Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.04 0.0 1.51 0.89 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0
0.0 0.0 2.75 2.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.05 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.09 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.22 6.83 1.69 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.08 0.29 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.21 2.16 0.78 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 7.56 2.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 1.54 0.87 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.34 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.0 2.59 1.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.12 0.0 0.0 0.0
0.38 0.65 5.79 3.42 0.13 0.09 0.05 0.0 0.0 0.16 0.0 0.35 0.0 0.06 0.11 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.19
0.0 0.0 0.86 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.18 0.7 0.57 0.03 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.12 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.19 0.0 0.0
2.21 3.94 82.66 25.94 2.12 1.26 0.99 0.81 1.2 0.41 0.61 0.71 0.39 0.89 1.74 1.75 1.04 1.46 1.83 1.12 0.57 1.2
0.04 0.07 0.32 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 2.88 1.08 0.05 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0
0.0 0.0 0.55 1.71 0.03 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27
0.05 0.11 0.74 0.38 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
0.02 0.28 2.3 0.57 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.56 30.52 8.87 0.06 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 5.54 1.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.67 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.09 1.12 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 0.36 2.32 0.96 0.02 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.08 0.12 0.06 0.05 0.08 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
0.21 0.16 0.85 0.96 0.02 0.03 0.07 0.04 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.03 0.12 0.02 0.08 0.06 0.0 0.0 0.25
0.34 1.62 11.38 0.73 0.0 0.08 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.36
0.28 0.0 0.91 1.2 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.81 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.06 2.07 1.2 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.08 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 0.0 4.06 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.91 2.69 17.75 0.79 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.56 6.74 1.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.34 9.59 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.83 0.65 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.62 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.57 0.39 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.77 2.8 0.8 0.02 0.07 0.08 0.0 0.29 0.27 0.0 0.0 0.0 0.05 0.2 0.11 0.0 0.08 0.0 0.12 0.0 0.15
0.05 0.0 0.41 0.65 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.13 1.18 0.79 0.12 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12 0.05 0.0 0.06 0.0 0.07 0.0 0.19
0.13 0.06 0.57 0.32 0.04 0.02 0.03 0.06 0.06 0.0 0.03 0.0 0.04 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 1.29 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.67 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.91 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.57 0.81 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.47 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 1.31 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 2.48 1.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 1.35 0.64 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.43 4.73 2.02 0.02 0.1 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 2.12 1.92 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.43 0.39 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4
0.06 0.09 0.92 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.99 4.03 1.5 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.39 1.24 0.45 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.29 0.86 0.14 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.84 1.33 323.41 114.94 0.05 0.28 0.48 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.52 0.19 0.37 0.23 0.11 0.67 0.25 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.68 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.19 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.49 2.3 21.06 0.34 0.4 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 2.81 1.42 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.31 1.69 0.5 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0
0.04 0.18 2.54 0.98 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0 0.08 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 5.37 2.05 0.05 0.01 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 1.42 1.69 0.01 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.12 5.58 1.35 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.14 2.73 0.87 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.12 0.0 0.14 0.0 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.81 0.29 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.37 0.0 5.51 1.69 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.54 15.51 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 1.84 1.28 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19
0.0 0.0 2.98 0.52 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.45 0.22 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15
0.24 0.0 30.7 1.44 0.85 0.07 0.0 0.0 0.0 1.37 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.29 4.93 1.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.26 1.31 0.6 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.07 0.52 0.96 0.05 0.03 0.01 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24
0.0 0.0 1.39 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.4 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.18 2.25 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.46 0.0
0.03 0.0 0.19 0.68 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.76 0.34 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.84 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.9 7.18 2.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.79 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.22 3.73 0.32 0.03 0.03 0.12 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.64 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.29 1.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.09 1.2 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.0 3.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.2 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.74 1.03 0.06 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 6.71 1.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)