Heatmap: Cluster_36 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.82 0.96 0.82 0.01 0.94 0.67 1.0 0.65 0.84 0.56 0.58 0.82 0.38 0.64 0.67 0.67 0.68 0.67 0.85 0.67 0.63 0.92
0.62 0.97 1.0 0.05 0.94 0.44 0.51 0.54 0.64 0.49 0.54 0.67 0.3 0.47 0.5 0.48 0.46 0.47 0.67 0.63 0.55 0.48
0.65 0.86 0.75 0.02 0.89 0.48 0.55 0.45 0.63 0.4 0.45 0.58 0.3 0.31 0.53 0.49 0.49 0.51 1.0 0.61 0.59 0.42
0.69 1.0 0.99 0.02 0.83 0.5 0.87 0.61 0.51 0.54 0.63 0.61 0.39 0.53 0.58 0.56 0.57 0.55 0.75 0.67 0.6 0.38
0.67 0.97 0.84 0.03 1.0 0.49 0.6 0.58 0.71 0.5 0.57 0.68 0.37 0.64 0.48 0.46 0.46 0.48 0.72 0.71 0.64 0.64
0.57 0.95 1.0 0.01 1.0 0.51 0.58 0.62 0.71 0.56 0.59 0.66 0.26 0.41 0.56 0.55 0.52 0.54 0.72 0.64 0.58 0.59
0.55 0.82 0.71 0.01 1.0 0.39 0.63 0.55 0.53 0.52 0.58 0.56 0.48 0.53 0.41 0.41 0.38 0.38 0.47 0.6 0.5 0.5
0.57 0.79 0.55 0.01 1.0 0.45 0.4 0.46 0.57 0.46 0.48 0.55 0.27 0.45 0.52 0.5 0.48 0.52 0.91 0.57 0.57 0.37
0.75 0.91 0.9 0.06 1.0 0.5 0.84 0.61 0.66 0.54 0.61 0.71 0.48 0.62 0.55 0.52 0.53 0.52 0.84 0.67 0.61 0.59
0.65 1.0 0.83 0.06 0.81 0.46 0.65 0.61 0.48 0.49 0.56 0.69 0.53 0.2 0.43 0.42 0.42 0.43 0.69 0.71 0.62 0.59
0.69 1.0 0.97 0.04 0.73 0.46 0.61 0.56 0.68 0.5 0.54 0.62 0.35 0.41 0.46 0.45 0.44 0.45 0.72 0.57 0.54 0.69
0.58 1.0 0.97 0.05 0.85 0.45 0.5 0.58 0.68 0.5 0.55 0.7 0.36 0.42 0.51 0.45 0.48 0.47 0.77 0.65 0.6 0.44
0.66 1.0 0.8 0.02 0.95 0.49 0.39 0.7 0.87 0.63 0.71 0.84 0.53 0.65 0.66 0.64 0.62 0.62 0.84 0.74 0.68 0.64
0.61 0.68 1.0 0.07 0.62 0.41 0.63 0.58 0.73 0.57 0.58 0.71 0.36 0.55 0.4 0.38 0.41 0.38 0.62 0.49 0.44 0.66
0.79 1.0 0.95 0.05 0.94 0.5 0.66 0.62 0.71 0.54 0.66 0.68 0.38 0.54 0.43 0.45 0.42 0.44 0.82 0.7 0.61 0.53
0.62 0.82 0.74 0.02 1.0 0.46 0.47 0.6 0.64 0.52 0.55 0.58 0.36 0.36 0.54 0.48 0.48 0.48 0.8 0.55 0.54 0.67
0.74 1.0 0.94 0.04 0.96 0.57 0.8 0.77 0.84 0.7 0.76 0.83 0.49 0.6 0.59 0.53 0.56 0.55 0.88 0.74 0.66 0.81
0.65 0.95 0.99 0.04 1.0 0.5 0.65 0.66 0.77 0.59 0.64 0.75 0.43 0.9 0.59 0.61 0.57 0.56 0.81 0.67 0.61 0.62
0.63 0.78 0.52 0.01 1.0 0.49 0.7 0.66 0.72 0.62 0.64 0.69 0.34 0.35 0.59 0.57 0.56 0.56 0.89 0.61 0.58 0.72
0.58 0.89 1.0 0.04 0.92 0.45 0.67 0.69 0.78 0.58 0.69 0.78 0.41 0.84 0.53 0.5 0.5 0.49 0.83 0.74 0.63 0.81
0.6 0.67 0.6 0.02 0.91 0.56 1.0 0.56 0.74 0.47 0.57 0.68 0.48 0.71 0.48 0.5 0.48 0.47 0.56 0.55 0.49 0.49
0.62 0.98 1.0 0.06 0.71 0.45 0.57 0.57 0.62 0.5 0.53 0.66 0.34 0.45 0.54 0.54 0.53 0.54 0.68 0.59 0.54 0.47
0.61 1.0 0.97 0.04 0.85 0.43 0.58 0.6 0.64 0.51 0.57 0.7 0.35 0.41 0.49 0.46 0.47 0.45 0.75 0.64 0.56 0.49
0.73 1.0 0.84 0.06 0.99 0.52 0.69 0.68 0.82 0.57 0.63 0.83 0.43 0.97 0.61 0.66 0.6 0.6 0.9 0.71 0.63 0.73
0.77 1.0 0.78 0.01 0.87 0.55 0.52 0.66 0.8 0.56 0.62 0.77 0.44 0.46 0.67 0.67 0.64 0.64 0.87 0.66 0.62 0.52
0.69 0.87 0.81 0.01 0.87 0.54 1.0 0.68 0.74 0.62 0.67 0.73 0.43 0.7 0.66 0.66 0.66 0.64 0.82 0.62 0.61 0.89
0.66 0.98 0.83 0.02 0.9 0.46 0.6 0.6 0.67 0.54 0.57 0.68 0.35 0.19 0.51 0.49 0.5 0.49 1.0 0.64 0.59 0.55
0.6 1.0 0.79 0.03 0.95 0.52 0.6 0.56 0.65 0.5 0.55 0.69 0.34 0.49 0.59 0.56 0.57 0.55 0.74 0.61 0.59 0.41
0.78 1.0 0.81 0.02 0.81 0.54 0.55 0.57 0.67 0.5 0.55 0.7 0.31 0.21 0.48 0.48 0.49 0.52 0.71 0.63 0.54 0.46
0.48 0.91 0.96 0.02 1.0 0.43 0.71 0.55 0.59 0.51 0.55 0.57 0.37 0.41 0.47 0.45 0.45 0.45 0.71 0.61 0.56 0.65
0.64 0.87 0.69 0.01 1.0 0.5 0.61 0.44 0.57 0.41 0.45 0.58 0.33 0.5 0.54 0.51 0.5 0.5 0.88 0.58 0.54 0.5
0.68 1.0 0.9 0.02 0.94 0.55 0.75 0.61 0.65 0.53 0.57 0.64 0.33 0.54 0.55 0.55 0.52 0.54 0.89 0.53 0.53 0.78
0.82 0.94 0.63 0.03 1.0 0.49 0.61 0.63 0.7 0.53 0.6 0.68 0.42 0.48 0.6 0.59 0.5 0.51 0.96 0.68 0.62 0.65
0.52 0.53 0.46 0.01 0.79 0.47 0.7 0.6 0.6 0.54 0.54 0.59 0.23 0.45 0.55 0.54 0.57 0.56 0.76 0.47 0.47 1.0
0.52 0.53 0.46 0.01 0.79 0.47 0.7 0.6 0.6 0.54 0.54 0.59 0.23 0.45 0.55 0.54 0.57 0.56 0.76 0.47 0.47 1.0
0.77 0.94 0.7 0.03 1.0 0.57 0.61 0.62 0.68 0.56 0.57 0.65 0.39 0.59 0.62 0.66 0.6 0.6 0.86 0.68 0.61 0.86
0.65 0.95 0.85 0.01 1.0 0.49 0.53 0.67 0.72 0.6 0.66 0.77 0.34 0.27 0.54 0.52 0.52 0.53 0.81 0.7 0.63 0.45
0.77 0.98 0.82 0.02 1.0 0.58 0.78 0.64 0.63 0.63 0.65 0.64 0.4 0.71 0.67 0.66 0.64 0.63 0.94 0.64 0.65 0.62
0.5 0.44 0.25 0.0 0.92 0.51 1.0 0.58 0.65 0.53 0.6 0.66 0.66 0.47 0.54 0.52 0.52 0.51 0.73 0.72 0.62 0.86
0.74 0.96 0.99 0.03 1.0 0.54 0.61 0.67 0.8 0.58 0.62 0.73 0.38 0.82 0.61 0.62 0.57 0.6 0.83 0.75 0.66 0.75
0.52 0.86 1.0 0.03 0.89 0.47 0.62 0.48 0.54 0.44 0.48 0.61 0.28 0.4 0.41 0.4 0.41 0.41 0.61 0.53 0.46 0.45
0.67 1.0 0.99 0.01 0.97 0.54 0.68 0.73 0.7 0.67 0.69 0.68 0.32 0.59 0.72 0.67 0.67 0.68 0.99 0.53 0.55 0.62
0.71 0.94 0.87 0.03 1.0 0.51 0.69 0.54 0.7 0.49 0.53 0.7 0.36 0.72 0.53 0.49 0.49 0.49 0.76 0.66 0.58 0.55
0.66 0.96 1.0 0.02 0.83 0.55 0.61 0.8 0.73 0.71 0.71 0.68 0.3 0.75 0.63 0.63 0.62 0.6 0.78 0.56 0.54 0.93
0.65 0.98 0.92 0.05 0.92 0.58 0.45 0.54 0.62 0.51 0.53 0.66 0.4 0.3 0.59 0.57 0.58 0.6 1.0 0.66 0.64 0.37
0.41 0.88 0.63 0.02 1.0 0.49 0.47 0.6 0.71 0.58 0.62 0.69 0.4 0.32 0.56 0.54 0.52 0.52 0.77 0.67 0.61 0.4
0.32 0.44 0.59 0.02 1.0 0.34 0.52 0.3 0.44 0.33 0.35 0.39 0.18 0.32 0.32 0.27 0.29 0.34 0.62 0.41 0.38 0.44
0.77 0.89 1.0 0.02 0.56 0.47 0.72 0.73 0.93 0.58 0.67 0.96 0.31 0.4 0.35 0.29 0.39 0.33 0.41 0.87 0.75 0.67
0.71 1.0 0.79 0.04 0.97 0.52 0.71 0.62 0.82 0.53 0.57 0.76 0.4 0.69 0.59 0.59 0.57 0.58 0.88 0.71 0.65 0.61
0.72 0.96 0.71 0.01 1.0 0.53 0.51 0.64 0.76 0.57 0.61 0.72 0.37 0.74 0.7 0.67 0.65 0.65 0.91 0.68 0.65 0.57
0.62 0.82 0.68 0.02 1.0 0.48 0.67 0.58 0.68 0.5 0.55 0.66 0.39 0.48 0.54 0.52 0.5 0.5 0.71 0.64 0.61 0.69
0.56 0.96 0.79 0.04 1.0 0.47 0.5 0.66 0.81 0.58 0.66 0.81 0.45 0.34 0.46 0.44 0.47 0.45 0.61 0.78 0.67 0.49
0.63 0.85 0.64 0.01 1.0 0.55 0.69 0.63 0.73 0.57 0.6 0.69 0.3 0.47 0.6 0.57 0.56 0.59 0.83 0.67 0.6 0.59
0.55 0.94 1.0 0.02 0.76 0.42 0.44 0.53 0.52 0.51 0.47 0.49 0.24 0.38 0.49 0.48 0.49 0.47 0.66 0.44 0.46 0.48
0.57 0.73 0.6 0.04 1.0 0.49 0.6 0.59 0.67 0.43 0.51 0.58 0.3 0.47 0.48 0.42 0.4 0.38 0.75 0.6 0.63 0.45
0.78 0.96 0.77 0.04 1.0 0.53 0.66 0.69 0.86 0.57 0.66 0.81 0.43 0.58 0.53 0.55 0.5 0.53 0.93 0.73 0.65 0.68
0.67 1.0 0.83 0.03 0.89 0.54 0.71 0.66 0.72 0.6 0.63 0.72 0.42 0.57 0.6 0.61 0.59 0.58 0.81 0.66 0.65 0.58
0.33 0.76 1.0 0.04 0.68 0.27 0.25 0.38 0.44 0.33 0.35 0.47 0.19 0.27 0.24 0.24 0.3 0.31 0.48 0.41 0.37 0.28
0.68 1.0 0.82 0.04 0.78 0.49 0.5 0.61 0.68 0.52 0.56 0.71 0.42 0.98 0.44 0.44 0.42 0.43 0.86 0.65 0.59 0.67
0.7 0.94 0.86 0.04 1.0 0.47 0.61 0.57 0.6 0.54 0.57 0.62 0.33 0.54 0.52 0.51 0.51 0.52 0.85 0.58 0.54 0.57
0.63 0.82 0.68 0.01 1.0 0.46 0.69 0.55 0.7 0.48 0.53 0.69 0.34 0.54 0.51 0.49 0.5 0.5 0.76 0.64 0.58 0.66
0.73 1.0 0.78 0.04 0.88 0.5 0.46 0.72 0.88 0.62 0.69 0.87 0.53 0.65 0.59 0.62 0.59 0.58 0.81 0.72 0.68 0.43
0.58 0.53 0.31 0.01 0.93 0.48 0.61 0.52 0.79 0.5 0.49 0.76 0.14 0.59 0.51 0.52 0.46 0.49 0.78 0.48 0.49 1.0
0.59 0.73 0.67 0.01 1.0 0.45 0.55 0.5 0.66 0.45 0.48 0.59 0.29 0.48 0.56 0.53 0.51 0.54 0.81 0.5 0.48 0.47
0.58 0.89 0.87 0.03 1.0 0.57 0.68 0.44 0.47 0.44 0.41 0.49 0.26 0.44 0.49 0.47 0.46 0.48 0.99 0.51 0.54 0.54
0.63 0.89 1.0 0.03 0.83 0.43 0.91 0.61 0.87 0.54 0.66 0.84 0.46 0.37 0.42 0.42 0.42 0.41 0.44 0.69 0.54 0.62
0.68 0.88 0.71 0.04 1.0 0.43 0.5 0.62 0.69 0.55 0.6 0.67 0.37 0.62 0.54 0.5 0.52 0.49 0.75 0.59 0.56 0.44
0.66 0.96 0.72 0.03 1.0 0.49 0.65 0.65 0.66 0.65 0.66 0.72 0.4 0.39 0.51 0.49 0.5 0.5 0.83 0.66 0.61 0.54
0.65 0.91 0.66 0.04 1.0 0.5 0.77 0.57 0.69 0.52 0.58 0.72 0.4 0.4 0.55 0.53 0.53 0.53 0.76 0.58 0.56 0.5
0.56 0.62 0.51 0.02 1.0 0.39 0.53 0.41 0.44 0.37 0.37 0.44 0.24 0.64 0.49 0.48 0.45 0.46 0.78 0.45 0.44 0.68
0.68 1.0 0.88 0.04 0.97 0.52 0.69 0.67 0.76 0.59 0.68 0.8 0.44 0.31 0.53 0.54 0.55 0.53 0.67 0.69 0.62 0.42
0.41 0.67 1.0 0.03 0.69 0.37 0.49 0.31 0.56 0.37 0.37 0.51 0.28 0.6 0.37 0.37 0.36 0.39 0.56 0.44 0.41 0.52
0.37 0.63 1.0 0.02 0.65 0.27 0.21 0.31 0.44 0.32 0.3 0.44 0.2 0.3 0.34 0.35 0.37 0.39 0.58 0.46 0.4 0.29
0.65 0.86 1.0 0.04 0.8 0.51 0.77 0.44 0.93 0.35 0.51 0.84 0.49 0.6 0.42 0.43 0.47 0.46 0.56 0.81 0.65 0.66
0.72 1.0 0.81 0.06 0.93 0.53 0.75 0.69 0.78 0.63 0.68 0.74 0.54 0.39 0.57 0.57 0.53 0.55 0.88 0.67 0.64 0.58
0.48 0.53 1.0 0.05 0.58 0.31 0.32 0.36 0.39 0.35 0.37 0.45 0.2 0.38 0.34 0.35 0.33 0.35 0.48 0.43 0.48 0.34
0.68 1.0 0.97 0.03 0.97 0.43 0.48 0.65 0.7 0.56 0.66 0.79 0.47 0.13 0.82 0.8 0.82 0.77 0.55 0.73 0.59 0.45
0.55 0.85 0.94 0.03 1.0 0.44 0.43 0.45 0.57 0.4 0.46 0.55 0.26 0.64 0.52 0.52 0.5 0.49 0.88 0.52 0.5 0.4
0.73 1.0 0.85 0.02 0.77 0.53 0.91 0.62 0.7 0.53 0.56 0.68 0.47 0.67 0.58 0.57 0.61 0.57 0.86 0.7 0.69 0.81
0.68 1.0 0.9 0.06 0.92 0.45 0.58 0.59 0.6 0.52 0.57 0.71 0.43 0.57 0.54 0.53 0.51 0.51 0.74 0.66 0.61 0.66
0.68 0.98 0.83 0.01 1.0 0.5 0.64 0.58 0.69 0.54 0.57 0.7 0.34 0.57 0.59 0.58 0.55 0.57 0.79 0.66 0.63 0.57
0.67 0.98 1.0 0.08 0.87 0.47 0.52 0.64 0.73 0.62 0.65 0.76 0.42 0.76 0.59 0.56 0.57 0.55 0.75 0.66 0.63 0.6
0.61 0.91 1.0 0.04 1.0 0.47 0.67 0.57 0.61 0.51 0.54 0.66 0.24 0.52 0.59 0.6 0.57 0.57 0.88 0.58 0.54 0.6
0.79 0.93 0.69 0.03 1.0 0.53 0.73 0.7 0.75 0.66 0.71 0.76 0.46 0.81 0.6 0.58 0.57 0.58 0.84 0.75 0.68 0.67
0.6 0.85 1.0 0.11 0.76 0.46 0.7 0.7 0.82 0.6 0.7 0.83 0.57 0.83 0.45 0.49 0.47 0.47 0.66 0.79 0.65 0.66
0.58 0.95 0.66 0.02 1.0 0.52 0.52 0.66 0.71 0.58 0.61 0.75 0.37 0.49 0.58 0.56 0.55 0.57 0.83 0.68 0.66 0.46
0.35 0.33 0.33 0.0 1.0 0.38 0.99 0.32 0.51 0.3 0.35 0.51 0.19 0.22 0.29 0.29 0.29 0.28 0.27 0.39 0.35 0.61
0.73 0.84 1.0 0.03 0.68 0.53 0.73 0.73 0.64 0.67 0.66 0.84 0.28 0.37 0.41 0.37 0.47 0.43 0.34 0.7 0.64 0.69
0.72 1.0 0.72 0.02 0.97 0.49 0.53 0.63 0.59 0.53 0.55 0.72 0.41 0.51 0.63 0.65 0.52 0.55 0.96 0.65 0.61 0.68
0.86 1.0 0.72 0.02 0.91 0.57 0.65 0.6 0.64 0.53 0.53 0.59 0.44 0.66 0.58 0.6 0.57 0.59 0.82 0.66 0.64 0.79
0.81 1.0 0.87 0.04 0.94 0.59 0.7 0.85 0.84 0.72 0.77 0.82 0.46 0.81 0.75 0.7 0.7 0.7 0.89 0.68 0.72 0.87
0.45 0.64 1.0 0.02 0.7 0.52 0.87 0.43 0.64 0.36 0.37 0.6 0.26 0.5 0.57 0.59 0.59 0.58 0.61 0.47 0.43 0.52
0.57 0.87 0.78 0.02 1.0 0.53 0.5 0.66 0.64 0.58 0.62 0.61 0.35 0.32 0.51 0.46 0.46 0.46 0.81 0.6 0.57 0.66
0.76 0.97 0.75 0.03 1.0 0.56 0.75 0.68 0.81 0.61 0.64 0.79 0.51 0.49 0.7 0.68 0.67 0.65 0.89 0.68 0.68 0.86
0.69 0.9 0.64 0.01 1.0 0.5 0.45 0.62 0.67 0.55 0.59 0.73 0.33 0.3 0.53 0.52 0.51 0.5 0.76 0.68 0.62 0.53
0.86 0.99 0.97 0.08 1.0 0.56 0.74 0.52 0.63 0.43 0.51 0.68 0.39 0.5 0.49 0.48 0.49 0.48 0.74 0.72 0.63 0.58
0.78 1.0 0.89 0.03 0.87 0.5 0.6 0.57 0.67 0.5 0.54 0.68 0.42 0.64 0.62 0.6 0.59 0.58 0.79 0.67 0.62 0.62
0.72 1.0 0.86 0.06 0.87 0.57 0.85 0.58 0.75 0.54 0.61 0.71 0.56 0.72 0.45 0.42 0.44 0.45 0.69 0.8 0.71 0.67
0.44 0.83 1.0 0.04 0.81 0.4 0.33 0.53 0.6 0.46 0.49 0.59 0.38 0.16 0.55 0.48 0.51 0.47 0.56 0.53 0.47 0.6
0.61 0.93 0.82 0.02 1.0 0.48 0.7 0.62 0.66 0.54 0.55 0.64 0.31 0.5 0.59 0.6 0.56 0.57 0.78 0.6 0.59 0.65
0.66 0.74 1.0 0.03 0.59 0.4 0.68 0.55 0.71 0.56 0.6 0.67 0.39 0.31 0.46 0.42 0.44 0.42 0.53 0.58 0.53 0.44
0.56 0.94 1.0 0.04 0.82 0.41 0.48 0.5 0.54 0.43 0.48 0.57 0.27 0.37 0.53 0.55 0.51 0.53 0.83 0.53 0.49 0.42
0.7 0.88 0.65 0.02 1.0 0.54 0.8 0.65 0.79 0.57 0.62 0.75 0.45 0.34 0.52 0.51 0.53 0.54 0.84 0.73 0.65 0.72
0.7 0.9 0.82 0.05 1.0 0.59 0.76 0.71 0.82 0.66 0.77 0.87 0.57 0.29 0.59 0.56 0.6 0.58 0.78 0.78 0.7 0.61
0.76 0.95 0.93 0.01 0.93 0.56 0.83 0.65 0.8 0.54 0.61 0.8 0.37 0.74 0.77 0.72 0.75 0.72 0.83 0.61 0.61 1.0
0.68 1.0 0.86 0.04 0.93 0.45 0.55 0.74 0.73 0.63 0.69 0.78 0.47 0.6 0.56 0.57 0.55 0.54 0.7 0.69 0.61 0.47
0.62 0.86 0.73 0.01 1.0 0.49 0.79 0.58 0.72 0.52 0.55 0.7 0.41 0.63 0.61 0.57 0.54 0.53 0.89 0.63 0.6 0.72
0.71 1.0 0.88 0.03 0.92 0.51 0.57 0.6 0.69 0.55 0.61 0.72 0.44 0.67 0.54 0.56 0.54 0.53 0.79 0.65 0.6 0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)