Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.72 1.0 0.99 0.01 0.63 0.79 0.72 0.72 0.68 0.74 0.67 0.66 0.39 0.5 0.47 0.45 0.55 0.48 0.69 0.63 0.67 0.77
0.68 1.0 0.87 0.02 0.6 0.67 0.71 0.6 0.61 0.58 0.59 0.62 0.29 0.42 0.46 0.46 0.53 0.5 0.67 0.51 0.49 0.73
0.47 0.82 1.0 0.01 0.56 0.58 0.33 0.59 0.44 0.46 0.5 0.39 0.16 0.32 0.42 0.4 0.39 0.39 0.62 0.38 0.39 0.46
0.41 0.6 1.0 0.08 0.59 0.56 0.42 0.48 0.51 0.42 0.43 0.55 0.22 0.47 0.49 0.42 0.5 0.46 0.76 0.47 0.47 0.5
0.85 1.0 0.9 0.08 0.92 0.92 0.7 0.66 0.46 0.58 0.57 0.55 0.23 0.59 0.74 0.76 0.64 0.64 0.87 0.58 0.6 0.65
0.51 0.74 1.0 0.04 0.51 0.55 0.39 0.42 0.44 0.35 0.37 0.48 0.32 0.3 0.35 0.31 0.32 0.32 0.45 0.5 0.45 0.48
0.41 0.75 1.0 0.04 0.46 0.66 0.46 0.45 0.52 0.45 0.42 0.47 0.32 0.38 0.3 0.34 0.31 0.36 0.49 0.48 0.41 0.47
0.76 1.0 0.98 0.05 0.72 0.86 0.62 0.55 0.49 0.55 0.49 0.55 0.34 0.41 0.59 0.64 0.58 0.59 0.7 0.54 0.51 0.36
0.55 0.9 1.0 0.04 0.57 0.65 0.37 0.45 0.43 0.35 0.42 0.45 0.22 0.44 0.36 0.38 0.37 0.39 0.59 0.41 0.4 0.28
0.91 1.0 0.9 0.03 0.75 0.89 0.75 0.77 0.63 0.65 0.63 0.64 0.28 0.58 0.65 0.6 0.59 0.58 0.89 0.6 0.59 0.69
0.58 0.83 1.0 0.05 0.63 0.72 0.46 0.5 0.43 0.49 0.48 0.52 0.27 0.31 0.45 0.43 0.38 0.41 0.69 0.48 0.57 0.51
0.87 1.0 0.99 0.01 0.57 0.83 0.87 0.53 0.63 0.45 0.48 0.56 0.22 0.47 0.57 0.53 0.61 0.59 0.78 0.53 0.54 0.75
0.79 0.82 0.48 0.01 0.46 0.7 0.64 0.71 0.53 0.79 1.0 0.44 0.22 0.38 0.41 0.44 0.44 0.41 0.17 0.62 0.58 0.39
0.76 0.9 1.0 0.03 0.54 0.77 0.65 0.68 0.71 0.68 0.63 0.82 0.36 0.59 0.43 0.4 0.44 0.4 0.35 0.33 0.33 0.85
0.26 0.54 1.0 0.1 0.44 0.43 0.21 0.27 0.38 0.3 0.25 0.34 0.16 0.45 0.19 0.19 0.19 0.24 0.27 0.33 0.24 0.34
0.99 1.0 0.91 0.02 0.57 0.61 0.78 0.42 0.42 0.32 0.39 0.38 0.16 0.55 0.54 0.55 0.56 0.55 0.71 0.33 0.36 0.69
0.74 0.73 1.0 0.02 0.6 0.73 0.71 0.53 0.79 0.52 0.53 0.8 0.27 0.64 0.43 0.36 0.45 0.48 0.54 0.8 0.67 0.77
0.41 0.56 1.0 0.04 0.52 0.58 0.34 0.23 0.39 0.21 0.2 0.35 0.16 0.27 0.3 0.32 0.28 0.28 0.36 0.22 0.3 0.34
0.92 1.0 0.95 0.02 0.67 0.64 0.77 0.41 0.4 0.33 0.35 0.36 0.26 0.38 0.52 0.56 0.59 0.54 0.69 0.4 0.41 0.57
1.0 0.73 0.63 0.03 0.76 0.86 0.72 0.55 0.62 0.51 0.53 0.6 0.29 0.46 0.51 0.53 0.55 0.53 0.68 0.7 0.76 0.92
0.97 1.0 0.7 0.04 0.71 0.87 0.76 0.68 0.6 0.62 0.63 0.7 0.29 0.57 0.63 0.63 0.63 0.6 0.8 0.48 0.53 0.61
0.88 1.0 0.75 0.02 0.51 0.8 0.66 0.56 0.71 0.53 0.54 0.72 0.3 0.48 0.53 0.55 0.58 0.51 0.72 0.62 0.58 0.8
0.52 0.69 1.0 0.03 0.55 0.56 0.55 0.42 0.49 0.39 0.37 0.42 0.21 0.5 0.41 0.42 0.41 0.38 0.55 0.35 0.38 0.59
0.54 0.68 1.0 0.01 0.61 0.65 0.67 0.45 0.66 0.41 0.43 0.65 0.23 0.65 0.51 0.52 0.54 0.52 0.68 0.43 0.46 0.69
0.7 1.0 0.77 0.01 0.69 0.73 0.54 0.64 0.54 0.57 0.49 0.56 0.24 0.43 0.58 0.53 0.54 0.51 0.69 0.56 0.74 0.75
0.86 1.0 0.83 0.02 0.49 0.68 0.78 0.56 0.64 0.45 0.48 0.55 0.3 0.59 0.49 0.45 0.49 0.49 0.58 0.42 0.48 0.68
0.64 0.91 0.89 0.02 0.9 1.0 0.57 0.52 0.7 0.48 0.47 0.69 0.3 0.47 0.6 0.64 0.54 0.6 0.95 0.67 0.62 0.43
0.46 0.89 1.0 0.03 0.41 0.52 0.3 0.28 0.24 0.31 0.28 0.35 0.13 0.44 0.32 0.29 0.27 0.29 0.39 0.36 0.39 0.24
0.64 0.95 1.0 0.05 0.7 0.76 0.6 0.57 0.71 0.53 0.5 0.76 0.43 0.51 0.48 0.48 0.49 0.5 0.74 0.58 0.66 0.79
0.48 0.89 1.0 0.01 0.51 0.54 0.49 0.61 0.55 0.49 0.53 0.55 0.27 0.3 0.31 0.33 0.32 0.33 0.44 0.57 0.65 0.59
0.91 1.0 0.91 0.01 0.56 0.85 0.71 0.81 0.79 0.67 0.73 0.8 0.33 0.54 0.54 0.46 0.54 0.51 0.62 0.5 0.52 0.78
0.6 0.77 1.0 0.04 0.54 0.65 0.59 0.45 0.51 0.47 0.49 0.53 0.24 0.33 0.35 0.33 0.38 0.39 0.5 0.34 0.38 0.54
0.61 1.0 0.83 0.03 0.41 0.67 0.56 0.53 0.68 0.44 0.5 0.58 0.36 0.54 0.43 0.38 0.39 0.4 0.5 0.47 0.5 0.59
0.32 0.66 1.0 0.03 0.54 0.69 0.43 0.53 0.54 0.62 0.58 0.53 0.24 0.28 0.34 0.33 0.31 0.3 0.49 0.3 0.33 0.45
0.36 0.71 1.0 0.01 0.49 0.64 0.5 0.5 0.55 0.54 0.51 0.59 0.24 0.41 0.38 0.37 0.41 0.39 0.58 0.42 0.45 0.55
0.81 1.0 0.87 0.03 0.53 0.63 0.72 0.54 0.43 0.46 0.52 0.5 0.25 0.49 0.49 0.47 0.5 0.49 0.59 0.49 0.49 0.74
0.56 0.88 1.0 0.03 0.43 0.62 0.38 0.53 0.42 0.34 0.37 0.47 0.26 0.29 0.45 0.39 0.4 0.41 0.59 0.48 0.5 0.37
0.61 0.8 0.92 0.03 0.67 0.76 0.54 0.46 0.49 0.33 0.34 0.47 0.33 0.38 0.43 0.45 0.46 0.46 1.0 0.59 0.46 0.51
0.7 1.0 0.77 0.04 0.54 0.73 0.59 0.55 0.67 0.46 0.54 0.6 0.41 0.36 0.41 0.38 0.43 0.47 0.68 0.47 0.47 0.59
1.0 0.8 0.61 0.04 0.86 0.96 0.87 0.96 0.73 0.83 0.88 0.72 0.27 0.67 0.7 0.75 0.73 0.68 0.74 0.6 0.68 0.78
0.98 1.0 0.67 0.01 0.8 0.94 0.85 0.77 0.64 0.65 0.75 0.65 0.32 0.38 0.59 0.58 0.63 0.58 0.72 0.62 0.6 0.8
0.95 0.68 0.8 0.02 0.74 0.77 0.86 0.63 0.79 0.6 0.54 0.74 0.3 0.73 0.57 0.55 0.53 0.53 0.57 0.66 0.66 1.0
0.69 0.86 1.0 0.06 0.65 0.6 0.53 0.51 0.44 0.28 0.37 0.51 0.22 0.37 0.39 0.48 0.42 0.38 0.68 0.51 0.37 0.45
0.82 1.0 0.89 0.03 0.68 0.75 0.77 0.59 0.73 0.6 0.55 0.91 0.37 0.56 0.49 0.5 0.52 0.5 0.56 0.53 0.57 0.52
0.81 0.94 1.0 0.03 0.6 0.7 0.63 0.72 0.61 0.51 0.62 0.51 0.35 0.51 0.43 0.44 0.46 0.46 0.65 0.46 0.45 0.64
0.64 0.87 1.0 0.05 0.61 0.61 0.41 0.51 0.37 0.53 0.54 0.49 0.31 0.36 0.4 0.42 0.46 0.39 0.48 0.51 0.58 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)