 3.02 0.0 0.13 3.61
1.07 1.39 2.42 3.35 1.93 0.59 2.92 0.01 0.06 0.05 0.04 0.03 0.0 1.17 1.54 1.34 3.53 1.14 0.48 1.91 1.95 1.62 2.11 0.75 0.18 0.68 0.34 1.55 2.58 0.28 2.08 1.46 0.55 0.67 1.42 0.87 1.12 0.67 0.39 0.09 0.15 0.36 0.44 2.21 0.93 0.11 0.0 0.97
4.41 4.32 5.9 6.43 4.29 4.93 5.05 3.49 2.13 0.72 0.78 0.02 1.67 3.5 5.88 2.9 2.74 3.22 1.9 4.21 3.32 2.99 2.97 3.43 1.18 2.84 3.03 3.18 4.92 1.16 4.71 3.83 2.29 1.91 4.74 2.32 3.35 2.93 2.55 2.95 0.0 1.33 2.16 3.33 2.53 0.06 0.1 2.44
5.14 4.25 3.03 2.2 2.35 0.19 2.64 0.04 0.07 0.01 0.05 0.03 0.0 1.86 1.8 0.83 0.84 1.12 0.64 3.77 1.36 1.41 2.56 1.0 0.26 0.86 0.16 3.59 2.67 0.28 3.14 1.65 1.29 1.09 4.26 0.97 0.81 1.28 0.48 0.34 0.03 0.34 0.78 3.5 1.88 0.07 0.0 1.42
5.61 3.02 6.79 8.45 5.93 2.29 8.04 0.07 0.13 0.07 0.07 0.0 0.03 1.78 1.45 0.62 0.5 0.79 0.84 2.36 1.15 1.45 3.29 0.7 0.82 0.39 0.14 2.63 2.23 0.94 2.36 2.12 0.79 0.75 3.11 0.64 1.02 1.4 0.33 0.19 0.61 0.3 1.24 6.26 1.85 0.0 0.0 3.86
3.45 2.23 3.44 3.55 2.27 1.25 3.44 0.04 0.02 0.01 0.0 0.06 0.04 1.74 1.44 1.99 0.97 1.47 0.48 2.33 2.41 2.78 3.91 1.1 0.42 1.07 0.33 2.63 1.1 0.34 2.21 2.73 0.81 0.85 3.41 1.12 1.27 1.63 0.56 0.42 0.05 0.64 0.73 4.16 2.46 0.0 0.0 2.43
1.84 2.77 4.47 5.41 1.9 0.36 4.51 0.01 1.09 0.0 0.29 0.02 0.01 1.81 1.93 1.49 1.05 1.34 0.98 3.38 2.3 2.74 3.82 0.99 0.82 0.73 0.31 4.35 3.58 0.65 3.03 2.55 1.16 1.02 4.65 0.63 0.96 1.49 0.66 0.43 0.03 0.35 0.62 3.88 1.93 0.0 0.0 2.18
AT1G21650 (SECA2)
 20.02 6.74 4.87 4.3 4.32 1.32 3.81 0.09 0.11 0.05 0.09 0.25 0.06 7.37 6.11 7.53 4.77 3.38 1.75 8.56 6.22 12.81 14.49 4.78 4.76 4.8 2.63 11.6 5.33 3.49 6.65 8.27 3.54 3.31 7.42 4.42 7.38 5.48 2.52 1.33 0.26 1.57 2.1 8.04 4.79 0.13 1.32 4.14
11.09 6.25 19.15 15.48 10.34 8.85 17.62 2.75 2.48 1.14 1.41 0.01 0.83 4.51 7.17 2.74 9.36 6.01 1.83 4.69 6.33 4.39 6.12 2.11 1.49 2.12 1.6 5.22 4.75 1.23 3.94 4.96 2.33 2.55 4.89 2.3 3.28 2.71 1.74 2.52 8.14 2.52 3.9 10.58 6.41 0.03 1.83 7.34
2.04 2.36 4.25 5.16 3.55 0.49 4.43 0.01 0.01 0.02 0.1 0.01 0.0 1.83 2.88 1.93 0.8 1.33 0.64 2.94 2.37 3.11 3.19 1.36 0.65 1.12 0.29 3.93 4.4 0.51 2.59 2.67 0.99 0.97 2.65 1.45 1.69 1.5 0.64 0.04 0.0 0.31 0.53 2.7 1.27 0.0 0.0 1.37
93.25 47.22 50.6 65.96 41.83 21.56 69.45 0.44 0.73 0.44 0.74 0.0 0.0 27.72 19.43 36.4 19.41 28.5 9.69 48.54 33.92 59.94 70.44 44.37 26.14 34.81 10.49 79.92 154.97 21.01 44.9 56.17 15.72 24.0 41.39 18.13 26.66 46.56 9.06 15.72 33.73 9.72 38.83 61.24 42.34 0.65 0.32 45.73
2.25 1.28 3.09 4.91 3.01 1.12 3.79 0.42 0.06 0.13 0.12 1.56 0.22 1.26 0.97 1.16 0.41 0.78 0.48 1.51 1.16 2.01 2.12 0.56 0.69 0.47 0.65 2.03 0.58 0.7 1.34 2.07 0.53 0.71 2.41 0.55 2.09 1.13 1.53 0.0 0.02 0.76 0.38 1.48 1.14 0.0 0.0 0.81
4.62 3.49 4.15 2.91 3.13 0.59 2.02 0.17 0.41 0.09 0.16 1.03 0.51 2.61 2.74 2.08 0.71 0.6 0.75 4.25 1.62 3.92 5.08 1.22 1.0 1.27 0.3 4.92 2.58 0.87 2.6 3.95 1.6 1.3 4.05 1.13 1.93 1.8 0.6 0.87 0.18 0.25 0.68 5.74 1.82 0.07 0.0 1.69
3.91 8.57 28.44 14.13 20.28 10.53 10.7 0.96 0.05 0.33 0.08 0.12 0.0 5.48 6.94 3.62 3.72 5.67 3.4 7.75 4.99 4.64 6.1 3.87 1.73 2.83 0.47 10.89 3.18 1.76 9.55 4.35 3.01 2.97 10.37 3.25 1.51 4.28 1.67 0.25 2.03 2.05 4.46 9.46 6.92 0.27 0.85 8.98
6.97 5.91 13.84 13.72 10.53 5.26 12.61 1.44 1.56 0.4 0.48 4.73 1.63 4.12 6.0 2.59 2.05 3.4 1.56 5.02 3.77 4.41 5.75 2.49 0.22 2.28 0.37 5.34 4.15 0.07 4.21 5.29 3.0 2.69 4.93 2.07 1.14 3.22 0.73 0.24 0.0 1.55 4.26 7.7 5.42 0.59 0.0 6.28
1.96 1.68 1.29 1.45 0.81 0.53 1.4 0.05 0.05 0.17 0.07 0.0 0.04 1.14 0.96 0.83 0.41 0.63 0.6 1.55 0.99 1.52 1.97 0.67 0.67 0.56 0.2 2.27 2.04 1.1 1.67 1.52 0.59 0.38 1.67 0.33 0.93 0.77 0.38 1.01 0.02 0.35 0.62 2.43 1.7 0.0 0.0 1.98
9.12 5.1 8.91 11.64 7.16 1.6 8.08 0.01 0.01 0.05 0.03 0.01 0.0 4.01 7.29 2.89 1.71 2.71 0.91 6.12 2.31 5.03 7.92 2.29 1.14 2.15 0.65 8.16 3.03 1.08 4.54 4.55 2.42 1.4 7.85 2.51 3.25 3.39 1.77 0.39 0.0 0.72 1.93 7.52 3.5 5.39 0.44 5.51
31.79 14.99 43.65 38.23 32.3 16.53 36.92 4.9 2.43 1.26 1.32 0.06 2.74 11.54 25.24 9.94 6.68 8.95 10.6 16.85 15.23 10.76 12.78 13.28 13.79 11.34 22.26 11.48 26.67 6.93 20.89 15.72 9.31 7.02 17.18 14.74 15.09 8.7 9.83 0.61 0.33 9.0 9.09 10.93 12.95 20.89 1.99 8.65
5.2 3.49 4.63 4.78 3.5 0.8 3.22 0.38 0.82 0.2 0.3 3.73 0.27 1.9 2.18 1.42 1.65 1.21 0.82 3.7 2.0 2.17 3.13 0.98 4.16 0.55 0.29 3.11 4.26 5.03 2.59 2.35 0.84 0.87 2.4 1.21 1.74 1.83 1.03 1.35 0.34 0.39 0.95 5.13 1.26 0.0 0.0 2.15
6.79 4.0 6.69 6.94 8.28 6.19 8.93 4.01 0.66 2.15 0.96 0.1 1.51 2.36 2.23 1.97 1.3 1.17 2.15 4.13 2.14 3.81 5.92 1.57 0.79 1.55 0.56 4.41 0.87 0.56 3.08 3.65 1.15 0.9 4.55 1.45 1.19 2.28 0.57 0.24 0.08 0.42 1.14 6.33 2.82 0.0 0.0 3.22
5.32 5.37 6.27 4.97 2.99 0.19 5.28 0.0 0.04 0.05 0.11 0.1 0.02 2.27 2.51 1.45 0.97 1.39 1.11 5.38 2.39 3.44 6.81 1.39 0.74 0.73 0.14 5.11 3.77 0.79 4.52 3.47 1.34 0.77 5.61 1.51 0.98 2.02 0.42 0.27 0.0 0.5 0.87 9.8 3.92 0.0 0.0 4.78
3.2 2.33 0.77 0.7 0.36 0.85 0.88 0.15 0.09 0.03 0.08 0.04 0.19 1.52 2.32 1.66 0.88 0.73 0.58 2.65 1.51 3.44 3.56 1.0 1.53 0.91 0.84 1.24 3.31 0.89 1.72 1.72 0.86 0.53 3.51 1.07 1.4 1.29 0.61 0.32 1.89 0.37 0.31 2.36 1.21 0.0 0.0 1.16
AT2G03880 (REME1)
 1.15 1.15 5.67 2.77 3.37 1.2 2.21 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 1.02 1.05 0.83 0.44 0.79 0.36 1.73 0.95 1.64 2.06 0.48 0.19 0.37 0.23 2.41 1.04 0.2 1.64 1.66 0.47 0.32 2.28 0.84 1.91 0.62 0.25 0.0 0.0 0.12 0.36 1.65 1.49 0.0 0.11 1.36
1.61 1.49 3.12 3.17 1.48 0.39 1.87 0.0 0.01 0.03 0.04 0.06 0.01 1.07 0.84 0.75 0.58 0.64 0.46 1.8 1.18 1.67 2.83 0.66 0.48 0.44 0.32 2.79 0.85 0.3 1.94 1.91 0.55 0.39 2.59 0.59 0.48 0.75 0.22 0.0 0.0 0.25 0.53 2.6 1.55 0.0 0.0 1.56
3.05 5.63 8.04 8.75 5.01 2.21 8.49 0.17 0.1 0.01 0.07 0.0 0.0 2.94 4.39 2.5 1.96 2.18 1.12 5.14 2.89 4.3 6.25 2.43 1.06 1.79 1.12 7.25 9.33 0.88 4.97 4.19 1.96 1.12 5.34 1.34 2.29 2.18 0.93 0.18 0.19 0.5 1.65 7.12 3.49 0.0 1.3 3.87
37.56 27.82 35.88 44.86 21.54 4.8 35.23 0.09 0.12 0.13 0.32 0.0 0.0 20.55 34.05 10.94 8.4 17.35 7.02 33.32 16.32 37.77 70.21 17.69 9.5 10.8 4.74 98.29 44.51 7.63 33.29 31.25 16.82 9.29 77.84 30.76 29.09 32.26 7.73 0.52 1.95 4.4 9.25 43.42 28.88 0.0 15.65 30.75
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AT3G05240 (MEF19)
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AT3G18970 (MEF20)
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AT4G33495 (RPD1)
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AT5G16790 (THO7)
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Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)