Heatmap: Cluster_63 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.25 0.41 0.33 0.07 1.0 0.6 0.35 0.26 0.15 0.24 0.19 0.23 0.2 0.18 0.31 0.29 0.32 0.3 0.62 0.17 0.17 0.79
0.31 0.48 1.0 0.05 0.94 0.44 0.22 0.19 0.22 0.13 0.13 0.21 0.12 0.13 0.33 0.41 0.39 0.32 0.18 0.16 0.14 0.09
0.77 0.74 1.0 0.07 0.95 0.76 0.69 0.35 0.52 0.26 0.32 0.46 0.36 0.44 0.56 0.59 0.54 0.52 0.76 0.54 0.48 0.46
0.61 0.74 1.0 0.06 0.88 0.79 0.78 0.61 0.92 0.83 0.89 0.78 0.38 0.41 0.3 0.33 0.32 0.3 0.5 0.41 0.35 0.77
0.29 0.31 0.21 0.01 1.0 0.53 0.27 0.28 0.52 0.36 0.32 0.56 0.09 0.22 0.24 0.24 0.26 0.26 0.39 0.39 0.38 0.3
0.78 0.66 0.3 0.04 1.0 0.8 0.7 0.47 0.68 0.41 0.45 0.67 0.28 0.49 0.47 0.42 0.49 0.46 0.71 0.59 0.52 0.67
0.38 0.24 0.07 0.01 0.84 0.54 0.24 0.31 0.42 0.32 0.29 0.4 0.13 0.26 0.33 0.31 0.35 0.31 0.31 0.34 0.29 1.0
0.29 0.59 1.0 0.03 0.72 0.34 0.44 0.21 0.24 0.29 0.32 0.19 0.17 0.35 0.26 0.27 0.28 0.26 0.37 0.15 0.15 0.45
0.29 0.04 0.01 0.02 1.0 0.56 0.28 0.13 0.74 0.11 0.25 0.74 0.07 0.23 0.11 0.18 0.13 0.11 0.35 0.39 0.15 0.29
0.25 0.48 1.0 0.05 0.8 0.34 0.28 0.18 0.2 0.09 0.14 0.23 0.1 0.15 0.23 0.27 0.24 0.24 0.41 0.21 0.23 0.17
0.6 0.68 0.85 0.04 0.84 1.0 0.5 0.42 0.41 0.38 0.31 0.36 0.4 0.53 0.49 0.59 0.51 0.51 0.88 0.43 0.52 0.44
0.01 0.0 0.0 0.01 1.0 0.58 0.09 0.05 0.08 0.05 0.04 0.04 0.21 0.04 0.11 0.22 0.16 0.25 0.09 0.05 0.09 0.03
0.54 0.8 1.0 0.1 0.94 0.67 0.48 0.46 0.62 0.43 0.47 0.53 0.25 0.41 0.55 0.47 0.52 0.51 0.56 0.36 0.36 0.33
0.15 0.13 0.12 0.0 1.0 0.89 0.45 0.18 0.31 0.22 0.3 0.17 0.39 0.09 0.49 0.45 0.41 0.41 0.24 0.29 0.39 0.35
0.53 0.71 0.18 0.02 1.0 0.89 0.44 0.45 0.61 0.51 0.64 0.74 0.16 0.77 0.42 0.41 0.4 0.41 0.97 0.43 0.39 0.85
0.15 0.02 0.0 0.11 0.32 0.67 0.16 0.12 0.3 0.77 0.39 0.21 0.01 0.19 0.14 0.15 0.09 0.06 0.05 0.0 0.0 1.0
0.53 0.8 0.29 0.02 1.0 0.77 0.48 0.61 0.62 0.62 0.64 0.66 0.34 0.31 0.46 0.42 0.66 0.62 0.93 0.4 0.43 0.54
0.65 0.64 0.66 0.03 0.7 1.0 0.67 0.69 0.63 0.61 0.58 0.68 0.31 0.75 0.77 0.65 0.67 0.61 0.74 0.5 0.58 0.56
0.51 0.43 0.53 0.05 0.59 0.59 0.6 0.43 0.5 0.35 0.29 0.55 0.26 1.0 0.41 0.39 0.39 0.39 0.6 0.41 0.42 0.66
0.56 0.29 0.14 0.16 0.81 0.67 1.0 0.49 0.58 0.41 0.39 0.53 0.31 0.68 0.39 0.48 0.44 0.39 0.58 0.51 0.52 0.57
0.39 0.22 0.03 0.03 0.92 0.76 0.37 0.8 0.7 0.7 0.54 0.77 0.11 0.62 0.56 0.61 0.53 0.6 0.61 1.0 0.9 0.86
0.03 0.02 0.0 0.02 1.0 0.71 0.19 0.03 0.12 0.04 0.04 0.11 0.02 0.07 0.01 0.02 0.02 0.03 0.21 0.08 0.06 0.74
0.4 0.39 0.31 0.04 1.0 0.53 0.41 0.37 0.47 0.28 0.28 0.43 0.33 0.36 0.42 0.43 0.54 0.49 0.4 0.52 0.53 0.53
0.79 0.78 0.15 0.03 0.94 0.69 0.68 0.75 0.92 0.82 0.71 1.0 0.26 0.75 0.37 0.41 0.44 0.36 0.49 0.51 0.5 0.76
0.03 0.01 0.0 0.0 1.0 0.5 0.03 0.03 0.09 0.03 0.04 0.1 0.01 0.25 0.09 0.19 0.08 0.07 0.55 0.02 0.03 0.17
0.19 0.21 0.1 0.02 0.95 0.88 0.94 0.29 1.0 0.82 0.62 0.83 0.24 0.51 0.21 0.19 0.22 0.27 0.72 0.15 0.23 0.82
0.65 0.81 0.53 0.01 0.85 0.78 0.81 0.53 0.78 0.52 0.63 0.77 0.39 0.38 0.38 0.4 0.39 0.41 0.75 0.46 0.61 1.0
0.04 0.03 0.08 0.01 0.91 0.86 0.19 0.24 0.77 0.43 0.59 0.62 0.03 0.44 0.07 0.06 0.13 0.05 0.09 0.01 0.01 1.0
0.14 0.22 1.0 0.22 0.65 0.35 0.32 0.27 0.44 0.23 0.29 0.48 0.07 0.26 0.21 0.2 0.23 0.22 0.2 0.33 0.27 0.25
0.47 0.58 0.83 0.02 1.0 0.64 0.39 0.32 0.58 0.35 0.41 0.54 0.19 0.46 0.43 0.42 0.43 0.43 0.54 0.36 0.36 0.33
0.32 0.37 0.13 0.07 1.0 0.83 0.46 0.45 0.43 0.39 0.48 0.41 0.31 0.38 0.51 0.51 0.55 0.51 0.67 0.37 0.47 0.77
0.02 0.01 0.0 0.01 0.41 0.29 0.09 0.11 0.06 0.13 0.15 0.06 0.06 0.17 0.18 0.19 0.2 0.2 0.26 0.09 0.1 1.0
0.42 0.39 0.5 0.04 1.0 0.65 0.23 0.33 0.38 0.31 0.22 0.58 0.33 0.29 0.38 0.43 0.5 0.38 0.55 0.4 0.51 0.28
0.41 0.23 0.03 0.06 1.0 0.69 0.35 0.51 0.63 0.47 0.54 0.58 0.18 0.56 0.34 0.32 0.41 0.36 0.62 0.49 0.4 0.89
0.72 0.94 0.89 0.16 1.0 0.88 0.43 0.49 0.5 0.5 0.41 0.65 0.36 0.61 0.67 0.62 0.64 0.57 0.67 0.66 0.52 0.29
0.29 0.07 0.0 0.01 0.99 1.0 0.82 0.29 0.63 0.54 0.49 0.79 0.23 0.31 0.39 0.37 0.43 0.37 0.71 0.2 0.22 0.3
0.19 0.24 0.0 0.03 1.0 0.55 0.28 0.07 0.08 0.18 0.37 0.16 0.12 0.24 0.08 0.22 0.09 0.19 0.98 0.13 0.1 0.51
0.34 0.41 0.18 0.01 0.55 0.94 0.56 0.5 0.57 0.49 0.48 0.6 0.22 0.75 0.57 0.52 0.59 0.52 0.58 0.28 0.29 1.0
0.51 0.48 1.0 0.02 0.7 0.6 0.54 0.39 0.5 0.36 0.48 0.48 0.37 0.36 0.44 0.4 0.43 0.47 0.37 0.38 0.37 0.32
0.32 0.65 0.83 0.04 1.0 0.47 0.26 0.18 0.22 0.24 0.2 0.24 0.09 0.21 0.62 0.57 0.51 0.58 0.44 0.26 0.24 0.14
0.51 0.45 0.01 0.03 0.99 1.0 0.67 0.54 0.81 0.35 0.55 0.68 0.18 0.65 0.46 0.42 0.46 0.45 0.66 0.22 0.23 0.64
0.17 0.22 0.0 0.06 0.49 0.53 0.67 0.24 0.19 0.47 0.86 0.15 0.14 0.22 0.06 0.11 0.12 0.08 1.0 0.16 0.05 0.98
0.72 0.63 0.84 0.01 1.0 0.76 0.7 0.45 0.76 0.38 0.44 0.64 0.44 0.51 0.56 0.52 0.54 0.47 0.81 0.62 0.56 0.8
0.26 0.11 0.0 0.03 1.0 0.77 0.43 0.5 0.44 0.31 0.36 0.16 0.94 0.41 0.46 0.4 0.3 0.21 0.59 0.27 0.74 0.53
0.0 0.01 0.0 0.18 0.14 0.33 0.17 0.04 0.0 0.07 0.35 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 1.0
0.42 0.76 1.0 0.04 0.81 0.73 0.77 0.38 0.99 0.69 0.61 0.93 0.35 0.2 0.34 0.37 0.36 0.34 0.42 0.43 0.47 0.62
0.46 0.53 0.38 0.04 1.0 0.73 0.41 0.52 0.54 0.57 0.61 0.44 0.2 0.36 0.59 0.61 0.51 0.47 0.55 0.45 0.43 0.73
0.43 0.45 0.57 0.07 0.75 0.64 1.0 0.32 0.55 0.31 0.35 0.58 0.33 0.8 0.49 0.47 0.47 0.44 0.37 0.57 0.57 0.73
0.07 0.08 0.0 0.07 0.5 0.54 0.02 0.42 0.51 0.3 0.19 0.58 0.03 1.0 0.13 0.12 0.12 0.08 0.23 0.6 0.71 0.5
0.46 0.29 0.04 0.02 0.66 0.61 0.67 0.38 0.36 0.3 0.33 0.35 0.31 0.57 0.32 0.32 0.33 0.3 0.44 0.28 0.32 1.0
0.04 0.09 0.01 0.01 0.58 0.47 0.21 0.2 0.12 0.18 0.23 0.16 0.23 0.23 0.32 0.41 0.37 0.31 0.7 0.17 0.19 1.0
0.04 0.12 1.0 0.01 0.93 0.34 0.05 0.05 0.11 0.06 0.07 0.12 0.08 0.13 0.14 0.23 0.15 0.12 0.27 0.04 0.06 0.6
0.4 0.44 0.73 0.22 0.67 0.5 0.85 0.33 0.59 0.29 0.4 0.76 0.18 0.81 0.34 0.32 0.43 0.36 0.43 0.52 0.56 1.0
0.29 0.2 0.03 0.05 0.78 0.6 1.0 0.29 0.25 0.33 0.26 0.3 0.09 0.34 0.45 0.43 0.52 0.45 0.59 0.28 0.27 0.5
0.62 0.56 0.61 0.05 1.0 0.59 0.48 0.37 0.39 0.27 0.27 0.36 0.2 0.63 0.28 0.3 0.31 0.3 0.3 0.3 0.32 0.61
0.86 0.86 1.0 0.01 1.0 0.76 0.78 0.54 0.78 0.45 0.58 0.64 0.26 0.5 0.54 0.52 0.54 0.49 0.84 0.53 0.49 0.95
0.59 0.39 0.47 0.05 1.0 0.72 0.7 0.52 0.49 0.38 0.46 0.45 0.28 0.43 0.44 0.48 0.53 0.38 0.57 0.43 0.37 0.68
0.12 0.02 0.0 0.15 1.0 0.5 0.17 0.34 0.07 0.17 0.6 0.44 0.09 0.3 0.11 0.1 0.09 0.12 0.72 0.18 0.35 0.96
0.07 0.0 0.0 0.17 0.94 0.36 0.11 0.24 0.2 0.18 0.35 0.3 0.04 0.27 0.06 0.09 0.08 0.08 1.0 0.15 0.07 0.43
0.47 0.49 0.19 0.01 0.67 0.83 0.62 0.72 0.99 0.68 0.76 0.95 0.36 0.7 0.7 0.69 0.71 0.66 0.79 1.0 0.99 0.92
0.16 0.17 0.01 0.17 1.0 0.62 0.31 0.13 0.32 0.2 0.18 0.36 0.87 0.31 0.48 0.32 0.46 0.47 0.82 0.27 0.36 0.23
0.45 0.58 0.75 0.02 0.83 0.68 0.87 0.26 0.9 0.58 0.48 1.0 0.33 0.75 0.48 0.5 0.51 0.52 0.63 0.37 0.39 0.37
0.13 0.22 0.01 0.0 0.73 0.5 0.2 0.34 0.42 0.27 0.28 0.4 0.14 0.51 0.28 0.25 0.33 0.3 0.48 0.39 0.36 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.47 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.07 0.19 0.2 0.18 0.18 0.28 0.06 0.08 0.0
0.11 0.11 0.0 0.11 0.55 0.61 0.5 0.35 0.29 0.24 0.35 0.29 0.13 0.13 0.07 0.05 0.11 0.09 0.18 0.07 0.07 1.0
0.54 0.7 0.82 0.08 1.0 0.55 0.4 0.54 0.54 0.56 0.44 0.58 0.16 0.34 0.37 0.35 0.33 0.34 0.54 0.61 0.56 0.47
0.42 0.54 0.85 0.03 1.0 0.55 0.41 0.27 0.35 0.33 0.41 0.5 0.1 0.48 0.38 0.35 0.39 0.39 0.32 0.41 0.33 0.46
0.03 0.08 0.0 0.06 0.89 0.95 1.0 0.16 0.37 0.17 0.16 0.3 0.69 0.31 0.57 0.57 0.62 0.64 0.27 0.29 0.37 0.89
0.04 0.08 0.0 0.02 0.45 0.66 1.0 0.06 0.35 0.06 0.1 0.26 0.26 0.08 0.29 0.31 0.32 0.36 0.23 0.1 0.1 0.4
0.07 0.08 0.03 0.03 0.9 1.0 0.51 0.13 0.26 0.19 0.19 0.25 0.2 0.5 0.35 0.49 0.32 0.37 0.84 0.09 0.08 0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)